Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00384890

Standard Name

VPS8F (vacuolar protein sorting 8F)

Aliases

PreTt24781 | 41.m00188

Description

corvet complex core vacuolar protein (previously "zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase")

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Gene Ontology Annotations

No Data fetched for Gene Ontology Annotations

Domains

  • ( PF00097 ) zinc finger, C3HC4 type (RING
  • ( PF00107 ) oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family
  • ( PF05316 ) Mitochondrial ribosomal protein (VAR1)
  • ( PF08240 ) Alcohol dehydrogenase GroES-like domain
  • ( TIGR00864 ) polycystin cation channel protein
  • ( TIGR01257 ) rim ABC transporter
  • ( TIGR01612 ) rhoptry protein
  • ( TIGR02824 ) putative NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3
  • ( TIGR03058 ) chlorosome envelope protein H
  • ( TIGR03201 ) 6-hydroxycyclohex-1-ene-1-carbonyl-CoA dehydrogenase

Gene Expression Profile

Vegetative Cell Cycle (Zhang et al., 2023)

GeneMania

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for Tetrahymena Stock Center

Homologs

Source Identifier Score
Tetrahymena borealis EI9_04409.1 9.997093137033517e-262
Description: hypothetical protein (1596 aa)
DictyBase DDB_G0291606 0.00000000002000577768187062
Description: vps8 on chromosome: 6 position 397697 to 403037
Oxytricha Contig21963.0.g17 0.00000000039982266684865623
Description: WD domain, G-beta repeat

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

  1. Ref:31964712: Sparvoli D, Zoltner M, Cheng CY, Field MC, Turkewitz AP (2020) Diversification of CORVET tethers facilitates transport complexity in . Journal of cell science 133:
  2. Ref:29478853: Sparvoli D, Richardson E, Osakada H, Lan X, Iwamoto M, Bowman GR, Kontur C, Bourland WA, Lynn DH, Pritchard JK, Haraguchi T, Dacks JB, Turkewitz AP (2018) Remodeling the Specificity of an Endosomal CORVET Tether Underlies Formation of Regulated Secretory Vesicles in the Ciliate Tetrahymena thermophila. Current biology : CB 28(5):697-710.e13

