Identifiers and Description
Gene Model Identifier
TTHERM_00530720Standard Name
Aliases
PreTt04735 | 67.m00250 | 3684.m00120 | MicNup98B | Nup96Description
Nucleoporin peptidase S59-likeGenome Browser (Macronucleus)
Genome Browser (Micronucleus)
External Links
Gene Ontology Annotations
No Data fetched for Gene Ontology Annotations
Domains
- ( PF04096 ) Nucleoporin autopeptidase
Gene Expression Profile
Vegetative Cell Cycle (Zhang et al., 2023)
GeneMania
Tetrahymena Stock Center
No Data fetched for Tetrahymena Stock Center
Homologs
No Data fetched for Homologs
General Information
No. Gene Name(s) Paragraph Text 2295 (no standard gene name) The first 2769 bp and later 3243 bp of TTHERM_00530720 (6012 bp) were expressed for MicNup98B and Nup96, respectively. 2296 (no standard gene name) The first 2769 bp and later 3243 bp of TTHERM_00530720 (6012 bp) were expressed for MicNup98B and Nup96, respectively.
Associated Literature
- Ref:25788697: Iwamoto M, Koujin T, Osakada H, Mori C, Kojidani T, Matsuda A, Asakawa H, Hiraoka Y, Haraguchi T (2015) Biased assembly of the nuclear pore complex is required for somatic and germline nuclear differentiation in Tetrahymena. Journal of cell science 128(9):1812-23
- Ref:19375312: Iwamoto M, Mori C, Kojidani T, Bunai F, Hori T, Fukagawa T, Hiraoka Y, Haraguchi T (2009) Two distinct repeat sequences of Nup98 nucleoporins characterize dual nuclei in the binucleated ciliate tetrahymena. Current biology : CB 19(10):843-7
Sequences
>TTHERM_00530720(coding)
ATGATAAACAATCTGTTTGCGAATAATAACACTAACTAGCCAAATATATTTCAGAATAAT
AATAACTAAAACAACAATAATAATAGCAGTAATATCTTTAATCGCAGCGGCTAGAACATA
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GGTGGAGCTTAAAATAATAATATTTTTAACAACAATAACTAAAATATGTACTAAAACAGT
AATAACCCTAATGCTTTGATAGGTTCTTAAAGAGGTAAGTATGAATTAACAAAATCTCCT
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AGAACAGGCAAATTATCTGATGCTGAAAAATAAAAAATAACTAGCTCAATATAAATAAAC
TCCTTTAACTAAAATCTTATTACCAACCTTCCTTAAAACTTTTAACCTCCAAACACTTAA
GCATTAAATAAAGACATTCGCATGGTTTAAAGTTAATATGTAGGTAATGTGAATAATAAT
AATAATATTTTTAACAATAACAACAATAACGGTAATAATAACAATATATTTGCAAATAAT
AACAATGTAAACAACTCAGTTAATCGGAACATTTTTAATAACAACAACATTAGCACTAAC
AACAACATTAACAATAACAACAATGGCAATATATTTAATAATAATAATAATAACATGAAT
AATAATGGAGGAAATATCTTTTCTGGAAATAATAATTAGAATAATAATGTAAATAACATA
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AACAGCACTAATAACACTAGCAATATTTTCTAAAATAATAATACAAATATGGGAAACAAC
