Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00716100

Standard Name

VPS8C (vacuolar protein sorting 8C)

Aliases

PreTt19082 | 113.m00121 | 3673.m00045

Description

corvet complex core vacuolar protein; endolysosomal pathway

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External Links

Gene Ontology Annotations

No Data fetched for Gene Ontology Annotations

Domains

  • ( PF00036 ) EF hand
  • ( PF00097 ) zinc finger, C3HC4 type (RING
  • ( PF00400 ) WD domain, G-beta repeat
  • ( PF00637 ) Region in Clathrin and VPS
  • ( PF05316 ) Mitochondrial ribosomal protein (VAR1)
  • ( PF07649 ) C1-like domain

Gene Expression Profile

Vegetative Cell Cycle (Zhang et al., 2023)

GeneMania

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for Tetrahymena Stock Center

Homologs

Source Identifier Score
Tetrahymena borealis EI9_16882.1 9.997093137033517e-262
Description: hypothetical protein (1441 aa)
Oxytricha Contig21963.0.g17 1.9991517704232713e-32
Description: WD domain, G-beta repeat
Stentor Coeruleus SteCoe_12909 2.9374821117108028e-30
Description: None
DictyBase DDB_G0291606 9.997764199084386e-16
Description: vps8 on chromosome: 6 position 397697 to 403037
SGD YAL002W 0.00000039992052383199455
Description: VPS8 Membrane-associated protein that interacts with Vps21p to facilitate soluble vacuolar protein localization; component of the CORVET complex; required for localization and trafficking of the CPY sorting receptor; contains RING finger motif

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

  1. Ref:31964712: Sparvoli D, Zoltner M, Cheng CY, Field MC, Turkewitz AP (2020) Diversification of CORVET tethers facilitates transport complexity in . Journal of cell science 133:
  2. Ref:29478853: Sparvoli D, Richardson E, Osakada H, Lan X, Iwamoto M, Bowman GR, Kontur C, Bourland WA, Lynn DH, Pritchard JK, Haraguchi T, Dacks JB, Turkewitz AP (2018) Remodeling the Specificity of an Endosomal CORVET Tether Underlies Formation of Regulated Secretory Vesicles in the Ciliate Tetrahymena thermophila. Current biology : CB 28(5):697-710.e13

