Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00023990

Standard Name

RRM63 (RNA recognition motif-containing protein 65)

Aliases

PreTt12012 | 1.m01060

Description

RRM63 splicing factor protein; Splicing factor 3B subunit 4

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Gene Ontology Annotations

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Domains

  • ( PF00076 ) RNA recognition motif. (a.k.a. RRM,
  • ( PF08199 ) Bacteriophage E2-like protein
  • ( TIGR01622 ) splicing factor, CC1-like family
  • ( TIGR01628 ) polyadenylate binding protein, human types
  • ( TIGR01659 ) sex-lethal family splicing factor
  • ( TIGR01661 ) ELAV/HuD family splicing factor

Gene Expression Profile

Tetrahymena Stock Center

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Homologs

Source Identifier Score
Tetrahymena borealis EI9_13866.1 3.999324360634196e-166
Description: splicing factor 3B subunit 4 (326 aa)
Oxytricha Contig15452.0.g39 6.001435805040647e-94
Description: RNA recognition motif_ (a_k_a_ RRM, RBD, or RNP domain)
WormBase WBGene00004723 8.995576032080571e-85
Description: locus:sap-49 Splicing factor 3B subunit 4 status:Confirmed UniProt:Q09442 protein_id:CAB60993.2
DictyBase DDB_G0267714 1.0004249259458435e-52
Description: sf3b4 on chromosome: 1 position 676187 to 677352
Stentor Coeruleus SteCoe_183 4.0795586671775603e-41
Description: None
SGD YOR319W 4.001714826231863e-32
Description: HSH49 U2-snRNP associated splicing factor with similarity to the mammalian splicing factor SAP49; proposed to function as a U2-snRNP assembly factor along with Hsh155p and binding partner Cus1p; contains two RNA recognition motifs (RRM)

General Information

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Associated Literature

No Data fetched for Associated Literature

Sequences 

>TTHERM_00023990(coding)
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>TTHERM_00023990(gene)
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CAATAGATCATCGATTCCGTAAATAAAAAATATATCATAATTTAGATTTTTAATTTTTAA
AGATTAAAATAAATTTTTTTATTTTTAAACAAATAGTATGGCAGAAGGATTAATATAGCC
TAATCCTATTGTTCCTCAAAATGCATATGCTTAACCTCCTAACTTTGCTCCTCCTATGCC
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TCAATAAATGCCCCCTGGTTATCCTCCTCTTCCTCCAAATATGCCCCCTCCTCCTATGGG
TATGCCTCCTCTTCCTCCAGGTTAGTACATGCCTCCTCCTCCAGGTTTTATGCGTAATAA
AATGAAATTATTTAGCTATTTAACAAATATAAATTTTTTTTGAATAAATAAATAGCTCCA
AACATGCCAAACTTGCCAATACCCCCAAGACTTAATTGA


>TTHERM_00023990(protein)
MLTFLRLMNFNISERNSDATLYVGGLDQKVTQEVLWELFSQCGIVINVHLPRDKITGEHQ
GYGFVEYKTEEDADYAIKILHLIKLYGKPIKVNKASQDKRTQEVGANIFIGNLDPSVTEM
QLQETFSTFGLIIGRRIVRDSDNNQSKGYAFISYDNFESSDNAISAMNGQYYGSQKISVQ
YAFKKDSKGERHGSAAERLLAANRPQPLQSGMGMNAPAPLVPSNKGINRSSIPMAEGLIQ
PNPIVPQNAYAQPPNFAPPMPGYNMPPNMPPNMPPPPMYMPQQMPPGYPPLPPNMPPPPM
GMPPLPPGQYMPPPPGFMPPNMPNLPIPPRLN