Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_01276320

Standard Name

GIW1 (Gentleman-In-Waiting 1)

Aliases

PreTt28295 | 304.m00015 | COI1

Description

GIW1 hypothetical protein; Twi1p-associated protein

Genome Browser (Macronucleus)



Genome Browser (Micronucleus)

External Links

Gene Ontology Annotations

Cellular Component

Biological Process

Domains

Gene Expression Profile

Vegetative Cell Cycle (Zhang et al., 2023)

GeneMania

Tetrahymena Stock Center

  • ( SD01818 ) Macronucleus: All GIW1 genes replaced by c-terminal HA tagged version with neo3 in 3’ flanking region
  • ( SD01819 ) Macronucleus: All GIW1 genes replaced by c-terminal HA tagged version with neo3 in 3’ flanking region
  • ( SD01820 ) Macronucleus: KO of GIW1 with neo3
  • ( SD01821 ) Macronucleus: KO of GIW1 with neo3
  • ( SD01822 ) Macronucleus: KO of GIW1 with neo3
  • ( SD01823 ) Macronucleus: KO of GIW1 with neo3
  • ( SD01824 ) Macronucleus: All GIW1 genes replaced by c-terminal V5 tagged version with neo3 in 3' flanking region
  • ( SD01825 ) Macronucleus: All GIW1 genes replaced by c-terminal V5tagged version with neo3 in 3’ flanking region
  • ( SD01826 ) Macronucleus: All GIW1 genes replaced by c-terminal V5 tagged version with neo3 in 3’ flanking region
  • ( SD01827 ) Macronucleus: All GIW1 genes replaced by c-terminal V5 tagged version with neo3 in 3’ flanking region

Homologs

Source Identifier Score
Tetrahymena borealis EI9_21071.1 4.998338612125368e-60
Description: hypothetical protein (376 aa)

General Information

No. Gene Name(s) Paragraph Text
104 GIW1, TWI1 Giw1p binds to Twi1p complexed with single-stranded, but not double-stranded, scnRNAs and that this interaction selectively promotes the MAC localization of the mature Twi1p-scnRNA complex (Noto et al. 2010).
105 GIW1, COI12, TWI1 ATP-dependent and ATP-independent activities of Coi12p facilitate scnRNA loading by counteracting the Twi1p-binding protein Giw1p, which is important for sorting scnRNAs to Twi1p (Woehrer et al. 2015).

Associated Literature

  1. Ref:29021213: Noto T, Mochizuki K (2017) Whats, hows and whys of programmed DNA elimination in Tetrahymena. Open biology 7(10):
  2. Ref:26688337: Kataoka K, Mochizuki K (2015) Phosphorylation of an HP1-like Protein Regulates Heterochromatin Body Assembly for DNA Elimination. Developmental cell 35(6):775-88
  3. Ref:25588944: Woehrer SL, Aronica L, Suhren JH, Busch CJ, Noto T, Mochizuki K (2015) A Tetrahymena Hsp90 co-chaperone promotes siRNA loading by ATP-dependent and ATP-independent mechanisms. The EMBO journal 34(4):559-77
  4. Ref:22103557: Mochizuki K (2012) Developmentally programmed, RNA-directed genome rearrangement in Tetrahymena. Development, growth & differentiation 54(1):108-19
  5. Ref:21915788: Kataoka K, Mochizuki K (2011) Programmed DNA elimination in Tetrahymena: a small RNA-mediated genome surveillance mechanism. Advances in experimental medicine and biology 722( ):156-73
  6. Ref:20211138: Noto T, Kurth HM, Kataoka K, Aronica L, DeSouza LV, Siu KW, Pearlman RE, Gorovsky MA, Mochizuki K (2010) The Tetrahymena argonaute-binding protein Giw1p directs a mature argonaute-siRNA complex to the nucleus. Cell 140(5):692-703