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GAATAAGAAGCTGAAGATAAAAAGGTAGTTAAATAATCGTATTTTATGCCATCATTTTGT
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GTTTAAGAAGAAAAAGGGATAAGAAAGTTAGCAAAGTCACTTCTTCCTCTTTAAGAAACT
ATAGCAAAAACTTAAAGAGGCCATTCTTCAGAGACTACTTCAAATGGAAAAAATGATTCA
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AAATAGCCCGCCTAAGAAACAAAGGGTAGAGAAATGTACGCTAGATAGCAACTATCCCAT
ACGAACCCAGTTAGCATTAAAGTTGAAGTACTTTGTAGCACTCTGGAAGGAGAAGAAGAG
GAAATTACTTTAGAGAACTAAATAGATACACTAAGTAAAATAAAATAAATAGGATTATAT
TGTAAAGACCATTTACTAAAAATGGGTAAAATGAAAGAAGACTCTCGTCCTTACTCATTT
TAAATTTATTATGATGGAAGTCTCATTAGAAACCAAGAATTACTAGCAAGTGATGTCTTT
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GAAGGAATAAATAATAAATGTATGATCACATATAAGAATGCATCTTCAATACAAAGGAAA
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GAATAAAATGTCTAATTTGTTAAATTTGATCAAAAAAATCTAACTTGGACAATATTAGTT
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GGACAGGATTCTGCTGCTAATTTATAAAATGTATCAAGCAATTCAAATTCTAGATCAAAT
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ATAAATAGCTCTTACTAATAGCTTCCGATGAGATAACATATTTAAAATTCTAACTAATTT
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ATGAGAGAGCAATAGAATGTTAGCAAGTCTTAGGAAAATTCATTTATTCAACAAGATTAT
CCAATTACTTCTCATTAACAATAAAACAGCAACTACTAAATGAATGAACATAATTAATAT
TAAAATTAACCTAGTTATATGAATCGCGGCTAATTATAGCAATAACAATATTATGGAACT
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ACTTAAGCAGATATTGATACTTTGAAATCTTAAGCTTAAGAATTAATTGAGCCTGTTTAT
CAGTTGCCAAAGACTTCATATTAGTAGTTCTTACGCTAGCAAAATAATGAAGAATAATTT
GTAAATTTGTAAAACAAGTAGAAGCCCTTAAATAATTTTAAAGATTTTAAAACTAGAGTA
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CTTTACTAACACTCAGTAAAGGAGTACACATTTAAAGGGAAGAAATTTTACAATGACTTT
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ATTAAAAAGCACACAATTCTTCCAAACAATATGGGAAGGATAAAAATTAAAGATAAATAG
AGAGATTAAATTGAGAAATATAACAACATAGTCATTAACGGATTTTTATAAAGTATTATT
GATAGTTAAGCAACTAATGTAATAGAAAATATAGATCAAATCACTAAATTATATACCAAA
GACTAAGGAATGTCTGATACCTAGATTTGGAGCACTCTTCCTGAAATAAAAATTCCTACA
GATAACCAATACACATTATTTTTAATTATCTATATAAAAAATTATCTTTTACCAGTTTTA
AGTGCATCAAAAAATAATCAAAACGATTTATACCAGTCTTTAAAAGAAGAACTAAGTATA
CTTATCATGGTCAATATACTTTTTGGTAATCCTTAAATAGATGTTATCTCGATTTTAAAG
AAGGTAAATAAAAATTCATTTAGTGAAAATCAATGGAAGGTACTCTTTGAAGGTCTAAGA
AATAACAAGATGAATTAAAATGAAAAAGTTGTACAAAATTTGAGAAAGAAATAACTAAAA
AAGTACTTTGAGTGGAAATATTCTGAAAATAAAGTCTAAATTAATGAGTAAAGAGCATTC
TTAGATATGAAGGAAATGAAAACTCAAGAAGAAGTTGAAGATGCTATAATTTAATGCCTC
AAGAATCATTAAATTTAAAATGCTATTTAATTAGCTGATAATTATAAATTACATACTATA
