Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00420610

Standard Name

SOR1 (Sortilin 1 )

Aliases

PreTt07186 | 46.m00241 | 3679.m00091

Description

SOR1 BNR/Asp-box protein; BNR/Asp-box repeat family/ VPS10 domain containing protein

Genome Browser (Macronucleus)

Full Screen View


Genome Browser (Micronucleus)

Full Screen View

External Links

Gene Ontology Annotations

No Data fetched for Gene Ontology Annotations

Domains

  • ( PF02012 ) BNR/Asp-box repeat
  • ( PF06645 ) Microsomal signal peptidase 12 kDa

Gene Expression Profile

Vegetative Cell Cycle (Zhang et al., 2023)

GeneMania

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for Tetrahymena Stock Center

Homologs

Source Identifier Score
Tetrahymena borealis EI9_11013.1 9.997093137033517e-262
Description: BNR/Asp-box repeat family protein (876 aa)
Oxytricha Contig4955.0.0.g74 2.9991470337942304e-139
Description: BNR/Asp-box repeat
Stentor Coeruleus SteCoe_29949 4.834541638053336e-68
Description: None
SGD YJL222W 7.00293386439118e-45
Description: VTH2 Putative membrane glycoprotein with strong similarity to Vth1p and Pep1p/Vps10p, may be involved in vacuolar protein sorting
DictyBase DDB_G0290081 1.999683289470905e-41
Description: sort1 on chromosome: 5 position 3627939 to 3630336