Sequences 

>TTHERM_00384890(coding)
ATGTCATAAAATAACAGCAAGGTTAGTAGTTTTCTCTCAAATACAAATGAAATGAATTAA
GATTCTAACCATTCGTTAGAAGATCCTAATATATAATCAGCTCTACCATTTTTAGAAAAA
AGGCTTAGCAATTATGAAAATATAGATCTAATTGAAAATAACCCTGCTAACAATATAGAT
GATGAACAGGTTACATGTGATAACACTAGCATGATTAGAGAACTCTCTAATGAATTTGAT
CACTATGAGAAAGAATAGTTTAATTTCAATAGTGTTTAACCTATTTAAAGCAAGAAGTCT
TTTAGCCAATATCACAATGAACAAAATAGCTCTAATTTTAGGTTTTCAAATGGTGAAGAG
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GTCTATACAAAAGAATTAAAGTAATGTGATTTTTAACTTACATATATGAAGTCTGAATAC
AAAAAAGAGTATCTTCGTTTTGAATTCATTTCTAAGTTAAATCACATAATATACAATAAG
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GGTGGTGGTAGTGGAAATTTCATTGTTTTTTCAAAGCTTAATTACGAGTATGAAATTTTT
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AATAAGCCAAACAAATTGAATAATTTGCAGGTAATTACCTCAGATATAAATGGATAAGTT
AAGGTTGTCTTTCTTACTAAAGGTATGTTTAAGTATAGTGTAAGTCAAAAGATTTTAATT
GAGAAAAAGAGTTTTCCAATTTAATAGATTACTCTTCTATCAGAAGATCTAAAAGCTAAA
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CAAATTTATAGCTATTCAATACAGACCATGAATCTCAATCTAATTTATCAATTTAAGAAC
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TGTTGGAAAAATAAATTATACATTCTTAAAGTACTTCCAAATATGAAATTTAAATAAAAT
TCTATTTCTGAAATACCATTTTTATTTGAGGAATCAAATCCTCTCATATTCGAGAAAAAT
ATTTTATACTCATGTTTTTTAGCCTAGTCAATAATTTTGATTGTTGATTCTGATCAATAT
CTCTATTTATTTAATATGTCTGATTTAAAAAAATTGTTTAATACTAGCTTATAAGCCTTG
GAAATATGCAAAGAAAATGGAACACTACCATTTCCTTTACCAGTTAAAGAAAAGTTCTTT
TTTCAACTTAATAAAATGAGTGGAAACAGTGCAGTATAAACTTACAATAATGTATTTAGC
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ATGCACTATCTAACAAATATTTATTATAATAAGGATAAGTTTGTAACTAACTTATCTTCC
AATCAGCAAGAAAGAAAAATATTGTTAGAAGAAAGTGTAAAAATAGTATCTAATAAATAT
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GACTATTTTGAGCAGAGAAACTAAATAAGTTTGATAGAAAAAATGATTCTTTAACTTGAT
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TCAAAGATGTGGGGGCACCATCTTTTCCACAAATATTAGCAATAGTAGGTAGCAGTTGAT
CCTAACTGCAATAAAGCTATATAATCTGAAAACGTTGATGATGATAGGATTTTTGGTGAA
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GAAGATAAAAAATATGAAAGTTTAGTTTATAACCTCGCTTAATGGGTGTTTAATATAAAC
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TTTACCAATAATGTAGCAGACATTATCAATAAGAAGCAATTTTCTTAGGTCAATAAAAAT
GAAAAAAAAGATAGAACTTCACGTCTCAGTATTAGTCTTAAGAGAACTACTTCAAATACA
TAGAATGAATCTAGACAAAATATTAGTAATTCTGATAATTACTCAAACGGATAAACATTA
AAAAATGGGCATTATTCTGCAAAAGAGTTTTCTCATAGCAATAGCTTAAACTCAAATTTT
