Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00530720

Standard Name

Aliases

PreTt04735 | 67.m00250 | 3684.m00120 | MicNup98B | Nup96

Description

nucleoporin putative

Genome Browser (Macronucleus)



Genome Browser (Micronucleus)

Gene Ontology Annotations

Molecular Function

  • obsolete manganese resistance permease activity (IEA) | GO:0015096
  • succinate-semialdehyde dehydrogenase [NAD(P)+] activity (IEA) | GO:0009013

Domains

  • ( PF01846 ) FF domain
  • ( PF04096 ) Nucleoporin autopeptidase
  • ( TIGR00449 ) tRNA-guanine transglycosylases, various specificities
  • ( TIGR00864 ) polycystin cation channel protein

Gene Expression Profile

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for Tetrahymena Stock Center

Homologs

Source Identifier Score
Tetrahymena borealis EI9_13582.1 7.001655022813022e-178
Description: nucleoporin autopeptidase (1921 aa)
SGD YMR047C 0.000000000006001570085597868
Description: NUP116 Subunit of the Nup82 subcomplex of the nuclear pore complex; localized to both sides of the pore; contains a repetitive GLFG motif that interacts with mRNA export factor Mex67p and with karyopherin Kap95p; homologous to Nup100p
Oxytricha Contig19821.0.0.g58 0.000000100009565553302
Description: Nucleoporin autopeptidase
WormBase WBGene00003796 0.00000019998969434520019
Description: locus:npp-10 Nuclear pore complex protein Nup98-Nup96 status:Confirmed UniProt:G5EEH9 protein_id:CCD70955.1

General Information

No. Gene Name(s) Paragraph Text
89 (no standard gene name) The first 2769 bp and later 3243 bp of TTHERM_00530720 (6012 bp) were expressed for MicNup98B and Nup96, respectively.

Associated Literature

  1. Ref:25788697: Iwamoto M, Koujin T, Osakada H, Mori C, Kojidani T, Matsuda A, Asakawa H, Hiraoka Y, Haraguchi T (2015) Biased assembly of the nuclear pore complex is required for somatic and germline nuclear differentiation in Tetrahymena. Journal of cell science 128(9):1812-23
  2. Ref:19375312: Iwamoto M, Mori C, Kojidani T, Bunai F, Hori T, Fukagawa T, Hiraoka Y, Haraguchi T (2009) Two distinct repeat sequences of Nup98 nucleoporins characterize dual nuclei in the binucleated ciliate tetrahymena. Current biology : CB 19(10):843-7

