Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00023990

Standard Name

RRM63 (RNA recognition motif-containing protein 65)

Aliases

PreTt12012 | 1.m01060

Description

RRM63 splicing factor protein; Splicing factor 3B subunit 4

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External Links

Gene Ontology Annotations

No Data fetched for Gene Ontology Annotations

Domains

  • ( PF00076 ) RNA recognition motif. (a.k.a. RRM,
  • ( PF08199 ) Bacteriophage E2-like protein
  • ( TIGR01622 ) splicing factor, CC1-like family
  • ( TIGR01628 ) polyadenylate binding protein, human types
  • ( TIGR01659 ) sex-lethal family splicing factor
  • ( TIGR01661 ) ELAV/HuD family splicing factor

Gene Expression Profile

Vegetative Cell Cycle (Zhang et al., 2023)

GeneMania

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for Tetrahymena Stock Center

Homologs

Source Identifier Score
Tetrahymena borealis EI9_13866.1 3.999324360634196e-166
Description: splicing factor 3B subunit 4 (326 aa)
Oxytricha Contig15452.0.g39 6.001435805040647e-94
Description: RNA recognition motif_ (a_k_a_ RRM, RBD, or RNP domain)
WormBase WBGene00004723 8.995576032080571e-85
Description: locus:sap-49 Splicing factor 3B subunit 4 status:Confirmed UniProt:Q09442 protein_id:CAB60993.2
DictyBase DDB_G0267714 1.0004249259458435e-52
Description: sf3b4 on chromosome: 1 position 676187 to 677352
Stentor Coeruleus SteCoe_183 4.0795586671775603e-41
Description: None
SGD YOR319W 4.001714826231863e-32
Description: HSH49 U2-snRNP associated splicing factor with similarity to the mammalian splicing factor SAP49; proposed to function as a U2-snRNP assembly factor along with Hsh155p and binding partner Cus1p; contains two RNA recognition motifs (RRM)

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

No Data fetched for Associated Literature

Sequences

>TTHERM_00023990(coding)
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>TTHERM_00023990(gene)
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CAATAGATCATCGATTCCGTAAATAAAAAATATATCATAATTTAGATTTTTAATTTTTAA
AGATTAAAATAAATTTTTTTATTTTTAAACAAATAGTATGGCAGAAGGATTAATATAGCC
TAATCCTATTGTTCCTCAAAATGCATATGCTTAACCTCCTAACTTTGCTCCTCCTATGCC
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TCAATAAATGCCCCCTGGTTATCCTCCTCTTCCTCCAAATATGCCCCCTCCTCCTATGGG
TATGCCTCCTCTTCCTCCAGGTTAGTACATGCCTCCTCCTCCAGGTTTTATGCGTAATAA
AATGAAATTATTTAGCTATTTAACAAATATAAATTTTTTTTGAATAAATAAATAGCTCCA
AACATGCCAAACTTGCCAATACCCCCAAGACTTAATTGA


>TTHERM_00023990(protein)
MLTFLRLMNFNISERNSDATLYVGGLDQKVTQEVLWELFSQCGIVINVHLPRDKITGEHQ
GYGFVEYKTEEDADYAIKILHLIKLYGKPIKVNKASQDKRTQEVGANIFIGNLDPSVTEM
QLQETFSTFGLIIGRRIVRDSDNNQSKGYAFISYDNFESSDNAISAMNGQYYGSQKISVQ
YAFKKDSKGERHGSAAERLLAANRPQPLQSGMGMNAPAPLVPSNKGINRSSIPMAEGLIQ
PNPIVPQNAYAQPPNFAPPMPGYNMPPNMPPNMPPPPMYMPQQMPPGYPPLPPNMPPPPM
GMPPLPPGQYMPPPPGFMPPNMPNLPIPPRLN