Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00085650

Standard Name

RPC2 (DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC2)

Aliases

PreTt16413 | 6.m00487 | 3836.m02081

Description

RPC2 DNA-directed RNA polymerase; Second largest subunit of RNA polymerase III; DNA-directed RNA polymerase, subunit 2

Genome Browser (Macronucleus)



Genome Browser (Micronucleus)

External Links

Gene Ontology Annotations

No Data fetched for Gene Ontology Annotations

Domains

  • ( PF00562 ) RNA polymerase Rpb2, domain 6
  • ( PF04560 ) RNA polymerase Rpb2, domain 7
  • ( PF04561 ) RNA polymerase Rpb2, domain 2
  • ( PF04563 ) RNA polymerase beta subunit
  • ( PF04565 ) RNA polymerase Rpb2, domain 3
  • ( PF04566 ) RNA polymerase Rpb2, domain 4
  • ( PF04567 ) RNA polymerase Rpb2, domain 5

Gene Expression Profile

Vegetative Cell Cycle (Zhang et al., 2023)

GeneMania

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for Tetrahymena Stock Center

Homologs

No Data fetched for Homologs

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

No Data fetched for Associated Literature

Sequences

>TTHERM_00085650(coding)
ATGGCTTCAAAAACTGCTGAACCATTACGCGAAAAAACAAGAATTATTGATTCTTATTTA
GCACATAATGGATTTGTTAGTCATCACATATAATCATTTAATTACTTTATCAATATAAAA
TTGCAATAAATTATTACATCATCAATGAATAAGGAATTGCGTTTAGATACAGACAACTCT
TTCTTACTAGAATATACCAAAATTTATATTGAGCCTCCTGCTCATGACAATAAAACAATG
ATGCTTCCTTAAGAAGCTAGATTGAGTAACTCTTCTTATGCAGGGAATATTTATGTTGAT
TGTGAACTCACATTTAATGGAAAGAAAGAAGATAGTTTGAGAAAGGTCAATATTGGAAAA
ATGCCAATTATGCTTGGATCTAGTCACTGCAATTTAATCAAAGCTTTGGAGTTAGGATAA
GTCCATAAATTATAAGAATGTGCTAATGACCCAAGAGGGTATTTCATTATCAAGGGAGTA
GAAAAGGTTTTCCTCATTTAAGAATAATTAGCTGATAATAGAATTTTCATTGAAGAAGAC
AAAAACAAAGAGTTAGTTGCTAACGTTAAATCAAACACAGTTGATACTAAATCAATCACT
TCATTAATTATCAAAAATCATAAAATTTATGTCAAAGTCAGTTCATTCAGCAAGCCTATT
CCTTTGCTTATATTTTTTAAGGCATACGGAGTAGAATCAGAATAGGAAATATTCTAGTTA
ATAGGTACTGAAGAGCACTTGCTCAATCGTCTAGCTCTATGCTTAGAAGATATTGAATAA
TCTCAAGTTTACACATAACAATAAGCCTTAGAATATCTCTCTAAGCGTCTAAGACCTAAA
ACGTTCTAAGATAAAAAATATTCCTCAAGAAATCCAGTTGACGAAGCAAGAGATATAATA
ACAAATGTCGTTTTGTGTCACATTCCTTGCAAGAATTATAACTATTATCCTCGTGCTATT
TTCTTGGGTTTGATGGCAAGAAGATTAATTGAAGCCTTGGATGACCCAAGCAAAATTGAT
AAGAGAGATTACTATGGTAACAAGAGAATGAAATGTGCTGGTTGGTACTTGGAATTACTT
TTTGAAGATAAATTTAAATAATTTAACATGATGGTTAGAAAAGAGCTCAGCAAAGAAATA