Sequences

>TTHERM_01276320(coding)
ATGTAAAGTTTTGTAAATCTTATCTAACTGGAAGAGAACTATAACTTAAGTCTTTTGTCT
TATTCAAACTCTATAAGGTAGTATCTATTAGATAACAAAGTGCACGAAGATAAATACATA
TAGCTCATGAAAGACATCAAAGATTTGTTTTCGTCTCCTACTTTTTTGATGCCAAATTTC
TCTGACAAAAGAAAATAATTTTTCTCATAATTATGCTTAATTGCTTTTGATTTTGCTAAT
AATTAAGTTACTGAATAATAATCTTTGAGTGAATTTAGAAAAAAATTCAAATTTCCTTTT
GTAATAATTGCTATTATTTACACTAAACTTTTAGAGATAAAAGAAGCCTTACCTGAAGAT
TTCTTAACTCTAGTGGATTGTCACTTCAAAAATAAAGGTCCTTAAAGTATATTTGCCTCT
TTGACATTGATTTCTTTATTTTTGAATGAAGTAGATTAATATGAAATAGATTGTGACCAT
ATTGAATCTTCAAATACATTAAGTAGTTGTAGCGAGGCTGCAGAGTCTAATATTCCTAAA
AAGGTCAATATAACTGTAAAGACAGTCTAAAATTTCTTTGATAAATAAGGATTATAGATG
ATAGCATTTCCCTTAAATGTTATCAAAAATATTCACTGTGTAGCACATGATCAATAGAGT
ATTATCCAGCTATTGCTAAAAATAGTTGTGATAATAATTAAAAACATGAGTAACAAAATC
AAATAAGAGTTTTTTTATTTTCATTAGAAGGATTTAAATGTGATTCTTTCATGTTTTATA
GGCTTTTTGTAGTAAAATAACTAGGCTAGAGAAGATCGCGATGTAGCTTTAGCAAATATT
TTTGAATTTTGCGAATTGCTAGCTAAATCTACTTCACCTGCTTAATTATACGTTGCGTTT
AAAGATTTTTTAGTTTATATTTCATAGAATTTTTCATTTGCTAATGATAGTATAGAATAC
TTTGACTTCAATTCTAAGTGTGTGGATTTTTTAGTTTCTATTACTCCATGCTTTATTTAA
TAGTCTGAGAATTTATCTGCATATCCTTTAATAATATAGTTATTGAAGTAATCTGCTAAA
ATAAATCTTGTGAATTTAGAGGATTAGATAGGCTGCTTGCATATATGGAGCCATTATTCT
GACTAGTTCATTCAGGCTTACGATAATAATAATAATTCAATAAAAGCTGAAACAATTAAT
AACTTAGCTATTCTGAATTCTACTTTTATTGAATCTCTACAATTTGATATAGAGCTATTA
TTTAATTTGTAGATAAAAGATCATGATTCTGAAGATGTTAATTAATTTGTGGACCAACTA
TCCCGCTTAGTTATTCATTCTAATCTCATTGATAACCAATTATTTGTAGAAGTAATAAAA
TCTTTGAGTCTACTTTATTAGAAAAATATGCTCCTTTATTATACTTTCCAAAAATGTTTG
ATGAAGTAGTACCTTAATTCTAAAGATACTCTCAGCTAAATTTACTAAGTTTTTGGCAAG
AGTAATGATTTTCTTTAGATTACAGAATTGTTATTTGAATCTTTTAGTTAAGCACAAAAA
TAATTTGCAAATTTAGATCTAAATACCATAGCTGCTATTGAAAAATTTACATAGTTCATG
TCTTAAATAGGTGCAAAGCTGTTTAATACTTAAATATCTCATCTTGAGTAGTCTTAAATT
TTGGGAATATTTCAAAAATATATTTTGAACCCAATTAAAATGTTTAATTTAAATATATTT
TCTTAATTACCTGAAAATTTTATACAGCTTAATGAAGTTTAATTTAGTCAAGTCTGCACA
ATGATGGAGTCAGTTCATTACTTTATTTTCTCTGACAATAAAAGCAATTCAGATTAAGTT
TTTGAGACAGAGGTTGATGTTTCTATGATAAAAAAGATATTGTTATTCAATTAATCAGTT
AACTAAGACATGGCCTACTGGATTAACCCACAATTAAAGAATGAAAGAAAAAAAATAAAA
TAATTCTACCAAAGTACAATTTATTGGGTAATATTTGCTTCAATTAATCTTGAAAATGCT
GCTAACATATTTGAAAGCTATTTCTTTTAGAAAGAGTTCAATATTTGGGTATTGAATTCT
ACTATCAAAAAGCTCAAAGGTAGGATATTACCAAACACATTTCTGCTTTACTTGTGTTAC
TATTTAAAATCCCTCACTGACTCTGATAGTTTTAGCAAAATTCCTAAGTAAGAGCTATTA
GAAAACTCTCAGATCTATAAAACTATTTCTCTTTACTTAAATCTGGCAATTAGATTTAAA
ATGGATTTTCTTGAGAAAGAAGAAACTTAGTCAGAAAATTCTCACTATTTTAATTTCATT
CTAGAGATATTAGACCACATGTATTTTACTAATAAAAAAATTGTGCTTGATTTTTGTTAA
AAGATATTGAATTATTTTGATTAAGATTGCTATAATTAAAACATTATTTAATTAGCTTAA
TCTAGCCAAACTTTTTAAAACATCACTCTTTAGCTTTTTACTAATATTTGGGAGTAAATC
TTCAATTTTTGTTCTAGTAGCAATGAAAAGGCAGAAGAGTTTAAAGAAAAAGATATTAGC
TAATCTATTGATTTTATTTTAAAATTCTCTAAGTGTTTATAAGGTAACTTGTCAATAATT
TAAGACCGTATTATGCTTGTTATAAAAGCCCATCCTATTTATAGTTCGAATTCTCAAATT
ATTTATTCCACTATCATAGAAAATTTGGTAATTAAAGAAATAGATGGAGTTAAGGTTCTT
TAAAATGTTTTTTTAAAATCTATAATTAAAGACTTACAGATTTGGGCTAAATCTATATGT
CCTTAGAGATTACAAAGCTGA


