Identifiers and Description
Gene Model Identifier
TTHERM_00047550
Standard Name
RPA1
(RNA Polymerase I largest subunit)
Aliases
PreTt11234 | 3.m01913 | RPII | 3824.m02992
Description
RPA1 DNA-directed RNA polymerase I protein; shared largest subunit of RNA Polymerase I; DNA-directed RNA polymerase, subunit beta-prime
Genome
Browser (Macronucleus)
No Genome Browser Data Present
Genome Browser (Micronucleus)
No Genome Browser Data Present
External Links
Gene Ontology Annotations
No Data fetched for Gene Ontology Annotations
Domains
- ( PF00623 ) RNA polymerase Rpb1, domain 2
- ( PF04983 ) RNA polymerase Rpb1, domain 3
- ( PF04997 ) RNA polymerase Rpb1, domain 1
- ( PF04998 ) RNA polymerase Rpb1, domain 5
- ( PF05000 ) RNA polymerase Rpb1, domain 4
Gene Expression Profile
GeneMania
No results were calculated for this gene in GeneMania.
Tetrahymena Stock Center
No Data fetched for Tetrahymena Stock Center
Homologs
No Data fetched for Homologs
General Information
No Data fetched for General Information
Associated Literature
- Ref:15470252: Mochizuki K, Gorovsky MA (2004) RNA polymerase II localizes in Tetrahymena thermophila meiotic micronuclei when micronuclear transcription associated with genome rearrangement occurs. Eukaryotic cell 3(5):1233-40
- Ref:8756729: Shen X, Gorovsky MA (1996) Linker histone H1 regulates specific gene expression but not global transcription in vivo. Cell 86(3):475-83
Sequences
>TTHERM_00047550(coding)
ATGAATGCTCATTGTGTGCAAAATTAATTTAGAGTATAAAAAATAGAATCAAAAAAAGAA
GCAATAAAAGAAAGAAATAAATAAGATAAATTAAAAGATAAAAAATAAAAATAAAAGGAA
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AATAGCATAAATATTGGCAAATGCCCTCACTGCAAAGAACCATAATAAGCAATTAGAAAA
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TATGTAAATGAATATAATGCTAAGCATCTCAGAAAACTTATTATCAATGGTCCTTTCTAA
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TATCGTCATTTATAATCTGGTGATGTCCTCCTTTTCAATAGACAACCTACCCTACATAAA
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TATGCAAACTGTAAATCATATAATGCAGATTTCGATGGTGATGAAATGAACTTGCATTTC
CTTTAATCTCATTTAGCCAGAGCTGAAGGTTATCACATTAGTTTAAATGATCGTTAATTC
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AAAGGTAGATTCTCTTCTAATGTTCTTAAACGTAAGCCCGAAGTTGACTATCTTTCAAAT
GAAAATCCCATTCTTGAGTAAATTCAAAGAAAGCTCGTTCGTGATCCCCAACTTGCTGAA
GCTTAAGATAATGTTTATAAGTCAACTATGTCTTAAAAAGGTTCCAAAATTCTTAACACT
GCTCTCGGTGGTCTTATTAAAAAATTCCCTTTCAACAATTTCACTACAATGACTAATTCT
GGTGCTAAGGGTTCTAAAGTCAACCATACGTAAGTTTCTGCCTTACTTGGTCAATAAGAA
TTAGAAGGTCGTAGAGTTCCCGTTATGGCTACTGGTCGTACTCTTCCTTGCTTCTTACCA
TATGATCCCAACCCAAGAGCTGGTGGTTTTATTAGTGATCGTTTCTTGAGTGGTCTTAGA
CCTGCTGAATTCTTCTTCCATTGTATGGCTGGTAGAGAAGGTTTGATTGATACTGCTGTC
AAAACAAGTAGATCCGGATATCTCCAAAGATGCTTAATGAAGCACTTAGAAGCACTTAAA
GTTGCATATGACTACACTGTCAGAGATGCTGATGGCTCAGTTGTCCAATTCTATTATGGT
GAAGACTCTATTGATCCCAATAAAGTTAAATATTTAGAAAAATTCCGTTTCTTAGCTGAA
AACTTTACTTCTTTCACTCAAAAATATGATCCTTATCACTTGAAAGACTCTCATGATTTC
GAATCTGTCAATCGTTTCTTGAAGAAAAGAAAGAGATAAGAAAGTTCTGAAACAGAAAAG
AAAACTTGTGACACTATTATGAACAACTTTTTACCTGGTAAACACATTGGCTCTGTTTCT
GAACGTGTCTACAAGAATGTAAAGGAATACATTAAGAAAGAATAGCAAAGTGCTGATCCT
TACAGCAACATCTTCAACATAAAGTAGGATTAATTAAGTCCTTAAAAATTCCATATGCTT
TTCAATGTAAAATACCTTAACTCTCTCATTCATCCTGGTGATTCTGTTGGTTGTCTTGCA
GCCCAAGCTATCGGTGAACCATCTACATAGATGACATTGAATACTTTCCACTTGGCTGGT
CACGGTGGTGTTAACCTTACCTTGGGTATTCCTCGTCTAAGAGAAATCTTGATGACTGCT
ACAGACAAATTGAAGACTCCAGTCATGCTTTTAAATCTTTCAAATCCTGAAGTTGCTTAA
