Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00825460

Standard Name

RAD4 (RADiation sensitive 4)

Aliases

PreTt04010 | 142.m00107 | 3683.m00040 | XPC1

Description

RAD4 DNA repair protein Rad4; DNA repair protein Rad4 containing protein; homolog of human XPC

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External Links

Gene Ontology Annotations

Cellular Component

Molecular Function

Biological Process

Domains

  • ( PF03835 ) DNA repair protein Rad4
  • ( PF06696 ) Streptococcal surface antigen repeat

Gene Expression Profile

Vegetative Cell Cycle (Zhang et al., 2023)

GeneMania

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for Tetrahymena Stock Center

Homologs

Source Identifier Score
Tetrahymena borealis EI9_18272.1 9.997093137033517e-262
Description: DNA repair protein Rad4 containing protein (932 aa)
Oxytricha Contig15291.0.g9 9.003144504923815e-42
Description: Rad4 beta-hairpin domain 3
DictyBase DDB_G0292296 1.000116773704384e-19
Description: xpc on chromosome: 6 position 1414792 to 1417980
WormBase WBGene00022296 1.000361553249356e-16
Description: locus:xpc-1 status:Partially_confirmed UniProt:Q9N4C3 protein_id:CCD73179.1
SGD YER162C 0.0000009995106777214876
Description: RAD4 Protein that recognizes and binds damaged DNA (with Rad23p) during nucleotide excision repair; subunit of Nuclear Excision Repair Factor 2 (NEF2); also involved, with Rad23p, in turnover of ubiquitylated proteins

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

  1. Ref:23884606: Gao S, Xiong J, Zhang C, Berquist BR, Yang R, Zhao M, Molascon AJ, Kwiatkowski SY, Yuan D, Qin Z, Wen J, Kapler GM, Andrews PC, Miao W, Liu Y (2013) Impaired replication elongation in Tetrahymena mutants deficient in histone H3 Lys 27 monomethylation. Genes & development 27(15):1662-79

Sequences

>TTHERM_00825460(coding)
ATGGATTCAAATGAAGATCTTGATTTCAATGATGAATTTGAAGAAGTAGATGAAAAATAA
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>TTHERM_00825460(gene)
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TCTTATTTAGACGTTTGCTGGTGATCCACCTGAAGGAACAGTTTTGATTGAAATCTAAGG
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ATCGACAGCATCTGGTAGATCTCATGTGGTTAAAAATGGTATACTAGCCCACAAGAAAGA
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AGAAAATCTTAAAAAAGAGCTTATGGGATTTTGGAGAAAAATATTTAAAGGAGTTTTACT
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>TTHERM_00825460(protein)
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GLPKLLKKHNIEYVEAVCGFESTASGRSHVVKNGILAHKKDEERIRQIYQDNYEIMKAQQ
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