AGCCATCTTTTAACAACTTTTGAATAAGGATCTGTTGAAAATTAGATAAAATAGCTTAAT
CAAGATAAATACCAAAACTTTAATAGAATAATTAATTTTGTTAGCGGCAATTTAGAAGAA
TTGTACAAATAAAGCTAGAGAAATGAAATATCAAATTTAAATAAATTTGCTTGTGAAATT
TGGTATTAAAAAAATTAGAGATAGAGTTTAGCAGAAACTTTTGATTAATTTGTATAAAAA
GTAGATAAATAAATATATGATGTTGATTCAAGATAATAAATAATCTCATTAGAAATTCTT
CTATTGTCTCTTTATGCTTAGCATTAGTTAGGTGAAAATTATGTAAGTAAATAGCTTGTA
AATATCAATATATTTGCTTAAATAAATTCATAGTGTTATTCTTAAAACAGACTTGATAAA
CGTCTAAGTTGGTTTATTATTGAATTTATGAATAGCGTCTATTTTAGTAATGATAAAGCT
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AAGAAATGGAAATATGAATTAATAGTTTTGATAATAATGAAAGATATTATCAGAAAACCA
TAATTTATTTCTAGCATAAAGAATACATTCTTACGTAACTGTATTCCTTAAATAAGTTAA
GAAGATAAATCAGAAGTAGGCTAGCCAAATAATTTAAATAATAAATTCTTGATTTAATCC
AGCAACAGAGACAGTTCTTCTGATAATTCATTAGAAATCAACAAAAGTTTTCAAATTGAC
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CAATCCTTAGGATTGTATTATTATAATTCTCAAATTTATTAGTCTGCACTATATCACTTT
ATGAGAGATCCCAATTTAACATATTTAGATATTAGCAATAAAATATTAGCATACTATGAA
GGACCTCGTATATATTTATTTGGTGAATAGAATGAGCGCTAAGAGATTGAAAAGTACTTG
GAACAGATTGCAAAAAAAGCAAATTTAATTTTCAAATACAAGTATTAATCTGGGTTAATA
AAAGAAGTTTTTTCCCTTTTGCAAAGTAATAACTAAGACCAATATAAGCAAGAATATATA
AATGGCATTATAAATCTTAAAGATCTCCTATTAGAAACTCAAAATGTGTTAAATTTAGTT
ATTTATCCCCATCAATATCAAGTTATAGTAGATAATTAAGAATTTTAATCTAAGAATAGA
AGACTACAAAGTAAGACTGATGATTCAGTAACAACTTTAGACAATGGCGGAATGCTCTTC
TAAGAATTTATTTCTTTCATATTCTAATAACTTGCAGAAAAGGTACCAGATATTAGAAGA
TATTCTTAACATTATTAAACTTCTGGTGATATTCAACAACTCTTAGAAATAGTATCTGAG
CATAAAGCCCCTAAAAATGAATAAATAAAGCACCTCATCCTATCAACTTTAAAATAAAAT
TAATATATGTGA>TTHERM_00530720(gene)
AGTAAAAAACTTAATAGAATTTGTGTTTTTTTATTTTAAAGATAGGAACAATAAATAGCT
GTTTAATAATAGTGTGTCTCTTACAAACATCTTTAAAAGTTACTCTATTTGATAATCAAT
TTAGCAATTTGATAAAGTTTTTACAGTTTAACTAATTTTATCTCGTCTGATATTTCATAA
TTATTATTAAAATTATATTTAGCGTAAATGATAAACAATCTGTTTGCGAATAATAACACT
AACTAGCCAAATATATTTCAGAATAATAATAACTAAAACAACAATAATAATAGCAGTAAT
ATCTTTAATCGCAGCGGCTAGAACATATTCCAGTCATAGAATAATAACGGATAAGTAAAT
ATCTTTAACGCCAATAATAATAATAATTAAGTAGGATACTAGAACTAGAGTTAAAACATC
TTTTAGCAAAATAGTAACATGAATAATGCCAGCAGCAGCAACAACAACAATATTTTTGGA
AATAACATAAGTAATAACAACAATTATGGTGGAGCTTAAAATAATAATATTTTTAACAAC
AATAACTAAAATATGTACTAAAACAGTAATAACCCTAATGCTTTGATAGGTTCTTAAAGA
GGTAAGTATGAATTAACAAAATCTCCTCACACTGAAACTTAATAAAATAATCAAGCGGGA
GTAATAATGAATACAAGTATTATTTTCTGTAAAGGATTTGAAAAAATGAATCCTTTGTTG
GTAAGGCTCGAAGATTATTACTTGATAAGAACAGGCAAATTATCTGATGCTGAAAAATAA
AAAATAACTAGCTCAATATAAATAAACTCCTTTAACTAAAATCTTATTACCAACCTTCCT
TAAAACTTTTAACCTCCAAACACTTAAGCATTAAATAAAGACATTCGCATGGTTTAAAGT
