Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00339610

Standard Name

RPN1 (26S proteasome regulatory subunit N1)

Aliases

PreTt06102 | 34.m00339 | 3689.m00133

Description

RPN1 26S proteasome regulatory subunit; Proteasome/cyclosome repeat family protein

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Gene Ontology Annotations

Biological Process

Domains

  • ( PF01851 ) Proteasome/cyclosome repeat
  • ( TIGR01752 ) flavodoxin
  • ( TIGR03338 ) phosphonate utilization associated transcriptional regulator

Gene Expression Profile

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for Tetrahymena Stock Center

Homologs

Source Identifier Score
Stentor Coeruleus SteCoe_14790 0
Description: None
Tetrahymena borealis EI9_15097.1 9.997093137033517e-262
Description: proteasome/cyclosome repeat family protein (883 aa)
DictyBase DDB_G0293752 9.997093137033517e-262
Description: psmD2 on chromosome: 6 position 3279468 to 3282352
Oxytricha Contig7554.0.g32 9.997093137033517e-262
Description: Proteasome/cyclosome repeat
WormBase WBGene00004458 9.998707956568768e-117
Description: locus:rpn-1 status:Confirmed UniProt:Q9GZH5 protein_id:CCD62025.1
SGD YHR027C 5.0021648428951944e-116
Description: RPN1 Non-ATPase base subunit of the 19S regulatory particle of the 26S proteasome; may participate in the recognition of several ligands of the proteasome; contains a leucine-rich repeat (LRR) domain, a site for protein-protein interactions

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

  1. Ref:21637855: Xiong J, Yuan D, Fillingham JS, Garg J, Lu X, Chang Y, Liu Y, Fu C, Pearlman RE, Miao W (2011) Gene network landscape of the ciliate Tetrahymena thermophila. PloS one 6(5):e20124

Sequences 

>TTHERM_00339610(coding)
ATGTCTGACAAAAACAAAATGGAGGAAGAAAAGCCTGTTGCTGAGTAACCTAAGAAAAAC
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AAAAATTGGGGTTATGAATATCTTAATCATTTATCAGCTGATATTGGATAAACATACAAC
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GAAAATAAAGCTATAGATATCAGAGTTGGACAAGCTGTAGATGTTGTTGGTCAAGCTGGT
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ATTATCATAGTATAGAAAAATCCCGATTATGTTCCTGAAGAAGAAAGTAAAAATAAAAGA
AAGCAATGA


>TTHERM_00339610(gene)
ATGTCTGACAAAAACAAAATGGAGGAAGAAAAGCCTGTTGCTGAGTAACCTAAGAAAAAC
AATAAAAAGGATAAGAAAGAAAAGGAAGACGAACTCGTAAAACAAATTTCACAATTAAAT
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AATATTGCATAATCAATTTGTAGCAAAATGCAAGCTAGGTTAATGAGTATTGATAAAAGG
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ATATTGTGTAGATTAAAATGAAATGGAAGAAACCTTAAAAGTTAATTATGAAATAGCATT
GTCACTTTAACTTTATGTTAGCGCATTGAGATTAGCCATTAAGTTAGATGATATTGAAAA
AATTAAAGAAGTTTTCTAAAGTTGTAAAGATAAATTAATTTTAAAATAACTCTGCTACCT
TATTGCCAGACAAAGAATTGTTCTTAGCGAGTTAGACCTTGATGAAGATCTTTTAAAAAT
TGCTTCCAACTAGCATCTCACTGATTTTTATTTGCGTTTTGCCAAAGAATTAGATGCCTT
AGAACCCAAAAAGCCCGAATAGGTTTATAAATCTGTCCTTGAAGATAATAAGGCATAAAT
TGATTCTTTAAATGCCAATATTGCAGATACTTACGTAAATGCTTTTGTCAATATGGGTTG
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GAAAACCGGTATTGCTGCTGCTACTTCTTCAATCGGTTTGATTGATATGTGGGATATTGA
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CACTGCACTTAGAAGGTAGAAGAAGACAAGGTATTTATTAGTTAAATAAACTATTGAGTT
TAAATTAAAATATTATCATATTTATAAAAGTCTGCTTTCTAATAAGCTGCAATTGTTTCT
CTTGCTTTGATAAGTTCAAGTGAAGGTATTGGTAATGAAATGGCTCACCGCTCATTAAAT
CATATTTTATAATACTGTGAATTACCTGTTAAAAGAGCAGTTCCATTAGCTCTCGCAATT
TTAAATATTTCAAATCCTAAAATTAATGTTATGGATCTCTTATTAAAATTCAGTCATGAT
GATGACTAAGAACTCAGCTAGAGAGCCATCTTCTCTATGGGTTTAGTAGGTGCTGGTACC
AATAATTCAAGATTAGCTGATATTTTGAGAAATTTATCATCAACTTATAAGTAAGACAGT
AGCAATAAATTCTTTATCAGAATTGCTTAAGGTCTTGTTTAGATGGGAAAAGTAATTAAT
ATCTAAAAATTTTGCAATTAATGTATTAAAAATTAATTAATTAATCAATTAGGGTATGGT
AACATTGTAACCTTACTATTCTGACAAATTCTTGTTGAACAAGGTCGGATTATCTGGCAT
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GAAAATGGTGAAAATAAAGCTATAGATATCAGAGTTGGACAAGCTGTAGATGTTGTTGGT
CAAGCTGGTAAGCCTAAGAAAATTACTGGTTTCTAAACTCATCAATCACCTGTCCTTATC
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AAATAAATAGAGCTGAGTTAGGAAGCGACGAATATATTCCTTTATAAGCAACTGTTCTTG
AAAATATTATCATAGTATAGAAAAATCCCGATTATGTTCCTGAAGAAGAAAGTAAAAATA
AAAGAAAGCAATGA


>TTHERM_00339610(protein)
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