Sequences

>TTHERM_00530720(coding)
ATGATAAACAATCTGTTTGCGAATAATAACACTAACTAGCCAAATATATTTCAGAATAAT
AATAACTAAAACAACAATAATAATAGCAGTAATATCTTTAATCGCAGCGGCTAGAACATA
TTCCAGTCATAGAATAATAACGGATAAGTAAATATCTTTAACGCCAATAATAATAATAAT
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GGTGGAGCTTAAAATAATAATATTTTTAACAACAATAACTAAAATATGTACTAAAACAGT
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AATAATATTTTTAACAATAACAACAATAACGGTAATAATAACAATATATTTGCAAATAAT
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AACAACATTAACAATAACAACAATGGCAATATATTTAATAATAATAATAATAACATGAAT
AATAATGGAGGAAATATCTTTTCTGGAAATAATAATTAGAATAATAATGTAAATAACATA
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TGGTAAGAACCAGTTGACTTAACAGACTTAGATATTGACAAGACCATTTACATTAGAGAT
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GAAGGAATAAATAATAAATGTATGATCACATATAAGAATGCATCTTCAATACAAAGGAAA
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ACTTAAGCAGATATTGATACTTTGAAATCTTAAGCTTAAGAATTAATTGAGCCTGTTTAT
CAGTTGCCAAAGACTTCATATTAGTAGTTCTTACGCTAGCAAAATAATGAAGAATAATTT
GTAAATTTGTAAAACAAGTAGAAGCCCTTAAATAATTTTAAAGATTTTAAAACTAGAGTA
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TACTAAAGTGTTAAAAAACATGAGATTGTAGCCAGAGGTATTTAGACTTTAAACCAATGT
CTTTACTAACACTCAGTAAAGGAGTACACATTTAAAGGGAAGAAATTTTACAATGACTTT
TCTTTTTGTCCCTCTTGGAACTAAAATAGTTATACAAGCTATTCTTCTAAGCTTAAAGCA
ATTAAAAAGCACACAATTCTTCCAAACAATATGGGAAGGATAAAAATTAAAGATAAATAG
AGAGATTAAATTGAGAAATATAACAACATAGTCATTAACGGATTTTTATAAAGTATTATT
GATAGTTAAGCAACTAATGTAATAGAAAATATAGATCAAATCACTAAATTATATACCAAA
GACTAAGGAATGTCTGATACCTAGATTTGGAGCACTCTTCCTGAAATAAAAATTCCTACA
GATAACCAATACACATTATTTTTAATTATCTATATAAAAAATTATCTTTTACCAGTTTTA
AGTGCATCAAAAAATAATCAAAACGATTTATACCAGTCTTTAAAAGAAGAACTAAGTATA
CTTATCATGGTCAATATACTTTTTGGTAATCCTTAAATAGATGTTATCTCGATTTTAAAG
AAGGTAAATAAAAATTCATTTAGTGAAAATCAATGGAAGGTACTCTTTGAAGGTCTAAGA
