Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00454090

Standard Name

MYO12 (Fusion of a myosin and an RCC1 protein.)

Aliases

PreTt15526 | 52.m00304 | 3811.m01052

Description

MYO12 myosin; Myosin heavy chain; member of proposed myosin Class XX- distinct from previously defined myosin classes; contains IQ motifs predicted to bind a calmodulin family protein.

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External Links

Gene Ontology Annotations

Cellular Component

Molecular Function

Domains

No Data fetched for Domains

Gene Expression Profile

Vegetative Cell Cycle (Zhang et al., 2023)

GeneMania

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for Tetrahymena Stock Center

Homologs

Source Identifier Score
Oxytricha Contig18292.0.g108 9.997093137033517e-262
Description: Myosin head (motor domain)
Tetrahymena borealis EI9_14937.1 2.999273696017743e-163
Description: myosin head domain-containing protein (1626 aa)
DictyBase DDB_G0274455 4.998388239298271e-113
Description: myoI on chromosome: 2 position 4534415 to 4541848
WormBase WBGene00002036 2.0000857274312427e-108
Description: locus:hum-2 status:Confirmed UniProt:Q95ZU1 protein_id:CCD68601.1
SGD YAL029C 1.0002646133906571e-103
Description: MYO4 One of two type V myosin motors (along with MYO2) involved in actin-based transport of cargos; required for mRNA transport, including ASH1 mRNA, and facilitating the growth and movement of ER tubules into the growing bud along with She3p
Stentor Coeruleus SteCoe_4080 2.1705220113036395e-29
Description: None

General Information

No. Gene Name(s) Paragraph Text
10 MYO1, MYO2, MYO3, MYO4, MYO5, MYO4 , MYO9, MYO10, MYO11, MYO12, MYO13 Proteins of the myosin superfamily are ATP-dependent molecular motors that travel unidirectionally along actin filaments. The myosin heavy chain proteins are comprised of three domains: a head (motor) domain responsible for ATP hydrolysis at the N-terminus, a neck (lever arm) region, and a C-terminal tail region. Thirteen predicted myosin heavy chain genes have been identified in the Tetrahymena genome and named MYO1-MYO13. A phylogenetic analysis comparing these predicted proteins with the 19 previously identified myosin classes suggests that Myo1p-Myo12p belong to a previously undescribed class of myosins. This new family, designated Class XX, does not include Myo13p, which did not branch with this class or any of the other classes in the analysis. The neck and tail regions of the Tetrahymena myosins include a variety of domains characterized in other myosin classes, with each protein containing one or more of the following domains: coiled-coil (which may support dimerization); IQ motif (binding sites for calmodulin or calmodulin-like proteins); FERM domain (Four-point-one protein, Ezrin, Radixin, Moesin homology); and MyTH4 domain (Myosin Tail Homology 4).

Associated Literature

  1. Ref:16505385: Foth BJ, Goedecke MC, Soldati D (2006) New insights into myosin evolution and classification. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 103(10):3681-6
  2. Ref:15988740: Williams SA, Gavin RH (2005) Myosin genes in Tetrahymena. Cell motility and the cytoskeleton 61(4):237-43

Sequences

>TTHERM_00454090(coding)
ATGAGTTAAACTAATCTTCCATAAAAGAAAACGGTCTTACCGCCTACATTATGGATAAGA
CCTGGTCAGGTGTGCTGGGTAGGCAATTATGATATCTAAAAGAAAGAAGTCACCAATTAT
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ATACCTTGGATTGAAGAAATAACAAGACCAAAAGCATTTAGTGTGGGAAGCAATCATACT
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GAACTAGCTTTCCCTTCATCTAAAGTCCTAATATCCTAAGTCTCTTGTGGTTTAAAGTTT
TCTATATTTTTATCAAATAATGGTGTCCTATATTCAATGGGATCAAACGAATAAGGCGAG
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TGGTGGGGAACTAATAATCACTTGAAATATTAAAGTTCACCTGTTGAAGTTGACTTGTCA
TAAATCCACAAAACTATGAATAGTTAAGATTTTTATCCTGTTAGAATAGAAACAACATGG
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ATTTAATTTAAACAAAAGCTAATAAATACTCTTATTCAAAAATGGCAAGAGTCTTATCTA
AATACAATGGATGTTCCTTTTTTCGATACCATTTCGAAAAATATTTCAAATCGCCATGTC
CTCAAACATTTTTCAGCATATAAAAGAGTAGGCCCTAAATACCCTAAATAAAAGGCAGAA
AAATATTATGTCTTATAAAACTCAAGTCCTATCAAAAAATAGGATGAATTTTTTGAAGAA
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TTGCAGGGGAAAGAAGAAGAAAATTTACTTGATACTATGAAAGTCTCACCAAACAGTCTA
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ATTCATAAAGTACCTTCAATGGGCCCTAATTAGAATATGCTTTAAAAAATGAAAACTTTA
TAGCCAACTAAGCTCTAGCCTCCGATGTTTGGAATAGTGAAGTAGGTAAGTAGCAACCTA
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TAAAATCAATATGCAAATAACTAGGAATCTATAGCTCCCTAAAGAGATTCTTCTCAGAAT
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AATGATGAAAAATATGAAAATAAAACTTCTGAAAATGACGAATTTATCAACTCACTGCAC
TAAAAGCTAGCTGGTATAAAATCCAGAATGCAAACTCTAACACGAATTCCAAAAGAAGAA
TGGACACTGGATGATCATTAATTTATGAGTGAAGTCTCTAATTCAAAAATGATAGAGTTT
TTCAAGAGTATAAGCTGA


