Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00499530

Standard Name

BrEt-2 (Bromodomain and ET domain 2)

Aliases

PreTt07996 | 63.m00174 | 3716.m00028

Description

bromodomain domain protein

Genome Browser (Macronucleus)



Genome Browser (Micronucleus)

External Links

Gene Ontology Annotations

No Data fetched for Gene Ontology Annotations

Domains

  • ( PF00439 ) Bromodomain
  • ( PF04702 ) Vicilin N terminal region
  • ( PF06133 ) Protein of unknown function (DUF964)

Gene Expression Profile

Vegetative Cell Cycle (Zhang et al., 2023)

GeneMania

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for Tetrahymena Stock Center

Homologs

Source Identifier Score
Tetrahymena borealis EI9_09681.1 9.997093137033517e-262
Description: bromodomain containing protein (921 aa)
SGD YDL070W 3.001003044337619e-17
Description: BDF2 Protein involved in transcription initiation at TATA-containing promoters; associates with the basal transcription factor TFIID; contains two bromodomains; corresponds to the C-terminal region of mammalian TAF1; redundant with Bdf1p
WormBase WBGene00000366 6.001122775063233e-17
Description: locus:cbp-1 Protein cbp-1 status:Partially_confirmed UniProt:P34545 protein_id:CAD18875.2
DictyBase DDB_G0270170 2.0004286606204839e-16
Description: DDB_G0270170 on chromosome: 1 position 4360881 to 4366105
Oxytricha Contig20804.0.g30 0.00000000000001000191320216021
Description: Bromodomain
Stentor Coeruleus SteCoe_26840 0.00000000000009357622968840175
Description: None

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

  1. Ref:29523178: Saettone A, Garg J, Lambert JP, Nabeel-Shah S, Ponce M, Burtch A, Thuppu Mudalige C, Gingras AC, Pearlman RE, Fillingham J (2018) The bromodomain-containing protein Ibd1 links multiple chromatin-related protein complexes to highly expressed genes in Tetrahymena thermophila. Epigenetics & chromatin 11(1):10

Sequences

>TTHERM_00499530(coding)
ATGAGTGATTAAGTATAAGAAATATTTTTGACATAAGAGTAATCAAAGTACATCAATAGT
ATGCTACCTAGAGGATACTCACTGTAATTCTCATCTTCTCACACTAGACGTGTTCAAATG
AATCCAAATGCTACAAAGTTAAATCAATATGAGCAAACACTGATCTAAGAGAGGTTAAAG
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TGCTTTTCGATATTGTAATAACTAAAGAAAAGCGAAAATGCAGGTCCATTTTTATAAAAA
GTTGATGCCTTAGCACAATAATGCCCTGACTACTATAAAATAATAAGAGATCCAATGGAT
TTATCGAAAGTGGAGTCAAATTTAAAACAGGGCTATTATTAAACTACTTTACAATTCGCA
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TAACCTGATACAACTGCATAATAAGCCAAAGCTAAAGATAAATATTAAACCAAATTAAGT
TAAGATGAAATCAACTAACTTTATTAAAATATCGGATCGCTTACAGAAGACGATACAAAA
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CAAAGCGCTGTCATCGGTGGTTATCAGAACAGACCCAGCTAATAGTATGATGCAGGTTAA
TAAGGCATGGCAATACCAAGCATGATTAATTAAACTTAGCAACCTTATTCAGGATAGCAG
TATAATCAATAGGGATAAGCATAATATTAAGGATATGGAAATAACATGCAAAATATGTAT
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GGTCATATTTAAAATTAGAATAACAGTGAGTAAAGTTCTGAAGCAATGCTCTCTGAAAGT
GAGGAAGAGTGA


