Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00424700

Standard Name

POL1 (DNA polymerase alpha-primase complex catalytic subunit POL1)

Aliases

PreTt14004 | 47.m00199

Description

POL1 DNA polymerase II; DNA polymerase catalytic subunit

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External Links

• Uniprot
• Alphafold

Gene Ontology Annotations

Molecular Function

• DNA binding (IEA) | GO:0003677
• DNA-directed DNA polymerase activity (IEA) | GO:0003887
• nucleotide binding (IEA) | GO:0000166

Biological Process

• DNA replication (IEA) | GO:0006260

Domains

• ( PF00136 ) DNA polymerase family B
• ( PF03104 ) DNA polymerase family B, exonuclease
• ( TIGR00592 ) DNA polymerase (pol2)
• ( TIGR01396 ) flagellar basal-body rod protein FlgB

Gene Expression Profile

Vegetative Cell Cycle (Zhang et al., 2023)

GeneMania

No results were calculated for this gene in GeneMania.

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for Tetrahymena Stock Center

Homologs

Source	Identifier	Score
Tetrahymena borealis	EI9_00216.1	9.997093137033517e-262
	Description: DNA polymerase catalytic subunit (3569 aa)
Oxytricha	Contig22794.0.g89	4.998437866964194e-166
	Description: DNA polymerase family B
WormBase	WBGene00012936	5.0014192254601655e-126
	Description: DNA polymerase status:Partially_confirmed UniProt:Q9NAH1 protein_id:CAB97239.2
SGD	YNL102W	9.997962730346853e-122
	Description: POL1 Catalytic subunit of the DNA polymerase I alpha-primase complex, required for the initiation of DNA replication during mitotic DNA synthesis and premeiotic DNA synthesis
DictyBase	DDB_G0282191	8.002072745601587e-114
	Description: polA1 on chromosome: 3 position 5500018 to 5504728
Stentor Coeruleus	SteCoe_30428	4.248354255291589e-18
	Description: None

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

No Data fetched for Associated Literature

Sequences

>TTHERM_00424700(coding)
ATGAGTGACAAATTAACAAGATTAGAGAGACTCAATAAAGAAGTCAAAAAGCAAAACAAG
CTCAAATAGCACTCAAAGAACAATCGCTTTGATGATGACATGGATATTGAGGCATATGAG
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AAGAACTACGCTTTTGAATTGCCTATACCAAGAGGTAAAAGTAGATGGTATTAAGTTGTA
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AAGTAACTTACTTCAATTTGTGGTAACATTTGGATGGGTTCCCTATAAAACTAAAGAGCA
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AAGGCTGCTATTTAATACTCTAAAAATTAAAATACTAAAGAGAATAAAATGTAAGATGAA
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GAAGTTATTAAAGGAATTGCTCCTCTTCCATCAATTTTATAATATTTGGTAGAACAAAGA
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TCTTCTCGTTTCTATGCTATGCCACTTGCATCCTTCATTACAGCTAAAGGTAGACATATT
CTATTTGATTCAAAGAAAATTGTAGAAGACATGGGCTATTCTGTAATCTATGGTGACACA
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TTCAAAAATATGCTTTTACTCAAAAAGAAAAAATATGCTACTTTGAAGGTTGCAAACTGG
GAAGAGGTAAAAAATACAAATGCTCCTGAAAAGTTAGAAAAAGAAATTAAAGGTATTGAC
GTTGTTCGTAGAGATTGGTGTTAATTATCCAGAGATGCTGGTAATAAAATCCTAGAAATT
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AGATCCATTTAAGAAAAAGGTATTGACCCTTAAACATACGTCAATCAAATTATCAGTTAT
ATCATCTGCAAAAATGAATAATCTAGCAGATTAGTAGATAAGGCTTATAGTCCTTAAGAA
TTTATCACTTAAAGTAAAAGTTTGGAAATAGACTTATAATACTATAAGAGATTTTAACTT
TTTGAACCAATAAAGAGAATGTTAGAAGTAATCGAGGGTATTAATCTTTAAGAAATTGCA
AGTATTCTTGAAGTTCACTACTCTGTCTAGCATGTTAGTTAAAATAATGAACTAAATGCT
GAAAATGTACTTAACTTGAAGAGTAAAAGAAATCAATTTTTAACATCTATTCCTCGTGTA
TTGGTAGATTGTAAGAAGTGTGATCAAACTTTCTTGTTTTTAGGTATTCTTGAAGAAAAT
GCAGATGCTGCTTCGATTCTAAAATGCAAGTGTGGAAACGATATTTATATTTAACTTAAA
AATAAAATAGCTCTTGTTGTTAAAGAGTTAATTAGAAATTTTGAAGAAAATGCAATTCAA
ATTGATAATGAAGAATTTGAATATACTCACTAAATTTCTTTAGTAGGAAAAGCCAAATAA
TAAAAAATGAGTAGCTTCACTTTGAACTAAAAGCTTCTTTCTATTCAAGCTATGTTTGAT
ATCACAAAAGAGGAATAAGAAAATACTCAAAAGGTCACTATAGAAAAAATAAAAACAATT
AAAAAAACACTTGATGATTTATTGTCAAAATCTTAATACAATAATTTAAATTTAAGCAAT
ATTTTTACAAGTTTCGGGTTATTAAAATGA

