Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_000160559

Standard Name

XPF1 (homolog of Xeroderma Pigmentosum group F-complementing protein 1)

Aliases

None

Description

14-3-3 protein 6

Genome Browser (Macronucleus)



Genome Browser (Micronucleus)

External Links

Gene Ontology Annotations

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Domains

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Gene Expression Profile

Vegetative Cell Cycle (Zhang et al., 2023)

GeneMania

Tetrahymena Stock Center

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Homologs

Source Identifier Score
Tetrahymena borealis EI9_05314.1 9.997093137033517e-262
Description: hypothetical protein (1229 aa)
SGD YPL022W 5.002276765025871e-34
Description: RAD1 Single-stranded DNA endonuclease (with Rad10p), cleaves single-stranded DNA during nucleotide excision repair and double-strand break repair; subunit of Nucleotide Excision Repair Factor 1 (NEF1); homolog of human XPF protein
DictyBase DDB_G0284419 9.99967697349061e-30
Description: xpf on chromosome: 4 position 1971161 to 1974139
Oxytricha Contig829.1.g135 1.9996410647472548e-29
Description: hypothetical protein
WormBase WBGene00008140 4.998394530072393e-19
Description: locus:xpf-1 status:Partially_confirmed UniProt:G5EBZ1 protein_id:CAA93766.2

General Information

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Associated Literature

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Sequences

>TTHERM_000160559(coding)
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>TTHERM_000160559(gene)
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TGAAAGTGAGAAAATTCTTTATAATAGTCTTCAAGAGAATTAAGCAACTGAGAGAATAGT
GAAAGAAAAAAATGAGATGCTAAGCAGTATTGATGAGCCAGTATTAAGAGTAAAAAATAT
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TGCCTCTCCTCGTCTCTTAATTCGATAATGTTAAAATAATTTGGTCGAAAGGTCCTATTT
ACACTTCTAAAATATTCTAAATGCTCAAATAAAATTAACTTGAGCCAAATCCTTCAGAAC
TACTTAAAGAATAAGAGAAGAAAGAAAAGAAGGAATCTACAATAGATTAGTATATCTAAG
CAAATTAAGATGATGACAAATATATTCCAACCTAAAAACGATTATTTGAGCAAATTAAAA
ATAGCAACGAAGAAGAAAATTGA


>TTHERM_000160559(protein)
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MSQGTGVYKVIGEYLDTFQQGPQTVFFLLNFDERDSLKSEINEIQYYCKQHKIVDVTNMI
SSKRSEIYSKGGIFSISEIVLLFDLLSGSIIHSERITGFIINKIQSVRNHQENLVWLCTL
LKTNNPSSIILGISECEQTLASRGLENIMRWFYLPRCFVWNMIRAEVQSDILKQPNQCEH
LDTFVDMNKRMRNIDNCIKVIIILILKELKSKRNASDTTELPIFNQEEFLNSHQYILEDK
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