Identifiers and Description
Gene Model Identifier
TTHERM_00037340
Standard Name
RPC1
(RNA polymerase III largest subunit Rpc1)
Aliases
PreTt14469 | 2.m02145 | 3825.m02839
Description
RPC1 DNA-directed RNA polymerase; RNA polymerase III largest subunit; DNA-directed RNA polymerase, subunit beta-prime
Genome
Browser (Macronucleus)
No Genome Browser Data Present
Genome Browser (Micronucleus)
No Genome Browser Data Present
External Links
Gene Ontology Annotations
No Data fetched for Gene Ontology Annotations
Domains
- ( PF00623 ) RNA polymerase Rpb1, domain 2
- ( PF04983 ) RNA polymerase Rpb1, domain 3
- ( PF04997 ) RNA polymerase Rpb1, domain 1
- ( PF04998 ) RNA polymerase Rpb1, domain 5
- ( PF05000 ) RNA polymerase Rpb1, domain 4
Gene Expression Profile
GeneMania
No results were calculated for this gene in GeneMania.
Tetrahymena Stock Center
No Data fetched for Tetrahymena Stock Center
Homologs
No Data fetched for Homologs
General Information
No Data fetched for General Information
Associated Literature
No Data fetched for Associated Literature
Sequences
>TTHERM_00037340(coding)
ATGTAAATGAGCGTTATTTAGCCTTTGAGGTAGTTAAAGGAGACTAAAAGAATTGGTAGC
ATCCAATACAGTATCTTATCTACTAATGAAATTATAGATATGTCTGAAGTGTGCCTTGAT
GAGCCTTCTTTTTATAATTAAACTACTCGTGCACCTTTAAATCGTGGTCCCTTAGATTTA
AGAATGGGTCCTTCAATGCGTGAAAATAATTTGAAATGTCAAACATGTAATTAAGAAATG
TTGGAATGTCCAGGTCATTTTGGTTTTATTAAATTGGCTCTACCAATATTCCATATAGGT
TTTTTTGGTGATGTCATTAACATCCTTTAATGTATTTGCAAGAGTTGTGGTAAGGTTTTG
CTGGATGAAGATGAAAAGAAGAACTCAATGAAAAGAATGCAAAAAGCTATTGATGACAAA
AATTATCAATTAAGAGCTGATTTGTATGTAAAAATGAGAAAAGAATGCAAAAAAGGTGCC
AACTAAAAATGTAGGTCTTGTGGATATAAAAACGGACCCTTAAAGAAAATGCCTAAAATG
CCTACAACTATTAGTTTTTCTGATCAAACCAAATTAGAATAGGATTTTCGTGACATTAGA
GAATCTGAAGACATATTTTAAGAGAATTTAAGAAAAATTTTGGAAAGTAAAAATATGAAG
GAAATGATTGAAATATTAAATCCTTTAGAAACCTATAAAATTTTCAGAAAAATTACATGT
GATGAAATTTTATTATTTAATATTCAATAAAACCATCCTTGTGATTTAATTCTCACTCAT
ATCATAGCACCCCCAGCTTGTATAAGACCAACTGTTAAAGAAGGAGAATCTAATGTTCGT
CACGATGATCTCACTGTTAAAATTAGAGATTTTTTGGACAGAAATAAAAGAATTGCTTAG