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

No Data fetched for Associated Literature

Sequences 

>TTHERM_00420610(coding)
ATGAAAGCGTACAAGCATTTATAGCTCATAGGTATTGTATTGCTTATTTCAGCTCTACAG
TTCACTGCAACAGCTAAATAGCAAGATATTTCTTTTAGCAAGAACTTTCTTGATTCTGAA
ATAGTTGATGTCATTTGGTGTGGCACCGACACATAGAATGACTAAAACGTTTTGGTTCAA
ACTGATAGTGGAACCATTTATAGATCTTAAAACAAAATGGTACACTTCGAAAATATTAGC
GATAATCTTGTTAATGCTGGTATCAAATATGTAGCTGATAATAGTTAAATAGTAGAAAGT
GAAGTTATTAGAATGATAAGAAGTCAAGCTAATCCTAATGTTATTGTTCTTTAAGGCAAA
AATGAAGTCAACTGGGTAACAAGAGACTGCGGTAATACATTTAGAGCCTTTTCAAGAAAG
AAAGATAGAATAAACACATTTAAGTTGCATCCCAGTTAAGAAGCATGGATGTTAGCAAGC
ACTAATAACGTTTGTGCCAAAAGCTAAAAAGCTCCATGCTTTTCTTTTGCTATACTATGG
TTAAGTAAAGATTTAGGAAATAGTTGGGAGAAGCTTACTCAATATGTTTACAAATTCGAA
TGGGGTAATTTAAACTTTACTAATAGCTAAGTTCCTCAACAAAGAATATTTTGGGTTTAA
GAAGATGGAAATAAGCAAAACCAAAATAGATATGGATTGCATGAAAAAAGAAACTTTTAT
TACAGCGATGACTTTTTAGCTTCAAAGAAGCTACTCATGACCAAAGGAAATGTCTTTTAC
ATTGATTATAATTACCTTTATGTTGTTCAACTTTTAGAATAAAATTCATAGCAAGTTAAC
CTAAAAGTTGCTAATCCTTAAGACTTAGATATTAAATTAAGGGATGTTTAGTTAGGCGAG
AAGCTGTAAAACCATAAGTTTACAATTTTAGATACTCGTGAAGGATAGGTTTTCTTAAAT
GTAAATCATTTAGGTTCAACATCTCCTATGGGTACTCTTTATATATCAGACTCATTAGGT
GCTCGCTTTTCCTCAAGCTTGTAGGGTCATCTTAGAAGTGAAAATGGTGATACAGATTTT
GAGCGCTTACATGGAATTTATGGAATTTATATAGCAAATGTTTATGAATAAAAAAGAAGA
GAAGAGTTTGAGAATATGTATGCAAGCGAATAAAATGATGATGATGAAAATTAAGGATAA
GACTCCAAAAATAAAAAAAGCAATACATCAATTAAATAGGATAAAAAAGCAGTAAAGATG
AAAGATTTGGTCACCCAAAAAATATAGACAATGATTACTTTCGATAAAGGTGGTATGTGG
AGTAGAATTAATGCTCCAACCACAGACTAGGAAAACAAAGAAATTAAATGTGGTGACAAC
TGCTTCTTAAATATACATTCTAATTCTAATGACTTATATAATTCATTCTACTCATCAAAA
AATGCTGTAGGTTTAGTTTTAGCAAATGGAAATGTTGGTAAGTATCTTTCACATAGTCCA
ACTCAAGTTAATACTTACCTTTCAAGAGATGCAGGTTTAACTTGGAAATAAATTAAAAGA
GGAGCTTATGTTTTCGAAATAGGTGATCATGGTTCAATAATAGTTATGGCTAAAGATAAG
GATTATGGAACCACTAAATTTATCGAATATACTTTAGATGAAGGTATTACTTGGAACCAA
GTTTAAATATCAGATACTGATATCGAAATAGATAATATAATAACAGAGCCATCAAATACT
GGAACCTCATTCATGGTTCTTGCAAAAACACTATCAACAGATAAAAAATAATATGGATTA
GCTATAACAATAGATTTTGCTAATCAGTTTAATAGAAACTGTTCTGGTGCAACAAGTCCA
GATGATCCTGATTCTGATTATGAAAAATGGATACCTCATAGCTATAAATCATCTCAATGT
CTCTTAGGTTAGAAAGTGACTTACTCACGTAAAAAACAAGAATCTGTTTGCTTAAATGGA
GAAGATTATGAAAGACAAATAGAACTTTAAGCATGTGTCTGCTCTGAAGAAGACTGGGAG
TGTGATATCGGCTATATTAGAAATGGATAAAATGGTCCATGTGTAAAGGATGGAACACTT
AGTGATGAAGAATATGAAGGAGTGATCCCAGAAATATGTACTGATTATTATTAAGTAAGT
AGAGGTTATAGAAAAATTCCTTACAATACATGCTAAGGAGGTGTAAATTATTCAGCGGAA
ACTAGAAGATGCCCTGGAAATTCAATTTTTAGCTTTAATACTTTAAAAAATTTGATTCTT
TTGATTTTAGCTATTGCAGCTATTTATTATGGAATTCAGTATAAGAGTTAACTCTCTAGC
TTGTTAATTTACTTAAGTTCTTTGATCCCTCTAATTTATTCTCATCGTAAAGATTATATT
GACTTTTCCAAAGCAAAGTCAGACCATGAAGAAAAGGAAAATAAATTTATGAATCTATTT
TCATTTAGCAACAAAAAAAATGTTAATCATTACAGCAACGTAAATGAAAGTGAAGATTAT
GAAGATAGTGAAGATCATTAACATCTTAATAACCAAAATTACAATCATTTAAATTAACAT
AACTATTTTACTGATAACCAAGATGAAGAGAGTCATTATGATTGA