AATAACAAGATGAATTAAAATGAAAAAGTTGTACAAAATTTGAGAAAGAAATAACTAAAA
AAGTACTTTGAGTGGAAATATTCTGAAAATAAAGTCTAAATTAATGAGTAAAGAGCATTC
TTAGATATGAAGGAAATGAAAACTCAAGAAGAAGTTGAAGATGCTATAATTTAATGCCTC
AAGAATCATTAAATTTAAAATGCTATTTAATTAGCTGATAATTATAAATTACATACTATA
AGCCATCTTTTAACAACTTTTGAATAAGGATCTGTTGAAAATTAGATAAAATAGCTTAAT
CAAGATAAATACCAAAACTTTAATAGAATAATTAATTTTGTTAGCGGCAATTTAGAAGAA
TTGTACAAATAAAGCTAGAGAAATGAAATATCAAATTTAAATAAATTTGCTTGTGAAATT
TGGTATTAAAAAAATTAGAGATAGAGTTTAGCAGAAACTTTTGATTAATTTGTATAAAAA
GTAGATAAATAAATATATGATGTTGATTCAAGATAATAAATAATCTCATTAGAAATTCTT
CTATTGTCTCTTTATGCTTAGCATTAGTTAGGTGAAAATTATGTAAGTAAATAGCTTGTA
AATATCAATATATTTGCTTAAATAAATTCATAGTGTTATTCTTAAAACAGACTTGATAAA
CGTCTAAGTTGGTTTATTATTGAATTTATGAATAGCGTCTATTTTAGTAATGATAAAGCT
CTTTTGAAAGATAAACGTGCAAGACTTATGAGAGGTTTTCTTTAATAACTATAAATTTTG
AAGAAATGGAAATATGAATTAATAGTTTTGATAATAATGAAAGATATTATCAGAAAACCA
TAATTTATTTCTAGCATAAAGAATACATTCTTACGTAACTGTATTCCTTAAATAAGTTAA
GAAGATAAATCAGAAGTAGGCTAGCCAAATAATTTAAATAATAAATTCTTGATTTAATCC
AGCAACAGAGACAGTTCTTCTGATAATTCATTAGAAATCAACAAAAGTTTTCAAATTGAC
TCAGAAAATAGCAACAGTGTTGAACGTTTGCTATACTTAATATATACTTAGTATTTCCAT
CAATCCTTAGGATTGTATTATTATAATTCTCAAATTTATTAGTCTGCACTATATCACTTT
ATGAGAGATCCCAATTTAACATATTTAGATATTAGCAATAAAATATTAGCATACTATGAA
GGACCTCGTATATATTTATTTGGTGAATAGAATGAGCGCTAAGAGATTGAAAAGTACTTG
GAACAGATTGCAAAAAAAGCAAATTTAATTTTCAAATACAAGTATTAATCTGGGTTAATA
AAAGAAGTTTTTTCCCTTTTGCAAAGTAATAACTAAGACCAATATAAGCAAGAATATATA
AATGGCATTATAAATCTTAAAGATCTCCTATTAGAAACTCAAAATGTGTTAAATTTAGTT
ATTTATCCCCATCAATATCAAGTTATAGTAGATAATTAAGAATTTTAATCTAAGAATAGA
AGACTACAAAGTAAGACTGATGATTCAGTAACAACTTTAGACAATGGCGGAATGCTCTTC
TAAGAATTTATTTCTTTCATATTCTAATAACTTGCAGAAAAGGTACCAGATATTAGAAGA
TATTCTTAACATTATTAAACTTCTGGTGATATTCAACAACTCTTAGAAATAGTATCTGAG
CATAAAGCCCCTAAAAATGAATAAATAAAGCACCTCATCCTATCAACTTTAAAATAAAAT
TAATATATGTGA