ATGATAGAAGATGGTGAAGATTTAATTAAAATTAACTAAGAGTGGTTCTTACTTTAGTGT
TCACATGCTCACTATTTGAATGCTGAAACTCCAAACTTGCCTTTTAAAATGGACAAAGAT
TTTGGTAAAAAGGATATTAGAGCACTTGCACAAAGATTAAAAGGTAAAAAAGGTAGATTC
AGAGGTAATCTTTCTGGTAAAAGATCAAACTTTACAGGTAGAACTGTTATTTCTCCTGAC
CCTAACATCCCTATTGATAATGTTGTTGTTCCTGAATACATGGCTAAAATTCTCACTTTC
CCTGAATAAGTTAATGCTATCAATATCGAAAGATTAAAAAAATTAGTTATAAATGGACCT
GAAAAATATCCAGGAGCTCATTATATAATAGCAAAAGACACAGAAGACAAATTTAATCTA
TCAATAGATAATAGAAGAAAGAAAGCAGATGAACTCAAGATTGGTGATATTGTAGAAAGA
CACATCCAAAACGGAGAAATTTTACTTTTTAATAGACAGCCTTCTTTGCATAGAATTTCA
ATTATGGCATTCAAGGCCAATATATAAAAATGGAATACAATCAGATTTAATGAATGTTGC
TGTGCTCCTTTCAATGCTGATTTTGATGGTGATGAAATGAATATTCATGTTCCATAAACA
ATAGAAGCAAGAGCTGAGGCCTAATATCTCCTTGATGTTAAACAAAATTTAATCAGTCCT
AAAAATGGTGAGTCAATTATTGCATTGATTTAGGATTTCTTAACTACTGCTTATTTAATC
ACTCATAAAGATATGTTTTTTGATAGAGCTGCTTTTTGCTAATGCTGTACTTACTTCAGT
GATGGTATTGAAAGAATTGATTTGCCTCCTCCAGCTATCATACTTCCTGTTGAAATGTGG
ACTGGAAAATAAATTATAGATGTCATCCTAAGACCTAATAGATTTAGCAATATTATTGTT
AATCTTATATTAAAAGAAAAATGCTACGATACTAAGTAAGATAGAGGTGTTATGTGTCCC
ACTGATGGTTATGTAGTCTTTCAATCATCTGAATTAATGTGTGGTAATCTTGGTAAAACT
ACTTTAGGTTCTGGTAATAAAAATGGTTTGTTTTACAGATTAAGTAGAGATAATTCTCAA
TACATGGCTGCATCAGTCATGAGTAGATTTGCAAAATTGTCTGCTCGTTGGATTACAAAT
TATGGCATGACAATTGGTATTAGTGATGTTACTCCTTCTCCAAGTCTCAACAAAATTAAT
GAAAAAAAGAAAGATGAAGCCATCGATTCTTGTAAGTTCCAAAGTCTTATTTTCACAAAT
TCTATTGGAAAACTAGATATGCAAACTGTTTCAGACAGAAAAAAGCTTGTAGAAGCTGAA
ATTAGTAAAACTTTGAATCAAGTCAGAGAAGACATAGGTTCAAATTGTAATAAGTAATTA
CCACCTACTAATGGTCCTCTTATTATGGCTACATGTGGTTCAAAGGGTTCAGCAACCAAC
CTTTCTTAAATGATTGGATGTGTCGGTTAATAAATTATTGGTGGTCGAAGAGTTCCTAAT
GGCTTTACTGGGCGTACTCTTCCTCATTTTGAAAAAGATGAAATATTCCCTCATCCAGAA
GCTATGGGTTTCGTTAGAAATTCCTTCTTTACTGGTTTAAGTGCACCAGAATTTTTCTTC
CACACAATGGCTGGTCGTGAATCTCTTGTTGATACTGCTGTCAAAACTGCAGATACAGGT
TATATGAGTAGAAGATTGGTTAAGATGCTTGAAGATTTATCTGTAAACTATGATCTTACA
ATTAGAACTTGTGATAAAAAAGAATTAGTTCAGTTTAGATATGGTGGTGATGGTATTTGT
CCTTGGATGTCAGAAGAAAAAGTAACTGATAAAAGTATTCCAATAGATCTTGAAACTATG