GAAAAGCACAAAAATAAATCTTACCCAATTAAAAACAGAGTAGAATCTATTTTAGAGAAG
AACCATGATATTATTACTTAAGGTTTGAATAATGCTATTTCAACTGGTAATTGGACAATT
AAGCGTTTTAGAATGGACACTGTTGGTGTTACCCAAGTCTTAGCAAGAATCTCATATATA
GCTGCTATTGGTATGATGACTAGAATGAACAGTCAATTTAAAAAATCAAGAAAGTTAACT
GGTCCTAGATCTTTGCTTGGTTCTCATTGGGGTTTAGTTTGTCCTGCTGATACTCCAGAT
GGTGAATCTTGTGGTTTAACAAAGAATCTTTCTCTGATGGCTCATATTACTATTGAAGAA
AAGAAAAATGTACTTTCAACTATTGCTTTGAATTTAGGTATGGAAGACATTGGACATTAC
AGCTCAGGAGAAATCCATGAAGATAAAAATTATATGGTTTTCTTAAATGGTTAAATTATT
GGTATGCACAGAGATCCTGAGGCTTTTGCTTAAAAATTAAGATTTATGAGAAGAAGAGGT
AAAATTGGTACTACTATTAGTATAAGCACAAACTCTGAAAAGAGAGCAGTTTATTTAGAT
ACAGATGATGGTAGACTTTGCAGATTATTAATTGTAGTAGAGAATGGAAAACCTTTGATC
ACTAATGACCATTTAAACGACTTAAAGGAAAAAAGAAAGAGCTATTTGGATTTAATTAGA
ATGGGTTTAATCGAATATATTGATGTTAATGAAGAAGATAATTGTTATATTGCTATTAAA
TAGGAAGATATTCCAAATCGTAGCAAGACTACTCATATGGAAATAGATCCATTAACATTA
TTAGGTGTAGTTTCAGGATTAGTTCCTTACCCACATCATAACCAAGCAAGTAGAAATACT
TTCTAATGTGCTATGGGTAAGCAGGCACTTGGTATTATTGGTAGTACTTCTATGAATAGA
GTTGATACAATTCTTTACTAACTAATTTATCCTTAAACTCCTTTGCTTAAAACCAAAGTT
ATTGAATATGCTGGTTACGATAAATTCCCAGCTGGTCACAATGCAAGTATTGCAGTTCTA
AGTTATTCTGGTTATGATATAGAAGATGCTACTGTACTAAATAAATCATCTCTTGATAGA
GGATTTGGTAGAACAATGGTTTTTAAGAAGTATGAAACTGAAATTCAAAAGCTCAAAATG
TCTGGTTTAACTGAATTACTAAGAGGTCCTCCAAAAGAAGCAGAAGGCTCATATAAAAAG
AAATAAAACAGAGTTTTAAAGAAGTTTGGTGCTTTGGATGATGATGGTACTCCTATAGTA
GGTGCCTCTATTAACAATGGCGATGTCTTATTCAACAAGTATACTCCTTTACTTACTCTC
GAATAGTAAAGAGGTCGTGATATTCTCAACAATAACTCTGTCTCTGAATATATTCATAAT
CCTACTACATTCAAAGGTAAAAAATTAGCTAGAATCGATAGAGTTATTAGAAGTCAATAA
GATGGAAACGTTATCATTAAAACTATAGTTAGAGAAACCCGTAGACCAGAATATGGTGAT
AAATTTAGTTCAAGACATGGTCAAAAAGGTATTATTGGTTTAATAGTAAATTAAGAAGAT
ATGCCATTCAGCGAGAAAGGTTGGGTCCCAGATTTAATTATGAATCCTCACGGTTACCCT
TCTCGTATGACAGTTGGCAAGCTCTTAGAATTGCTTGGTTCAAAGGCAGCTGTTTTATCT
GGATAGTTTAAGTACGGCACAGCATTTGGAGGAGATAAGATGGCTGATTTATCTTCAATT
TTAGTATAGAATGGATTTTCATATACAGGTAAAGATGTTATCATAAGTGGTATCACTGGT
GAATATATGTAGTGCTATGTTTTCTGCGGTCCTGTATTCTATTAGAGATTAAAACACATG
GTTGCTGATAAAGTTCATGCTCGTGCAAAAGGAAGAGTAACAACTCTTACAAGATAACCT
ACTGAAGGTAGAGCAAAAGATGGTGGTTTAAGATTAGGAGAAATGGAAAGAGATAGTTTA
TTAGCTTTTGCTTCATCAAACTTGCTGATAGAAAGATTGATGATAAGTTCTGATAAATTT
TCTGTATAAGTTTGTGAGAAATGTGGTTTCATTCAGCATACAAATAGTTGCAAGATGTGC
TAAACTGATTAGGTTAGCAAGGTAGTCATGCCTTATGCTTGCAAACTGCTTTTCTAAGAG
CTTCTTTCAATGAATATAAAACCAAAATTGAATCTTGTTGATATAAATAAAATTGAAAAC
TCTTGA