AACAAAGAATAAGTTCAAAATCATGCTCGTAAGCTCTAAAAAATTAATTTATTAGAACTT
GTTAATAACATCGAAGTCAAGGAACAAAAAATTATTGTTGTTGATAACAATATTTTACCC
TTCAATGAACGTTTCAGACACTATGAAATTAAAATCAACTTAGAAGACTTAGAAGCTATT
CACTTCGCATTCTAATTAAACATTGACACAATTAATCGTAGAATTGAAAAGGTCTTCCTT
CCTAACCTCTTCTAATACATTAACAAAGAACTTAAACGTGATTAAAAATCTGAACTTTAA
ACTAGAGTTCTTAAGAAGAAAGAAAATGAAAGCAGCGGTATGGAAACTGAAGGCTTAGTT
AGCGATTTCGACAAAGAAGCTGCTTCAGATGGTGAAGAATTAAAGAAAGCTGCTGATGCT
TTAGTAAGCGAAGTAGAATATGGCATATTTACTGAGACAGAAGATGAATTAAAATCTAAG
TCCAAACCTCAATCTGCAGAACCAGTAAAGAGAGTCCCAACTAGAACTTCCAAAGCAGAA
TTATTTGAAGCTTCTCCTTATTACAACGGTCATACTATAGAAGGTGAACGTATAGTTTGT
AACATTAAATTACCTTTAGATTCTAAGAAGTTATTGATGGTCAACTTGGTTGAAAAAATA
TTAAAGAAGACTTTGGTTTATGAAGTAAAGAATATCTCTAATGCAACTGTCCTCAAAAAG
GATAATAAAGGAGCCACTTCTTATCAAATTTAAACAGAAGGTGTTAATTTCAAGTAAATC
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AAATGTTACGGTATTGAAGCTGCTAGAAATGCAATTGTAAAAGAAATCGTCACTGTGTTC
GGTGTTTATGGTGTCGTTGTTGATTACAGACACTTGTACTTAATTGCTGATTATCTTACT
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CTCAAGATGTCTTTCGAAACTTGTGTTAAATTCCTTACAAATGCTGCTACAAATAATGAA
ATCGATACTCTTTCTACTCCTTCTTCCTCAATTGTCTTAGGTAGAGTTCCCTAAGTAGGT
ACTGGTGTTTTCGACATTCTCCATAAGGTTTGA
>TTHERM_00047550(gene)
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TTAAAAGATAAAAAATAAAAATAAAAGGAATTATTATTATATACTTATAGATATTAAATG
AGTAATAGTTTAGGCTAATTCCAAGAGGTCATTAGTAGACGTCTCGCTGGTGTAGGCTTT
TCTTATTACACTGCTGACGAAATCCGTAAATTGTCAGTAAAGGAAATAACTAATCCTATT
GCATTCGACTCATTAAATAGACCTATCAAAGGTGGTTTATATGATCCTTGTATGGGTGTA
TCTCCTTACGATAAATTTACTCGTTGCGAAACTTGTGGTTGTGAAGGATTGGAATGTCCT
GGTCATATGGGTCACGTAGAACTCCTCTTACCTGTTTATAACCCTTTCTTAATTGATAAG
TTGCTCAAGTTATTAAGAGCCTAGTGTTTAAAATGCAATAAGTTTAGAATGACAAATTAA
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TAGAATAATATTAACAACCTTGAAGATAAAAAGAAGCAATTGCTCTCTTTAATTAATGTT
AAGCAAAATAATACAGAATAGTTTTCAAAGGGTGTTTCTTACACAAATGCCATGAACAGT
GCATTTGAATAAGCCCTCAAAGAATTTTGGAATAGCATAAATATTGGCAAATGCCCTCAC
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GATGATGATCAAAGTGAGTCTGGTCACTCTAAGGCTGAAAAAGCTAATGCTAATTAAAAA
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TTGCTTAACATCATTTACGGTACTATCGAAGTTACTCCTTAAACTTTAAAAAACTCTTCT
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TTTTAAAATTAATTATAATTAAAGCAAAACTAGAATTTCTAGCAAACTATTAACAATATT
GTTAAGCTTAATGATGTCATCACTAAGTGGTTAGATATACAAGAAGCTGTTAACTGCTTT
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CTTTTAAATAACTCTAAAAATAAAGTTGTCTATCGTCATTTATAATCTGGTGATGTCCTC
CTTTTCAATAGACAACCTACCCTACATAAAGCTTCATTGATGAGTCATATAGCTAGAGTA
CTTCCCAGAGAATAAACTATTAGAATGCACTATGCAAACTGTAAATCATATAATGCAGAT
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GACGAATTGACTGGTATTTATAAGGACGATACAGTTGTCATAATCAGAGATAATGAACTT
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AAGCTCTAAAAAATTAATTTATTAGAACTTGTTAATAACATCGAAGTCAAGGAACAAAAA
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ATAGACTCAAATGATATAGCTGCCTTAAACAAATGTTACGGTATTGAAGCTGCTAGAAAT
GCAATTGTAAAAGAAATCGTCACTGTGTTCGGTGTTTATGGTGTCGTTGTTGATTACAGA
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TGAAAGAAATAAATAACTTCCTACTTTTGATAAAATCTAATATAAATTTACTTCTATTTA
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TAAACATTTTAGTTAAATAAATTAAATTGAATAAAACTTAAATTTAAGTTTCTGTAAAAT
CCTGCCAAGAGAAAATATAGAAAATAAAAATTTAACAAATTCATCAATCAATCCATCCAT
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>TTHERM_00047550(protein)
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