Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00085650

Standard Name

RPC2 (DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC2)

Aliases

PreTt16413 | 6.m00487 | 3836.m02081

Description

RPC2 DNA-directed RNA polymerase; Second largest subunit of RNA polymerase III

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External Links

Gene Ontology Annotations

Molecular Function

Biological Process

Domains

  • ( PF00562 ) RNA polymerase Rpb2, domain 6
  • ( PF04560 ) RNA polymerase Rpb2, domain 7
  • ( PF04561 ) RNA polymerase Rpb2, domain 2
  • ( PF04563 ) RNA polymerase beta subunit
  • ( PF04565 ) RNA polymerase Rpb2, domain 3
  • ( PF04566 ) RNA polymerase Rpb2, domain 4
  • ( PF04567 ) RNA polymerase Rpb2, domain 5
  • ( TIGR02013 ) DNA-directed RNA polymerase, beta subunit

Gene Expression Profile

Vegetative Cell Cycle (Zhang et al., 2023)

GeneMania

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for Tetrahymena Stock Center

Homologs

Source Identifier Score
Stentor Coeruleus SteCoe_21047 0
Description: None
WormBase WBGene00017300 9.997093137033517e-262
Description: locus:rpc-2 DNA-directed RNA polymerase status:Confirmed UniProt:Q27492 protein_id:CCD68383.1
Tetrahymena borealis EI9_02458.1 9.997093137033517e-262
Description: DNA-directed RNA polymerase, beta subunit protein (1138 aa)
DictyBase DDB_G0288449 9.997093137033517e-262
Description: rpc2 on chromosome: 5 position 1494028 to 1499084
Oxytricha Contig6272.0.g55 9.997093137033517e-262
Description: RNA polymerase Rpb2, domain 6
SGD YOR207C 9.997093137033517e-262
Description: RET1 Second-largest subunit of RNA polymerase III, which is responsible for the transcription of tRNA and 5S RNA genes, and other low molecular weight RNAs
Tetrahymena borealis EI9_05554.2 9.997093137033517e-262
Description: PHD-finger family protein (1003 aa)

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

No Data fetched for Associated Literature

Sequences 

>TTHERM_00085650(coding)
ATGGCTTCAAAAACTGCTGAACCATTACGCGAAAAAACAAGAATTATTGATTCTTATTTA
GCACATAATGGATTTGTTAGTCATCACATATAATCATTTAATTACTTTATCAATATAAAA
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TTCTTACTAGAATATACCAAAATTTATATTGAGCCTCCTGCTCATGACAATAAAACAATG
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TGTGAACTCACATTTAATGGAAAGAAAGAAGATAGTTTGAGAAAGGTCAATATTGGAAAA
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GAAAAGGTTTTCCTCATTTAAGAATAATTAGCTGATAATAGAATTTTCATTGAAGAAGAC
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AAATTTAGTTCAAGACATGGTCAAAAAGGTATTATTGGTTTAATAGTAAATTAAGAAGAT
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TCTCGTATGACAGTTGGCAAGCTCTTAGAATTGCTTGGTTCAAAGGCAGCTGTTTTATCT
GGATAGTTTAAGTACGGCACAGCATTTGGAGGAGATAAGATGGCTGATTTATCTTCAATT
TTAGTATAGAATGGATTTTCATATACAGGTAAAGATGTTATCATAAGTGGTATCACTGGT
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TTAGCTTTTGCTTCATCAAACTTGCTGATAGAAAGATTGATGATAAGTTCTGATAAATTT
TCTGTATAAGTTTGTGAGAAATGTGGTTTCATTCAGCATACAAATAGTTGCAAGATGTGC
TAAACTGATTAGGTTAGCAAGGTAGTCATGCCTTATGCTTGCAAACTGCTTTTCTAAGAG
CTTCTTTCAATGAATATAAAACCAAAATTGAATCTTGTTGATATAAATAAAATTGAAAAC
TCTTGA


