Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00089240

Standard Name

IFT172 (IntraFlagellar Transport 172)

Aliases

PreTt16475 | 6.m00549 | 3836.m02141 | EF495115 | IFT172

Description

IFT172 intraflagellar transporter putative; N-terminal WD domain (WDD) and C-terminal repeat domain (RPD) containing protein; involved in anterograde and retrograde transport during ciliary assembly; essential for ciliary assembly; WD40 repeat

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Gene Ontology Annotations

Cellular Component

Biological Process

Domains

  • ( PF00400 ) WD domain, G-beta repeat

Gene Expression Profile

Vegetative Cell Cycle (Zhang et al., 2023)

GeneMania

Tetrahymena Stock Center

  • ( SD01793 ) Micronucleus: Neo3 into coding of IFT172
  • ( SD01794 ) Micronucleus: Neo3 into coding of IFT172
  • ( SD01795 ) Micronucleus: Neo3 into coding of IFT172

Homologs

No Data fetched for Homologs

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

  1. Ref:18211962: Tsao CC, Gorovsky MA (2008) Tetrahymena IFT122A is not essential for cilia assembly but plays a role in returning IFT proteins from the ciliary tip to the cell body. Journal of cell science 121(Pt 4):428-36
  2. Ref:18199688: Tsao CC, Gorovsky MA (2008) Different effects of Tetrahymena IFT172 domains on anterograde and retrograde intraflagellar transport. Molecular biology of the cell 19(4):1450-61

Sequences 

>TTHERM_00089240(coding)
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GAAGCTATTTTATTAGATCATGAAGAGGTTGAAGAAGCTATGGAAATGTATTAGGAACTC
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CTTTGTGATAGAAAGGAATTCGATGAAGCTTTTAGAATGGCTCAAAAGGCTATCCATAAA
AAGCCTGATGTTCACCTCAAATATGCATTTGAACTTGAAGATAACAAAAGATATAAGGAA
GCTGAAGAACACTTTATTAAGGCAGGTAAACCTGAAGAAGCTATTAATATGTATGAGCAT
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AATGCTAGAGTATCTGAAGATAGCAGAGATTACAACAAGGCAATAGATTCTTACCTCAAT
GTTACTCCTGAAAATTGTGATGAAAATACAGTTGTAGCAGTCTGGAATAAAGCTATATAA
ATTGCCTAAACTTATGTTAAGGAAAGATTGCAAGAAGTTGTCTTAATTGTTGCAAAGGGA
TTATAAAATTTAAATAAAGCTGATTAGGCTGCTGATATTTATGAAAACTTTGGATTCTAC
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TAATAAGTCAATAATCCTAGTTTCTAGTAGAAGATGATAGCACGTATCTAATAACTTCAA
ATGACTGAATAATAAAACACAGGAGATACTAGAGGTATGATTGAAGGTGGTCATGTTGAC
TAAGCTATAGAAATGATGATTTAAAAAGGAGATTGGAGATAGGCATTAGACACAGCTCAA
AATCAGGGTGCAGAAATACTAGCCAAGATAATGAGACGCTATGTCAAATTTACTATGGAA
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GAAAACTTTAAGCATTACATTAACCTTTGCTTAGAAATATTTGTTGAGTGCGATCCTAAA
GAAATCAACAGCTTGCGTACTGCTTTATATAACTTTTACAAACTCTTATAAGGCTCTAAA
GTAGACTAGTCTCAAGAAGGAAGATAATTCTAAAGGTACTTAACCATAGCACACTTAGCA
AACCTAAAGAATGTTTATGAAAAGAAAAATATGAGTGCTCTTTATGCTAGAACTTCAATT
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GCTTGCAAAAAATAAAACTGGCTCACATATGCATTCGTCATCTTAAATAGATACTTAGAT
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AATACTGATATTCCATCTCCTTATTAAGTAGAACTCATTCCTGAAAAGAACCTAGTAGAC
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GAAAAGGACTTACCTATCCGTAGTTGTGAAAGCTGCAGAACTTAAATATATGAAGGATGC
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>TTHERM_00089240(gene)
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CAAAAAAACTCGCAGTTTGCACAGCTGAAAGAGTAGTTCATTTGTTTGATGAGCAAGGAT
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GAGCAGTAGCTTTTTCTCCAGATAGTGAAAAGGTAGCAGTCGCATAATCAGATAATATAG
TTTTTGTCTATAAGATTGGCAAGGAATGGGGTGAAAAAAAATCTATTTGTAATAAATTCC
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TGTATTCAACTGATAGTTATGTTGTTAGCTTAGCAGCATGTAAAGACGGAGAAAATTTTG
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ATTTGCAAACCATTTACATTTAAGATCTCATGAGTAACTCAAATATTGGTTAGATTCTTC
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ATGCTCACTACGGCATGCAGTTGATTCCTGAAAACTTTAAGCATTACATTAACCTTTGCT
TAGAAATATTTGTTGAGTGCGATCCTAAAGAAATCAACAGCTTGCGTACTGCTTTATATA
ACTTTTACAAACTCTTATAAGGCTCTAAAGTAGACTAGTCTCAAGAAGGAAGATAATTCT
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AAGTTTGTATCCTAACAGGATAACCTCTTTTAAAGGGAACATTCGTTAACTGTAGAAGTT
GCGGAAAAGGAGGTCTCAAAGAATATTGGTCGATGTACTTATAAAACTTTGCAAACTGTC
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>TTHERM_00089240(protein)
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