Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_01075780

Standard Name

RPA2 (RNA polymerase I subunit 2)

Aliases

PreTt02690 | 219.m00043

Description

RPA2 DNA-directed RNA polymerase; DNA-directed RNA polymerase I complex subunit

Genome Browser (Macronucleus)



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External Links

Gene Ontology Annotations

Cellular Component

Molecular Function

Biological Process

Domains

  • ( PF00562 ) DNA-directed RNA polymerase, beta subunit
  • ( PF02363 ) Cysteine rich repeat
  • ( PF04560 ) RNA polymerase Rpb2, domain 7
  • ( PF04561 ) RNA polymerase Rpb2, domain 2
  • ( PF04563 ) DNA-directed RNA polymerase, beta subunit
  • ( PF04565 ) RNA polymerase Rpb2, domain 3
  • ( PF04567 ) RNA polymerase Rpb2, domain 5
  • ( PF06883 ) RNA polymerase I, Rpa2 specific
  • ( PF09268 ) Clathrin, heavy-chain linker
  • ( TIGR02013 ) DNA-directed RNA polymerase, beta subunit

Gene Expression Profile

Vegetative Cell Cycle (Zhang et al., 2023)

GeneMania

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for Tetrahymena Stock Center

Homologs

Source Identifier Score
Stentor Coeruleus SteCoe_17515 0
Description: None
WormBase WBGene00008781 9.997093137033517e-262
Description: locus:rpoa-2 DNA-directed RNA polymerase status:Partially_confirmed UniProt:Q27493 protein_id:CAA99827.1
Tetrahymena borealis EI9_15329.1 9.997093137033517e-262
Description: DNA-directed RNA polymerase, beta subunit protein (1160 aa)
DictyBase DDB_G0293560 9.997093137033517e-262
Description: rpa2 on chromosome: 6 position 3044865 to 3048492
Oxytricha Contig2863.0.g30 9.997093137033517e-262
Description: RNA polymerase Rpb2, domain 6
SGD YPR010C 9.997093137033517e-262
Description: RPA135 RNA polymerase I second largest subunit A135

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

No Data fetched for Associated Literature

Sequences

>TTHERM_01075780(coding)
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TTTTCAAAAAAGCTTAAGTAAGCTGCCTTTGCTCACATAGACTCTTTCAACTTCATTTAC
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ATGAGTGGTGAGGCTATTGATAGTTTCTATAATTACAATAAGGGTGTTTAAAAGTCAAAA
CCTAAATGCAGAAAGTGCCAAAATGCTGAGTGTTCTAAAGTAGTAATTCCTTTTGTATTA
AGATACTTGACTAACGAGCTTGCTGCTATGAATATCAAGCTTGCCTTTAAGCTTGAATGA