ATGAATAACTTTGTTGAGAATAGTACCGTATTAGATGAAATTCTTGAAACTATTTAAGTT
TGCTTTGAATAAATTATGGAAAACGAAGATCCTCTTTATTAGTTCAATTTTTAGAATAAC
AGAAGTTCTTTGAAAGAAATGGTCTTAGATAGCAGAGGAAAGTCGTATAGTCATGATTCA
GTAAATGGAAATATTATTGGTTAAGTAAAGCAGGAATATTTCCTTTTTATTTGCAAGCTA
TTTTTAGAGTAAAACTCAGAAAACAATGACAATCTGTTAAAATCAGATCATATTCTTAAT
TTAAATGATAGCGGAGAGAATGGTAGCAAGACAGAAGGACAATTATCAAAAAGCAAAGGC
TCATATTATAATGGATAAAATCTTAGATTTCATTTAAAAAAAGGTTAAATTTTTGATGCT
ATCATTTATCTTATATAAAATCCTTTGATAATAAACGTGCTAAGTAACAATAAAGATCAT
CCTACTCCTCATATTACCTTGATTGAATGGGATAACTAATAGGAGGTTGCAGAAATATAC
TAAGGATAATTTATTTAGTTTGTGCTATCTAGAGTTGATTTTGATAAATATCAAATTCAA
ACACTGAACAACCTTTTATTGAATTCTTTTGGCTTTAATGAATTGAAAGCCAGCATTTAC
AAAGATATGAAAGAATATAAAAAATCGCTTGATTTATTTATTACTTCCAAAAATTAGTTA
ATTCAAAATAGATTATTTAACTGGCTAAACTACTAATTATCAGCTAATCACTAATAAAAT
GACCATTATAATAACTTGCTATTAATTATTGAAGAAAAGTTAATAGAAATTATCAAAATC
AACCCAGAAAAAACTAGGGAACTTATAAAAAAGCACTTGTCTGAAATAGAAACTAGAATG
ATAAGAAAGATGAAAGATTTTCCAGATAAATAGCTTGAATACATCTAGAAAGTATTAGAA
GAAAGAGATGAGAATAGCATACCAAAAGATCTCCTTACTCTATACATAGAACTCCTATGT
AATTTAAACCCCTCTATTATTTTATAGGAGTTAGAAAAGTACGATTACGATTTAGATGCA
TGCTTGAATCTTTGCAAAGTGAATGGAATCAATGATGCCTGTGCATATCTTTATGAGAAA
TAAGGTGATATCTAAAGCAGTTTTATGATTCATATAGAATATTTAAAAAATATATATGAA
GAAATGATAAAAACATTTGAAAAATTAGAAGACGAAGAAGAAAAAAGTAAACAAAATTTC
AATGAAATAACAATTTTGTTACCTTTACTGGATAAGTTAAATAAAGAAATCTAGAAGCTA
TTCAATTTATGCAAAATAAACATGCCTATGAATGGTTTAGAAGAATGTATAAGACTAATA
TAAAATTTATTAGATTTATTTGTAGAATTGCTTGCCTAAAAAGATTATAAAACAAGCTTG
CCAGATGATTTTTACTATAACTATATAGGATAAATATTTATTGAAATGTTAAAATATGTG
GATCTTGATTATTTTATTGATTAGCTATCAACTAAATACATTCATTTAAATCTAAAGAAG
CTTTCAAGCACAATTTCAAGTATTCTATCAGATTTAGAGTACACTATGCAAACATATATA
AACACTTCAGAGCTCCTTAAAGAATTCATTAATGATTAAACTATTATCTTATAAAAAGTT
CTAAATAACGGTCTAAATGGATATCCTGTTTGCTAAATTTGCTTTTAAGCTATTACAAAC
CCTCTTCTATCTATATAAATTGAAAATTAAAAGACTCAATAAACTTTAAATGGATGGGTA
CTACCTGATTATTTACTAAATTAACCAGTAGAGAAACCTAAAGAAGAGCTCACAAAAATA
AAGTTTTAAAATACAATATTATTTAAATGTAATCATTACTACCATGATACATGCTACTTC
TAAGTTAAAGCAACAATATAAAGCGAATTAGTGAAGTAAAAATCCATTCTTGTTGAAACT
CCTCTTTGTTTACTTTGTTATTCTCAACAGAGCAGTGATTTATATATGAATCTTTTAATT
TAAAATGAAATAAGATAAAAAAATATTAAAGAAAATTTAGCTGGTACTGTATAAACAAGG
AATTCAGGCGGAGGTTCAAGTTAACAAAAGCCTTCTTGTCACACAGTAGAATAAATGAAA
AAACCTTTAAATAGTAAAGTCCCTTAATAATCAACACAGGATTTAAAGCAAATAGTTCAA
AAGTAATAATAAAGAAAAGAATAGCTTTACAAATTTGATAAAAATAAAAATATATAAAAT
ATTGATAAAAAATAATTATTTAAAACAATAGTAGAATTTTGA


