Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00532700

Standard Name

VPS8D (vacuolar protein sorting 8D)

Aliases

PreTt19926 | 68.m00215 | 3830.m00579

Description

corvet complex core vacuolar protein; contractile vacuole-associated

Genome Browser (Macronucleus)



Genome Browser (Micronucleus)

External Links

Gene Ontology Annotations

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Domains

Gene Expression Profile

Vegetative Cell Cycle (Zhang et al., 2023)

GeneMania

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for Tetrahymena Stock Center

Homologs

Source Identifier Score
Tetrahymena borealis EI9_11872.1 9.997093137033517e-262
Description: hypothetical protein (1667 aa)
Oxytricha Contig21963.0.g17 2.0000236365077126e-43
Description: WD domain, G-beta repeat
DictyBase DDB_G0291606 7.996210139153865e-29
Description: vps8 on chromosome: 6 position 397697 to 403037
Stentor Coeruleus SteCoe_23007 3.532628572200807e-24
Description: None
WormBase WBGene00016582 0.00020003864201578029
Description: status:Partially_confirmed UniProt:A3QMB3 protein_id:CAM36345.1
SGD YAL002W 0.0004000184047659232
Description: VPS8 Membrane-associated protein that interacts with Vps21p to facilitate soluble vacuolar protein localization; component of the CORVET complex; required for localization and trafficking of the CPY sorting receptor; contains RING finger motif

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

  1. Ref:31964712: Sparvoli D, Zoltner M, Cheng CY, Field MC, Turkewitz AP (2020) Diversification of CORVET tethers facilitates transport complexity in . Journal of cell science 133:
  2. Ref:29478853: Sparvoli D, Richardson E, Osakada H, Lan X, Iwamoto M, Bowman GR, Kontur C, Bourland WA, Lynn DH, Pritchard JK, Haraguchi T, Dacks JB, Turkewitz AP (2018) Remodeling the Specificity of an Endosomal CORVET Tether Underlies Formation of Regulated Secretory Vesicles in the Ciliate Tetrahymena thermophila. Current biology : CB 28(5):697-710.e13

Sequences

>TTHERM_00532700(coding)
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TAAATAAGAAGACAGTATGAAAATTATTATTGA


>TTHERM_00532700(gene)
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GAAAAATATGTTTATCGTTGTCTCTGGTTTATTCGTCTTACTTTGCAGTAAAAATTGTAC
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TTTTTCTCTGATTAAGTCATAACTGATTTTGCAAAAGTTGATTCTAATGTATATTTTGAG
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CAGAGCAAGATCTAAATTCTTAAATAAATAACTTAAATTTAAATAGAGAAGCTGGGTATA
GTTCTAGCTAATATTAAGAAAGCTAAAAAGACTCTCAATCTGTTATAACTGATAGAAGTA
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AAGTATTTGACAAATTTATATAATAAGATATGGATAATTTTGAATAAATAAGAAGACAGT
ATGAAAATTATTATTGA


>TTHERM_00532700(protein)
MDIENNDSFSDVSAGNLDLEQILQSSDDDDDLQEEILATPSSKQIDEQQKKELAQDNQQK
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LIDQEQGQIMNNDNQLFQNFEKELIISRAKLPDDYNMEYNSLESISSYLYPQIGVEQEFR
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MNKMIIMQITSQQNVISEGFDIVGHLVIDHSIFYMQWISFSMIYLLNSRNELKIIYTGET
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FMFLIKDQQNKLKRTFNNSIVVSNSDVFILTSKNIIRGHFFEWKECIFKYIKKKDWTIAL
KIAMMLQHGSLQSFAKLPDKIDSVQKKDFNETCEKLFLSYLEKEKNRIENYVPNSDKQEE
TWRFSKICFEYLIETRDFETLFKDARRCIMELDSNEAFHALLEPFILKHKIKRIPKEYFN
FALKFFLEKKKFNVVQIMIVNLDLSSIDQYETLKQCVEYQLFTPLIYISTRKDNDFISSL
EKMYNEYQTAVREQNVKKSSEKYVYRCLWFIRLTLQQKLYPNDQIEENKFPSALRTVVSW
FFSDQVITDFAKVDSNVYFEVVYLLFVGKPANILREKDQLLFKYFLYDSEQKDQNVIQYP
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