Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00047480

Standard Name

RPS1 (Ribosomal Protein of the Small subunit 1)

Aliases

PreTt11227 | 3.m01917 | 3824.m02985

Description

RPS1 40S ribosomal protein S3a; Homolog of yeast RPS1- human RPS3A

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External Links

• Uniprot
• Alphafold

Gene Ontology Annotations

Cellular Component

• intracellular anatomical structure (IEA) | GO:0005622
• ribosome (IEA) | GO:0005840

Molecular Function

• structural constituent of ribosome (IEA) | GO:0003735

Biological Process

• translation (IEA) | GO:0006412

Domains

No Data fetched for Domains

Gene Expression Profile

Vegetative Cell Cycle (Zhang et al., 2023)

GeneMania

No results were calculated for this gene in GeneMania.

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for Tetrahymena Stock Center

Homologs

Source	Identifier	Score
Tetrahymena borealis	EI9_01703.1	2.9990501533945683e-168
	Description: ribosomal S3Ae family protein (266 aa)
SGD	YLR441C	3.9997119520108244e-79
	Description: RPS1A Ribosomal protein 10 (rp10) of the small (40S) subunit; nearly identical to Rps1Bp and has similarity to rat S3a ribosomal protein
Oxytricha	Contig850.1.g11	7.000846320060671e-65
	Description: Ribosomal S3Ae family
WormBase	WBGene00004470	3.0014802379878627e-60
	Description: locus:rps-1 40S ribosomal protein S3a status:Confirmed UniProt:P48154 protein_id:CAA83605.1
WormBase	WBGene00013808	3.0014802379878627e-60
	Description: locus:sfa-1 status:Confirmed UniProt:G5EF97 protein_id:CAB55136.2
DictyBase	DDB_G0277345	2.9997246065828143e-59
	Description: rps3a on chromosome: 2 position 7795600 to 7797187
Stentor Coeruleus	SteCoe_1787	1.8048513878454153e-35
	Description: None

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

1. Ref:21205638: Rabl J, Leibundgut M, Ataide SF, Haag A, Ban N (2011) Crystal structure of the eukaryotic 40S ribosomal subunit in complex with initiation factor 1. Science (New York, N.Y.) 331(6018):730-6

Sequences

>TTHERM_00047480(coding)
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>TTHERM_00047480(gene)
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GGATTCTTACCTTGAGTCATTTTTACTTTTGTTCCTTTTTTGTTTTGTGTTTTATTATCT
TTAATTATTTCTTAAAAAATTACCCTTGTATTGCTTTTTTAGCTTTGA

>TTHERM_00047480(protein)
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