>TTHERM_00384890(gene)
ATGTCATAAAATAACAGCAAGGTTAGTAGTTTTCTCTCAAATACAAATGAAATGAATTAA
GATTCTAACCATTCGTTAGAAGATCCTAATATATAATCAGCTCTACCATTTTTAGAAAAA
AGGCTTAGCAATTATGAAAATATAGATCTAATTGAAAATAACCCTGCTAACAATATAGAT
GATGAACAGGTTACATGTGATAACACTAGCATGATTAGAGAACTCTCTAATGAATTTGAT
CACTATGAGAAAGAATAGTTTAATTTCAATAGTGTTTAACCTATTTAAAGCAAGAAGTCT
TTTAGCCAATATCACAATGAACAAAATAGCTCTAATTTTAGGTTTTCAAATGGTGAAGAG
CACATATCTAGATACTCAAGCGAATATTAAGAAAAATGTCAATTTGAGGAATTAAATGAA
GTCTATACAAAAGAATTAAAGTAATGTGATTTTTAACTTACATATATGAAGTCTGAATAC
AAAAAAGAGTATCTTCGTTTTGAATTCATTTCTAAGTTAAATCACATAATATACAATAAG
GAAAGAGCTGTATTGTCATGGCCAAATTGTTTATAGATAAATAGCAATTATTTTATTGTT
GGTGGTGGTAGTGGAAATTTCATTGTTTTTTCAAAGCTTAATTACGAGTATGAAATTTTT
AGCACTTAGGGATCACTCAGAAAAATAAATTGTATAGAAATGAGCGAAGATTTTAGAGTA
ATTTGTATTGGAGATAGTGTAGGTACTCTAGGAATATATGATATGAAGAAAAAAAAGGTA
GTTAAATTTTTAGAAGGATTGCATGGAAACCAGGCTATTATGTCTATTAAAATTGTTTAT
AATAAGCCAAACAAATTGAATAATTTGCAGGTAATTACCTCAGATATAAATGGATAAGTT
AAGGTTGTCTTTCTTACTAAAGGTATGTTTAAGTATAGTGTAAGTCAAAAGATTTTAATT
GAGAAAAAGAGTTTTCCAATTTAATAGATTACTCTTCTATCAGAAGATCTAAAAGCTAAA
TATTAAAGGACAGAAAATAATGAAATCAGATACCTGTCATTTATTTCTGTTTCAGGTATC
CAAATTTATAGCTATTCAATACAGACCATGAATCTCAATCTAATTTATCAGTAAAAATTA
AAATCTTAAACCAAATTAATTTATTTCTAATTTACCGTAATTATTCTAACTTAAGTCCTT
CCATTTTCTAGAAAATTTCAAATTGAAAGGTCATTTTAACTAGCTTAATTATGAAAGGGT
TTAATATTTTTTTACTTATCAAAGAATATTTACAGTAAGTTAACAAATTTATGAAAAAGT
CAGATTTATTTTATTAAATTTGCTAAAAAGCTCCTATTATTATTAGTATTTATTGATAAT
AAATTTTTTTTCTTTAATTTTATCAAATTAGATTTAAGAACAAAGATTTTATTCCATCAT
AGTTTACCCACTAAGACCTTGGTTTTGTCAATTTGTCTTGGGGAGAAGGATTCATTTTTG
AAGTTGCTGGATATCTATATAAAACTATTACTAAAGTTATTTGTTGGAAAAATAAATTAT
ACATTCTTAAAGTACTTCCAAATATGAAATTTAAATAAAATTCTATTTCTGAAATACCAT
TTTTATTTGAGGAATCAAATCCTCTCATATTCGAGAAAAATATTTTATACTCATGTTTTT
TAGCCTAGTCAATAATTTTGATTGTTGATTCTGATCAATATCTCTATTTATTTAATATGT
CTGATTTAAAAAAATTGTTTAATACTAGCTTATAAGCCTTGGAAATATGCAAAGAAAATG
GAACACTACCATTTCCTTTACCAGTTAAAGAAAAGTTCTTTTTTCAACTTAATAAAATGA
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TTAAATAATTTCATTAGAAATAAAAATGTTGAATTTTGGCAATTAAAATTAAATAAATTT
AAATTGTTCTTTGTTTATAAGAATTTTAAATTATTTTAAATAAAAATGTGAAATGTCAAA
TTAAATTTTAATTGACAAGTTAAATAAAATAATTATTTTTATATTCTTTTTGTTTTAACA
AAATAAATAATTTTTTTTTTTTTTTTAGTAATGTATTTAGCTAGAGCAAATATGACCAAG
AATTATTATTTATTGTTGATGGTAAAATGGGAGTGTGTGCGTTAGCTAAATGGTAATCAG
TTTACAATAACTTGATCGAAAATGGAGAATGGAGACAAGCTATGCACTATCTAACAAATA
TTTATTATAATAAGGATAAGTTTGTAACTAACTTATCTTCCAATCAGCAAGAAAGAAAAA
TATTGTTAGAAGAAAGTGTAAAAATAGTATCTAATAAATATTTACAAATGTGCTTTTAAG
TATTTAATTTAAACAAAGATGAAGTAAATTAAATAATGAAAAAATAGATATATATTTAAC
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AGTTCTTACTGAGAATTATGAGTTTTTGTTTAATGAACTCAAGCTGATAACTGAGGAACA
TTTCAAGTGCTCTAATTTGTTCATCGAATGCCTAGTTCCATTTTTAAGAAAATATAAAAT
TAAATATATTCCTGTTTCTTATTTAAACTATTTAATTGACTATTTTGAGCAGAGAAACTA
AATAAGTTTGATAGAAAAAATGATTCTTTAACTTGATACTACTTTAATGAATACTCATTA
GTTGATGGAAATATGTCTTAAGAAAAGACTTACTAAAGCCTTAATATACATATGTACTAA
AGGTGAAGAAGGAGAGGATATTTACATGACTCCTTTATCAAAGATGTGGGGGCACCATCT
