Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00653910

Standard Name

LIA5 (localized in macronuclear anlagen 5)

Aliases

PreTt12878 | 95.m00124 | 3825.m02531

Description

LIA5 transposase IS4 protein

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Domains

Gene Expression Profile

Vegetative Cell Cycle (Zhang et al., 2023)

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Homologs

Source Identifier Score
Tetrahymena borealis EI9_00713.1 9.997093137033517e-262
Description: hypothetical protein (905 aa)

General Information

No. Gene Name(s) Paragraph Text
115 COI7, COI6, JMJ1, LIA5 Coi6p, its interaction partners Coi7p and Lia5p, and the histone demethylase Jmj1p are crucial for confining the production of small RNAs and the formation of heterochromatin to the eliminated sequences. The loss of Coi6p, Coi7p or Jmj1p causes ectopic DNA elimination.

Associated Literature

  1. Ref:29021213: Noto T, Mochizuki K (2017) Whats, hows and whys of programmed DNA elimination in Tetrahymena. Open biology 7(10):
  2. Ref:28273462: Suhren JH, Noto T, Kataoka K, Gao S, Liu Y, Mochizuki K (2017) Negative Regulators of an RNAi-Heterochromatin Positive Feedback Loop Safeguard Somatic Genome Integrity in Tetrahymena. Cell reports 18(10):2494-2507
  3. Ref:28087716: Cheng CY, Young JM, Lin CG, Chao JL, Malik HS, Yao MC (2016) The piggyBac transposon-derived genes TPB1 and TPB6 mediate essential transposon-like excision during the developmental rearrangement of key genes in Tetrahymena thermophila. Genes & development 30(24):2724-2736
  4. Ref:24069402: Shieh AW, Chalker DL (2013) LIA5 is required for nuclear reorganization and programmed DNA rearrangements occurring during tetrahymena macronuclear differentiation. PloS one 8(9):e75337
  5. Ref:17519286: Yao MC, Yao CH, Halasz LM, Fuller P, Rexer CH, Wang SH, Jain R, Coyne RS, Chalker DL (2007) Identification of novel chromatin-associated proteins involved in programmed genome rearrangements in Tetrahymena. Journal of cell science 120(Pt 12):1978-89

Sequences 

>TTHERM_00653910(coding)
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>TTHERM_00653910(gene)
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>TTHERM_00653910(protein)
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