TAATATGTAGGTAATGTGAATAATAATAATAATATTTTTAACAATAACAACAATAACGGT
AATAATAACAATATATTTGCAAATAATAACAATGTAAACAACTCAGTTAATCGGAACATT
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TTTAATAATAATAATAATAACATGAATAATAATGGAGGAAATATCTTTTCTGGAAATAAT
AATTAGAATAATAATGTAAATAACATATTTAGCTTTAACAATAGTTAAAACAACAATATG
AATAAATCTAATATCTTCAACAATGGGAACAGCACTAATAACACTAGCAATATTTTCTAA
AATAATAATACAAATATGGGAAACAACAGCATATTTTAAGGAAATAACAATAATAACAAT
AATAATATTTTTAGAAATGATAATTCTACAAATAATACTAATTTGAATATTTTTAGTAAT
AATAACAACAACATTAATAATAGTATATTTAGAAACAATAATAACAACAATACAAATATT
TTTAACAATGGTAATAATAATGGTGGGAACAATACTTCAAGTATCTTTAATAATAGTGGT
AGCAATAATAGTGTTAATATTTTCAGAAGTAATAACAATAATAATGGAGGTAGCATTTTC
TCAAATAATAATAATAGCTCAGTCTAAAACATATTCTAAAAAAATAACTCCTCAATATTT
AATAACAACAATAATAACGGAGGTAGCATTTTTAATAACAATAACTCAATATTTGGGCCT
AATGTTTAGGGAGGAAATATATTTTAAAATAACAACAATAATAATTTTAACAATGGAAAT
ATTTTTACAAATTATAACAATCCTTAAATGTACTAATCAAACCTTCCTGGACCTGCTAAC
GGATATTATTCTATTTAATCGGGTATGTATTATGCTCCAACAATCTAAACTGGTGATTTA
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TAATCGTATTTTATGCCATCATTTTGTCCTGAAGAATATGCTCCTGCTTTTAGGAAAAAG
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AAGTCACTTCTTCCTCTTTAAGAAACTATAGCAAAAACTTAAAGAGGCCATTCTTCAGAG
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ATGTACGCTAGATAGCAACTATCCCATACGAACCCAGTTAGCATTAAAGTTGAAGTACTT
TGTAGCACTCTGGAAGGAGAAGAAGAGGAAATTACTTTAGAGAACTAAATAGATACACTA
AGTAAAATAAAATAAATAGGATTATATTGTAAAGACCATTTACTAAAAATGGGTAAAATG
AAAGAAGACTCTCGTCCTTACTCATTTTAAATTTATTATGATGGAAGTCTCATTAGAAAC
CAAGAATTACTAGCAAGTGATGTCTTTCCTGTTAAGTTAGAAGCTACTTATTAGTGTGAA
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CCTTTGGAAGAGCTTCAGACTTATTCATTAAAAGAGTTGAAAAATGTTCATAATTTTAGC
GTAGAAGGTCATTATGGAAAGTTAGAGTGGTAAGAACCAGTTGACTTAACAGACTTAGAT
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AAAAATCTAACTTGGACAATATTAGTTGATCATTTTTCAGGATATTAATTTAATCTTGAT
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TCAAGCAATTCAAATTCTAGATCAAATCCATCTAAGTAGTAATAATTAATCTAAGGTTAA
CAATAATTTAATTAAGACTCGTAAAGAACTGCCAATTAGTAATTACAATAATAATAATTA
TAGGCTGAAAATTAGTTTTAACAAAAGATAAATAGCTCTTACTAATAGCTTCCGATGAGA
TAACATATTTAAAATTCTAACTAATTTAAGTAAATATATGGTTAAAATGAGCATTAGCCT
TCTGAAACATAAAAATATATCAATTAAATGAGAGAGCAATAGAATGTTAGCAAGTCTTAG
GAAAATTCATTTATTCAACAAGATTATCCAATTACTTCTCATTAACAATAAAACAGCAAC
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TTATAGCAATAACAATATTATGGAACTCATATTGATCCTTCTAATGATATTATAATTGAA
GAAGTTGAAAACGGATCATATAATAATACTTAAGCAGATATTGATACTTTGAAATCTTAA
