Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00393150

Standard Name

VPS8B (vacuolar protein sorting 8B)

Aliases

PreTt23543 | 42.m00277 | 3813.m01498

Description

corvet complex core vacuolar protein; phagosome-associated

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Gene Ontology Annotations

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Domains

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Gene Expression Profile

Vegetative Cell Cycle (Zhang et al., 2023)

GeneMania

Tetrahymena Stock Center

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Homologs

Source Identifier Score
Tetrahymena borealis EI9_11508.1 9.997093137033517e-262
Description: hypothetical protein (1480 aa)
DictyBase DDB_G0291606 9.998720540547892e-23
Description: vps8 on chromosome: 6 position 397697 to 403037
Stentor Coeruleus SteCoe_12909 2.3195228302435696e-16
Description: None
Oxytricha Contig21963.0.g17 0.0000000000010000211161514907
Description: WD domain, G-beta repeat
SGD YAL002W 0.0000899730839127287
Description: VPS8 Membrane-associated protein that interacts with Vps21p to facilitate soluble vacuolar protein localization; component of the CORVET complex; required for localization and trafficking of the CPY sorting receptor; contains RING finger motif
WormBase WBGene00016582 0.0004999512321494991
Description: status:Partially_confirmed UniProt:A3QMB3 protein_id:CAM36345.1

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

  1. Ref:31964712: Sparvoli D, Zoltner M, Cheng CY, Field MC, Turkewitz AP (2020) Diversification of CORVET tethers facilitates transport complexity in . Journal of cell science 133:
  2. Ref:29478853: Sparvoli D, Richardson E, Osakada H, Lan X, Iwamoto M, Bowman GR, Kontur C, Bourland WA, Lynn DH, Pritchard JK, Haraguchi T, Dacks JB, Turkewitz AP (2018) Remodeling the Specificity of an Endosomal CORVET Tether Underlies Formation of Regulated Secretory Vesicles in the Ciliate Tetrahymena thermophila. Current biology : CB 28(5):697-710.e13

