Identifiers and Description
Gene Model Identifier
TTHERM_00089240Standard Name
IFT172 (IntraFlagellar Transport 172)Aliases
PreTt16475 | 6.m00549 | 3836.m02141 | EF495115 | IFT172Description
intraflagellar transporter putative; N-terminal WD domain (WDD) and C-terminal repeat domain (RPD) containing protein; involved in anterograde and retrograde transport during ciliary assembly; essential for ciliary assemblyGenome Browser (Macronucleus)
Genome Browser (Micronucleus)
External Links
Gene Ontology Annotations
Cellular Component
- axoneme (IDA) | GO:0005930
- ciliary basal body (IDA) | GO:0036064
Biological Process
- ciliary basal body organization (IMP) | GO:0032053
Domains
Gene Expression Profile
Vegetative Cell Cycle (Zhang et al., 2023)
GeneMania
Tetrahymena Stock Center
Homologs
Source Identifier Score Stentor Coeruleus SteCoe_32978 0 Description: None WormBase WBGene00003883 9.997093137033517e-262 Description: locus:osm-1 Intraflagellar transport protein osm-1 status:Confirmed UniProt:Q22830 protein_id:CCD72791.1 Tetrahymena borealis EI9_02512.1 9.997093137033517e-262 Description: IF.272/intraflagellar transport particle protein 172 (1719 aa) Oxytricha Contig20157.0.g30 9.997093137033517e-262 Description: Region in Clathrin and VPS
General Information
No Data fetched for General Information
Associated Literature
- Ref:18211962: Tsao CC, Gorovsky MA (2008) Tetrahymena IFT122A is not essential for cilia assembly but plays a role in returning IFT proteins from the ciliary tip to the cell body. Journal of cell science 121(Pt 4):428-36
- Ref:18199688: Tsao CC, Gorovsky MA (2008) Different effects of Tetrahymena IFT172 domains on anterograde and retrograde intraflagellar transport. Molecular biology of the cell 19(4):1450-61
Sequences
>TTHERM_00089240(coding)
ATGCATAAAAAAAAAATAAAGCCATTCAGAAACACAAACAATTACTAATTTCCAAAGAGA
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TTATAGCGTGCTGGAAACTTGAAATAAGCAGAACATCACTATATTGAAGCTGGTGCTTGG
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AAGCTTTATGGATCTGATAAGGAAACATGTGAACTTGCTAAATAATGGGCAGAAACTTTG
GGTCCTGATGCTGGTATGAAAATTCTTTTAAAATACAATTTAATCGATGCTGTCATTGAA
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AAAAAGCCTGATGTTCACCTCAAATATGCATTTGAACTTGAAGATAACAAAAGATATAAG
GAAGCTGAAGAACACTTTATTAAGGCAGGTAAACCTGAAGAAGCTATTAATATGTATGAG
CATTTGAGTGATTTCTAAGCTGCATTATAGGTAGCAAAAGTACACTAAAAATAGAGTATA
AGCATGATTCTTATGAATTAAGCTCGTACTTTCATTGAAAAAAGAGAATATAAGAAGGCT
GAAAACTGCTTTATCCAGGCTAAGAAACCAGAATTAGCAGTTAAAATGTACAAGGATATT
TAAAATTGGTAAGAAGCCTTCAGAGTAGCCAAAAAGGAAGCTCCTCATTTAGTTTCAGAA
CTTACTTCTTAACATTAATAAGTTGGTAGAGGAGGAGCTATGACTGGTGAAGACTATATC
TAAAATGCTAGAGTATCTGAAGATAGCAGAGATTACAACAAGGCAATAGATTCTTACCTC
AATGTTACTCCTGAAAATTGTGATGAAAATACAGTTGTAGCAGTCTGGAATAAAGCTATA
TAAATTGCCTAAACTTATGTTAAGGAAAGATTGCAAGAAGTTGTCTTAATTGTTGCAAAG
GGATTATAAAATTTAAATAAAGCTGATTAGGCTGCTGATATTTATGAAAACTTTGGATTC
