Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00569500

Standard Name

GEF1 (Guanine nucleotide Exchange Factor 1 )

Aliases

PreTt10478 | 76.m00180 | SEC7 | 3810.m02041

Description

GEF1 guanine nucleotide exchange factor; Guanine nucleotide exchange factor

Genome Browser (Macronucleus)



Genome Browser (Micronucleus)

External Links

Gene Ontology Annotations

Cellular Component

Molecular Function

  • ARF guanyl-nucleotide exchange factor activity (IEA) | GO:0005086

Biological Process

Domains

No Data fetched for Domains

Gene Expression Profile

Vegetative Cell Cycle (Zhang et al., 2023)

GeneMania

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for Tetrahymena Stock Center

Homologs

Source Identifier Score
Tetrahymena borealis EI9_03460.1 9.997093137033517e-262
Description: Sec7 domain-containing protein (2007 aa)
Oxytricha Contig10719.0.g52 9.997093137033517e-262
Description: Sec7 domain
WormBase WBGene00012386 9.998707956568768e-117
Description: locus:agef-1 status:Partially_confirmed UniProt:G5EFH7 protein_id:CAA21704.3
SGD YDR170C 3.0011595823640496e-94
Description: SEC7 Guanine nucleotide exchange factor (GEF) for ADP ribosylation factors involved in proliferation of the Golgi, intra-Golgi transport and ER-to-Golgi transport; found in the cytoplasm and on Golgi-associated coated vesicles
Stentor Coeruleus SteCoe_8405 9.964733010103672e-77
Description: None
DictyBase DDB_G0273101 1.0003503620230312e-57
Description: DDB_G0273101 on chromosome: 2 position 2569065 to 2575617

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

  1. Ref:15717927: Mouratou B, Biou V, Joubert A, Cohen J, Shields DJ, Geldner N, Jürgens G, Melançon P, Cherfils J (2005) The domain architecture of large guanine nucleotide exchange factors for the small GTP-binding protein Arf. BMC genomics 6( ):20

Sequences

>TTHERM_00569500(coding)
ATGTAGTAAATGTAGCAGCCAGAAGAAAATCTATAGCCTATTTAGATATACCAAGATATT
TTGGGTAATTCTTTTGAAAAGATCAAAAAGAATCTTCCTAAAAAATATCTTGGAGTCAAA
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AATGAAAAGAGCATCTTTTCTCTTTCATTTGGTATTTTCCTGTAGCTTCTTATTTACCAT
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CTGAGCTGCCATTTTAATTTAGAATAAGAAAGAAACTCATTTGTAGAAGCTCTTTGCTAA
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TTAACTTTAATCAGCAAGTTGAATGAAAATAGGCTTATATAAAACGGAGCAGATAAAAGA
CCCAGTGGTAGTGGTAGGAGACCAAGCAGCTTAGTCCTTACTGATTCAGAGTGGAGTCTT
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GATGGAGAGAGTATTTAAGACTTTATTACTGCTCTTTGTCAAGTTTCTAAAGATGAGCTA