>TTHERM_00454090(gene)
ATGAGTTAAACTAATCTTCCATAAAAGAAAACGGTCTTACCGCCTACATTATGGATAAGA
CCTGGTATACAGATTGATAATCAATTATTTATGACAATATAAACACACACACACCAATTT
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TTTTCTTATTATTTTTACTCTAAAATAAAAATATAAATTAATATTTTAATTTTATTGTTT
TTTAATAACAGATTATTAATTGCAATCCTATCCTAGAAGCGTTTGGCAATGCCAAAACTA
TTAAAAATGATAATAGCAGTAGATTTGGTAAATTTGTTAGTATTTTTATTGACATGAAGC
TTGAAAAAATTATGGGTGCGAGAACATAAAGCTATCTGCTAGAAAAATCAAGAGTTATTT
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TTAATTATCTTAATAAATCAGATTGCTACACTGTAAATACCATTAACGATGAAACATCAT
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AAGCTATAAAAATTTTTTTATGATTGCTATTAAAGTTAAAAATATAAATTTATTTAATAG
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ATAAATAAAACGAATATTATCCTAGATAAGTTAATCTTAGTGCTAATTACAGCAAGCAGA
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CATGGAGTAAATCTGTATCGCTCACTTATATTAGAATGGCAGATACACGAACATTTGATT
AGGGAATTTAATTTAAACAAAAGCTAATAAATACTCTTATTCAAAAATGGCAAGAGTCTT
ATCTAAATACAAGTAAATTTATTTTCAATTTTCTAAAAAAAATTGATATAAATAATATTA
ATTGCTTATTTTTCTTGTAAAATTAGTGGATGTTCCTTTTTTCGATACCATTTCGAAAAA
TATTTCAAATCGCCATGTCCTCAAACATTTTTCAGCATATAAAGTAAAAATTTAAGAAAA
AAAAATTTAACCTGATATAATATATTTTAATAATTAGAGAGTAGGCCCTAAATACCCTAA
ATAAAAGGCAGAAAAATATTATGTCTTATAAAACTCAAGTCCTATCAAAAAATAGGATGA
ATTTTTTGAAGAAAATACATAAGGCAGCAGATTTTAAAATTCTTCTGTCATAACATAATC
GTCTCCAGGCAAACCTTTTAAAGATGTCTTTTAAAATTTTATAGAAAACTCTGCAAAAAA
AGAAAATAAGATTTTAAAAAGCTAAAATTAATAAGAAGGGGGTTTAGATGAAGTAAATTT
TTTATTTTAAAAAATAGTTATTAAAGTTAAAATTATATATATAGTTTGTTTCTCCTGTTG
CAAAATTGCAGGGGAAAGAAGAAGAAAATTTACTTGATACTATGAAAGTCTCACCAAACA
GTCTATTTGAGAAATACAAAAATGAAAATAAAAACCAATAGAAAGTCTCTTAATTTGAAA
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CTTTATAGCCAACTAAGCTCTAGCCTCCGATGTTTGGAATAGTGAAGTAGGTAAGTAGCA
ACCTACCAGCAAATAGAGGATCAATAGATTCAGAATCATCTCAAATTACTTCTTCTAGAT
CAAAATCAAAGGAAAAACCAAAGCAAAACGTTAAATTTAGTGATAACTAATTCTAAAAAA
GTTCATTTTCATCTAATAACAGAGATGGACCTAATTAAGATTAAAATGAGTAAAGGTAAT
TTGCTACAAAATATAATATTCCCACCTCAGAATAAGGAATGCTTTCATCTAAAGTTATAT
ATGCCTAAAATCAATATGCAAATAACTAGGAATCTATAGCTCCCTAAAGAGATTCTTCTC
AGAATCAAAACTATAGAAAAGAGAATAGAGTATTGGAAAAAACATATTCAAAATAAAATA
TGTAAAGCATAAAAGAATTGAAATTTAACAATGTAACTAAAGATCAAGTGAAATACCCAT
TTATAAATGATGAAAAATATGAAAATAAAACTTCTGAAAATGACGAATTTATCAACTCAC
TGTAAATATTTATCATAATATCATAAAATTAAAAAAAATGTATTAACAAATTAATAGGCA
CTAAAAGCTAGCTGGTATAAAATCCAGAATGCAAACTCTAACACGAATTCCAAAAGAAGA
ATGGACACTGGATGATCATTAATTTATGAGTGAAGTCTCTAATTCAAAAATGATAGAGTT
TTTCAAGAGTATAAGCTGA


>TTHERM_00454090(protein)
MSQTNLPQKKTVLPPTLWIRPGQVCWVGNYDIQKKEVTNYFAAFIQTSNHSLQNARVKYL
DNIDAPTEVAMKFILMRSDDNKINFNSMDNLINLPILNEAELIQCIKIRFQNNQIFSYVG
QTLIIVNPFKDIFDLFSNEIIENFKHCARKRGFILKQEQPHIYAVAALTYNQLFEYYKSQ
AIVISGESGTGKTVNTKLCMKLIVQMSSQKQNTNQQSHQLEQQIINCNPILEAFGNAKTI
KNDNSSRFGKFVSIFIDMKLEKIMGARTQSYLLEKSRVISQSKEERNYHIFYSLMYSNDS
ELLQSLGLKEKNQKVNLTKFNYLNKSDCYTVNTINDETSYFDVCQALSTLEIDTIDPKYI
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NDEKYENKTSENDEFINSLHQKLAGIKSRMQTLTRIPKEEWTLDDHQFMSEVSNSKMIEF
FKSIS