>TTHERM_01276320(gene)
ATGTAAAGTTTTGTAAATCTTATCTAACTGGAAGAGAACTATAACTTAAGTCTTTTGTCT
TATTCAAACTCTATAAGGTAGTATCTATTAGATAACAAAGTGCACGAAGATAAATACATA
TAGCTCATGAAAGACATCAAAGATTTGTTTTCGTCTCCTACTTTTTTGATGCCAAATTTC
TCTGACAAAAGAAAATAATTTTTCTCATAATTATGCTTAATTGCTTTTGATTTTGCTAAT
AATTAAGTTACTGAATAATAATCTTTGAGTGAATTTAGAAAAAAATTCAAATTTCCTTTT
GTAATAATTGCTATTATTTACACTAAACTTTTAGAGATAAAAGAAGCCTTACCTGAAGAT
TTCTTAACTCTAGTGGATTGTCACTTCAAAAATAAAGGTCCTTAAAGTATATTTGCCTCT
TTGACATTGATTTCTTTATTTTTGAATGAAGTAGATTAATATGAAATAGATTGTGACCAT
ATTGAATCTTCAAATACATTAAGTAGTTGTAGCGAGGCTGCAGAGTCTAATATTCCTAAA
AAGGTCAATATAACTGTAAAGACAGTCTAAAATTTCTTTGATAAATAAGGATTATAGATG
ATAGCATTTCCCTTAAATGTTATCAAAAATATTCACTGTGTAGCACATGATCAATAGAGT
ATTATCCAGCTATTGCTAAAAATAGTTGTGATAATAATTAAAAACATGAGTAACAGTATA
GATTTCACTTAAATTTACTTTTAAAATATATTAAATTATTTTTTTAATTAATTTAGAAAT
CAAATAAGAGTTTTTTTATTTTCATTAGAAGGATTTAAATGTGATTCTTTCATGTTTTAT
AGGCTTTTTGTAGTAAAATAACTAGGCTAGAGAAGATCGCGATGTAGCTTTAGCAAATAT
TTTTGAATTTTGCGAATTGCTAGCTAAATCTACTTCACCTGCTTAATTATACGTTGCGTT
TAAAGATTTTTTAGTTTATATTTCATAGAATTTTTCATTTGCTAATGATAGTATAGAATA
CTTTGACTTCAATTCTAAGTGTGTGGATTTTTTAGTTTCTATTACTCCATGCTTTATTTA
ATAGTCTGAGAATTTATCTGCATATCCTTTAATAATATAGTTATTGAAGTAATCTGCTAA
AATAAATCTTGTGAATTTAGAGGATTAGATAGGCTGCTTGCATATATGGAGCCATTATTC
TGACTAGTTCATTCAGGCTTACGATAATAATAATAATTCAATAAAAGCTGAAACAATTAA
TAACTTAGCTATTCTGAATTCTACTTTTATTGAATCTCTACAATTTGATATAGAGCTATT
ATTTAATTTGTAGATAAAAGATCATGATTCTGAAGATGTTAATTAATTTGTGGACCAACT
ATCCCGCTTAGTTATTCATTCTAATCTCATTGATAACCAATTGTAATTTTTTAGTTTACT
TTAAAATATAGTAATGTTTAATTATCTTTTTTGTTTATTTATAAAAATATTAATTAGATT
TGTAGAAGTAATAAAATCTTTGAGTCTACTTTATTAGAAAAATATGCTCCTTTATTATAC
TTTCCAAAAATGTTTGATGAAGTAGTACCTTAATTCTAAAGATACTCTCAGCTAAATTTA
CTAAGTTTTTGGCAAGAGTAATGATTTTCTTTAGATTACAGAATTGTTATTTGAATCTTT
TAGTTAAGCACAAAAATAATTTGCAAATTTAGATCTAAATACCATAGCTGCTATTGAAAA