TTAAAATATGTCAAATCAATAGCTCCCATAAATTATAAGAGAGAGTAATCCTTGTATCCT
TATTAAATTTATCAAATCTGTTTGGAAGAATTAAAAAGAACAAAAATGGATTATATTCCA
GAATTAAGTTTAGAACCTATGTAAAACTCATCTTATAATAGAGAATTCGACTAAGATTAC
ATACAATAATAATTGAATAGTACAGATAACAAGTTTGATGTCCAACTAGTAAAAGAGCCC
TTAGAGTACTTTAAAGACTCAGTAAGTCTATTTATCAAGTAGATATGCTAAAAAATTATG
AAAGTGAGAACTTAACTTGGATTAACTCCTGGTGATATTGAGTCACCTGATAATGCTACT
AGCATCCATGTTGATAATACAATTCATATTACTAAAAGACAAATTAATTACTTCTTTAAA
ACTTTGTGGGAAAGATATCCATAGATGCTTGTTGAACCAGGAGAGGCTGTAGGTGCAGTT
GGTGCAACATCAATATCTGAACCAGCTACTTAAATGACTTTAAAATCTTTTCACTTTGCT
GGTGTTGCGAGTATGAATATTACATAGGGTGTTCCAAGAATGAAAGAAATCATTGATGCT
GCTAAGAAAATTAGCACTCCAATCATAGATGTTAAGTTGCTTCCTCAATTTTAGAGTGAG
CACTCTTATAGATCAATTCGTTTACAAATAGAAAAAACTTATCTTGGTGAAATCAGTAAC
TTCTATCAAGAAGTTTACTCTCCTAAAGATTGCCACCTTTACATAGAGTATAATAAGAAA
AAATTGGAATAATTCAGACTTTATGGATTAGAAATACCTTTATCAAGCATTAAAAAAGGT
ATTCTTGAAATTGCTAAAGATATAAAGGAAGATTAAATTATTGCCGTAAAGGATTAAGAT
CTCAAGCCTGTTGGTATTAAAATCAACCCAGGTAATGATGTCAAGAAGAACGTGTTCTTT
AAAATTTAAAACTGGAAAAAGATACTTCCAGGAGCTGTTGTTTCAGGTATGAAGGATGTA
AAGAGAGTAAGTATCTCAAAAGACAAGAAGAAGGGAGATAAAAATGAGTACAAATTCGAT
TTGTTTGTTGAAGGTAATTCTTTTAAATAAGTTTTACAACTTGATGAGGTAGATTTTGCA
AATACTCTTTCTGTTGATATTTTCGAAGTATTACAAATTTTGGGTGTAGAAGCTGCAAGA
AAGACAATTATAAATGAAATTACTAAAACTATCAAATCCCACTCTCTTAATGTCGATAGA
CGTCACTTGATTTTAGTTGCCGATGTCCTTACTTCTAAGGGTCGCTTACATGGCTCAACC
AGATAGGGAATCAATAGTATGAAAGACTCAACTTTGATGTTGGCTTCATTCGAAAAAACT
ACTGAAATCTTATACAACGCTGCCTTATAGGGAAGAAAAGACACTTTAGAAGGTGTATCT
GAAAGAATTATTATTGGTCAAAATATTCCTATGGGAACAGGTACATTTAATTTGCTTTAT
GGAAACAGAAGTATTGTTCAGAAAAAGAAGAAGAAAATTATATCTTCTAAAGTTAAATTT
ACTCCTCTTTTTAAAGATTCAAAATGA
>TTHERM_00037340(gene)
TAATAAATATAAATTGGTTGATCAAAATATCTTTGTCTAACAAATAAATAAATTAATTAA
TAATTACTTATTTCATATATACATTGAATAAGATAAATAAACTTAGCATATAAATATACA
TATATACATCTATATAGTTAATAGTATAAACAAGGATATAATTAATCAATCATTAAAGTC
TAGTATAGAATCAATCAATTTGCTACATGTAAATGAGCGTTATTTAGCCTTTGAGGTAGT
TAAAGGAGACTAAAAGAATTGGTAGCATCCAATACAGTATCTTATCTACTAATGAAATTA
TAGATATGTCTGAAGTGTGCCTTGATGAGCCTTCTTTTTATAATTAAACTACTCGTGCAC