>TTHERM_00085650(gene)
ATGGCTTCAAAAACTGCTGAACCATTACGCGTAAATTTAACTATTTAGCTTTAGCAAACA
AATTTATAGCCTTTTGAATAAATAAAACCCCCTTTTTACATTGAATAGCCATAGGAGAAG
ATTTATAATATTCATTAGATCTAATTTTAAAAACAAACTAAATAGAGTGGTTCAGAATGG
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TTTATTTTAAATTATTATTTAGGAAAAAACAAGAATTATTGATTCTTATTTAGCACATAA
TGGATTTGTTAGTCATCACATATAATCATTTAATTACTTTATCAATATAAAATTGCAATA
AATTATTACATCATCAATGAATAAGGAATTGCGTTTAGATACAGACAACTCTTTCTTACT
AGAGTGATCTTTAATTAATACAATATTTTATACTTACAATTAATTATTTTATTAGATATA
CCAAAATTTATATTGAGCCTCCTGCTCATGACAATAAAACAATGATGCTTCCTTAAGAAG
CTAGATTGAGTAACTCTTCTTATGCAGGGAATATTTAGTAAATTTTTATATTACACTGAA
TGAAAGTATATAAATTTATAATATATTAGTGTTGATTGTGAACTCACATTTAATGGAAAG
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TAAGTTTATTTATTTTAAATTTAACAGTCTAATTAATTAATAATCTATTTTGTATAATAT
TTCTATTTTTATTAAAAGAATGCCAATTATGCTTGGATCTAGTCACTGCAATTTAATCAA
AGCTTTGGAGTTAGGATAAGTCCATAAATTATAAGAATGTGCTAATGACCCAAGAGGGTA
TTTCATTATCAAGGGAGTAGAAAAGGTAATTTTTGCTTAAATTGATATATGTTATTGAGT
TTAAATCTCATTAGATTTATTTTTATCGAATAAAAATACAATTTTTTATAATATTTAATA
ATAGGTTTTCCTCATTTAAGAATAATTAGCTGATAATAGAATTTTCATTGAAGAAGACAA
AAACAAAGAGTTAGTTGCTAACGTTAAATCAAACACAGTTGATACTAAATCAATCACTTC
ATTAATTATCAAAAATCATAAAATTTATGTCAAAGTCAGTTCATTCAGCAAGCCTATTCC
TTTGCTTATATTTTTTAAGGCATACGGAGTAGAATCAGAATAGGAAATATTCTAGTTAAT
AGGTACTGAAGAGCACTTGCTCAATCGTCTAGCTCTATGCTTAGAAGATATTGAATAATC
TCAAGTTTACACATAACAATAAGCCTTAGAATATCTCTCTAAGCGTCTAAGACCTAAAAC
GTTCTAAGATAAAAAATATTCCTCAAGAAATCCAGTTGACGAAGCAAGAGATATAATAAC
AAGTAAGCTATTTTTTTACAAATTTTACCAGCAAACTTATTAGTTTAAAACGGAATAATT
TGAGCTATTATTGATATGGTTTGTTAAATAAAATTTAATGATCAATCATTCAACATAATT
TATTAAAAATTAGATGTCGTTTTGTGTCACATTCCTTGCAAGAATTATAACTATTATCCT
CGTGCTATTTTCTTGGGTTTGATGGCAAGAAGATTAATTGAAGCCTTGGATGACCCAAGC
AAAATTGATAAGAGAGATTACTATGGTAACAAGAGAATGAAATGTGCTGGTTGGTACTTG
GAATTACTTTTTGAAGATAAATTTAAATAATTTAACATGATGGTTAGAAAAGAGCTCAGC
AAAGAAATAGAAAAGCACAAAAATAAATCTTACCCAATTAAAAACAGAGTAGAATCTATT
TTAGAGAAGAACCATGATATTATTACTTAAGGTTTGAATAATGCTATTTCAACTGGTAAT
TGGACAATTAAGCGTTTTAGAATGGACACTGTTGGTGTTACCCAAGTAAATTACTTTAAA
ATATTTTTTATATTTTATTAACTATCTTCTCTTCAAAGGTCTTAGCAAGAATCTCATATA
TAGCTGCTATTGGTATGATGACTAGAATGAACAGTCAATTTAAAAAATCAAGAAAGTTAA
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ATGGTGAATCTTGTGGTTTAACAAAGAATCTTTCTCTGATGGCTCATATTACTATTGAAG
AAAAGAAAAATGTACTTTCAACTATTGCTTTGAATTTAGGTATGGAAGACATTGGACATT
ACAGCTCAGGAGAAATCCATGAAGATAAAAATTATATGGTTTTCTTAAATGGTTAAATTA
TTGGTATGCACAGAGATCCTGAGGCTTTTGCTTAAAAATTAAGGTACTAAATTAATTTAT
TTTTATGAAAATGAATATTGAAAAGCTAAATTAATTTATTATCAGATTTATGAGAAGAAG
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AGATACAGATGATGGTAGACTTTGCAGATTATTAATTGTAGTAGAGAATGGAAAACCTTT
GATCACTAATGACCATTTAAACGACTTAAAGGAAAAAAGAAAGAGCTATTTGGATTTAAT
TAGAATGGGTTTAATCGAATATATTGATGTTAATGAAGAAGATAATTGTTATATTGCTAT
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ATTATTAGGTGTAGTTTCAGGATTAGTTCCTTACCCACATCATAACCAAGCAAGTAGAAA
TACTTTCTAATGTGCTATGGGTAAGCAGGCACTTGGTATTATTGGTAGTACTTCTATGAA
TAGAGTTGATACAATTCTTTACTAACTAATTTATCCTTAAACTCCTTTGCTTAAAACCAA
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TCTAAGTTATTCTGGTTATGATATAGAAGATGCTACTGTACTAAATAAATCATCTCTTGA
TAGAGGATTTGGTAGAACAATGGTTTTTAAGAAGTATGAAACTGAAATTCAAAAGCTCAA
AATGTCTGGTTTAACTGAATTACTAAGAGGTCCTCCAAAAGAAGCAGAAGGCTCATATAA
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GTGCCTCTATTAACAATGGCGATGTCTTATTCAACAAGTATACTCCTTTACTTACTCTCG
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GAAATATCTCATTTTTCACTTAATTTTTTATTAAAATAAATATAAATAAAAAAAAAGAAT
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GATGGAAACGTTATCATTAAAACTATAGTTAGAGAAACCCGTAGACCAGAATATGGTGAT
AAATTTAGTTCAAGACATGGTAAGAATTTATTTTTATTTAAAAAATAAAGAAAAGTCAAT
CAATTTTTAATTAAAATTAATTTAGGTCAAAAAGGTATTATTGGTTTAATAGTAAATTAA
GAAGATATGCCATTCAGCGAGAAAGGTTGGGTCCCAGATTTAATTATGAATCCTCACGGT
TACCCTTCTCGTATGACAGTTGGCAAGCTCTTAGAATTGCTTGGTTCAAAGGCAGCTGTT
TTATCTGGATAGTTTAAGTACGGCACAGCATTTGGAGGAGATAAGATGGCTGATTTATCT
TCAATTTTAGTATAGAATGGATTTTCATATACAGGTAAAGATGTTATCATAAGTGGTATC
ACTGGTGAATATATGTAGTGCTATGTTTTCTGCGGTCCTGTATTCTATTAGAGATTAAAA
CACATGGTTGCTGATAAAGTTCATGCTCGTGCAAAAGGAAGAGTAACAACTCTTACAAGA
TAACCTACTGAAGGTAAATTATTTATTAAATAAATAAAATAATTTAATTTTTTTTAATTA
GAATGCCTTAAAAATACTTTTTTGATATTAAATTTTTTAATTTGCTAAATATATAATAGG
TAGAGCAAAAGATGGTGGTTTAAGATTAGGAGAAATGGAAAGAGATAGTTTATTAGCTTT
TGCTTCATCAAACTTGCTGATAGAAAGATTGATGATAAGTTCTGATAAATTTTCTGTATA
AGTTTGTGAGAAATGTGGTTTCATTCAGCATACAAATAGTTGCAAGATGTGCTAAACTGA
TTAGGTAAATTAAAAAAAAATTATTTATTGATTTTAATATTTGAATAGTTTTGTAACATA
AAAAATCTAATTGATATTATTTAAAAAAACAAAATATTAACTTTGAGCTATTCATAAAAT
ATTATTTTTGAATTATAAATTTTATCATAAAAATAAAACATATTTTATTAATTCTAAGTA
ACTAATTAATACTTTTGTTAAATAATAGGTTAGCAAGGTAGTCATGCCTTATGCTTGCAA
ACTGCTTTTCTAAGAGCTTCTTTCAATGAATATAAAACCAAAATTGAATCTTGTTGATAT
AAATAAAATTGAAAACTCTTGA