ATTTACATAGTTCATGTCTTAAATAGGTGCAAAGCTGTTTAATACTTAAATATCTCATCT
TGAGTAGTCTTAAATTTTGGGAATATTTCAAAAATATATTTTGAACCCAATTAAAATGTT
TAATTTAAATATATTTTCTTAATTACCTGAAAATTTTATACAGCTTAATGAAGTTTAATT
TAGTCAAGTCTGCACAATGATGGAGTCAGTTCATTACTTTATTTTCTCTGACAATAAAAG
CAATTCAGATTAAGTAATAACTTTTAAATTAAAAATACTTTTAAAAATTCCTTTTTAAAT
AAAATTTAAAGGTTTTTGAGACAGAGGTTGATGTTTCTATGATAAAAAAGATATTGTTAT
TCAATTAATCAGTTAACTAAGACATGGCCTACTGGATTAACCCACAATTAAAGAATGAAA
GAAAAAAAATAAAATAATTCTACCAAAGTACAATTTATTGGGTAATATTTGCTTCAATTA
ATCTTGAAAATGCTGCTAACATATTTGAAAGCTATTTCTTTTAGAAAGAGTTCAATATTT
GGGTATTGAATTCTACTATCAAAAAGCTCAAAGGTAGGATATTACCAAACACATTTCTGC
TTTACTTGTGTTACTATTTAAAATCCCTCACTGACTCTGATAGTTTTAGCAAAAGTAAAT
TAATTTTATTCATTTATTTATTTCACAAATTTTTTAGTTGTTTAAAAGAGTGAATATGAA
GAAAAATTTAGAAAATTAATGGTAAATATTTCTAAATCTGTACCTTCTGAGATATATGTA
GATTACTCTAAAATTTAGTACTATCTTTAATTATACATTAATGAAGAGTGTTAAATGTTT
AGATTTTAAATATTAAGTGACTAGACAGTCAGCTTACTGACATTAGAAAACAGATTTTCT
CATGTTTATAAAGTATTTATAATATTAGAAGATCTCTTTACAATTGTTTAGAGATTTCCT
AAGTTTTATTATGAAAATACATTTATGGGTCTAAAAAGGAATTTCTTTTTAAATCGTGTT
TTTTGGATTATTGTTAAATGCTTTACAATAGTTCCTAAGTAAGAGCTATTAGAAAACTCT
CAGATCTATAAAACTATTTCTCTTTACTTAAATCTGGCAATTAGATTTAAAATGGATTTT
CTTGAGAAAGAAGAAACTTAGTCAGAAAATTCTCACTATTTTAATTTCATTCTAGAGGTA
TTTAATTTATTTTAATCTAAATTATTTTTATTTAAATTTATTTTTTAAAAAGATATTAGA
CCACATGTATTTTACTAATAAAAAAATTGTGCTTGATTTTTGTTAAAAGATATTGAATTA
TTTTGATTAAGATTGCTATAATTAAAACATTATTTAATTAGCTTAATCTAGCCAAACTTT
TTAAAACATCACTCTTTAGCTTTTTACTAATATTTGGGAGTAAATCTTCAATTTTTGTTC
TAGTAGCAATGAAAAGGCAGAAGAGTTTAAAGAAAAAGATATTAGCTAATCTATTGATTT
TATTTTAAAATTCTCTAAGTGTTTATAAGGTAACTTGTCAATAATTTAAGACCGTATTAT
GCTTGTTATAAAAGCCCATCCTATTTATAGTTCGAATTCTCAAATTATTTATTCCACTAT
CATAGAAAATTTGGTAATTAAAGAAATAGATGGAGTTAAGGTTCTTTAAAATGTTTTTTT
AAAATCTATAATTAAAGACTTACAGATTTGGGCTAAATCTATATGTCCTTAGAGATTACA
AAGCTGA