CTTTAAATCGTGGTCCCTTAGATTTAAGAATGGGTCCTTCAATGCGTGAAAATAATTTGA
AATGTCAAACATGTAATTAAGAAATGTTGGAATGTCCAGGTCATTTTGGTTTTATTAAAT
TGGCTCTACCAATATTCCATATAGGTTTTTTTGGTGATGTCATTAACATCCTTTAATGTA
TTTGCAAGAGTTGTGGTAAGGTTTTGCTGGATGAAGATGAAAAGAAGAACTCAATGAAAA
GAATGCAAAAAGCTATTGATGACAAAAATTATCAATTAAGAGCTGATTTGTATGTAAAAA
TGAGAAAAGAATGCAAAAAAGGTGCCAACTAAAAATGTAGGTCTTGTGGATATAAAAACG
GACCCTTAAAGAAAATGCCTAAAATGCCTACAACTATTAGTTTTTCTGATCAAACCAAAT
TAGAATAGGATTTTCGTGACATTAGAGAATCTGAAGACATATTTTAAGAGAATTTAAGAA
AAATTTTGGAAAGTAAAAATATGAAGGAAATGATTGAAATATTAAATCCTTTAGAAACCT
ATAAAATTTTCAGAAAAATTACATGTGATGAAATTTTATTATTTAATATTCAATAAAACC
ATCCTTGTGATTTAATTCTCACTCATATCATAGCACCCCCAGCTTGTATAAGACCAACTG
TTAAAGAAGGAGAATCTAATGTTCGTCACGATGATCTCACTGTTAAAATTAGAGATTTTT
TGGACAGAAATAAAAGAATTGCTTAGATGATAGAAGATGGTGAAGATTTAATTAAAATTA
ACTAAGAGTGGTTCTTACTTTAGTGTTCACATGCTCACTATTTGAATGCTGAAACTCCAA
ACTTGCCTTTTAAAATGGACAAAGATTTTGGTAAAAAGGATATTAGAGCACTTGCACAAA
GATTAAAAGGTAAAAAAGGTAGATTCAGAGGTAATCTTTCTGGTAAAAGATCAAACTTTA
CAGGTAGAACTGTTATTTCTCCTGACCCTAACATCCCTATTGATAATGTTGTTGTTCCTG
AATACATGGCTAAAATTCTCACTTTCCCTGAATAAGTTAATGCTATCAATATCGAAAGAT
TAAAAAAATTAGTTATAAATGGACCTGAAAAATATCCAGGAGCTCATTATATAATAGCAA
AAGACACAGAAGACAAATTTAATCTATCAATAGATAATAGAAGAAAGAAAGCAGATGAAC
TCAAGATTGGTGATATTGTAGAAAGACACATCCAAAACGGAGAAATTTTACTTTTTAATA
GACAGCCTTCTTTGCATAGAATTTCAATTATGGCATTCAAGGCCAATATATAAAAATGGA
ATACAATCAGATTTAATGAATGTTGCTGTGCTCCTTTCAATGCTGATTTTGATGGTGATG
AAATGAATATTCATGTTCCATAAACAATAGAAGCAAGAGCTGAGGCCTAATATCTCCTTG
ATGTTAAACAAAATTTAATCAGTCCTAAAAATGGTGAGTCAATTATTGCATTGATTTAGG
ATTTCTTAACTACTGCTTATTTAATCACTCATAAAGATATGTTTTTTGATAGAGCTGCTT
TTTGCTAATGCTGTACTTACTTCAGTGATGGTATTGAAAGAATTGATTTGCCTCCTCCAG
CTATCATACTTCCTGTTGAAATGTGGACTGGAAAATAAATTATAGATGTCATCCTAAGAC
CTAATAGATTTAGCAATATTATTGTTAATCTTATATTAAAAGAAAAATGCTACGATACTA
AGTAAGATAGAGGTGTTATGTGTCCCACTGATGGTTATGTAGTCTTTCAATCATCTGAAT
TAATGTGTGGTAATCTTGGTAAAACTACTTTAGGTTCTGGTAATAAAAATGGTTTGTTTT
ACAGATTAAGTAGAGATAATTCTCAATACATGGCTGCATCAGTCATGAGTAGATTTGCAA