>TTHERM_00420610(gene)
ATGAAAGCGTACAAGCATTTATAGCTCATAGGTATTGTATTGCTTATTTCAGCTCTACAG
TTCACTGCAACAGCTAAATAGCAAGATATTTCTTTTAGCAAGAACTTTCTTGATTCTGAA
ATAGTTGATGTCATTTGGTGTGGCACCGACACATAGAATGACTAAAACGTTTTGGTTCAA
ACTGATAGTGGAACCATTTATAGATCTTAAAACAAAATGGTACACTTCGAAAATATTAGC
GATAATCTTGTTAATGCTGGTATCAAATATGTAGCTGATAATAGTTAAATAGTAAGTTTT
ACATTCAGAAAAAGGTTTTATTACATTTAACTTTATAATAATAATCAACTTAAAGGTAGA
AAGTGAAGTTATTAGAATGATAAGAAGTCAAGCTAATCCTAATGTTATTGTTCTTTAAGG
CAAAAATGAAGTCAACTGGGTAACAAGAGACTGCGGTAATACATTTAGAGCCTTTTCAAG
AAAGAAAGATAGGTAAATTTTACAAGAATTGTTAGACTAGAAATAATTTGACTGAATTTT
CTTTTTTATTTAAGAATAAACACATTTAAGTTGCATCCCAGTTAAGAAGCATGGATGTTA
GCAAGCACTAATAACGTTTGTGCCAAAAGCTAAAAAGCTCCATGCTTTTCTTTTGCTATA
CTATGGTTAAGTAAAGATTTAGGAAATAGTTGGGAGAAGCTTACTCAATATGTTTACAAA
TTCGAATGGTAAATTTCAAAATAATAAAGACAAAGCTCATCACTAATTTATTTTAAAAAT
AAAATCAATTTAGGGGTAATTTAAACTTTACTAATAGCTAAGTTCCTCAACAAAGAATAT
TTTGGGTTTAAGAAGATGGAAGTAATCTAATTTTTAAAATAAATTCAAAAATAGCAAATA
AAATTTTAATAATTAGATAAGCAAAACCAAAATAGATATGGATTGCATGAAAAAAGAAAC
TTTTATTACAGCGATGACTTTTTAGCTTCAAAGAAGCTACTCATGACCAAAGGAAATGTC
TTTTACATTGATTATAATTACCTTTATGTTGTTCAACGTAAATATTTTTATTCACAATAC
TTAGCGAATTTAAATATCTTAAAATAAATTAGTTTTAGAATAAAATTCATAGCAAGTTAA
CCTAAAAGTTGCTAATCCTTAAGACTTAGATATTAAATTAAGGGATGTTTAGTTAGGCGA
GAAGCTGTAAAACCATAAGTTTACAATTTTAGATACTCGTGAAGGATAGGTTTTCTTAAA
TGTAAATCATTTAGGTTCAACATCTCCTATGGGTACTCTTTATATATCAGACTCATTAGG
TGCTCGCTTTTCCTCAAGCTTGTAGGGTCATCTTAGAAGTGAAAATGGTGATACAGATTT
TGAGCGCTTACATGGAATTTATGGAATTTATATAGCAAATGTTTATGAATAAAAAAGAAG
AGAAGAGTTTGAGAATATGTATGCAAGCGAATAAAATGATGATGATGAAAATTAAGGATA
AGACTCCAAAAATAAAAAAAGCAATACATCAATTAAATAGGATAAAAAAGCAGTAAAGAT
GAAAGATTTGGTCACCCAAAAAATATAGACAATGATTACTTTCGATAAAGGTGGTATGTG
GAGTAGAATTAATGCTCCAACCACAGACTAGGAAAACAAAGAAATTAAATGTGGTGACAA
CTGCTTCTTAAATATACATTCTAATTCTAATGACTTATATAATTCATTCTACTCATCAAA
AAATGCTGTAGGTTTAGTTTTAGCAAATGGAAATGTTGGTAAGTATCTTTCACATAGTCC
AACTCAAGTTAATACTTACCTTTCAAGAGATGCAGGTTTAACTTGGAAATAAGTAATTTA
AAATTAAGATTTAACTTCATATTTATTTATTCTTTCAATGATTTAAAAGATTAAAAGAGG
AGCTTATGTTTTCGAAATAGGTGATCATGGTTCAATAATAGTTATGGCTAAAGATAAGGA
TTATGGAACCACTAAATTTATCGAATATACTTTAGATGAAGGTATTACTTGGAACCAAGT
TTAAATATCAGATACTGATATCGAAATAGATAATATAATAACAGAGCCATCAAATACTGG
AACCTCATTCATGGTTCTTGCAAAAACACTATCAACAGATAAAAAATAATATGGATTAGC
TATAACAATAGATTTTGCTAATCAGTTTAATAGAAACTGTTCTGGTGCAACAAGTCCAGA
TGATCCTGATTCTGATTATGAAAAATGGATACCTCATAGCTATAAATCATCTCAATGTCT
CTTAGGTTAGAAAGTGACTTACTCACGTAAAAAACAAGAATCTGTTTGCTTAAATGGAGA
AGTAAAATATTTTAGATATAAAAAAAAAAAATTAAATTAGTAAATTGTAACAAAAGGATT
ATGAAAGACAAATAGAACTTTAAGCATGTGTCTGCTCTGAAGAAGACTGGGAGTGTGATA
TCGGCTATATTAGAAATGGATAAAATGGTCCATGTGTAAAGGATGGAACACTTAGTGATG
AAGAATATGAAGGAGTGATCCCAGAAATATGTACTGATTATTATTAAGTAAGTAGAGGTT
ATAGAAAAATTCCTTACAATACATGCTAAGGAGGTGTAAATTATTCAGCGGAAACTAGAA
GATGCCCTGGAAATTCAATTTTTAGCTTTAATACTTTAAAAAATTTGATTCTTTTGATTT
TAGCTATTGCAGCTATTTATTATGGAATTCAGTATAAGAGTTAACTCTCTAGCTTGTTAA
TTTACTTAAGTTCTTTGATCCCTCTAATTTATTCTCATCGTAAAGATTATATTGACTTTT
CCAAAGCAAAGTCAGACCATGAAGAAAAGGAAAATAAATTTATGAATCTATTTTCATTTA
GCAACAAAAAAAATGTTAATCATTACAGCAACGTAAATGAAAGTGAAGATTATGAAGATA
GTGAAGATCATTAACATCTTAATAACCAAAATTACAATCATTTAAATTAACATAACTATT
TTACTGATAACCAAGATGAAGAGAGTCATTATGATTGA