TTTCCACAAATATTAGCAATAGTAGGTAGCAGTTGATCCTAACTGCAATAAAGCTATATA
ATCTGAAAACGTTGATGATGATAGGATTTTTGGTGAAAGAAGTCTTTGGTATGCTAGAAT
ATGCTTGAAGAAGCATACTATAATGGGTGAAGACATTGAAGATAAAAAATATGAAAGTTT
AGTTTATAACCTCGCTTAATGGGTGTTTAATATAAACAATTTAAATGAAATTTTATTGTT
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TATCAATAAGAAGCAATTTTCTTAGGTCAATAAAAATGAAAAAAAAGATAGAACTTCACG
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TAGTAATTCTGATAATTACTCAAACGGATAAACATTAAAAAATGGGCATTATTCTGCAAA
AGAGTTTTCTCATAGCAATAGCTTAAACTCAAATTTTATGAATAACTTTGTTGAGAATAG
TACCGTATTAGATGAAATTCTTGAAACTATTTAAGTTTGCTTTGAATAAATTATGGAAAA
CGAAGATCCTCTTTATTAGTTCAATTTTTAGAATAACAGAAGTTCTTTGAAAGAAATGGT
CTTAGATAGCAGAGGAAAGTCGTATAGTCATGATTCAGTAAATGGAAATATTATTGGTTA
AGTAAAGCAGGAATATTTCCTTTTTATTTGCAAGCTATTTTTAGAGTAAAACTCAGAAAA
CAATGACAATCTGTTAAAATCAGATCATATTCTTAATTTAAATGATAGCGGAGAGAATGG
TAGCAAGACAGAAGGACAATTATCAAAAAGCAAAGGCTCATATTATAATGGATAAAATCT
TAGATTTCATTTAAAAAAAGGTTAAATTTTTGATGCTATCATTTATCTTATATAAAATCC
TTTGATAATAAACGTGCTAAGTAACAATAAAGATCATCCTACTCCTCATATTACCTTGAT
TGAATGGGATAACTAATAGGAGGTTGCAGAAATATACTAAGGATAATTTATTTAGTTTGT
GCTATCTAGAGTTGATTTTGATAAATATCAAATTCAAACACTGAACAACCTTTTATTGAA
TTCTTTTGGCTTTAATGAATTGAAAGTAAATTTAAAAAAAATAATTTAATTTAAGCATTT
ATTTAAAACTATTTTTAATAAAATTAAATAGGCCAGCATTTACAAAGATATGAAAGAATA
TAAAAAATCGCTTGATTTATTTATTACTTCCAAAAATTAGTTAATTCAAAATAGATTATT
TAACTGGCTAAACTACTAATTATCAGCTAATCACTAATAAAATGACCATTATAATAACTT
GCTATTAATTATTGAAGAAAAGTTAATAGAAATTATCAAAATCAACCCAGAAAAAACTAG
GGAACTTATAAAAAAGCACTTGTCTGAAATAGAAACTAGAATGATAAGAAAGATGAAAGA
TTTTCCAGATAAATAGCTTGAATACATCTAGAAAGTATTAGAAGAAAGAGATGAGAATAG
CATACCAAAAGATCTCCTTACTCTATACATAGAACTCCTATGTAATTTAAACCCCTCTAT
TATTTTATAGGAGTTAGAAAAGTACGATTACGATTTAGATGCATGCTTGAATCTTTGCAA
AGTGAATGGAATCAATGATGCCTGTGCATATCTTTATGAGAAATAAGGTGATATCTAAAG
CAGTTTTATGATTCATATAGAATATTTAAAAAATATATATGAAGAAATGATAAAAACATT
TGAAAAATTAGAAGACGAAGAAGAAAAAAGTAAACAAAATTTCAATGAAATAACAATTTT
GTTACCTTTACTGGATAAGTTAAATAAAGAAATCTAGAAGCTATTCAATTTATGCAAAAT
AAACATGCCTATGAATGGTTTAGAAGAATGTATAAGACTAATATAAAATTTATTAGATTT
ATTTGTAGAATTGCTTGCCTAAAAAGATTATAAAACAAGCTTGCCAGATGATTTTTACTA
TAACTATATAGGATAAATATTTATTGAAATGTTAAAATATGTGGATCTTGATTATTTTAT
TGATTAGCTATCAACTAAATACATTCATTTAAATCTAAAGAAGCTTTCAAGCACAATTTC
AAGTATTCTATCAGATTTAGAGTACACTATGCAAACATATATAAACACTTCAGAGCTCCT
TAAAGAATTCATTAATGATTAAACTATTATCTTATAAAAAGTTCTAAATAACGGTCTAAA
TGGATATCCTGTTTGCTAAATTTGCTTTTAAGCTATTACAAACCCTCTTCTATCTATATA
AATTGAAAATTAAAAGACTCAATAAACTTTAAATGGATGGGTACTACCTGATTATTTACT
AAATTAACCAGTAGAGAAACCTAAAGAAGAGCTCACAAAAATAAAGTTTTAAAATACAAT
ATTATTTAAATGTAATCATTACTACCATGATACATGCTACTTCTAAGTTAAAGCAACAAT
ATAAAGCGAATTAGTGAAGTAAAAATCCATTCTTGTTGAAACTCCTCTTTGTTTACTTTG
TTATTCTCAACAGAGCAGTGATTTATATATGAATCTTTTAATTTAAAATGAAATAAGATA
AAAAAATATTAAAGAAAATTTAGCTGGTACTGTATAAACAAGGAATTCAGGCGGAGGTTC
AAGTTAACAAAAGCCTTCTTGTCACACAGTAGAATAAATGAAAAAACCTTTAAATAGTAA
AGTCCCTTAATAATCAACACAGGATTTAAAGCAAATAGTTCAAAAGTAATAATAAAGAAA
AGAATAGCTTTACAAATTTGATAAAAATAAAAATATATAAAATATTGATAAAAAATAATT
ATTTAAAACAATAGTAGAATTTTGA