>TTHERM_00424700(gene)
ATGAGTGACAAATTAACAAGATTAGAGAGACTCAATAAAGAAGTCAAAAAGCAAAACAAG
CTCGTAATTAATCGAGTTCTTTTTTAGGATATCAATCAATTTTTTTATCAAATGTAATTA
GAAATAGCACTCAAAGAACAATCGCTTTGATGATGACATGGATATTGAGGCATATGAGGA
TGATGAATAGATAGAAGAAGATGATTTTATAGATGACACATAAGGTTAATTAATTAATTA
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TTAATGACAGAAATCTTAGATTTCAGAGAAAGCAAACAAGAGCAATTTATTTTACAATTT
AAATATTTAGATAAAAAGAAATATAGAGAAATAGAAGATGAGTTCGACCAAGAGATTGAA
GAGGAAGAGGAGTTAAATAAAAAGAAGAAGACTAAGAATACAATTTTAAATTATACAAAC
ACCACAGCTGTTACCAATAATAAGAAAAAGGCAATTAGCAAGTAGATTCCAGATATTGAT
ATTGAAGAAATTATGAAGCTAACTGAGAGGAAAAAAAAAATAGAGTAAGAAGAAGCTCAG
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TAGACAGCATTTCTGAATTTTAGAAATTAAAAAGTTTAGCACAAAAAGCTAATTTGGCAA
ACGAGAGCCTAAAATAAAGCAAAGTCAGCAATACAGAAATTAATTTGACTAACCTCTCTA
TTTCTTAAGTGAAAAAGATCAATGACTATAAGAATGAAGATGGTAAATTTGGAATTAATT
TTGTTTTATAATAGATTTATATGTTGTAAATTAATTTTAAAAATAAATAGGTTCTGTTGA
TGCTTATTTGTATGATTACTTTTATGATGCCTAAGTTAAACCTGATAAAATATATGCATT
TGCCAAAGTTTAAAACAAGCAAACAAATGCTTTTGATACTTGTGTTATTCAAATTGATAC
TATTATCAGAAATCTCTTCTTCTATCCTTCTTCTGACACAGTTACTGAGCAGGTATCAAT
TAAAAATTCATTCATTATTTTAAACCTATAAACTAAACAAATAATTAGAAATGATTTTTA
ATCTTTCCTTATTTATTTATTAATGTAGTCTAATTTCTTTATTGTGATAGAAATTTTTTA
ATTTTAAAAGTATTCCTTAGAATTAAATTGTAAAAATAAATAAAAGGGATAAATAAAATA
ATAAAATTTAAAGTCATATGAAAAATTTAATAAAGGTTCAATATAAATGTTGGTCAAATA
GCAATTAATTTAGCAAATAAATAGAGTCTATTTCATAGATAATAATTATTCAATTAAATA
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AAGTTGGGTACGCTTTTAAAATGTGAAGGATACTACTTCATGCATAACAAATAGAAAATT
AGAATTTAGAGTAGATTATACTAATTAATCAAATATATAAGTATTACAAAAATAATTGCC
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AACTCACATAGATCCCACTAAAAAGTAAGATAGTATCACTAAAAAGGGTACTCTTCCTGA
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TGAGATTGATCCTGATATTGTTGTGGCACATGATCTATACTCTACTGTTTTTGAAATTAT
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ATTTACAAATTGTTCCTCTTACTAAGTAACTTACTTCAATTTGTGGTAACATTTGGATGG
GTTCCCTATAAAACTAAAGAGCAGAAAGAAACGAAATGCTTCTCCTTCATAAGTTTAATT
AAGTAATTATTGAACTAACTAAAAATTACATTATTAATAATTTATTAAATATAATTAATT