>TTHERM_00085650(gene)
TCATATTAAAAGATAATTAGAATGAATGAAACTAAAGATATATATGTATCATTAAGATAA
ATAAATCAATAAATATATAGACACTTTTTTCTTTCCTACTTATATTAATTAACTAGAATT
CTATAAAAAATTTAACTCTCATAAATACTTAACTTAATTCATATTTAGAGTATAGTAGAA
GGAAATAATTTTTAGATCCTAATTTATTATTAAAAATGGCTTCAAAAACTGCTGAACCAT
TACGCGAAAAAACAAGAATTATTGATTCTTATTTAGCACATAATGGATTTGTTAGTCATC
ACATATAATCATTTAATTACTTTATCAATATAAAATTGCAATAAATTATTACATCATCAA
TGAATAAGGAATTGCGTTTAGATACAGACAACTCTTTCTTACTAGAATATACCAAAATTT
ATATTGAGCCTCCTGCTCATGACAATAAAACAATGATGCTTCCTTAAGAAGCTAGATTGA
GTAACTCTTCTTATGCAGGGAATATTTATGTTGATTGTGAACTCACATTTAATGGAAAGA
AAGAAGATAGTTTGAGAAAGGTCAATATTGGAAAAATGCCAATTATGCTTGGATCTAGTC
ACTGCAATTTAATCAAAGCTTTGGAGTTAGGATAAGTCCATAAATTATAAGAATGTGCTA
ATGACCCAAGAGGGTATTTCATTATCAAGGGAGTAGAAAAGGTTTTCCTCATTTAAGAAT
AATTAGCTGATAATAGAATTTTCATTGAAGAAGACAAAAACAAAGAGTTAGTTGCTAACG
TTAAATCAAACACAGTTGATACTAAATCAATCACTTCATTAATTATCAAAAATCATAAAA
TTTATGTCAAAGTCAGTTCATTCAGCAAGCCTATTCCTTTGCTTATATTTTTTAAGGCAT
ACGGAGTAGAATCAGAATAGGAAATATTCTAGTTAATAGGTACTGAAGAGCACTTGCTCA
ATCGTCTAGCTCTATGCTTAGAAGATATTGAATAATCTCAAGTTTACACATAACAATAAG
CCTTAGAATATCTCTCTAAGCGTCTAAGACCTAAAACGTTCTAAGATAAAAAATATTCCT
CAAGAAATCCAGTTGACGAAGCAAGAGATATAATAACAAATGTCGTTTTGTGTCACATTC
CTTGCAAGAATTATAACTATTATCCTCGTGCTATTTTCTTGGGTTTGATGGCAAGAAGAT
TAATTGAAGCCTTGGATGACCCAAGCAAAATTGATAAGAGAGATTACTATGGTAACAAGA
GAATGAAATGTGCTGGTTGGTACTTGGAATTACTTTTTGAAGATAAATTTAAATAATTTA
ACATGATGGTTAGAAAAGAGCTCAGCAAAGAAATAGAAAAGCACAAAAATAAATCTTACC
CAATTAAAAACAGAGTAGAATCTATTTTAGAGAAGAACCATGATATTATTACTTAAGGTT
TGAATAATGCTATTTCAACTGGTAATTGGACAATTAAGCGTTTTAGAATGGACACTGTTG
GTGTTACCCAAGTCTTAGCAAGAATCTCATATATAGCTGCTATTGGTATGATGACTAGAA
TGAACAGTCAATTTAAAAAATCAAGAAAGTTAACTGGTCCTAGATCTTTGCTTGGTTCTC
ATTGGGGTTTAGTTTGTCCTGCTGATACTCCAGATGGTGAATCTTGTGGTTTAACAAAGA
ATCTTTCTCTGATGGCTCATATTACTATTGAAGAAAAGAAAAATGTACTTTCAACTATTG
CTTTGAATTTAGGTATGGAAGACATTGGACATTACAGCTCAGGAGAAATCCATGAAGATA