>TTHERM_00384890(protein)
MSQNNSKVSSFLSNTNEMNQDSNHSLEDPNIQSALPFLEKRLSNYENIDLIENNPANNID
DEQVTCDNTSMIRELSNEFDHYEKEQFNFNSVQPIQSKKSFSQYHNEQNSSNFRFSNGEE
HISRYSSEYQEKCQFEELNEVYTKELKQCDFQLTYMKSEYKKEYLRFEFISKLNHIIYNK
ERAVLSWPNCLQINSNYFIVGGGSGNFIVFSKLNYEYEIFSTQGSLRKINCIEMSEDFRV
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ERDENSIPKDLLTLYIELLCNLNPSIILQELEKYDYDLDACLNLCKVNGINDACAYLYEK
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FNLCKINMPMNGLEECIRLIQNLLDLFVELLAQKDYKTSLPDDFYYNYIGQIFIEMLKYV
DLDYFIDQLSTKYIHLNLKKLSSTISSILSDLEYTMQTYINTSELLKEFINDQTIILQKV
LNNGLNGYPVCQICFQAITNPLLSIQIENQKTQQTLNGWVLPDYLLNQPVEKPKEELTKI
KFQNTILFKCNHYYHDTCYFQVKATIQSELVKQKSILVETPLCLLCYSQQSSDLYMNLLI
QNEIRQKNIKENLAGTVQTRNSGGGSSQQKPSCHTVEQMKKPLNSKVPQQSTQDLKQIVQ
KQQQRKEQLYKFDKNKNIQNIDKKQLFKTIVEF