>TTHERM_00420610(protein)
MKAYKHLQLIGIVLLISALQFTATAKQQDISFSKNFLDSEIVDVIWCGTDTQNDQNVLVQ
TDSGTIYRSQNKMVHFENISDNLVNAGIKYVADNSQIVESEVIRMIRSQANPNVIVLQGK
NEVNWVTRDCGNTFRAFSRKKDRINTFKLHPSQEAWMLASTNNVCAKSQKAPCFSFAILW
LSKDLGNSWEKLTQYVYKFEWGNLNFTNSQVPQQRIFWVQEDGNKQNQNRYGLHEKRNFY
YSDDFLASKKLLMTKGNVFYIDYNYLYVVQLLEQNSQQVNLKVANPQDLDIKLRDVQLGE
KLQNHKFTILDTREGQVFLNVNHLGSTSPMGTLYISDSLGARFSSSLQGHLRSENGDTDF
ERLHGIYGIYIANVYEQKRREEFENMYASEQNDDDENQGQDSKNKKSNTSIKQDKKAVKM
KDLVTQKIQTMITFDKGGMWSRINAPTTDQENKEIKCGDNCFLNIHSNSNDLYNSFYSSK
NAVGLVLANGNVGKYLSHSPTQVNTYLSRDAGLTWKQIKRGAYVFEIGDHGSIIVMAKDK
DYGTTKFIEYTLDEGITWNQVQISDTDIEIDNIITEPSNTGTSFMVLAKTLSTDKKQYGL
AITIDFANQFNRNCSGATSPDDPDSDYEKWIPHSYKSSQCLLGQKVTYSRKKQESVCLNG
EDYERQIELQACVCSEEDWECDIGYIRNGQNGPCVKDGTLSDEEYEGVIPEICTDYYQVS
RGYRKIPYNTCQGGVNYSAETRRCPGNSIFSFNTLKNLILLILAIAAIYYGIQYKSQLSS
LLIYLSSLIPLIYSHRKDYIDFSKAKSDHEEKENKFMNLFSFSNKKNVNHYSNVNESEDY
EDSEDHQHLNNQNYNHLNQHNYFTDNQDEESHYD