>TTHERM_01075780(gene)
ATGAAGGAATCATTAAGTAGAGAAGATCATATTGCTCGTGCAAAGCAATCAAATTTAGAT
TTTTCAAAAAAGCTTAAGTAAGCTGCCTTTGCTCACATAGACTCTTTCAACTTCATTTAC
GATGAAGGATTAAAAAAAATCACTTAGTACTTGTAGCCAGTTGAAATTATTAAAGAATAA
AGATCTGAAGAATACAAGTAGAGTTACTTGCCCTTTAAATCTATGAAGGTTTGGATTGAA
AACCTCGAAATAGCGTAATTAATTATGATTTATTCGTTTAATTACCTTTCATCTGCAAAC
CAAAAAGTGGTATTTTTTGAAGATTTGGTTTTCAAATCTTAAACAAGACTAATTTATTTA
TAAGTCCCATCAATGTTTTTTAAAAGAAATCTTCTACTTTAAAGAAAAGTACATTTTTTA
ATTTACTTTACAAACAGGACAGCATACCACAAAAACTAATAGAATAGAATCATTTTTATT
TCAAATATGATAAAATTTACTTTCGATTTTGACTTTTTTTTAAAGGAATTATAAAATAAC
AAATTGTCTAAGCAATACTTTATATTTAGTAGCTAATTTAACCATCTTCAAAAATAATTT
ATTTTCCAAGGTTTATAATTCCATTAAGATAGAATGATTTATTTGATACTTTTATATTTG
ATAATAATGATGATGGTGGATGATAAGGTTAATAATAGATAAATAAATTTAATGATATTT
CAAAAACAATTTCTTATAGTTGTAATGTTTTTAAACTTTTTTAATAATTATATTCTAGCA
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GAATAGGAAGAAAGACTTATGGAGCTCCTCTTTTCGCAAAGGTAGCTCGTAGTATTGATG
GAGGAAAGCCTGAAAGCATAAATATTAGATTAGGCGACATTCCTATCATCGTTAGAAGTG
ATCATTGCCATTTAGCAAAAATGACTCCTAAGGAATTAGTGAAAGCTCACGAAGATTGCA
ATGAATTTGGTGGATATTTTATTGTCAATGGTAATGAAAAGATAGTCAGAATGCTTATCC
TTCAAAAAAGAAATTATCCTATTGCTTTTATCAGAGCAGGTTATGTTAATAGAGGTCCTA
ATTACACACCTTTTGCAGTTTAAATGAAGTGTGTGAGAGAAGATTTATACTCAAAAACAA
TTACTCTCCACTATGTTTCTGATGGTTCTGTTTTCTTGCGTATTCTTCACAGAAAGCAAG
AATTCTTGATTCCAGCTATCGTTATCCTTAAAGCTTTAGCTGATATTTCTGACCTTCAAA
TTTACAATAAAGTAAATTTTTATTTAATGATAAATTTATTAAGTATTATAGTTTAATGAA
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AAACAATATTAATTAAATAGTTAGTTAAAGGTTAAAGCAGCAAGAGTGCTATTAGTGATA
GAGTTGAAGTACTTATTAGGGGTAGTAAAGCAATGAGTTTAAATACTAAGGAAGAATGTT
TGGCTCACTTAGGTAAAAATTTCAGAGTCGTACTCAACATCACTAACCCAGAAATTACTG
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TCGATAAGCTCAACACTATTTGTGTTATGATTAGCAAATTATATGCCTTAGTCAGTGATG
AAATTTGTCCTGATAACTTAGATTCTTTGCAAAATTAGGAAGTCCTCTTACCTGGTCATC
TCTATATGATGATTTTAAGAGAAAAGTTAGAAGAAATGCTTTTAGGTATCCGTGCTAAAG
TTTTTAAGGATGGTTCTAGACCCGAAGAAGCTATTAGAATTCCTCATATCGCTTACTTAA
AAAAAGCCATTGAATTTTAAGGCTCTATTGGAAATAAAATTGAATATTTCCTCTCTACTG
GTAATTTAAAATCCCAAACTGGTTTAGATCTCATGCAAGTAATATTTAAATTCATTTCTA
AAAAAATTTATATTGATTAAAAACTATCATAATAAAGGCTAAAGGTTTCACAATTATAGC
TGATAAGTTAAATAATATGCGTTTCTTGAGTCACTTTAGAAGTGTCCATAGAGGTGCTTA
TTTTACAGAAATGAAAACAACAACAGTTAGAAAATTATTACCTGAAAATTGGGGTTTCAT
TTGCCCTGTGCACACTCCTGATGGTGGTCCTTGCGGTTTGTTAAATCACATTTCTTAATC
ATGCAAACCCCTTACCAGACCTGGGTATGATGGTAATATTCACTTCAATTTAGTAACTCT
CTGCACTGAGATAGGTATGAATCCTATTGTAAACGATTTGTCTATCGTATTCCCTCCTAC
TTCTGTTACTATTATGCTTGATGGTAGAGTTATTGGTTATATTGAATCTAAAAATGCATA