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TTTGCAGAGGCTGGATGTCACTAGAACCCTTAGATTGCTATTTTAGCAGTTGATAGTCTG
AAACAGCTCTCATAAAAATTTTTTATTAAGGAAGAGAGATTCAATCAATAATTCTAAAGA
GATTTCTTAAAACCTTTCGAAATTATTTTTTAAAATGTCCCAATCTAAAACTTATTCATT
AAAGATTTTATCCTAGACTGCTTTAAAAATTTTCTTGGAAATAAGACTATATATAAAAAA
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GACGAGCTCTCTCGCAATGCTTATAACATTATAAAAGGAATTATGGAGGAAAATCTGGAC
ACGATACATGATGTCTTTGTTGATTTGGTGCAATGCCTCAATAAGTTGAGTAAAAAGAGA
TAAGAGGATTTAGCATTAGCCTCTATTGAGCTAGTTTAGAAATGCTTGTACTACTTAGCT
GATAAATCTCATGTAGTTCCTAAGTCAAAATTATCATTTTCTTCCCTTCAATCTTAATCA
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AAATCAAACGAAAGCTACTGGGTTCCTCTACTTGGTGTTTTATCAAACTTATGCGGAGAC
CATAGACCAGAAATTTAAGAAAAAAGTATGGAGTCATTATTCAACATCCTTACAGAATAC
GGTTACACTTTTTCAATAGAATTTTGGAAGATGATATTCTAAGGAGTATTGAGACCCTTA
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AATAATAGAAAGTTTAACTGGCTCAAATAATCTTGTAATAAGGCATTCCATCATATCACA
AACTTGCTCTTTGATTATTATGATGAATTGCAATCACTTGTGATTGAGTTTATCAAGACT
TATGAAAATTGCATAAACAATACAAATGAATAGCTGATAAAGTAATCTGTAACAGCTGCC
AAAAATACAATCATTTAACTAGGTCCTAAATTTAAATCAGAAGATTGGGATATGATAATT
GGATTTTTTGAAAGAATGATCAGATTAACTACTCCTTAAAAGCTTTTGAGCATTAATTCA
GACGAAAATGGATAAAAGATAGCTTAAGATGTCAAAGGAAAGAGGAAAGAATCTCTCATG
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TTACTGATTAAGGTTATCTAAGATGTTATAAATTCCTTTTAAGATAAACTATCTTCAAAT
TAACTTGATAATCTCTGCAACATCCTAGACAAATCCTATCTTTTTGCTATTGAATTTAAC
TCTCAAATATTTTTGAGATACTGCTTATGGAAGACAGGATTTAATCCTGAGTTAAAGCAA
TTACCAGGAATACTAAGATAGGAGAGATAAGCTTAGGCAATGAGTTTGTACATCAAATAT
ACACATTATAGAAAATAAATGAAGTCAGGATCTTGCTTTAATTATAATGACCTAATAGAT
AAATTAGTGGAATACATGACACTCTTCTTAAAAAAGCACAAAGATTTACTTAAGATTATT
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TTGGATGTTCCAGATTTAAACGAAGAAACTATCGATCTTGTTGTGCACAAAATAAAACTC
ACCGAAGTAGAGAGAGATGTTAACAATCATCGCACTATGATATCAGAGACCGTTCTTCCT
ATTTTAGAAAAAATTGATTTGTCACATATGAAAGAAAGAGTAAAAGAAATATACTGTATT
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TGCAAAAATTGTAGTAGATGCTAGAATTTAGATGAAGATCTAGATATCTTTATAAGAAAA
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GCTTAGGTTGTTTTAGAATAAAGTGCTTTGCTAAAATCAGTAAATTAAAATCCTATAATT
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ACAAATGAAATAAATGCTGAAATTGATGAAGTATAAAATGAAAATGACAAATAAAAAGTA
AATATAATAAGGAGTGAGTAACATTATCAAGACGATTCAGATAACTAGCTAAAAATTGAA
AAAAATTTAATTAAATAAGTTGCAGGAGATTATGATGAAGATGATTTAAATGGATCAGGA
AATAAAAATTTAAATTAAAATAATTAAATAAATATTAACAGCAATGATAATAGTAAGTCC
AACAGTGAAAACAATATAGATCAAAACTAGTAAAGCAAATGA