GCTTAAGAATTAATTGAGCCTGTTTATCAGTTGCCAAAGACTTCATATTAGTAGTTCTTA
CGCTAGCAAAATAATGAAGAATAATTTGTAAATTTGTAAAACAAGTAGAAGCCCTTAAAT
AATTTTAAAGATTTTAAAACTAGAGTAGACCAACGCAAAAATAAAATATTTTAAAAAGAA
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GGAAGGATAAAAATTAAAGATAAATAGAGAGATTAAATTGAGAAATATAACAACATAGTC
ATTAACGGATTTTTATAAAGTATTATTGATAGTTAAGCAACTAATGTAATAGAAAATATA
GATCAAATCACTAAATTATATACCAAAGACTAAGGAATGTCTGATACCTAGATTTGGAGC
ACTCTTCCTGAAATAAAAATTCCTACAGATAACCAATACACATTATTTTTAATTATCTAT
ATAAAAAATTATCTTTTACCAGTTTTAAGTGCATCAAAAAATAATCAAAACGATTTATAC
CAGTCTTTAAAAGAAGAACTAAGTATACTTATCATGGTCAATATACTTTTTGGTAATCCT
TAAATAGATGTTATCTCGATTTTAAAGAAGGTAAATAAAAATTCATTTAGTGAAAATCAA
TGGAAGGTACTCTTTGAAGGTCTAAGAAATAACAAGATGAATTAAAATGAAAAAGTTGTA
CAAAATTTGAGAAAGAAATAACTAAAAAAGTACTTTGAGTGGAAATATTCTGAAAATAAA
GTCTAAATTAATGAGTAAAGAGCATTCTTAGATATGAAGGAAATGAAAACTCAAGAAGAA
GTTGAAGATGCTATAATTTAATGCCTCAAGAATCATTAAATTTAAAATGCTATTTAATTA
GCTGATAATTATAAATTACATACTATAAGCCATCTTTTAACAACTTTTGAATAAGGATCT
GTTGAAAATTAGATAAAATAGCTTAATCAAGATAAATACCAAAACTTTAATAGAATAATT
AATTTTGTTAGCGGCAATTTAGAAGAATTGTACAAATAAAGCTAGAGAAATGAAATATCA
AATTTAAATAAATTTGCTTGTGAAATTTGGTATTAAAAAAATTAGAGATAGAGTTTAGCA
GAAACTTTTGATTAATTTGTATAAAAAGTAGATAAATAAATATATGATGTTGATTCAAGA
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GAAAATTATGTAAGTAAATAGCTTGTAAATATCAATATATTTGCTTAAATAAATTCATAG
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AGCGTCTATTTTAGTAATGATAAAGCTCTTTTGAAAGATAAACGTGCAAGACTTATGAGA
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ATAATGAAAGATATTATCAGAAAACCATAATTTATTTCTAGCATAAAGAATACATTCTTA
CGTAACTGTATTCCTTAAATAAGTTAAGAAGATAAATCAGAAGTAGGCTAGCCAAATAAT
TTAAATAATAAATTCTTGATTTAATCCAGCAACAGAGACAGTTCTTCTGATAATTCATTA
GAAATCAACAAAAGTTTTCAAATTGACTCAGAAAATAGCAACAGTGTTGAACGTTTGCTA
TACTTAATATATACTTAGTATTTCCATCAATCCTTAGGATTGTATTATTATAATTCTCAA
ATTTATTAGTCTGCACTATATCACTTTATGAGAGATCCCAATTTAACATATTTAGATATT
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GAGCGCTAAGAGATTGAAAAGTACTTGGAACAGATTGCAAAAAAAGCAAATTTAATTTTC
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TAAGACCAATATAAGCAAGAATATATAAATGGCATTATAAATCTTAAAGATCTCCTATTA
GAAACTCAAAATGTGTTAAATTTAGTTATTTATCCCCATCAATATCAAGTTATAGTAGAT
AATTAAGAATTTTAATCTAAGAATAGAAGACTACAAAGTAAGACTGATGATTCAGTAACA
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TCTCATTTTATTAGTATTCGCATAATAATTTTACTAAAATTTTGTGATATACTTAGTTAG
ATTTAATTATATCAA>TTHERM_00530720(protein)
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HKAPKNEQIKHLILSTLKQNQYM