>TTHERM_00530720(gene)
ATGATAAACAATCTGTTTGCGAATAATAACACTAACTAGCCAAATATATTTCAGAATAAT
AATAACTAAAACAACAATAATAATAGCAGTAATATCTTTAATCGCAGCGGCTAGAACATA
TTCCAGTCATAGAATAATAACGGATAAGTAAATATCTTTAACGCCAATAATAATAATAAT
TAAGTAGGATACTAGAACTAGAGTTAAAACATCTTTTAGCAAAATAGTAACATGAATAAT
GCCAGCAGCAGCAACAACAACAATATTTTTGGAAATAACATAAGTAATAACAACAATTAT
GGTGGAGCTTAAAATAATAATATTTTTAACAACAATAACTAAAATATGTACTAAAACAGT
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CACACTGAAACTTAATAAAATAATCAAGCGGGAGTAATAATGAATACAAGTATTATTTTC
TGTAAAGGATTTGAAAAAATGAATCCTTTGTTGGTAAGGCTCGAAGATTATTACTTGATA
AGAACAGGCAAATTATCTGATGCTGAAAAATAAAAAATAACTAGCTCAATATAAATAAAC
TCCTTTAACTAAAATCTTATTACCAACCTTCCTTAAAACTTTTAACCTCCAAACACTTAA
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TTTAGAAACAATAATAACAACAATACAAATATTTTTAACAATGGTAATAATAATGGTGGG
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TGATGGAAGTCTCATTAGAAACCAAGAATTACTAGCAAGTGATGTCTTTCCTGTTAAGTT
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TAACAGACTTAGATATTGACAAGGTATACATACATACTTGCAGAATTTAATTGTTTCTTA
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ATTAGACCATTTACATTAGAGATTAGCAAATATAAGTTTATCCTGAAGTTGAATATGCAT
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AAGAATTAATTGAGCCTGTTTATCAGTTGCCAAAGACTTCATATTAGTAGTTCTTACGCT
AGCAAAATAATGAAGAATAATTTGTAAATTTGTAAAACAAGTAGAAGCCCTTAAATAATT
TTAAAGATTTTAAAACTAGAGTAGACCAACGCAAAAATAAAATATTTTAAAAAGAATAGC
AAGTCCCTAAATGTGGTGTTCTTTACTAAAGTGTTAAAAAACATGAGATTGTAGCCAGAG
GTATTTAGACTTTAAACCAATGTCTTTACTAACACTCAGTAAAGGAGTACACATTTAAAG
GGAAGAAATTTTACAATGACTTTTCTTTTTGTCCCTCTTGGAACTAAAATAGTTATACAA
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AATCAAAACGATTTATACCAGTCTTTAAAAGAAGAACTAAGTATACTTATCATGGTCAAT
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TTAATTCATTTTTTTATACTCTTGTGAAAAATTTTTTAAAAATAAGTTTTTGTTAATTTT
ACATTTTATAAACACAAAAAAGGTAAATAAAAATTCATTTAGTGAAAATCAATGGAAGGT
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GAGAAAGAAATAACTAAAAAAGTACTTTGAGTGGAAATATTCTGAAAATAAAGTCTAAAT
TAATGAGTAAAGAGCATTCTTAGATATGAAGGAAATGAAAACTCAAGAAGAAGTTGAAGA
TGCTATAATTTAATGCCTCAAGAATCATTAAATTTAAAATGCTATTTAATTAGCTGATAA
TTATAAATTACATACTATAAGCCATCTTTTAACAACTTTTGAATAAGGATCTGTTGAAAA
TTAGATAAAATAGCTTAATCAAGATAAATACCAAAACTTTAATAGAATAATTAATTTTGT
TAGCGGCAATTTAGAAGAATTGTACAAATAAAGCTAGAGAAATGAAATATCAAATTTAAA
TAAATTTGCTTGTGAAATTTGGTATTAAAAAAATTAGAGATAGAGTTTAGCAGAAACTTT
TGATTAATTTGTATAAAAAGTAGATAAATAAATATATGATGTTGATTCAAGATAATAAAT
AATCTCATTAGAAATTCTTCTATTGTCTCTTTATGCTTAGCATTAGTTAGGTGAAAATTA
TGTAAGTAAATAGCTTGTAAATATCAATATATTTGCTTAAATAAATTCATAGTGTTATTC
TTAAAACAGACTTGATAAACGTCTAAGTTGGTTTATTATTGAATTTATGAATAGCGTCTA
TTTTAGTAATGATAAAGCTCTTTTGAAAGATAAACGTGCAAGACTTATGAGAGGTTTTCT
TTAATAACTATAAATTTTGAAGAAATGGAAATATGAATTAATAGTTTTGATAATAATGAA
AGATATTATCAGAAAACCATAATTTATTTCTAGCATAAAGAATACATTCTTACGTAACTG
TATTCCTTAAATAAGTTAAGAAGATAAATCAGAAGTAGGCTAGCCAAATAATTTAAATAA
TAAATTCTTGATTTAATCCAGCAACAGAGACAGTTCTTCTGATAATTCATTAGAAATCAA
CAAAAGTTTTCAAATTGACTCAGAAAATAGCAACAGTGTTGAACGTTTGCTATACTTAAT
ATATACTTAGTATTTCCATCAATCCTTAGGATTGTATTATTATAATTCTCAAATTTATTA
GTCTGCACTATATCACTTTATGAGAGATCCCAATTTAACATATTTAGATATTAGCAATAA
AATATTAGCATACTATGAAGGACCTCGTATATATTTATTTGGTGAATAGAATGAGCGCTA
AGAGATTGAAAAGTACTTGGAACAGATTGCAAAAAAAGCAAATTTAATTTTCAAATACAA
GTATTAATCTGGGTTAATAAAAGAAGTTTTTTCCCTTTTGCAAAGTAATAACTAAGACCA
ATATAAGCAAGAATATATAAATGGCATTATAAATCTTAAAGATCTCCTATTAGAAACTCA
AAATGTGTTAAATTTAGTTATTTATCCCCATCAATATCAAGTTATAGTAGATAATTAAGA
ATTTTAATCTAAGAATAGAAGACTACAAAGTAAGACTGATGATTCAGTAACAACTTTAGA
CAATGGCGGAATGCTCTTCTAAGAATTTATTTCTTTCATATTCTAATAACTTGCAGAAAA
GGTACCAGATATTAGAAGATATTCTTAACATTATTAAACTTCTGGTGATATTCAACAACT
CTTAGAAATAGTATCTGAGCATAAAGCCCCTAAAAATGAATAAATAAAGCACCTCATCCT
ATCAACTTTAAAATAAAATTAATATATGTGA