AATTGTCTGCTCGTTGGATTACAAATTATGGCATGACAATTGGTATTAGTGATGTTACTC
CTTCTCCAAGTCTCAACAAAATTAATGAAAAAAAGAAAGATGAAGCCATCGATTCTTGTA
AGTTCCAAAGTCTTATTTTCACAAATTCTATTGGAAAACTAGATATGCAAACTGTTTCAG
ACAGAAAAAAGCTTGTAGAAGCTGAAATTAGTAAAACTTTGAATCAAGTCAGAGAAGACA
TAGGTTCAAATTGTAATAAGTAATTACCACCTACTAATGGTCCTCTTATTATGGCTACAT
GTGGTTCAAAGGGTTCAGCAACCAACCTTTCTTAAATGATTGGATGTGTCGGTTAATAAA
TTATTGGTGGTCGAAGAGTTCCTAATGGCTTTACTGGGCGTACTCTTCCTCATTTTGAAA
AAGATGAAATATTCCCTCATCCAGAAGCTATGGGTTTCGTTAGAAATTCCTTCTTTACTG
GTTTAAGTGCACCAGAATTTTTCTTCCACACAATGGCTGGTCGTGAATCTCTTGTTGATA
CTGCTGTCAAAACTGCAGATACAGGTTATATGAGTAGAAGATTGGTTAAGATGCTTGAAG
ATTTATCTGTAAACTATGATCTTACAATTAGAACTTGTGATAAAAAAGAATTAGTTCAGT
TTAGATATGGTGGTGATGGTATTTGTCCTTGGATGTCAGAAGAAAAAGTAACTGATAAAA
GTATTCCAATAGATCTTGAAACTATGTTAAAATATGTCAAATCAATAGCTCCCATAAATT
ATAAGAGAGAGTAATCCTTGTATCCTTATTAAATTTATCAAATCTGTTTGGAAGAATTAA
AAAGAACAAAAATGGATTATATTCCAGAATTAAGTTTAGAACCTATGTAAAACTCATCTT
ATAATAGAGAATTCGACTAAGATTACATACAATAATAATTGAATAGTACAGATAACAAGT
TTGATGTCCAACTAGTAAAAGAGCCCTTAGAGTACTTTAAAGACTCAGTAAGTCTATTTA
TCAAGTAGATATGCTAAAAAATTATGAAAGTGAGAACTTAACTTGGATTAACTCCTGGTG
ATATTGAGTCACCTGATAATGCTACTAGCATCCATGTTGATAATACAATTCATATTACTA
AAAGACAAATTAATTACTTCTTTAAAACTTTGTGGGAAAGATATCCATAGATGCTTGTTG
AACCAGGAGAGGCTGTAGGTGCAGTTGGTGCAACATCAATATCTGAACCAGCTACTTAAA
TGACTTTAAAATCTTTTCACTTTGCTGGTGTTGCGAGTATGAATATTACATAGGGTGTTC
CAAGAATGAAAGAAATCATTGATGCTGCTAAGAAAATTAGCACTCCAATCATAGATGTTA
AGTTGCTTCCTCAATTTTAGAGTGAGCACTCTTATAGATCAATTCGTTTACAAATAGAAA
AAACTTATCTTGGTGAAATCAGTAACTTCTATCAAGAAGTTTACTCTCCTAAAGATTGCC
ACCTTTACATAGAGTATAATAAGAAAAAATTGGAATAATTCAGACTTTATGGATTAGAAA
TACCTTTATCAAGCATTAAAAAAGGTATTCTTGAAATTGCTAAAGATATAAAGGAAGATT
AAATTATTGCCGTAAAGGATTAAGATCTCAAGCCTGTTGGTATTAAAATCAACCCAGGTA
ATGATGTCAAGAAGAACGTGTTCTTTAAAATTTAAAACTGGAAAAAGATACTTCCAGGAG
CTGTTGTTTCAGGTATGAAGGATGTAAAGAGAGTAAGTATCTCAAAAGACAAGAAGAAGG
GAGATAAAAATGAGTACAAATTCGATTTGTTTGTTGAAGGTAATTCTTTTAAATAAGTTT
TACAACTTGATGAGGTAGATTTTGCAAATACTCTTTCTGTTGATATTTTCGAAGTATTAC
AAATTTTGGGTGTAGAAGCTGCAAGAAAGACAATTATAAATGAAATTACTAAAACTATCA