>TTHERM_00569500(gene)
ATGTAGTAAATGTAGCAGCCAGAAGAAAATCTATAGCCTATTTAGATATACCAAGATATT
TTGGGTAATTCTTTTGAAAAGATCAAAAAGAATCTTCCTAAAAAATATCTTGGAGTCAAA
GACCTAGTTCAGAAAATGCAAAGTAAATAGTTTTTGAGCAATTTGTTGAAAAAATGTAGC
ACTGTGGATGCTTAAAATTATAAATGAGGAAACATAAATTTTGCTCTTAAATGTTTATTA
TTTGAATTAAATTGATATTTTGTAATATAAAAGACCATGTGATGTAAGACCCTGCTCATA
AATTGGATGCAAACAGATATTTCATCATTTATAAACTAGCAATCAATACCAAATAACCAA
AGTTGATAGAAGTTTCTTTAAAAGCAATTCAAGTAGATAAAAACACTCATTTTATTTAAT
CAGCATTAATTATATTTTCTATTTTACCATGTTTAATCTTAGAGTTTAAACAAAAAATAT
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TTAGTTGATAAATAAATGATTATTGCAAAACGAAATTGATTTGAAAAACTTAAATAAAAC
AATAGAAAAATCAGAAAATAATATTTCAGATATTTTAATTAAATATAAAACATATTATTT
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AATACGAGAAAATTAATATCTACAATAATGGATATGATGGTTTCTCTTACGAATGAAAAG
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TTACTTACTTACTTAATTACTATCTAAGTCACTAAAATATTATGACAATATTTTCAAAAC
ATTTACTTCTTTCTAAAATTTTTTCTAATTAATTTTCTCTTTCCCTTTTAATTTTTTCAA
AAAAAATTAATAGTTTTTGAATAGCTTAAAAAGCAAATTATATAAAAAATAAAATAATTT
TTATTAAAAATAGAAACTAGAAATAGTCAAGTAGAGAAACTTGCTAAATAAGCACTTTAG
CAGATCATAAATTATAATTATTAGAAACTTTCCTTAATAGAAGGAGAAAAAATCAAAAAA
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AGAGGGAGAACAACTTAGGATTAAAGTGTTATTTAAAAAGAAAGATCTCCTTCTCCTAAC
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AATCAATTAAATTAAAAAGAGTTATCGCCAATTAACAATATCCTCAAATCATAAGAAGAT
GCTTAAGATGCAGATATGAGTGGATATTTTGATGGTGTAAACAGCTTTTCTAAAAATCAA
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GATGCTATAGTTGAAAAAATTAACCAAGATGAAAATATTCCAAGCGATTAGAAGTAAAAT
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AATGATCCATAATATTATAGAGTACTACCCATTAACTCAGACCAATTAGTAAATGAAAAC
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GATTTCTTAAAACCTTTCGAAATTATTTTTTAAAATGTCCCAATCTAAAACTTATTCATT
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ATCAAATCTGGCTGGAGAATTATATTTAATATTCTCGGATTTGCTTTGCTAGAAGAATCT
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GAAAATCTGGACACGATACATGATGTCTTTGTTGATTTGGTGCAATGCCTCAATAAGTTG
AGTAAAAAGAGATAAGAGGATTTAGCATTAGCCTCTATTGAGCTAGTTTAGAAATGCTTG
TACTACTTAGCTGATAAATCTCATGTAGTTCCTAAGTCAAAATTATCATTTTCTTCCCTT
CAATCTTAATCATCCGATCCTAATATTAATTCATAAACAGGTGAGCATTCTAATACTCAC
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TTTTCAATTAATTTTTTTTTAGGCTACTGGGTTCCTCTACTTGGTGTTTTATCAAACTTA
TGCGGAGACCATAGACCAGAAATTTAAGAAAAAAGTATGGAGTCATTATTCAACATCCTT
ACAGAATACGGTTACACTTTTTCAATAGAATTTTGGAAGATGATATTCTAAGGAGTATTG
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ACAGCTGCCAAAAATACAATCATTTAACTAGGTCCTAAATTTAAATCAGAAGATTGGGAT
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TTAATTCAGACGAAAATGGATAAAAGATAGCTTAAGATGTCAAAGGAAAGAGGAAAGAAT
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TTATTTATTTATTTTTTATAAAGAATTAAAAAATTAACTTTGATGATGCAAACGCTTAAT
CAAAAGCATAGCTTTTACTGATTAAGGTTATCTAAGATGTTATAAATTCCTTTTAAGATA
AACTATCTTCAAATTAACTTGATAATCTCTGCAACATCCTAGACAAATCCTATCTTTTTG
CTATTGAATTTAACTCTCAAATATTTTTGAGATACTGCTTATGGAAGACAGGTAATATAT
TTGATTAATTTAAAAAAGAATGAGTAAATAAATTGTTTATTAATTAATTAAAAGGATTTA
ATCCTGAGTTAAAGCAATTACCAGGAATACTAAGATAGGAGAGATAAGCTTAGGCAATGA
GTTTGTACATCAAATATACACATTATAGAAAATAAATGAAGTCAGGATCTTGCTTTAATT
ATAATGACCTAATAGAGTAAGAATATAAAAAAAATTACAATACTAAAAATATTTTATCAT
ATCAAATAGTAAATTAGTGGAATACATGACACTCTTCTTAAAAAAGCACAAAGATTTACT
TAAGATTATTGAAAGTGAAAGAGAAAAAAGAAATACAGATGAAAGGAGCTATTATGATAG
CTATGAAAGATTGGATGTTCCAGATTTAAACGAAGAAACTATCGATCTTGTTGTGCACAA
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CGTTCTTCCTATTTTAGAAAAAATTGATTTGTCACATGTAAGTTACAACATATTTTACTT
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ATAAATTACTAATTAGAAATCAATTAATTCAGACTATGTAAAAATAACAAATAGCTCCTC
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TGACAAATAAAAAGTAAATATAATAAGGAGTGAGTAACATTATCAAGACGATTCAGATAA
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>TTHERM_00569500(protein)
MQQMQQPEENLQPIQIYQDILGNSFEKIKKNLPKKYLGVKDLVQKMQNHVMQDPAHKLDA
NRYFIIYKLAINTKQPKLIEVSLKAIQQLISYNFLNGNCPDYTLEVNLEEFKDLHDPFPL
RDQLNTRKLISTIMDMMVSLTNEKDENHQMLVIKIFVLLATHIHTEMHGIHISAAIQTII
IYYSQTRNSQVEKLAKQALQQIINYNYQKLSLIEGEKIKKQLFGNGFFIGNAQQLQQQRE
RGRTTQDQSVIQKERSPSPNQTNMTKQLISIRGDTTLMQQNQLNQKELSPINNILKSQED
AQDADMSGYFDGVNSFSKNQNFMFQGIRKNNDKNQPTFDTICLDTLINIVDDVCIYEARK
DAIVEKINQDENIPSDQKQNYIQVELQNIPTRVVPTQLDPNDPQYYRVLPINSDQLVNEN
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