>TTHERM_00499530(gene)
ATGAGTGATGTAATATCTTAAATAACTTCCTAAACAGAAGAGCAATCATTTATACTCAAT
TATTTGTGAATTAACTATCATTTTATTCTCTAAATTTTTTGAATTTCAGCAAACCTAATC
TTTGTGTATGATTTTAAAATTAGTAAGTATAAGAAATATTTTTGACATAAGAGTAATCAA
AGTACATCAATAGTATGCTACCTAGAGGATACTCACTGTAATTCTCATCTTCTCACACTA
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GACCAAACTTTTGAGCTTTGTTTACAATTTTTGATGTTACATTAAAGATCATAATTTTAA
ACTTGGAAGAAAACTCTTAAGTATTAAGATAAATAACGATATGAAGGCATTCATATACTC
TTCACCCAAATACAATGCATAGGAAATAAATAAAATGAAATAGAATTTATAATATATTAG
TATAGCAAAATATGTTGCATAGAAAGATATGAAAAATAAAGTTCCTAAATTTTAGATTGA
TTTATTTAAATATCAAACAAAAGCAATATGAGCAAACACTGATCTAAGAGAGGTTAAAGT
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AACAAAATAAAAATGATAAAGATAAAAAGTTGTAATCCAAAAAAGAAAATATACCTGAAA
AAGAATAAATAGCCGATTCTCCAGAAAGCGGAAATACAAAGAAAAGAAAGTAGTAGGAAA
AAATTTTAGAAAAGTAAGCAGCAAAAAGCTTAAAACAGCAAAATTAAGTTTTATAGTAAG
TAATTAGTGTTGACACACAATAGAAAGGAACAATTCCTGTTTCTGAAGACATAAGGGTGT
GCTTTTCGATATTGTAATAACTAAAGAAAAGCGAAAATGCAGGTCCATTTTTATAAAAAG
TTGATGCCTTAGCACAATAATGCCCTGACTACTATAAAATAATAAGAGATCCAATGGATT
TATCGAAAGTGGAGTCAAATTTAAAACAGGGCTATTATTAAACTACTTTACAATTCGCAG
ATGATGTTAGAAAGATATGGAATAACTCCTTTACATATAACTAAAAAGGAAGCTAAATCT
ATAAAATGACAGAAGAAATGAGCAGGTTATTTGAAAAAATTTTTACTCAGGTAAAAAGTT
AATCACTTCCTAACCCTATGGAGTATCAGTAATAATTTTTTATTTAAATTATAAATGTAA
ATTCATTCAGAATGCTGAAAAATATGAATTTTTGTTAACTTAAACGAAGTAAAACACAAA
AGAAAGGTGGAAAAAATAATTTTATTTTCACATACAAAAAATACAGCAGTAAAAGTTATT
GGTTTTGAGTTGATTCATTTAAAAAATATAATTTTTGAACGAAATCCTCTATTTATTCAA
TAAAATTTCCTCAAAATTGTTGCACTTAATCTTCATTAGTTAATTAAGTGAAAATAAAAA
AATAATTCCATTCAAATTAAAAAAAATTGATTGATTGATTAATTAATTATTTGAACGAAC
ATCTTTTTATAAAATTTTTCAAATTTCTTTAGTGGATAAAAAAATTCCAAATAGGAGCAA
TAACAAAAAATTTCAAATAAAAAGCAATAGGTTGATGGTTGTAGCATTTAAATACATTTT
TAATTAAAATTTACACATTTACTTATATATCTTTTTGATCAAAAAATAAACAACATCAAG
ATCCTTTGCTTTCACTTACTTACATATATTAGGATATATAAATATAATTTTTTAATTTTA
GTTTACCAAAGTCGTAGAACTTAATAAATAAAAAATTAAATATCCTTCATTAATTAATTA
TCAATTTGTATTTTCATTCTCATAATTTTTTGCATACAAAATTAGAGATTCAATAGACGC
TTCTTCCAACTCTATCAACAATAATACCGCTTCGTCATTAAAGAAGAGAGCTAATAAATA
AGCATAAAATGTTACTTAATAATAGAATTAGATTTAATAGCTATCTTCTGCTTCAGTGCC
AATAACTTAAAATTCAGCTATACCAGCAAATCCTCCAAAACCTGAAAAATAAAAAAAGAC
