Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00037210

Standard Name

RAD5 (RADiation sensitive protein family 5)

Aliases

PreTt14456 | 2.m02413 | 3825.m02825

Description

SNF2 family amine-terminal protein; SNF2 family N-terminal domain containing protein

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Gene Ontology Annotations

Molecular Function

Biological Process

Domains

No Data fetched for Domains

Gene Expression Profile

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for Tetrahymena Stock Center

Homologs

Source Identifier Score
Tetrahymena borealis EI9_00974.1 9.997093137033517e-262
Description: SNF2 family domain-containing protein (1516 aa)
SGD YLR032W 4.99876080819921e-108
Description: RAD5 DNA helicase proposed to promote replication fork regression during postreplication repair by template switching; RING finger containing ubiquitin ligase; stimulates the synthesis of free and PCNA-bound polyubiquitin chains by Ubc13p-Mms2p
Stentor Coeruleus SteCoe_19683 9.462629465836378e-57
Description: None
DictyBase DDB_G0282115 3.00017180903994e-49
Description: DDB_G0282115 on chromosome: 3 position 5399711 to 5404710
WormBase WBGene00010061 2.9990874792167046e-33
Description: status:Partially_confirmed UniProt:G5EEW5 protein_id:CAB05213.1
Oxytricha Contig13957.0.g3 6.999211576891585e-27
Description: SNF2 family N-terminal domain

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

  1. Ref:23884606: Gao S, Xiong J, Zhang C, Berquist BR, Yang R, Zhao M, Molascon AJ, Kwiatkowski SY, Yuan D, Qin Z, Wen J, Kapler GM, Andrews PC, Miao W, Liu Y (2013) Impaired replication elongation in Tetrahymena mutants deficient in histone H3 Lys 27 monomethylation. Genes & development 27(15):1662-79

Sequences 

>TTHERM_00037210(coding)
ATGAATAATCATATATAAATTGAAATGGAATACTATTAAAGTTTATATGACTCTTTTGTT
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GAATTCACTGGAATGTGCCCAATTTGCAGAAAATTCATTTCTAAGGAAGACATTATGACT
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TTTACATAATTTTTGGGCATGATGGACTTATTTGAAATAGATTTCCAAAAAAATAAAATT
CCTTATCTAAGACTAGATGGTTCAGTTAATTAAAAATAAAGAGCTGAAATAATTAAAAGA
TTTAACGAAGACAGCTAATACAAAGTTTTCATGATTTCATTAAAGGCAGGAGGTGTAGGT
CTTAATCTAGTGAAAGCAAATCATGTTTTGATGGTAGATCCATGGTGGAATCCAGCAGTG
GAAGAACAAGCAATAGAAAGATGTCATAGAATAGGACAGAAAAAAGAAGTATTTGTTACT
AGATTTATTTGTGATGACTCTATTGAGTCCAGAATGATTAAACTTCATGAAGAAAAAAGA
GACCTCTTTGAAAATACAATACAAGCTACTAAAAAAGATAAAAAAGAATAAAACATAGAG
CACTTTAAATATCTAATGTCAACATATTGA