Sequences 

>TTHERM_00393150(coding)
ATGGATAAATAAATAAGAAAGAATTCGAATGAAACTTAGTTATATAAAAATGATGATAAA
CTCATAAAATAAGGAAGGAAATATTCAGATAGTCTAACTTAAAATTATATAGACCCATTG
AAGGAGCTAGACAAAGAAATTAGAGATTCATTTTTTTTTAGGCAAGGCGTTAAACACACT
GATTTTTTCAGATTATCTCAATTAGATACAACTATAGATGAAAAAACTTAAGTCAACTAG
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GAAGAAATAAGTTACTTTGATTCTATATAGTCAAGTTAGTTTTTTAAAAAGCACTTTAAG
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GAATACCTTTTTAGTGTTGTATCTATTGGTATTAAAAATTTTGGCTACGAAGAAAATTTC
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ATTTTAAATCTAGATCTTACAAATTTAGATATTTCTCCCCTGCTTGTTATGTGCATGGAG
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CTTGTTAAGCTTTTTGGAAGACATTAGAGGGGTTTTGAAAAAAAAGAATAAGAGAGAAAA
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TAGATTGAAAATTTGTAAAATCTACTTTAAATAGATAGAAAAATAACTCTTGATATAGTA
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ATTGAAGTTGAAGAAGAAAATATTAAAAAATACAACATTTTCTAACAGGACAAGATTACT
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ATCGATTTAGTTTAAAAGTCAAACAAAAGTTAAGAAGATAAAAAACTAGAAATACAGGTC
CTAGAGCATCTAAATAATGTATTTTTCAGCAGAGTCTTAGAGCTTTAATCCTATCCATTC
AACCTAGATAAATAAATAGAGATAGTCAATTTCTTGATTGATAATCCAAAAATTTTTAAT
TACTTTGAATAGAAGATGCTTGGTTTAGATGCTGAAGTATTGAGCTAAGAAGAAAGAATT
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AAATGTCTTGTTAGAAATGCTTTTCTGATTAATGTTTTGAGACCCCTAGTTCCAGAAATT
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GCATGTTGCTTTTTGTATAATTTCTAAAAGAATTACAAAAAGTGCTTTGATTTATATTAT
GAGTGCAGAAATCCTCTCATTCAAACAAGGATATTTGAGTGGATAGAGCAAGTGTTTGAA
AATCAGTAGCCAGGTGTCTAGGATTTGAAAAATATTGTTATTAAAAAAATTAAGGAACTT
GTTAAATTAGATTAATATAAAGCTAAAATCTTAATTAAAAAGTATTTTAGTGATCAGCAA
AGAGATATCATTCTTCAACTTGACTAATACCCAGACGATTAATTAGCTATTTTAGAGGAA
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TTGTGCTAAAGAAAACCTTAAATGGTCATTTAGGCTTTAAAGGAAAGAGAGTAATACCCT
ATTGACTAAGCTCTGTAATATTGCAAAGAATACAAAGTTTTAGATGCATAGGTTTATCTT
AACTAAAGAAATGGTAACTTCACAGATGCACTTAATATTTAGCTTTAAATTATACAGCAG
TGCTGGAAGGAGTATGTCAAAAACTACAGCCCTGACTAAATTAACTTCAATTAAAACTTA
GTTAAAAATATCTAGTTGAACCTCAAAAAGGGAATGGAAATATGCTACTAAGCTTAAAAA
GAAGATGACTCAAACGATTCTTTATGGTTTACAATGTTTGATGAAGTAGTTGTTTAGGAA
ATAGGAATCTAAACCTTAACTTCACCCTCTGACTTAAACCTTTAATCTGTCTCTACTCAA
ATTGTTTCAGAATTATTGGAGGCTATGGCAATCAATATTAATTTAAATGACGTTTTAGAT
AGGATAAATTCTAACTATTAAGACATTCCTTTGAAAGCCTTCCTTCAAACAAACGAACAC
TTCAAACAAAGTTTTGAATTCTTGACTAGTGCACACACTACGGCTAAATAAATCCTTTAA
GATCACATGATAAAGATTTAAGAAAATTATCTCAAGATAAAGAATAGGGGATTAAGTGGA
TCTTAGTTGCCTGATTATAGAGTTTGCTAATTTTGTGAGAATTAAATTAAAGCTAACTAA
TAAGAATTTTAAAACACTGAAACTATTGTATTTTATTGTGGCCATACTTTCCATAAGAAG
TGTGTGGATGAATTCATTTAGCCAATAGCATGTCCTATTTGCATTGAAAACCCTATAATT
TATTTAACTAACTACTTGAGTAAAAATATTACCAAAAATTTGCCAAATCGTTTAAACTAA
AAAGAAGAAGAAAATGATTCTTTCCTTGATGAAGCATCATCTTAAGCAGCTGCTGCAAAT
GGGTGGAATACAACCACTACCTATTCTGCCCCAATAGCATAAGAAAAACCAATAATCAAA
TAAACCAAAAATAAAATGCTAGAAAAATTACAAAAATTTGATAAAAATAAGAAGCAAAAA
GTTAAAGAAACATAAGATTATATCTATTCTCAACAATGA


