Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00047550

Standard Name

RPA1 (RNA Polymerase I largest subunit)

Aliases

PreTt11234 | 3.m01913 | RPII | 3824.m02992

Description

RPA1 DNA-directed RNA polymerase I protein; shared largest subunit of RNA Polymerase I

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Gene Ontology Annotations

Biological Process

Domains

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Gene Expression Profile

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for Tetrahymena Stock Center

Homologs

Source Identifier Score
Stentor Coeruleus SteCoe_9278 0
Description: None
WormBase WBGene00012999 9.997093137033517e-262
Description: locus:rpoa-1 DNA-directed RNA polymerase status:Partially_confirmed UniProt:G5ED21 protein_id:CAB07687.2
Tetrahymena borealis EI9_01697.1 9.997093137033517e-262
Description: RNA polymerase Rpb1, domain 2 family protein (1722 aa)
DictyBase DDB_G0275759 9.997093137033517e-262
Description: rpa1 on chromosome: 2 position 5808489 to 5813651
Oxytricha Contig17704.0.g32 9.997093137033517e-262
Description: RNA polymerase Rpb1, domain 5
SGD YOR341W 9.997093137033517e-262
Description: RPA190 RNA polymerase I largest subunit A190

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

  1. Ref:15470252: Mochizuki K, Gorovsky MA (2004) RNA polymerase II localizes in Tetrahymena thermophila meiotic micronuclei when micronuclear transcription associated with genome rearrangement occurs. Eukaryotic cell 3(5):1233-40
  2. Ref:8756729: Shen X, Gorovsky MA (1996) Linker histone H1 regulates specific gene expression but not global transcription in vivo. Cell 86(3):475-83

Sequences 

>TTHERM_00047550(coding)
ATGAATGCTCATTGTGTGCAAAATTAATTTAGAGTATAAAAAATAGAATCAAAAAAAGAA
GCAATAAAAGAAAGAAATAAATAAGATAAATTAAAAGATAAAAAATAAAAATAAAAGGAA
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GAAAATCCCATTCTTGAGTAAATTCAAAGAAAGCTCGTTCGTGATCCCCAACTTGCTGAA
GCTTAAGATAATGTTTATAAGTCAACTATGTCTTAAAAAGGTTCCAAAATTCTTAACACT
GCTCTCGGTGGTCTTATTAAAAAATTCCCTTTCAACAATTTCACTACAATGACTAATTCT
GGTGCTAAGGGTTCTAAAGTCAACCATACGTAAGTTTCTGCCTTACTTGGTCAATAAGAA
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GTTGCATATGACTACACTGTCAGAGATGCTGATGGCTCAGTTGTCCAATTCTATTATGGT
GAAGACTCTATTGATCCCAATAAAGTTAAATATTTAGAAAAATTCCGTTTCTTAGCTGAA
AACTTTACTTCTTTCACTCAAAAATATGATCCTTATCACTTGAAAGACTCTCATGATTTC
GAATCTGTCAATCGTTTCTTGAAGAAAAGAAAGAGATAAGAAAGTTCTGAAACAGAAAAG
AAAACTTGTGACACTATTATGAACAACTTTTTACCTGGTAAACACATTGGCTCTGTTTCT
GAACGTGTCTACAAGAATGTAAAGGAATACATTAAGAAAGAATAGCAAAGTGCTGATCCT
TACAGCAACATCTTCAACATAAAGTAGGATTAATTAAGTCCTTAAAAATTCCATATGCTT
TTCAATGTAAAATACCTTAACTCTCTCATTCATCCTGGTGATTCTGTTGGTTGTCTTGCA
GCCCAAGCTATCGGTGAACCATCTACATAGATGACATTGAATACTTTCCACTTGGCTGGT
CACGGTGGTGTTAACCTTACCTTGGGTATTCCTCGTCTAAGAGAAATCTTGATGACTGCT
ACAGACAAATTGAAGACTCCAGTCATGCTTTTAAATCTTTCAAATCCTGAAGTTGCTTAA
AACAAAGAATAAGTTCAAAATCATGCTCGTAAGCTCTAAAAAATTAATTTATTAGAACTT
GTTAATAACATCGAAGTCAAGGAACAAAAAATTATTGTTGTTGATAACAATATTTTACCC
TTCAATGAACGTTTCAGACACTATGAAATTAAAATCAACTTAGAAGACTTAGAAGCTATT
CACTTCGCATTCTAATTAAACATTGACACAATTAATCGTAGAATTGAAAAGGTCTTCCTT
CCTAACCTCTTCTAATACATTAACAAAGAACTTAAACGTGATTAAAAATCTGAACTTTAA
ACTAGAGTTCTTAAGAAGAAAGAAAATGAAAGCAGCGGTATGGAAACTGAAGGCTTAGTT
AGCGATTTCGACAAAGAAGCTGCTTCAGATGGTGAAGAATTAAAGAAAGCTGCTGATGCT
TTAGTAAGCGAAGTAGAATATGGCATATTTACTGAGACAGAAGATGAATTAAAATCTAAG
TCCAAACCTCAATCTGCAGAACCAGTAAAGAGAGTCCCAACTAGAACTTCCAAAGCAGAA
TTATTTGAAGCTTCTCCTTATTACAACGGTCATACTATAGAAGGTGAACGTATAGTTTGT
AACATTAAATTACCTTTAGATTCTAAGAAGTTATTGATGGTCAACTTGGTTGAAAAAATA
TTAAAGAAGACTTTGGTTTATGAAGTAAAGAATATCTCTAATGCAACTGTCCTCAAAAAG
GATAATAAAGGAGCCACTTCTTATCAAATTTAAACAGAAGGTGTTAATTTCAAGTAAATC
TGGAAAATGGATCACTTCGACTCTAATACTATAGACTCAAATGATATAGCTGCCTTAAAC
AAATGTTACGGTATTGAAGCTGCTAGAAATGCAATTGTAAAAGAAATCGTCACTGTGTTC
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ATCGATACTCTTTCTACTCCTTCTTCCTCAATTGTCTTAGGTAGAGTTCCCTAAGTAGGT
ACTGGTGTTTTCGACATTCTCCATAAGGTTTGA