AACATTCTGCCAATCATTAAAATATTTAAAAATTATGCAAGATCCTACTCGTTTAATCCC
TGCTGATTTGGAAATCGGTTATGTTCCTAAACTTAATCTTGAAAAACAAAATATTTTCCC
AGGTATCTTTTTACACACTAATGAAGCTCGTTTTGTTCGTCCTGTTAAGCACTTGAAATT
AAATGCCTTAGAATGGATTACTCCTTTCGAATAAGTCCATCTTTCTATTGCTTGCATTGA
AGAAGATATTAGAAACGATACTGAATACTAAGAACTCTCACCTTCATACATTCTTTCAAT
TTTACCTTCTTAAATTCCTTTCCTCAATTATAACTAATCCCCTAGAAATATGTATCAGTG
CTAGATGGCTAAGCAAACTATGGGTACTTCTATGCACAATTTCCCTTATCGCTTTGATAA
CAGAATATATAGATTATTAAATGGTTAAATTCCTATGGTTAAAGGTATGGATCCTGAAAG
TTATGGTCTTTCTGATTATCCTTCTGGAACAAATGCTATCGTTGCAGTTATCAGTTATAC
TGGTTATGATATGGAAGACGCTATGATTCTGAATAAATCATCATACGAAAGAGGATTCGG
ACATGGTTGTGTCTATAAAAACTACTCATACGATGTTGCTGAATTAAATAAAGAAAAAAA
TTCTAAATTTAAGATGTTGAATGAAGTTAAAAATATTGACAGTAAATTATCTTAATCTTT
TTTTTAATTAAAATTTATATTTTCTATTTGAAAATTATTTAGAGAGTTAAATCGCTGAAG
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TCTAAATATATGATACTTAAAAAAATGCTATGAAAACTTTCTACCACAAGGACTCAGAAT
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AATATAGAATTAGAATTCCCAGAAATCCTATTATTGGTGATAAATTCTCATCTCGTCACG
GTCAAAAAGGTGTTCTTTCTGTCCTTTGGCCTCATATCGATATGCCCTTCACTGAAAGTG
GTATTACTCCTGATGTTATCATTAACCCTCACGCTTTCCCCTCCAGAATGACAATTGGTA
AATTTACTCTTTATTCAAGAAGATTAACTAATTAATTAAATTTTAATAAAAAAGGTATGT
TAATCGAAAGTATGGCAGGTAAATCTGGAGCTCTTAATGGAAATATATTAGAAACTTAAC
CTTTCTAAAATTATTAAGATGATGATATTGTTAATTATTTCGGTAAATAACTTTAATCTC
ATGGTTATAATTATTACGGTAACGAAGTTATGTATAGCGGTACATATGGTTGCATGATGA
AAGTTGATATCTATATGGGTATTGTATACTATCAAAGATTACGTCACATGGTATTTAAAA
TTTTTGTTAAAGATTGTTAATTAATTGTTATTTCTAATAATATATTAAAGGTTTCAGATA
AAGCTTAAGCAAGATCTACTGGTCCCGTTGATATGCTTACTTAACAACCTATTAAAGGTA
ATTATTAAAAAAATATGTCTTCTAGCTTACTTAATTATATACAAAAAAAAAAAAAAATAG
GTAGAAAGAGAGGTGGTGGTATTAGAATGGGTGAAATGGAAAGAGATGCTCTTCTTTCTC
ACGGTATCTCCTTCTGTATGCATGATAGATTCTTAAACTGCTCAGATTATTCTGAAGGTT
ATGTTTGTAATAGTTGTGGTTCATTGGTCTCAACATACCTACATACTAATTTAATGAGTG
GTGAGGCTATTGATAGTTTCTATAATTACAATAAGGGTGTTTAAAAGTCAAAACCTAAAT
GCAGAAAGTGCCAAAATGCTGAGTGTTCTAAAGTAGTAATTCCTTTTGTATTAAGATACT
TGACTAACGAGCTTGCTGCTATGAATATCAAGCTTGCCTTTAAGCTTGAATGA


>TTHERM_01075780(protein)
MKESLSREDHIARAKQSNLDFSKKLKQAAFAHIDSFNFIYDEGLKKITQYLQPVEIIKEQ
RSEEYKQSYLPFKSMKVWIENLEIATPIRADSGVAEDNKLMPEECRIGRKTYGAPLFAKV
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ECLAHLGKNFRVVLNITNPEITDKQVGEIFMNENICVHLNNNIDKLNTICVMISKLYALV
SDEICPDNLDSLQNQEVLLPGHLYMMILREKLEEMLLGIRAKVFKDGSRPEEAIRIPHIA
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EGYVCNSCGSLVSTYLHTNLMSGEAIDSFYNYNKGVQKSKPKCRKCQNAECSKVVIPFVL
RYLTNELAAMNIKLAFKLE