>TTHERM_00393150(gene)
ATGGATAAATAAATAAGAAAGAATTCGAATGTATTTTTAGAAATATTTTGTAGATTGAAA
TTAAAAGCTATTAACAAACTATCTATTAAATTAGGAAACTTAGTTATATAAAAATGATGA
TAAACTCATAAAATAAGGAAGGAAATATTCAGATAGTCTAACTTAAAATTATATAGACCC
ATTGAAGGAGCTAGACAAAGAAATTAGAGATTCATTTTTTTTTAGGCAAGGCGTTAAACA
CACTGATTTTTTCAGATTATCTCAATTAGATACAACTATAGATGAAAAAACTTAAGTCAA
CTAGATAGATATAATTCATCATGAATTTACTCATGAAATTATTATTGAAAACATGGAAGA
TTATGGTGCACCTACAGCCATCTGCGAATCCAAAAATTACTTGATTATAGGAACAAGTCG
ATCAATATTTTACATTTTTGATAAAAGAGAAAAAGAAAATGTATTTTTTGGAGGTATTGA
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TGCTGCAGGTAAATAAAATTTATAAATAAATTAATGCGTTTTATTTACACTTTTAACTAA
CAAACAGGATTTGAAAATGGTGACATAGGAATTTACGAATTAAAAAGCAACTATCCAAGA
ATGACAACAATAAAAAAGGTTTTCAAATCGCCTATTAAAATAATTCAATTCATATCTGAA
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AATTTTATTTTAAATATTTTAGATTTTGCATGATAGTTTTTGACACAACTGGGTAAAATC
AAAAGATATAAGTAGATGTAACAATTGTTTTTGAAAAGAGATTTACATCAGTAACTAAAG
ATAAATACACTTACTAACTAATGACTTAAATTAATGATGAGATGATCGATAACCATAGAT
CTAATTCTGCTACTGATGAGCATTAACATATTAGAGAAAGATCTATAAGTGATAAATATA
AGGAAACATTTAAGACTTAAGATGGTTAATCATAAAAGACAGAAATTATTAATTATTTAC
CAATTGAAGAAATAAGTTACTTTGATTCTATATAGTCAAGTTAGTTTTTTAAAAAGCACT
TTAAGATTTTAGCTATGACAACAAATGATTCAATTTACGTTGGGTTTATAATGTACAAAT
CAATTTAAATTACATTTTAGTTCTAAAAATCCAAAATGAGTTCAAAAGAAGAAGAGGAGG
AGGAAAATAAACCTTCCAAACCATCAATTTCTTGGGGTTAAGGTTACTTTTATGGCAACA
ACAGTGGGCAGCCTATTTTATGCATAGGCTGGGAAGACCATGTTTTTTTAATTAAAGCCT
AGCTTTTAGATGATGAATATGTGCATTTCTATTAAACAGCTTATGCTAAATTTTCTTACT
AAGTTGAAAAATGTGTATTTATAAGCAATTCAATTATATTTATTATCTTCACAAATAAGG
AATGTGCCATAATCCATACAAGCAACTTTACTCTTGGTCCTTTAGACACATCCATTTCAA
AATTAAACTCTTGCATGTATCTTGATCATATACCAGAATTCTAAAAATTGAGTTTATTCT
GTTCTTAATCAAAGCATACTCTGTTTTATCACTTCGGTGATTGCAGTGCTAAATTTTTGC
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ACAAATTTAGATATTTCTCCCCTGCTTGTTATGTGCATGGAGTATGATTTGTATAATGCA
TTGATTTATATCTGTGCTAAATCTGGAGATTTTCTGACTCCTCTTGTTAAGCTTTTTGGA
AGACATTAGAGGGGTTTTGAAAAAAAAGAATAAGAGAGAAAATTTGGATTAAAAGTTTTA
TGGTAATTAAAGAAGAAAAATTTATATTTATTTATTTTAATTTATTTTTTATTAAAAAGG
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GTTTAAGGCATAATTATGAAAAACTATGACATTTTCCGTATTGAAGTTGAAGAAGAAAAT
ATTAAAAAATACAACATTTTCTAACAGGACAAGATTACTCCATAATTTGTGCCATATCAA
AGAATACTCACAATTTTACTTAAAAATAAAGATGCTGAAATCGATTTAGTTTAAAAGTCA
AACAAAAGTTAAGAAGATAAAAAACTAGAAATACAGGTCCTAGAGCATCTAAATAATGTA
TTTTTCAGCAGAGTCTTAGAGCTTTAATCCTATCCATTCAACCTAGATAAATAAATAGAG
