Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00185640

Standard Name

JMJ1 (JMJC domain-encoding 1)

Aliases

PreTt29886 | 14.m00453

Description

JMJ1 JmjC domain protein; JmjC domain containing protein

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External Links

Gene Ontology Annotations

Biological Process

Domains

  • ( PF02373 ) JmjC domain
  • ( PF05864 ) Chordopoxvirus DNA-directed RNA polymerase 7
  • ( PF08323 ) Starch synthase catalytic domain
  • ( PF09022 ) Staphostatin A

Gene Expression Profile

Vegetative Cell Cycle (Zhang et al., 2023)

GeneMania

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for Tetrahymena Stock Center

Homologs

Source Identifier Score
Tetrahymena borealis EI9_09915.1 9.997093137033517e-262
Description: jmjC domain-containing protein (1133 aa)
WormBase WBGene00009089 9.995317835403734e-19
Description: locus:jmjd-3.2 status:Partially_confirmed UniProt:Q19760 protein_id:CAA94916.1
Stentor Coeruleus SteCoe_21185 4.248354255291589e-18
Description: None

General Information

No. Gene Name(s) Paragraph Text
115 COI7, COI6, JMJ1, LIA5 Coi6p, its interaction partners Coi7p and Lia5p, and the histone demethylase Jmj1p are crucial for confining the production of small RNAs and the formation of heterochromatin to the eliminated sequences. The loss of Coi6p, Coi7p or Jmj1p causes ectopic DNA elimination.

Associated Literature

  1. Ref:29021213: Noto T, Mochizuki K (2017) Whats, hows and whys of programmed DNA elimination in Tetrahymena. Open biology 7(10):
  2. Ref:28273462: Suhren JH, Noto T, Kataoka K, Gao S, Liu Y, Mochizuki K (2017) Negative Regulators of an RNAi-Heterochromatin Positive Feedback Loop Safeguard Somatic Genome Integrity in Tetrahymena. Cell reports 18(10):2494-2507
  3. Ref:26688337: Kataoka K, Mochizuki K (2015) Phosphorylation of an HP1-like Protein Regulates Heterochromatin Body Assembly for DNA Elimination. Developmental cell 35(6):775-88
  4. Ref:22427430: Chung PH, Yao MC (2012) Tetrahymena thermophila JMJD3 homolog regulates H3K27 methylation and nuclear differentiation. Eukaryotic cell 11(5):601-14

Sequences 

>TTHERM_00185640(coding)
ATGAATCTTAGGAACAAGAGAAAGGTTTCTTCAAGTACTAGCGAAGAAAAAGACTAACAC
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>TTHERM_00185640(gene)
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>TTHERM_00185640(protein)
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