AAAATTATATGGTTTTCTTAAATGGTTAAATTATTGGTATGCACAGAGATCCTGAGGCTT
TTGCTTAAAAATTAAGATTTATGAGAAGAAGAGGTAAAATTGGTACTACTATTAGTATAA
GCACAAACTCTGAAAAGAGAGCAGTTTATTTAGATACAGATGATGGTAGACTTTGCAGAT
TATTAATTGTAGTAGAGAATGGAAAACCTTTGATCACTAATGACCATTTAAACGACTTAA
AGGAAAAAAGAAAGAGCTATTTGGATTTAATTAGAATGGGTTTAATCGAATATATTGATG
TTAATGAAGAAGATAATTGTTATATTGCTATTAAATAGGAAGATATTCCAAATCGTAGCA
AGACTACTCATATGGAAATAGATCCATTAACATTATTAGGTGTAGTTTCAGGATTAGTTC
CTTACCCACATCATAACCAAGCAAGTAGAAATACTTTCTAATGTGCTATGGGTAAGCAGG
CACTTGGTATTATTGGTAGTACTTCTATGAATAGAGTTGATACAATTCTTTACTAACTAA
TTTATCCTTAAACTCCTTTGCTTAAAACCAAAGTTATTGAATATGCTGGTTACGATAAAT
TCCCAGCTGGTCACAATGCAAGTATTGCAGTTCTAAGTTATTCTGGTTATGATATAGAAG
ATGCTACTGTACTAAATAAATCATCTCTTGATAGAGGATTTGGTAGAACAATGGTTTTTA
AGAAGTATGAAACTGAAATTCAAAAGCTCAAAATGTCTGGTTTAACTGAATTACTAAGAG
GTCCTCCAAAAGAAGCAGAAGGCTCATATAAAAAGAAATAAAACAGAGTTTTAAAGAAGT
TTGGTGCTTTGGATGATGATGGTACTCCTATAGTAGGTGCCTCTATTAACAATGGCGATG
TCTTATTCAACAAGTATACTCCTTTACTTACTCTCGAATAGTAAAGAGGTCGTGATATTC
TCAACAATAACTCTGTCTCTGAATATATTCATAATCCTACTACATTCAAAGGTAAAAAAT
TAGCTAGAATCGATAGAGTTATTAGAAGTCAATAAGATGGAAACGTTATCATTAAAACTA
TAGTTAGAGAAACCCGTAGACCAGAATATGGTGATAAATTTAGTTCAAGACATGGTCAAA
AAGGTATTATTGGTTTAATAGTAAATTAAGAAGATATGCCATTCAGCGAGAAAGGTTGGG
TCCCAGATTTAATTATGAATCCTCACGGTTACCCTTCTCGTATGACAGTTGGCAAGCTCT
TAGAATTGCTTGGTTCAAAGGCAGCTGTTTTATCTGGATAGTTTAAGTACGGCACAGCAT
TTGGAGGAGATAAGATGGCTGATTTATCTTCAATTTTAGTATAGAATGGATTTTCATATA
CAGGTAAAGATGTTATCATAAGTGGTATCACTGGTGAATATATGTAGTGCTATGTTTTCT
GCGGTCCTGTATTCTATTAGAGATTAAAACACATGGTTGCTGATAAAGTTCATGCTCGTG
CAAAAGGAAGAGTAACAACTCTTACAAGATAACCTACTGAAGGTAGAGCAAAAGATGGTG
GTTTAAGATTAGGAGAAATGGAAAGAGATAGTTTATTAGCTTTTGCTTCATCAAACTTGC
TGATAGAAAGATTGATGATAAGTTCTGATAAATTTTCTGTATAAGTTTGTGAGAAATGTG
GTTTCATTCAGCATACAAATAGTTGCAAGATGTGCTAAACTGATTAGGTTAGCAAGGTAG
TCATGCCTTATGCTTGCAAACTGCTTTTCTAAGAGCTTCTTTCAATGAATATAAAACCAA
AATTGAATCTTGTTGATATAAATAAAATTGAAAACTCTTGATTTATTTATTTTTATAGAG
TAACAAAAACTTAAAA