ATAGTCAATTTCTTGATTGATAATCCAAAAATTTTTAATTACTTTGAATAGAAGATGCTT
GGTTTAGATGCTGAAGTATTGAGCTAAGAAGAAAGAATTAAATAAAATATATTGCTTGAG
TAAGGGCTTTTCTTAACTGATACTCAAAAATATCACAAAAAATGTCTTGTTAGAAATGCT
TTTCTGATTAATGTTTTGAGACCCCTAGTTCCAGAAATTAAGAATCCTTTAGTGATGTCA
AATTTAATTCAATAAACAGAACTTAGTGAATTGTAATTTATTTTTTAAGTTAAAAATCTT
GAATAAAATATCTTTTTTTATAACAAAGCACTGAGGCATGTTGCTTTTTGTATAATTTCT
AAAAGAATTACAAAAAGTGCTTTGATTTATATTATGAGTGCAGAAATCCTCTCATTCAAA
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TGAAAAATATTGTTATTAAAAAAATTAAGGAACTTGTTAAATTAGATTAATATAAAGCTA
AAATCTTAATTAAAAAGTATTTTAGTGATCAGCAAAGAGATATCATTCTTCAACTTGACT
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ATATTCATTTTTTAAAGTTTCTCTTTGTAAATATTTTTATTTTGTTTAACAACAGCTGTC
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GCACTTAATATTTAGCTTTAAATTATACAGCAGTGCTGGAAGGAGTATGTCAAAAACTAC
AGCCCTGACTAAATTAACTTCAATTAAAACTTAGTTAAAAATATCTAGTTGAACCTCAAA
AAGGGAATGGAAATATGCTACTAAGCTTAAAAAGAAGATGACTCAAACGATGTATTAAAT
AAAAATTATTACTTTTTATTTTATTAAAAAATTATTTAAATTAATAAGTCTTTATGGTTT
ACAATGTTTGATGAAGTAGTTGTTTAGGAAATAGGAATCTAAACCTTAACTTCACCCTCT
GACTTAAACCTTTAATCTGTCTCTACTCAAATTGTTTCAGAATTATTGGAGGCTATGGCA
ATCAATATTAATTTAAATGACGTTTTAGATGTAATTTTTTTAAATTAAAAATGATATTTT
CATCTAATAAATATGAAAAATTTATTTATTTTTCTAAAGAGGATAAATTCTAACTATTAA
GACATTCCTTTGAAAGCCTTCCTTCAAACAAACGAACACTTCAAACAAAGTTTTGAATTC
TTGACTAGTGCACACACTACGGCTAAATAAATCCTTTAAGATCACATGATAAAGATTTAA
GAAAATTATCTCAAGATAAAGGTATAAGAAATTTCTTAAAAAAATTTATTAACATAATTT
ACTTACAGAATAGGGGATTAAGTGGATCTTAGTTGCCTGATTATAGAGTTTGCTAATTTT
GTGAGAATTAAATTAAAGCTAACTAATAAGAATTTTAAAACACTGAAACTATTGTATTTT
ATTGTGGCCATACTTTCCATAAGAAGTGTGTGGATGAATTCATTTAGCCAATAGCATGTC
CTATTTGCATTGAAAACCCTATAATTTATTGTAAATAAAAAAAAATATTTAAATTTTTGC
TTTTTTTATTCATTTAATTTTTTTAAAATTAGTAACTAACTACTTGAGTAAAAATATTAC
CAAAAATTTGCCAAATCGTTTAAACTAAAAAGAAGAAGAAAATGATTCTTTCCTTGATGA
AGCATCATCTTAAGCAGCTGCTGCAAATGGGTGGAATACAACCACTACCTATTCTGCCCC
AATAGCATAAGAAAAACCAATAATCAAATAAACCAAAAATAAAATGCTAGAAAAATTACA
AAAATTTGATAAAAATAAGAAGCAAAAAGTTAAAGAAACATAAGATTATATCTATTCTCA
ACAATGA


>TTHERM_00393150(protein)
MDKQIRKNSNETQLYKNDDKLIKQGRKYSDSLTQNYIDPLKELDKEIRDSFFFRQGVKHT
DFFRLSQLDTTIDEKTQVNQIDIIHHEFTHEIIIENMEDYGAPTAICESKNYLIIGTSRS
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TTIKKVFKSPIKIIQFISEYQNSLKEFCMIVFDTTGQNQKIQVDVTIVFEKRFTSVTKDK
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FGLKVLWYIQQSFSGIMIDGSKIEDKIYPQMLRNLILFVFQIENLQNLLQIDRKITLDIV
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