Sequences 

>TTHERM_00716100(coding)
ATGTTTGAAGAAGAATAAGAGTAAGATAGAGAACTTGTTCATTAGATTTTATGTGAAGTT
CTAGGCGAAAATTACATGAATGAGCCCTATGATGATGGCGATGATTCTTCTATGAAATCT
TCAGTTGATATTCAAGCTTTAATCGAAGAACAAAGTATTTCTAGTAATAGTCTTCTAAGT
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GTTGAAAACATTTTAAGAGTTATTGATAAGAATGAGAAGAATAAATTAAATAGTTAAGAA
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GATTTGATTATTTCAGCACAAGATGTGTAGAAGGCAGACAGAAAATATCCTCAAATTTTC
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GCAAGTGATAATAGCGGCAATATTATGATAACTAAAATAAAAAAAAACCTATTTGCTTAC
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GAAAAAGAAATACTTTTTATGGAATTCTTAAATGAAAATTTGATATTTTATTTAGACCCT
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AATGAGTTAATCAGAAGCTGCTATGCTAATTCTGTTAATGTTTATAACTAAACTATTTAC
ATTCTAGATAGTAGAAATATTGTCAACGCATAGCTGCAATTCTGGGAATCTTATATTAAT
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ATGATAAGAATATGTAATGAAAAAAAGCTATTTTCAATGCTAGCTTATCTTTATCCTAAG
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AAATTAGATACTAAAACTGCTTACTTTTGTTTATGGTACTTGCGATATACACTCCAAGGA
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ATTCTTGAAGTTTCTTATCGAGACTTTGAAGTATCACATACTATGGCTATTGAATGTGCT
AAATTCTTTTTTGAGAGTCCTGATTCTAGTTTTTATAGAAGCAAGAAGCATATGAGCATA
GACTATAAGAGTGAGAGATTAATAAAATTACTGTCTACTTATGAAAGCTAAATAAACACT
AAAGGAAAAATAGAAAAATTAATACAAAAAGCACGATATTCTCCTTTTATAGAAGTTTGT
GCTTTCTTGTGTTTTATAAACTAAGATTACTAAGAGTGCATAGATTTATATTTACTCTCT
CCTAAAAAACATATTAACTTGAAAATATTTCCTTTCTTAGAAACTCTATTTGAAGAACTC
AATAAAAATAAAGATAATTAAAAAATAAAAGTACTGCTATAGTATATTTTTACTTCAAAG
CTTAAAGATCTTGTTAGACTAGATTCTGAAAAGACTAAAGAATTCATTGAGAAATTTACT
ACAGCAGGAGAAGCTGATCAGGCAATAGAATAGCTATCATAATTCCCTGAGTTATAATTT
AAGCTTCTAGATAAAATCATTTAAAGTAAAAGAAACAAATAATAAGATATTCCAGAACAT
TTACTAGTCCTTTAGCTAGAATTAGTAGCCAAGTTAAATCCTGCTAGAGTTCTTTTCGAG
TTAAAAAGCTTCGATTATCCTCTTGATGAAAGTCTAAAAATTAGTTTAAAATACGGCATT
TTAGATGCAACTGCTTACCTATATGAAAGAAGTGGAGATATAACTAAATCCATCAATTTA
TACTTTGAAGTTTTTAAAGGAAAATTAAATTAATTAATAACTTATCCTGATGTAAATGAA
AACAAACTAACTCACCTCACTTAATTTATAAAACCATGTTTAGAGATATGTATTTCCCAT
AATAAGAAAGGAGATAAAGAATCTGAGGAAAACTGGTTTTTAGTAGTAGACAATATTATA
AATATTCAAAAGAAAACTGTTGCAGAATTTTAGTTTGATAAAAGAATAATTATCAATTTC
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TTCATAGAAAATCTTTTACTTATCCTTTAAATTTACACTTTGAAAGACATGAAATCAACA
TTTTAGAGATTGCTCCATGATTTTTCTTTTGAATTTAGTGTATTAAATAGCTCAATTAGC
ATACTCAAGTTGAATTGTAACAAATAACAGCAATAAATACTCCAGTTCTATTCTTAAGGT
TACAGTATTTAAAAGTAGTGTTGTTCATGCTAAGAAATTATTGGTCCATAAGATGTTTAT
ATTTTATTTAATTGCAAACATACTTCTCATTAGAAATGTTCCTTTAATTAAACATATTGT
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TACAAAGGGTCTTCAAAGGAATAAATATTATAGTAGGAAAGAGTATCAACTGGTAAATAG
GAAAATCTAGCTGTACTTAAGAAAAAAAATATTTTCAAACAACTAAACGAGTTAGATTAA
AAGAAGAAGGACTTACAAGAAACATAATACAAAAGCATATTTGAAGAGGTTACTGATTTG
TATTGA


