Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00016360

Standard Name

BBC53 (Basal Body Component 53)

Aliases

PreTt11942 | 1.m00990

Description

BBC53 chromosome condensation regulator RCC1 repeat protein; Regulator of chromosome condensation

Genome Browser (Macronucleus)



Genome Browser (Micronucleus)

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Domains

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Gene Expression Profile

Vegetative Cell Cycle (Zhang et al., 2023)

GeneMania

Tetrahymena Stock Center

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Homologs

Source Identifier Score
Tetrahymena borealis EI9_02617.1 9.997093137033517e-262
Description: regulator-chromosome condensation (406 aa)
Oxytricha Contig1238.1.g128 8.998739065740874e-48
Description: Regulator of chromosome condensation (RCC1) repeat
Stentor Coeruleus SteCoe_28163 1.9287498479639178e-22
Description: None
DictyBase DDB_G0267586 5.999654353873483e-20
Description: DDB_G0267586 on chromosome: 1 position 375348 to 376736
WormBase WBGene00021685 7.003160085026828e-16
Description: locus:herc-1 status:Confirmed UniProt:Q9BL11 protein_id:CCD73459.1
Tetrahymena borealis EI9_12495.1 7.003160085026828e-16
Description: hypothetical protein (293 aa)
SGD YGL097W 0.000008000552149328928
Description: SRM1 Nucleotide exchange factor for Gsp1p, localizes to the nucleus, required for nucleocytoplasmic trafficking of macromolecules; suppressor of the pheromone response pathway; potentially phosphorylated by Cdc28p

General Information

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Associated Literature

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Sequences

>TTHERM_00016360(coding)
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>TTHERM_00016360(gene)
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AAAAAATGATCAATTAAATTATTCAAAATAGCATTTTCATATTTGTTTTTGTATCTTTAT
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AAAAATTATCAAATAAAATTTATTTTACAAAGATAAAAAATTAGTTTGCTTAATTTTTTA
AACTCATTTACAACTTTTCTGTTTTTTTTAGATAAAATCAATTCTTTAAATCTGCTTTAA
TACTAATCAATTAATACAAACTTACATACTGTAAAATAAAAAATATTTAATTATTATTTG
TTATACTTTTATATCTCAAAAATACAATCAAATTTTTTGA


>TTHERM_00016360(protein)
MYLFMHLCMCFCMISSSQKKEKLNKGKNKQIKLNKKKEKQNKKIEIIKKEKERRSNPQMI
SKTQAFARLFQLSSKSFSTVKGGNLYTWGQYASGTGFETASAVPRKVDYFSGNVSKVAMG
PYHTAVITNDGSLYTFGWGQNGALGNGAKEFQLSPSPVSFFNDKKLKVKDVVVGESYTIA
VTENGEVYSWGYGGEPSSKINLDFFRNAILPQRCGALGSGDNKNRLTPQQIANLKADGYK
NISGGDNFATLVNQSGEVINWGTGLFGSLGNGSDYPLFTPEVNAYFKHLKEHEGLTVQSI
KSAGHFSAALLSNGKLYTFGVNTQGQLGIRENLGHNTDQNARLPTPVVDRHFVGQKVVDF
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IIQFQSKQLKKTQKIIKQNLFYKDKKLVCLIFQTHLQLFCFFQIKSILQICFNTNQLIQT
YILQNKKYLIIICYTFISQKYNQIF