AAAGCTGAATTACGTTTATCCTGATAATTTTAAAAATCTACCAGAATCATATAAAAAGAA
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AGGTTTGTATAATGAGTACATCGTACTGTTGGATTTCAACTCTCTTTATCCTTCAATTAT
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AATGGCTCCCTTCTTGGGAAATAAAAAGGCTGCTATTTAATACTCTAAAAATTAAAATAC
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TATGTATGGTTGCTTGGGTTTCAGCTCTTCTCGTTTCTATGCTATGCCACTTGCATCCTT
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TATTATAGGTAGACATATTCTATTTGATTCAAAGAAAATTGTAGAAGACATGGGCTATTC
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GCTTATAGTCCTTAAGAATTTATCACTTAAAGTAAAAGTTTGGAAATAGACTTATAATAC
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TAAAAAAAACAAGATTAATTTATTATAATATTAACTTTTAATCTAAAATTAATTTAGAAA
TAATGAACTAAATGCTGAAAATGTACTTAACTTGAAGAGTAAAAGAAATCAATTTTTAAC
ATCTATTCCTCGTGTATTGGTAGATTGTAAGAAGTGTGATCAAACTTTCTTGTTTTTAGG
TATTCTTGAAGAAAATGCAGATGCTGCTTCGATTCTAAAATGCAAGTGTGGAAACGATAT
TTATATTTAACTTAAAAATAAAATAGCTCTTGTTGTTAAAGAGTTAATTAGAAATTTTGA
AGAAAATGCAATTCAAATTGATAATGAAGAATTTGAATATACTCACTAAATTTCTTTAGT
AGGAAAAGCCAAATAATAAAAAATGAGTAGCTTCACTTTGAACTAAAAGCTTCTTTCTAT
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TAATCTATTTTTATTTTAAAAGAAAACACTTGATGATTTATTGTCAAAATCTTAATACAA
TAATTTAAATTTAAGCAATATTTTTACAAGTTTCGGGTTATTAAAATGA

>TTHERM_00424700(protein)
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ERKKKIEQEEAQLLQEEQELLEQEKREEEEKKRISQEAKSILREDCASSKTANSSKGKVD
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VKKINDYKNEDGSVDAYLYDYFYDAQVKPDKIYAFAKVQNKQTNAFDTCVIQIDTIIRNL
FFYPSSDTVTEQQIKNEIAELLKKEQTSRKNVEFLGAFVDKNYAFELPIPRGKSRWYQVV
MSYEYEVISPDTKGQYFSYCVGSTYSALETFLITKKITGPSWVRFQNVKDTTSCITNRKL
EFRVDYTNQSNIQVLQKQLPTPPLSVVCISLKTSQQIVLSQKKKEYKKEIFNLNMKYHEG
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EIDPDIVVAHDLYSTVFEIILTRIREKGIRKWNLLSKLINIGSSDIPKYGSSTFKTKMAM
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ADAASILKCKCGNDIYIQLKNKIALVVKELIRNFEENAIQIDNEEFEYTHQISLVGKAKQ
QKMSSFTLNQKLLSIQAMFDITKEEQENTQKVTIEKIKTIKKTLDDLLSKSQYNNLNLSN
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