>TTHERM_00085650(protein)
MASKTAEPLREKTRIIDSYLAHNGFVSHHIQSFNYFINIKLQQIITSSMNKELRLDTDNS
FLLEYTKIYIEPPAHDNKTMMLPQEARLSNSSYAGNIYVDCELTFNGKKEDSLRKVNIGK
MPIMLGSSHCNLIKALELGQVHKLQECANDPRGYFIIKGVEKVFLIQEQLADNRIFIEED
KNKELVANVKSNTVDTKSITSLIIKNHKIYVKVSSFSKPIPLLIFFKAYGVESEQEIFQL
IGTEEHLLNRLALCLEDIEQSQVYTQQQALEYLSKRLRPKTFQDKKYSSRNPVDEARDII
TNVVLCHIPCKNYNYYPRAIFLGLMARRLIEALDDPSKIDKRDYYGNKRMKCAGWYLELL
FEDKFKQFNMMVRKELSKEIEKHKNKSYPIKNRVESILEKNHDIITQGLNNAISTGNWTI
KRFRMDTVGVTQVLARISYIAAIGMMTRMNSQFKKSRKLTGPRSLLGSHWGLVCPADTPD
GESCGLTKNLSLMAHITIEEKKNVLSTIALNLGMEDIGHYSSGEIHEDKNYMVFLNGQII
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S