Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_01205260

Standard Name

VPS11 (vacuolar protein sorting 11)

Aliases

PreTt02716 | 273.m00021

Description

corvet complex core vacuolar protein

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External Links

Gene Ontology Annotations

No Data fetched for Gene Ontology Annotations

Domains

  • ( PF00097 ) zinc finger, C3HC4 type (RING
  • ( PF00637 ) Region in Clathrin and VPS
  • ( PF08086 ) Ergtoxin family
  • ( TIGR00190 ) thiamine biosynthesis protein ThiC

Gene Expression Profile

Vegetative Cell Cycle (Zhang et al., 2023)

GeneMania

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for Tetrahymena Stock Center

Homologs

Source Identifier Score
Tetrahymena borealis EI9_20559.1 9.997093137033517e-262
Description: hypothetical protein (971 aa)
DictyBase DDB_G0278141 9.00237276798251e-88
Description: vps11 on chromosome: 3 position 343671 to 346615
Stentor Coeruleus SteCoe_5015 1.2479464629129513e-47
Description: None
Oxytricha Contig961.0.g89 6.001376218974307e-41
Description: Zinc finger, C3HC4 type (RING finger)
WormBase WBGene00011067 4.0006511639687014e-23
Description: locus:vps-11 Vacuolar protein sorting-associated protein 11 homolog status:Partially_confirmed UniProt:Q09600 protein_id:CAA86774.2
SGD YMR231W 3.998609120989657e-17
Description: PEP5 Component of CORVET tethering complex; peripheral vacuolar membrane protein required for protein trafficking and vacuole biogenesis; interacts with Pep7p

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

  1. Ref:31964712: Sparvoli D, Zoltner M, Cheng CY, Field MC, Turkewitz AP (2020) Diversification of CORVET tethers facilitates transport complexity in . Journal of cell science 133:

Sequences 

>TTHERM_01205260(coding)
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>TTHERM_01205260(gene)
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GTCTTAGAAAAGGTTATGATAAATAATAATAAAATGCATCATCTAACTAAAAGATCAATA
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AAATCTACAATGATTTGTTAAATGAACCAGATAAATATTTCCATATTTTTGTAAACGGTA
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TTAGTTCTCTTTAAAATGTATAATTTCGAACCTGGTATCATCCATCTCTACAATGAAATG
AGATTAAAAGAAGAACTCCTTAACTTTTATATTATGACAAATCAAGGAGATAAAATTATT
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ATCAAGACAGAGAAGAGTACATGAAACTTAAGACTTAAGCAAAAGTATTTTTTTTACTAT
TATTGATAATTAAATATAAATTTTTAATTTAATAACAGATTTTCAGTCAAAAGTAATGCT
AAGAATGTACAAATGACTTATCAGGTACTCGTGTTCATTTCATGTGTGGCCACAGCTATC
ATGATTAATGTTTACATGGTGATTCTGCACAAAAAGAATGTGAAAAATGTGCTGATAATT
TCAAGCCTATCCTAAATAGAAAAGAAGGATTTGACGAAAAGGCTAGTGATTCAACTTAAT
TCCTAGAAAATATAAGCAGAAAAGAAAATAAATTCGATACAATAGCATCATATTTAGGAA
AAGGGCTCTTTAGTCAATCAATATTAAATGGCAAAAATAACTCTGCTTCAAATAATTTTT
GA


>TTHERM_01205260(protein)
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