Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_01093550

Standard Name

SPT6 (SuPressor of Tys 6)

Aliases

PreTt16928 | 230.m00037 | 3806.m00218

Description

SPT6 zinc knuckle protein; Zinc knuckle family protein; homolog of SPT6 in S. cerevisiae; contains SH2 phosphorylated tyrosine binding pocket; transcription elongation factor; H3-H4 chaperone

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Gene Ontology Annotations

Molecular Function

Domains

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Gene Expression Profile

Vegetative Cell Cycle (Zhang et al., 2023)

GeneMania

Tetrahymena Stock Center

  • ( SD01742 ) Micronucleus: PAR1 gene partially replaced by neo4-KanR2 cassette. Macronucleus: SPT6 gene partially replaced by neo4-KanR2 cassette.

Homologs

Source Identifier Score
Tetrahymena borealis EI9_20570.1 9.997093137033517e-262
Description: zinc knuckle family protein (1499 aa)
Oxytricha Contig16618.0.1.g58 2.999467474389571e-105
Description: Zinc knuckle
DictyBase DDB_G0272354 1.0001478224244938e-84
Description: spt6 on chromosome: 2 position 1271354 to 1276784
SGD YGR116W 1.0004249259458435e-52
Description: SPT6 Transcription elongation factor required for the maintenance of chromatin structure during transcription in order to inhibit transcription from promoters within the coding region
Stentor Coeruleus SteCoe_11339 9.221146422925876e-47
Description: None
WormBase WBGene00001259 4.9986056260133516e-43
Description: locus:emb-5 Suppressor of Ty 6 homolog status:Confirmed UniProt:P34703 protein_id:CAA84737.1

General Information

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Associated Literature

No Data fetched for Associated Literature

Sequences 

>TTHERM_01093550(coding)
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GAAGAAGAAGATTATTAAGGGCAAGTAGAAGAAGAGGAAGATGGCAACAATCAAGTAGAA
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GACAACGAGCATTGA


>TTHERM_01093550(gene)
ATGAGTAAACCAAGAAAAAACGAAGAAGTTGATGATTAAATGAGAAATATTGGAGACGAA
GAAGAAGAAGATTATTAAGGGCAAGTAGAAGAAGAGGAAGATGGCAACAATCAAGTAGAA
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AACAAAATAAGCCCTAAGCCTATGCTGATAATTTAATTTCAGAAAACCCAAATGTTCCTT
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TAATAATTCTATGATTTTGAACTACTTCACCAAGAAAGAAGACTAGCTTTCAACTAAAGC
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TTAATTAATTGTTGTTGCTGCCAATAGCATAGAATCTTAAAGACTTAAAAATCTACTTCA
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TATTTAAATCATAATTAATTTATAAATAGAATGTTAAAACTGTGGTAAATATGGTCATGC
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TGGAGCAAGTAAAATATGATTTAAAATACTTTAGATTTATTTATTTTAAAATATTTTATA
TTAAAAGAACAATGTTTCCACTGTAAGGGTACTGACCACTTTATTAAAGACTGCCCAAAT
AAAACTCATCAAAGCAATAAAGGAAGTGGCGGTTTTAGCTATAGCAGAAGAGATAGAAAT
CAATAACACTCACGCTCTAGATCTCGTTCATATGACAACGAGCATTGA


>TTHERM_01093550(protein)
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IPERLQIRMQGRKAPDPEELMEETKWISEKIKTIKDYKGSKKLNDINFHSKIFSFLQSLH
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DNEH