>TTHERM_00530720(protein)
MINNLFANNNTNQPNIFQNNNNQNNNNNSSNIFNRSGQNIFQSQNNNGQVNIFNANNNNN
QVGYQNQSQNIFQQNSNMNNASSSNNNNIFGNNISNNNNYGGAQNNNIFNNNNQNMYQNS
NNPNALIGSQRGKYELTKSPHTETQQNNQAGVIMNTSIIFCKGFEKMNPLLVRLEDYYLI
RTGKLSDAEKQKITSSIQINSFNQNLITNLPQNFQPPNTQALNKDIRMVQSQYVGNVNNN
NNIFNNNNNNGNNNNIFANNNNVNNSVNRNIFNNNNISTNNNINNNNNGNIFNNNNNNMN
NNGGNIFSGNNNQNNNVNNIFSFNNSQNNNMNKSNIFNNGNSTNNTSNIFQNNNTNMGNN
SIFQGNNNNNNNNIFRNDNSTNNTNLNIFSNNNNNINNSIFRNNNNNNTNIFNNGNNNGG
NNTSSIFNNSGSNNSVNIFRSNNNNNGGSIFSNNNNSSVQNIFQKNNSSIFNNNNNNGGS
IFNNNNSIFGPNVQGGNIFQNNNNNNFNNGNIFTNYNNPQMYQSNLPGPANGYYSIQSGM
YYAPTIQTGDLTRQQYLDLLEQEAEDKKVVKQSYFMPSFCPEEYAPAFRKKPIFKPFYVT
VQEEKGIRKLAKSLLPLQETIAKTQRGHSSETTSNGKNDSFQLTQSAIKQRKQMEEFNFY
KQPAQETKGREMYARQQLSHTNPVSIKVEVLCSTLEGEEEEITLENQIDTLSKIKQIGLY
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FMNTSDYIINPPLEELQTYSLKELKNVHNFSVEGHYGKLEWQEPVDLTDLDIDKTIYIRD
QQIQVYPEVEYASKYKPKVGEGINNKCMITYKNASSIQRKIKSGELNLQTVIKCIKKQSD
EQNVQFVKFDQKNLTWTILVDHFSGYQFNLDEQDDEENKEGQDSAANLQNVSSNSNSRSN
PSKQQQLIQGQQQFNQDSQRTANQQLQQQQLQAENQFQQKINSSYQQLPMRQHIQNSNQF
KQIYGQNEHQPSETQKYINQMREQQNVSKSQENSFIQQDYPITSHQQQNSNYQMNEHNQY
QNQPSYMNRGQLQQQQYYGTHIDPSNDIIIEEVENGSYNNTQADIDTLKSQAQELIEPVY
QLPKTSYQQFLRQQNNEEQFVNLQNKQKPLNNFKDFKTRVDQRKNKIFQKEQQVPKCGVL
YQSVKKHEIVARGIQTLNQCLYQHSVKEYTFKGKKFYNDFSFCPSWNQNSYTSYSSKLKA
IKKHTILPNNMGRIKIKDKQRDQIEKYNNIVINGFLQSIIDSQATNVIENIDQITKLYTK
DQGMSDTQIWSTLPEIKIPTDNQYTLFLIIYIKNYLLPVLSASKNNQNDLYQSLKEELSI
LIMVNILFGNPQIDVISILKKVNKNSFSENQWKVLFEGLRNNKMNQNEKVVQNLRKKQLK
KYFEWKYSENKVQINEQRAFLDMKEMKTQEEVEDAIIQCLKNHQIQNAIQLADNYKLHTI
SHLLTTFEQGSVENQIKQLNQDKYQNFNRIINFVSGNLEELYKQSQRNEISNLNKFACEI
WYQKNQRQSLAETFDQFVQKVDKQIYDVDSRQQIISLEILLLSLYAQHQLGENYVSKQLV
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KKWKYELIVLIIMKDIIRKPQFISSIKNTFLRNCIPQISQEDKSEVGQPNNLNNKFLIQS
SNRDSSSDNSLEINKSFQIDSENSNSVERLLYLIYTQYFHQSLGLYYYNSQIYQSALYHF
MRDPNLTYLDISNKILAYYEGPRIYLFGEQNERQEIEKYLEQIAKKANLIFKYKYQSGLI
KEVFSLLQSNNQDQYKQEYINGIINLKDLLLETQNVLNLVIYPHQYQVIVDNQEFQSKNR
RLQSKTDDSVTTLDNGGMLFQEFISFIFQQLAEKVPDIRRYSQHYQTSGDIQQLLEIVSE
HKAPKNEQIKHLILSTLKQNQYM