>TTHERM_00037210(gene)
ATGAATAATCATATATAAATTGAAGTAATAATTAAAGTATTATAATTTCTTAGCATAAGA
GATGAAATTTACTGTATCTAAATATTCATCTTTAGCCAGCTTTTCTATATACAAATCTTC
AACTGCTTTGGTATGCTGAATATGTTTGCCTTTTTGAGGATACTAATTAATCTATATATA
TATATTCTTCTCTTATCTCATAGTAAATTATCTAGATTATTTGTAGACTCTTTACAGATC
AAATTAAAGTAAATTTTACTCAAATGAGAGAAAGATTTTAATCATTCACAAAATAGTAAA
AATTAATTAAAATTTTAGAAACTATTTATTTCTAAAATTATTTTCCACTCTATATAAATA
TTTTTATTTTCAAATATCTTTTTAAAAATCATTTTTTTGAGTAAATAAATATAATTAAAT
GGCAAAAATTTAAAAATCTTTGGAAAATTATTTTTTATTAAATTATTATTGTTTTGGAAT
AATTTAATCATATTCATAATTAGGTTCTTTGTAAAAATTAAAAGTAGTTGAGATCAAAAG
AAAAACTACTAATAATTAAATTAATTTTTATAATAATATTTAAATAGATGAAAACTCTTT
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TAAAGTCTCTTCTTTTCATTTAACAAAATTTTATAACTTTGGAATATTAAAATAATTCAA
TCAATATAAAGATTAATAAAATACGAATTATTAAATAAATAGATAATATTTTTGAAAGTT
AAAATAATTAATTTTAATATCAATATATTTGATACAAAGAATAAAATATGAATTTTAATG
ATAAAGTTTAATAATTTATATTATTTAGAAACTATATATTTTTAATTAGAAAGTAGGTGC
AATTCAATTCGTTCAGCTTTTTTGATTTTTTGTTTACCTATTTATTTTAATGAAAAGTTT
GTTATATAATTTTATAAGTTTAAATGTAAAATTTATTTAAATAAATAAATAAAAATTAAC
TATTGAATAAAAATCTCTTTCAATAATTTGTTTAAAAATATTTTAACTTTAAAAAAAATT
TACTTGATTATATAATTGTCAACCATGACAAAGTTACTTGATTTTTGATCTAACATAAAC
ACTTAGACAATTTCCTCTTTAGATTAGTTATTTAATATATCATCGTATTTGTTTTTGCTT
TCATTAATAATATTGTTAAATTCTTCCACTAAACCTGATTCATTACTTTTAAGCTTTTCT
AATAAAGTTTTTCTTACTATTTCAAACTCACAATTGAAGTTTTTCAGCAAATTTTTTTTT
TAATTGTTTAGAATATCTTGCTCATCATTTTATTATAAGCTGTTTTAATTATTGACTCTT
GAATTTTAAAATTTTTCACTATTTTTATCTGGCGAATTTCTTTTAATTCTAACATTTTCT
GTCTTTATTTTTTATATTGTTTCTCTATTTTTTTAATATTCCTCACTTAATTAATTTAAT
AGCAAGGTAAGCAACTTTAAGCCTAAATAATTGTTATCATTTTCCTAATAGTTTTTACTG
ATTTAAAATAAGCAATACTTAGATTCGTTAAAGCAGTAAGTAAACAATGTTTCAAGGTCT
TATTAGCTTTACTCCAATTCCTAGAAATGTTTTTCTTAAAAAAAGAAACTTTAATGTTTT
TTGATTTTTTTAATTTCCTCATCAGTCAACTAAGAAATATCTTTATTGTACACTTCATTG
TAGATATCCATAAAATATCTCATCTTTAAATATCTATACTCTGCTAATTCGAAAAAGAAG
AGAAATAACCTCACGCAAGTGCAAAAATATCTGTAATAACGCTGTTTTTCTGACTAGAAT
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AATTGGTCTTCTTATTCAACCTTTTGAAACAAGATTTCATTATAATTTGGAATTTCGTAT
ACATCTTTTGAATATACATCTTTTATTTCTTTATTAATTTTATAGAAGTCTTTCTTTATT
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TTTTCTTATAATATTTATCCATTTAAACCTTCAATAAATTTTTTATTACAAGAGTATTTT
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TGAGTGATATTCTAAGCAATAATCTAATAATTAACTTCTACCTATTTTAATTAAACAGTA
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AGCTTCAAATTGTAAAATAAGAAACCAGATTAAAATTAGGAGTAACAAGAAAGATCTGTT
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ATTCTAATTATAAATCAATTATTTATTTTTTTATTACAGGCTCATTACATAAAAGGGAGA
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GGAACACCACTACAAAATAAGCTAGATGAGTTGTTTCCTTTAATTCACTTTATCAAACTT
GAACCATGGAGTGATTATATTTGGTTCAATAATTATATAAACAAGGTAAACAATTAAAAG
GAAAACAATTTTTAAAAATTATTATTAAAATTTAGCCTCATGAGAAAGGTGATTTAGTTG
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AAGATATTCATGGAAGAAGTATTATTAGCCTTCCAGAGAAACATTGCTTCATAGAGAAAG
TTGAGTTCACTCCTGAAGAAAGAATGTTTTATGACAAAGTTCACCAAACTTCCAAAGAAG
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AGACTTAGATAGATCTGTGATCACATATTTTTGCTGACAACTAGAGGTGACGTAACCAAC
ACAGATGGATTAGAATAAAAAATTAAGTCCTTTGTTGACAGGCGTAACAAAGCCTTGAAA
GAGCAAACTGAGCAAATTGAAAAAAAGGGAAAATCTGTTTATCTATAAAATTAATAAAAT
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GTAATTTTAGATGAGAACAATGTTGAATAGAGAATAGAAATTCCAGATAACTTTAACTTC
GACTATTCAGAATTATATTTGAATAAAGTAGTTGAAGACATCAAGTACAATAAAATAACT
TCATGTAACATTTGCTTAGAAGATATGGAAGATGCTGTCTTAACAGCATGTTTGCACGTT
TCATGCCGTTTATGCGCAATACGTTCCATTGAATTCACTGGAATGTGCCCAATTTGCAGA
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AAAAAATAAAATTATATATTGATAAATCTTAATAATAATAATAATAATTAGGTTTACTTT
TGATCCTACTTAAAAGTACATAAGAAGCTCAAAAATAAATGCTGTAATGAATTACATTTA
AAACTTATAAAAAACTGATGATAAATGTTTAGTGTTTACATAATTTTTGGGCATGATGGA
CTTATTTGAAATAGATTTCCAAAAAAATAAAATTCCTTATCTAGTAAAAATTTATTTAAA
TAAAAAAACATTTATTTATTTCCTAAAAACTAAATAGAGACTAGATGGTTCAGTTAATTA
AAAATAAAGAGCTGAAATAATTAAAAGATTTAACGAAGACAGCTAATACAAAGTTTTCAT
GATTTCATTAAAGGCAGGAGGTGTAGGTCTTAATCTAGTGAAAGCAAATCATGTTTTGAT
GGTAGATCCATGGTGGAATCCAGCAGTGTAATTTAATATTTATTTTGAATAATAATAATA
ATAATAAGAGTAATTTAATTACAAAATAAAGGGAAGAACAAGCAATAGAAAGATGTCATA
GAATAGGACAGAAAAAAGAAGTATTTGTTACTAGATTTATTTGTGATGACTCTATTGAGT
CCAGAATGATTAAACTTCATGAAGAAAAAAGAGACCTCTTTGAAAATACAATACAAGCTA
CTAAAAAAGATAAAAAAGAATAAAACATAGAGCACTTTAAATATCTAATGTCAACATATT
GA


>TTHERM_00037210(protein)
MNNHIQIEMEYYQSLYDSFVAIVGEGVCTDDEIKKYIQWGNGNLEISLNYYFQQQTKSSG
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DLFENTIQATKKDKKEQNIEHFKYLMSTY