Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_01435670

Standard Name

GLC3 (GLyCogen branching enzyme 3)

Aliases

PreTt03614 | 388.m00008

Description

GLC3 1-4-alpha-glucan branching enzyme from glycoside hydrolase family GH13 protein putative; Alpha amylase; catalytic domain containing protein

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External Links

• Uniprot
• Alphafold

Gene Ontology Annotations

Molecular Function

• catalytic activity (IEA) | GO:0003824
• cation binding (IEA) | GO:0043169
• hydrolase activity, hydrolyzing O-glycosyl compounds (IEA) | GO:0004553

Biological Process

• carbohydrate metabolic process (IEA) | GO:0005975

Domains

• ( PF00128 ) Alpha amylase, catalytic domain
• ( PF02806 ) Alpha amylase, C-terminal all-beta domain
• ( PF02922 ) Isoamylase N-terminal domain
• ( TIGR01515 ) 1,4-alpha-glucan branching enzyme
• ( TIGR02104 ) pullulanase, type I
• ( TIGR02402 ) malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase
• ( TIGR02403 ) alpha,alpha-phosphotrehalase
• ( TIGR02456 ) trehalose synthase

Gene Expression Profile

Vegetative Cell Cycle (Zhang et al., 2023)

GeneMania

No results were calculated for this gene in GeneMania.

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for Tetrahymena Stock Center

Homologs

Source	Identifier	Score
Stentor Coeruleus	SteCoe_31581	0
	Description: None
WormBase	WBGene00011409	9.997093137033517e-262
	Description: status:Confirmed UniProt:Q22137 protein_id:CAA84727.1
Tetrahymena borealis	EI9_09467.1	9.997093137033517e-262
	Description: alpha amylase, catalytic domain-containing protein (808 aa)
DictyBase	DDB_G0274105	9.997093137033517e-262
	Description: glgB on chromosome: 2 position 4089271 to 4091779
Oxytricha	Contig22093.0.g31	9.997093137033517e-262
	Description: Alpha amylase, C-terminal all-beta domain
SGD	YEL011W	9.997093137033517e-262
	Description: GLC3 Glycogen branching enzyme, involved in glycogen accumulation; green fluorescent protein (GFP)-fusion protein localizes to the cytoplasm in a punctate pattern

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

No Data fetched for Associated Literature

Sequences

>TTHERM_01435670(coding)
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>TTHERM_01435670(gene)
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TAAAAAATAATTAATTGAAATTTCTTTTTAAAATTTAATTTGTTTTTTTTAATTAAAAGT
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CCTTAGTCGGAGATAAAACTCTTTCCATGTGGCTTTTTGATGCTGTAAATAAATTTGATT
AATAATAAATATATTTTATTCTTTAAATTAAAATAAAAGTAAATTTATGAAAATATGAGC
ACTCTTTCTCATGAAACTCTCACAGTAAATAGAGGTATTGCTCTCCATAAGATGATCAGA
TTAATAACAATTGCCCTTGGAGGAGAAGTATTTTAATTTAACTTTTAACAAATATTTATT
GAAAATATTTCTATTTTCTTAGATAAATTGTTATTTTTTTTCATACTAAAATTGATTTTT
GTAATAAAAAGGGTTATCTTAACTTTATGGGTAACGAATTTGGTCACCCAGAATGGATTG
ATTTCCCCAGATAAGATAATGGCTGGAGCTATCATCATTGTCGTAGAAGATGGGACTTAG
TAGATGACTAACTTCTCAGATTCAGATTCTTTAATGTAAATATTAAAAAAATACTTTATT
TGTTGAATGAAATTTATTTATTAAAAGAATTTCGATAGAGACATGATTCATCTTGAAAGT
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GTTATTGTTTTTGAGAGAGATAATCTTCTTTTCGTATTTAACTTCCATCCTACACAAGTA
AAATTAACAGCTTTATTAATAACAAGTTATTTATTCAAATCTTTTTAAAAATTCATTAGA
GCTTCGAAAATTATAAAATCGGTACCAACATTGCTGAAGATCATTTAATTATTATGGATA
CTGATGAGGTAATTAATTTTCACATTTAAAAAAATATATTTCAATCAATAGCTTTTAATA
ATATATATTTCTATTATTATAATAGCCTCATTACGGTGGTCATGATAGAGTTAGAGCTGG
ACATGAAAAGCCTTTCCCTTATATTTAAGAAAACTTTAATGGTAGACCCTATTGCTTAAA
CGTGTATATACCATCAAGATGTGCTATGGTTTTAACATCTGTAAGCTAAGCACATAATTA
CTGGAACTAAAAAAAGTTACTTAATGAAGCCAAAAAGCATCACTGA

>TTHERM_01435670(protein)
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