TAAATAAACTGCTAACTAACCTGATACAACTGCATAATAAGCCAAAGCTAAAGATAAATA
TTAAACCAAATTAAGTTAAGATGAAATCAACTAACTTTATTAAAATATCGGATCGCTTAC
AGAAGACGATACAAAATAATTATACGAGTTAATAAAGGATTACTGTGAAACAAATAACGA
ATAGATTGAATTAAATATAGATAATCTCCCTATTAAAACTGCAAGAGAAGTACAAGAATT
CGTTCTTTTCAAAAGACGTTTACCATCTTAGCAATAAGTCAATCAATAACAATAATAATA
ATAATAGTTGTAGTAATAATAATAGTTGTAATAATAATAATAATTACAGCAGCAATAAAT
CCAATAATAGAAATAGCAATAGTCATAAGAGTAATTAATTCTATTTAATTTTTTACTTCA
CCATTAATTTTTGCTAAATAACCTTCAACTCAACCATAAATCTTAAATTTTTTCCAACTG
CTGAACTAAAATAAATTAATTGGTTAATGAAAAAAATATTTTGAATTATAAAAAGAAATT
TATATTGAAAATTATCGCAAAATAATTTATTTAAATTTTACATTAATATTATCATTTTAA
TTAACAAAAGTGAATAGTAAGACAATAAAAAGAAGAAGAAGATTGGAAAATTGGAAAAGA
AAGACATCCCATTAACTATCAGTGAAAAGAAGCAACTAGGAATAAATATACGTAGACTTC
CTCCAGAAGATTTAAATGGAATTTGGAGTATAGTATAAGATAGCTAATAAAATAGTGAAG
TGATAGAATTTGATATTGATACATTGCCAGTAAGAAAAGCTAGAGAATTAGAAGCATATG
TCAAGTAAAGAGCTGCATTTCAACAAAAAAAACAACGTGTTTAGAAAAATTAACCAAATA
ACCTTTTATCAGACAGCTAACAATAAGCTAAAGCTTAGTTACCATACTCTACGCCTACAA
CAACTACAACTGCAAGTACTACAGTAAATACTAATTAAACTCCAATTGATGCTGCAGTAA
ACAACTTCCCACAATAAACTAGCTTTACTGCTGCTTAGTAATATCCTGCCACAGCTTACG
CTAGTAATCCAGGTTATACATAAGCAAATTAACTTATTCAAAATAATGGTTCTGCTTAAA
ATGCTGCAAGTGCAAAAGTCAACAACAGCTAAATGATATAGTAGGGATAGTATGTTCAAG
CTAATCCAGTAGCTTAGTAATAACTACCCATTGCTTAAGCAACTACATAATAAAACATGG
CTTCTATATAAGGATACAATCATTTAAATTAATAATAGTATGCTTAGCAATCGACATACT
AAAATTAAATGATGATGAATTAATATCCTTCTGCTTTTCCTATTTAGTAACCTATGGTAC
TTTCTTGTTCACTTTTTTAAAACTTTTTAAAAATTTTATCAAATATAAAAGCAAAGCGCT
GTCATCGGTGGTTATCAGAACAGACCCAGCTAATAGTATGATGCAGGTTAATAAGGCATG
GCAATACCAAGCATGATTAATTAAACTTAGCAACCTTATTCAGGATAGCAGTATAATCAA
TAGGGATAAGCATAATATTAAGGATATGGAAATAACATGCAAAATATGTATATGAATTAG
CCTCTTAGTGCTAATTCAAATGGCAATCACAATAGAAATATTGTGCCTAATTAACAAATT
CAATATGGAGCTAATACATAAGTGTAAAATGGAATCAGCTAATACCCTCAATCGTAAAAT
TACTACAATGCTTAATATCAATCAAACCCAAGCTAGTATTAGTAACATTTACAATAAATG
AATGTAAATCCACAGTACAGCAGTAATAGTAATTAAGCTTAGTAATATAACGGTCATATT
TAAAATTAGAATAACAGTGAGTAAAGTTCTGAAGCAATGCTCTCTGGTAATTTTAAAAAA
CATTAAAATATTTAATAAAATTATTTAAATTGATTTATTTCTTAAAAATAATTAGAAAGT
GAGGAAGAGTGA


>TTHERM_00499530(protein)
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