>TTHERM_00716100(gene)
ATGTTTGAAGAAGAATAAGAGTAAGATAGAGAACTTGTTCATTAGATTTTATGTGAAGTT
CTAGGCGAAAATTACATGAATGAGCCCTATGATGATGGCGATGATTCTTCTATGAAATCT
TCAGTTGATATTGTATAAAAATATTAATTTTATATTTTTTAAAATTCTCAAATGGCTATA
TTTAAAAATATTGCTTTTTAAAAACAGCAAGCTTTAATCGAAGAACAAAGTATTTCTAGT
AATAGTCTTCTAAGTGGAAGAGAAGGAAAGGTAGGTGGTATTTAAAGTAATAAGAATGGG
TTTGAATAGGGAGAAGTTGAAAACATTTTAAGAGTTATTGATAAGAATGAGAAGAATAAA
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TATCCTCAAATTTTCACATAAATTTAGGAATAGAATTTTGTTTAAGGCGATAACATTAGC
TTTTATTTGCACAATCTTGTTTTTAAATTTTCATAAAAACATCCCCAGTTTTTGTTTACT
TGCTTTTAAGTAAATATTTATTGATATACAATTTACTCTTTTACATTTATGTGTTTTTAC
TTTTATTAGTTTTTTTAGACATGTAGAAAAATAAAAAACACTATTAACATTTTAAATTAT
TGTTAAAAATAAAAAGATATACTAAGAAAATAATTGCTTAGAAAGACTATTATTAGGATG
TTAAGATGGATCGTTTGTAGTACTTGATGCAAATCCTAATTCAGGATAAGAAAACTATAC
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TTGTTTACTTGCAGCTTTAGTTTCAGTTGAGTTTATATTAATTGTGATGATAGAACCATA
AGTGGTGAATATAACAAGAATAGATAATGAATAAAATAATAAAATGATTTATTTCTCATG
GACTCCAATTATTCAAAACACTCCTCCTCAATTTGCTATTTCTTGTGATACTTTGATTAA
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TTACATATTTTCATTTTATTTTATTTTATTTAAAACAGTAGGTATATTTTAAAGCATGAA
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TAAAACTGCTTACTTTTGTTTATGGTACTTGCGATATACACTCCAAGGATACTAATTTCC
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AATATTTACAAATCTTCATTTAATTTACTAATTATTATTAAAATTATTATCTAATTGAAA
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TAAAAGTACTGCTATAGTATATTTTTACTTCAAAGCTTAAAGATCTTGTTAGACTAGATT
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GTATTGA


>TTHERM_00716100(protein)
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SVEFILIVMIEPQVVNITRIDNEQNNKMIYFSWTPIIQNTPPQFAISCDTLIKFYQIDSI
KEDTSQKIIKKISFQSYFYSEKEILFMEFLNENLIFYLDPNNLISIIAVNKFRTSDTFQV
IPQNTLVDKYILKHEEIKEAIVYRDFLKSEVYYHMFVKANNELIRSCYANSVNVYNQTIY
ILDSRNIVNAQLQFWESYINKLIEKSDWIQALFKLIQIFEGKDLLYSHLSSQKLQRQKQI
QRFVESISRRYIEEVASILSEQNSEELWIMRISTLTEFLLHLEFYDFIFEDLLIMFENIA
ADQYFMKILEPFILRGQIKAVPALAFRKILNYFFTQAKDKIHLVKKLIVNLDLEKMDIDN
MIRICNEKKLFSMLAYLYPKNNLDFKTPALVCYANYLQGQKLDTKTAYFCLWYLRYTLQG
YQFPNDFLDFKSQTAAVIQLVQWIFVKETLQELIKIDCFFMFEIILLFFEKPCSTIIEQN
NNELYKLLEIDNKIKTRKQINEKEIDLLEATPPVHSLMIQLVQECVQQNNVDEIQCFHHL
ILEVSYRDFEVSHTMAIECAKFFFESPDSSFYRSKKHMSIDYKSERLIKLLSTYESQINT
KGKIEKLIQKARYSPFIEVCAFLCFINQDYQECIDLYLLSPKKHINLKIFPFLETLFEEL
NKNKDNQKIKVLLQYIFTSKLKDLVRLDSEKTKEFIEKFTTAGEADQAIEQLSQFPELQF
KLLDKIIQSKRNKQQDIPEHLLVLQLELVAKLNPARVLFELKSFDYPLDESLKISLKYGI
LDATAYLYERSGDITKSINLYFEVFKGKLNQLITYPDVNENKLTHLTQFIKPCLEICISH
NKKGDKESEENWFLVVDNIINIQKKTVAEFQFDKRIIINFFSNVINEVVEKMVNFVKFNS
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Y