AATCCCACTCTCTTAATGTCGATAGACGTCACTTGATTTTAGTTGCCGATGTCCTTACTT
CTAAGGGTCGCTTACATGGCTCAACCAGATAGGGAATCAATAGTATGAAAGACTCAACTT
TGATGTTGGCTTCATTCGAAAAAACTACTGAAATCTTATACAACGCTGCCTTATAGGGAA
GAAAAGACACTTTAGAAGGTGTATCTGAAAGAATTATTATTGGTCAAAATATTCCTATGG
GAACAGGTACATTTAATTTGCTTTATGGAAACAGAAGTATTGTTCAGAAAAAGAAGAAGA
AAATTATATCTTCTAAAGTTAAATTTACTCCTCTTTTTAAAGATTCAAAATGAAGAAATT
GTGTTAAATGCTAGTTAGCTGTTTAAAATATTTAATTTTATAAATGCTCCTATTTCAAAA
TAATTTATTATTGTATGTATTGTTC
>TTHERM_00037340(protein)
MQMSVIQPLRQLKETKRIGSIQYSILSTNEIIDMSEVCLDEPSFYNQTTRAPLNRGPLDL
RMGPSMRENNLKCQTCNQEMLECPGHFGFIKLALPIFHIGFFGDVINILQCICKSCGKVL
LDEDEKKNSMKRMQKAIDDKNYQLRADLYVKMRKECKKGANQKCRSCGYKNGPLKKMPKM
PTTISFSDQTKLEQDFRDIRESEDIFQENLRKILESKNMKEMIEILNPLETYKIFRKITC
DEILLFNIQQNHPCDLILTHIIAPPACIRPTVKEGESNVRHDDLTVKIRDFLDRNKRIAQ
MIEDGEDLIKINQEWFLLQCSHAHYLNAETPNLPFKMDKDFGKKDIRALAQRLKGKKGRF
RGNLSGKRSNFTGRTVISPDPNIPIDNVVVPEYMAKILTFPEQVNAINIERLKKLVINGP
EKYPGAHYIIAKDTEDKFNLSIDNRRKKADELKIGDIVERHIQNGEILLFNRQPSLHRIS
IMAFKANIQKWNTIRFNECCCAPFNADFDGDEMNIHVPQTIEARAEAQYLLDVKQNLISP
KNGESIIALIQDFLTTAYLITHKDMFFDRAAFCQCCTYFSDGIERIDLPPPAIILPVEMW
TGKQIIDVILRPNRFSNIIVNLILKEKCYDTKQDRGVMCPTDGYVVFQSSELMCGNLGKT
TLGSGNKNGLFYRLSRDNSQYMAASVMSRFAKLSARWITNYGMTIGISDVTPSPSLNKIN
EKKKDEAIDSCKFQSLIFTNSIGKLDMQTVSDRKKLVEAEISKTLNQVREDIGSNCNKQL
PPTNGPLIMATCGSKGSATNLSQMIGCVGQQIIGGRRVPNGFTGRTLPHFEKDEIFPHPE
AMGFVRNSFFTGLSAPEFFFHTMAGRESLVDTAVKTADTGYMSRRLVKMLEDLSVNYDLT
IRTCDKKELVQFRYGGDGICPWMSEEKVTDKSIPIDLETMLKYVKSIAPINYKREQSLYP
YQIYQICLEELKRTKMDYIPELSLEPMQNSSYNREFDQDYIQQQLNSTDNKFDVQLVKEP
LEYFKDSVSLFIKQICQKIMKVRTQLGLTPGDIESPDNATSIHVDNTIHITKRQINYFFK
TLWERYPQMLVEPGEAVGAVGATSISEPATQMTLKSFHFAGVASMNITQGVPRMKEIIDA
AKKISTPIIDVKLLPQFQSEHSYRSIRLQIEKTYLGEISNFYQEVYSPKDCHLYIEYNKK
KLEQFRLYGLEIPLSSIKKGILEIAKDIKEDQIIAVKDQDLKPVGIKINPGNDVKKNVFF
KIQNWKKILPGAVVSGMKDVKRVSISKDKKKGDKNEYKFDLFVEGNSFKQVLQLDEVDFA
NTLSVDIFEVLQILGVEAARKTIINEITKTIKSHSLNVDRRHLILVADVLTSKGRLHGST
RQGINSMKDSTLMLASFEKTTEILYNAALQGRKDTLEGVSERIIIGQNIPMGTGTFNLLY
GNRSIVQKKKKKIISSKVKFTPLFKDSK