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GCCTAATAAGTCAATAATCCTAGTTTCTAGTAGAAGATGATAGCACGTATCTAATAACTT
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CAAAATCAGGGTGCAGAAATACTAGCCAAGATAATGAGACGCTATGTCAAATTTACTATG
GAAAGTGGTAAATTTGGTGAAACTATTGAAGCCTATGCTCACTACGGCATGCAGTTGATT
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AAAGAAATCAACAGCTTGCGTACTGCTTTATATAACTTTTACAAACTCTTATAAGGCTCT
AAAGTAGACTAGTCTCAAGAAGGAAGATAATTCTAAAGGTACTTAACCATAGCACACTTA
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ATTTCAATGCTTAGATACGGAGATCTTATTCGTATGGATAAATTGTTCTATGATGCAGGT
GTTGCTTGCAAAAAATAAAACTGGCTCACATATGCATTCGTCATCTTAAATAGATACTTA
GATATCTTTGAAGTCATAGAAGATCCTAACAGTGCTGATACTGGAGATAACTAAGTCTTC
TTAAATACTGATATTCCATCTCCTTATTAAGTAGAACTCATTCCTGAAAAGAACCTAGTA
GACTCAAATCAAATTGAAGGAATACGTAATTGGATTTTGGAAGTTAGTTGCAATTCTAAA
ATAGAAAAGGACTTACCTATCCGTAGTTGTGAAAGCTGCAGAACTTAAATATATGAAGGA
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CTTTTAAAGGGAACATTCGTTAACTGTAGAAGTTGCGGAAAAGGAGGTCTCAAAGAATAT
TGGTCGATGTACTTATAAAACTTTGCAAACTGTCCTTGGTGCAATAATCCCCCAAATTGA>TTHERM_00089240(gene)
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GAAATGAAACTTGCTTATTTTGGAAATATCATTCCACCAGTTGATGGAATGCAAAAGATT
TCATCAGTAGCATGGTCTCCTAATTAGCATGGGCCAAAAAAACTCGCAGTTTGCACAGCT
GAAAGAGTAAGATTTAAAATATTTCATTTTTAAAACGATTTGTAAACAAAATTTCCATAC
TTTTTCCATAGGTGCTTTGTTATTTTTCTTTTTAAGTTAGGTTTCTACTTAATTTTCATA
TACAAAGAAAGCACTTAAAACTGCTTTATTCTTTTAACAATAGCAAATAATCTAAGCTAA
AAGGAATTCAAACCATTAAATAATTAGCGATTAAAAGATTTAAAACATGATTAATTTTAT
TATGAATGTTTAATTTATAGAATTTTTTTATAAATAAAGGTAGTTCATTTGTTTGATGAG
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AGTATAATTGCATCAGCTAATAGCCATAAAATATTTTAAGATTGATTAGATAAAGTTGAA
TGAAAATATGTTTAATTTTCTTTGAGTTTTTAAAATTTTAAATTTATAGCGTTTCAATCT
AATAAAAAAAATAATTAAAAATATTTAGGGTTAAAAGTCATATGTTGTTAGAGCAGTAGC
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TAAGATTGGCAAGGAATGGGGTGAAAAAAAATCTATTTGTAATAAATTCCCAACTTCTTC
CTCAGTAACATGTCTTTGCTGGCCTCATGAACGTGCAGGAGAAGTTATTTTTGGTTTGGC
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AAAGGCGTGAAGCATTTATTCAATTTTTGTTTATAACAACAGTCATAAGTAATGTATTCA
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CACTTAGATGGTACAATCTACGCATTTGGAAAAAAAATTGTAGTTCATCATTCAATCCCA
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GATAATATATTGGATGAAAGAAAATAAGACAGCTTAAGGAGAATAATATTTTTATATAGA
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CTTTCTTTTATTCATTTTTTTTTTTTTGAATTGTAAATCAATTATATTTTTATATGTTAG
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AACTGGTTCTCTTTGCGGAAGTGTTGATTGGTACAATGCCTCATTTAAAATGATTAATTA
TAAGGGAAAGTTTGAGTTGAATTATGTGTCTCCTTCATAAATTGTAGTCAAAACATTATC
ATCTGGTAGAAAATCTGTTGTTAGAAGTGCCTAAGGTGCTGAAATTACCAAAATCAACAT
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ATTTATTTAAATAAAAAAATGCCAAACATTTTACAGAAAATAACATGAAATGTTTTAAGG
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