>TTHERM_00085650(protein)
MASKTAEPLREKTRIIDSYLAHNGFVSHHIQSFNYFINIKLQQIITSSMNKELRLDTDNS
FLLEYTKIYIEPPAHDNKTMMLPQEARLSNSSYAGNIYVDCELTFNGKKEDSLRKVNIGK
MPIMLGSSHCNLIKALELGQVHKLQECANDPRGYFIIKGVEKVFLIQEQLADNRIFIEED
KNKELVANVKSNTVDTKSITSLIIKNHKIYVKVSSFSKPIPLLIFFKAYGVESEQEIFQL
IGTEEHLLNRLALCLEDIEQSQVYTQQQALEYLSKRLRPKTFQDKKYSSRNPVDEARDII
TNVVLCHIPCKNYNYYPRAIFLGLMARRLIEALDDPSKIDKRDYYGNKRMKCAGWYLELL
FEDKFKQFNMMVRKELSKEIEKHKNKSYPIKNRVESILEKNHDIITQGLNNAISTGNWTI
KRFRMDTVGVTQVLARISYIAAIGMMTRMNSQFKKSRKLTGPRSLLGSHWGLVCPADTPD
GESCGLTKNLSLMAHITIEEKKNVLSTIALNLGMEDIGHYSSGEIHEDKNYMVFLNGQII
GMHRDPEAFAQKLRFMRRRGKIGTTISISTNSEKRAVYLDTDDGRLCRLLIVVENGKPLI
TNDHLNDLKEKRKSYLDLIRMGLIEYIDVNEEDNCYIAIKQEDIPNRSKTTHMEIDPLTL
LGVVSGLVPYPHHNQASRNTFQCAMGKQALGIIGSTSMNRVDTILYQLIYPQTPLLKTKV
IEYAGYDKFPAGHNASIAVLSYSGYDIEDATVLNKSSLDRGFGRTMVFKKYETEIQKLKM
SGLTELLRGPPKEAEGSYKKKQNRVLKKFGALDDDGTPIVGASINNGDVLFNKYTPLLTL
EQQRGRDILNNNSVSEYIHNPTTFKGKKLARIDRVIRSQQDGNVIIKTIVRETRRPEYGD
KFSSRHGQKGIIGLIVNQEDMPFSEKGWVPDLIMNPHGYPSRMTVGKLLELLGSKAAVLS
GQFKYGTAFGGDKMADLSSILVQNGFSYTGKDVIISGITGEYMQCYVFCGPVFYQRLKHM
VADKVHARAKGRVTTLTRQPTEGRAKDGGLRLGEMERDSLLAFASSNLLIERLMISSDKF
SVQVCEKCGFIQHTNSCKMCQTDQVSKVVMPYACKLLFQELLSMNIKPKLNLVDINKIEN
S