>TTHERM_00047550(gene)
ATGAATGCTCATTGTGTGCAAAATTAATTTAGAGTATAAAAAATAGAATCAAAAAAAGAA
GCAATAAAAGAAAGAAATAAATAAGATAAATTAAAAGATAAAAAATAAAAATAAAAGGAA
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ATTAGTAGACGTCTCGCTGGTGTAGGCTTTTCTTATTACACTGCTGACGAAATCCGTAAA
TTGTCAGTAAAGGAAATAACTAATCCTATTGCATTCGACTCATTAAATAGACCTATCAAA
GGTAATAAATCGATTTTTCATAATTTATAAAATTCCTTTTCATGATTTCATAATGCTACT
TTGATTATTTAAAGATTGTAGTTATGGAATCTTTTAAAACTTTGATATTTTTTTTCCCAA
ATTTATTACAATACTCAAAGCATTATATAATGAAATATATTTTAATAAACAAAGGTGGTT
TATATGATCCTTGTATGGGTGTATCTCCTTACGATAAATTTACTCGTTGCGAAACTTGTG
GTTGTGAAGGATTGGAATGTCCTGGTATAAATTTATTAATAAATTTTGATTTATCCATTG
AATTTCATGAAGCTGATATCTTGCATTTTTGGTTAATCATTAAGTTGATAAGCATTAAGA
AAAATTTACGGATTTCATGAATTTTCAATATAACTTTGAAAAATTTTACTCAATCGTTTT
ATTTCTACATTAAATAAAATAGGTCATATGGGTCACGTAGAACTCCTCTTACCTGTTTAT
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TAAAGGTATTTATTTATTTGTTAATATATTTTTTTTCTAGAAAATAATAACTAATTTATT
TTAATTTAATAGGTTTTATGATAAGAAGAAATGACTATAATATGTTCTTTATTGAAGTTA
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ATGGACATACTGTAGTTTTGACAAAAATTTTATAATTCAATGTTGAATTAAGACGTATGA
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ATTCTCGCTTTTAAAATTAATTATAATTAAAGCAAAACTAGAATTTCTAGCAAACTATTA
ACAATATTGTTAAGCTTAATGATGTCATCACTAAGTGGTTAGATATACAAGAAGCTGTTA
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GTTAACTCCTTGAAAAGAAGGAAGGTCTCTTTAGAATGAAAATGATGGGTAAGCGTGTTA
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TTCCACTTTTTGTTGCAAAAAAACTTACTTTCCCTGAATATGTAAATGAATATAATGCTA
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TTGAAAACGGAAACAAGATTTCCCTTGAAGCTCTCAATGAGCAATAAAGAATAGGTCTTG
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TAATTTATTAGAACTTGTTAATAACATCGAAGTCAAGGAACAAAAAATTATTGTTGTTGA
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AGACTTAGAAGCTATTCACTTCGCATTCTAATTAAACATTGACACAATTAATCGTAGAAT
TGAAAAGGTCTTCCTTCCTAACCTCTTCTAATACATTAACAAAGAACTTAAACGTGATTA
AAAATCTGAACTTTAAACTAGAGTTCTTAAGAAGAAAGAAAATGAAAGTAAAATTATTTT
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TGAAGGCTTAGTTAGCGATTTCGACAAAGAAGCTGCTTCAGATGGTGAAGAATTAAAGAA
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CAAAACCATAAGTAATATCTATATATTAATCAAAAAGGGTCATACTATAGAAGGTGAACG
TATAGTTTGTAACATTAAATTACCTTTAGATTCTAAGAAGTTATTGATGGTCAAGTAATA
ATTCTTTACTATTTTTTATTTATTTGTGCTTTCTTCAATTTTAAAAAAACACTTATTAAT
TCTCATTTTACATAAAATAGCTTGGTTGAAAAAATATTAAAGAAGACTTTGGTTTATGAA
GTAAAGAATATCTCTAATGCAACTGTCCTCAAAAAGGATAATAAAGGAGCCACTTCTTAT
CAAATTTAAACAGAAGGTGTTAATTTCAAGTAAATCTGGAAAATGGATCACTTCGACTCT
AATACTATAGACTCAAATGATATAGCTGCCTTAAACAAATGTTACGGTGTAAGAAATTCA
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TGGTGTCGTTGTTGATTACAGACACTTGTACTTAATTGCTGATTATCTTACTTTCAGCGG
AGAAATGAAGGCCATGAATAGAGTTTGGATGGATGAAAGCATCAGTCCTTTCCTCAAGAT
GTCTTTCGAAACTTGTGTTAAATTCCTTACAAATGCTGCTACAAATAATGAAATCGATAC
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TTTCGACATTCTCCATAAGGTTTGA


>TTHERM_00047550(protein)
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