>TTHERM_01276320(protein)
MQSFVNLIQLEENYNLSLLSYSNSIRQYLLDNKVHEDKYIQLMKDIKDLFSSPTFLMPNF
SDKRKQFFSQLCLIAFDFANNQVTEQQSLSEFRKKFKFPFVIIAIIYTKLLEIKEALPED
FLTLVDCHFKNKGPQSIFASLTLISLFLNEVDQYEIDCDHIESSNTLSSCSEAAESNIPK
KVNITVKTVQNFFDKQGLQMIAFPLNVIKNIHCVAHDQQSIIQLLLKIVVIIIKNMSNKI
KQEFFYFHQKDLNVILSCFIGFLQQNNQAREDRDVALANIFEFCELLAKSTSPAQLYVAF
KDFLVYISQNFSFANDSIEYFDFNSKCVDFLVSITPCFIQQSENLSAYPLIIQLLKQSAK
INLVNLEDQIGCLHIWSHYSDQFIQAYDNNNNSIKAETINNLAILNSTFIESLQFDIELL
FNLQIKDHDSEDVNQFVDQLSRLVIHSNLIDNQLFVEVIKSLSLLYQKNMLLYYTFQKCL
MKQYLNSKDTLSQIYQVFGKSNDFLQITELLFESFSQAQKQFANLDLNTIAAIEKFTQFM
SQIGAKLFNTQISHLEQSQILGIFQKYILNPIKMFNLNIFSQLPENFIQLNEVQFSQVCT
MMESVHYFIFSDNKSNSDQVFETEVDVSMIKKILLFNQSVNQDMAYWINPQLKNERKKIK
QFYQSTIYWVIFASINLENAANIFESYFFQKEFNIWVLNSTIKKLKGRILPNTFLLYLCY
YLKSLTDSDSFSKIPKQELLENSQIYKTISLYLNLAIRFKMDFLEKEETQSENSHYFNFI
LEILDHMYFTNKKIVLDFCQKILNYFDQDCYNQNIIQLAQSSQTFQNITLQLFTNIWEQI
FNFCSSSNEKAEEFKEKDISQSIDFILKFSKCLQGNLSIIQDRIMLVIKAHPIYSSNSQI
IYSTIIENLVIKEIDGVKVLQNVFLKSIIKDLQIWAKSICPQRLQS