Identifiers and Description
Gene Model Identifier
TTHERM_00091620Standard Name
NUP308Aliases
PreTt16515 | 6.m00589 | 3836.m02175 | Nup308Description
nucleoporin putativeGenome Browser (Macronucleus)
Genome Browser (Micronucleus)
External Links
Gene Ontology Annotations
Cellular Component
- nuclear pore (ISS) | GO:0005643
Biological Process
- transport (ISS) | GO:0006810
Domains
Gene Expression Profile
Vegetative Cell Cycle (Zhang et al., 2023)
GeneMania
Tetrahymena Stock Center
No Data fetched for Tetrahymena Stock Center
Homologs
Source Identifier Score Tetrahymena borealis EI9_02524.1 9.997093137033517e-262 Description: hypothetical protein (2551 aa) DictyBase DDB_G0291390 2.9992476920535046e-16 Description: nup98 on chromosome: 6 position 239658 to 246409 SGD YMR047C 0.0000000029989608248573072 Description: NUP116 Subunit of the Nup82 subcomplex of the nuclear pore complex; localized to both sides of the pore; contains a repetitive GLFG motif that interacts with mRNA export factor Mex67p and with karyopherin Kap95p; homologous to Nup100p WormBase WBGene00003797 0.000000030002053728821195 Description: locus:npp-11 status:Partially_confirmed UniProt:O01576 protein_id:CCD66423.1 WormBase WBGene00020109 0.000000030002053728821195 Description: Derlin-2 status:Confirmed UniProt:Q21997 protein_id:CCD70760.1
General Information
No Data fetched for General Information
Associated Literature
- Ref:28386019: Iwamoto M, Osakada H, Mori C, Fukuda Y, Nagao K, Obuse C, Hiraoka Y, Haraguchi T (2017) Compositionally distinct nuclear pore complexes of functionally distinct dimorphic nuclei in the ciliate Tetrahymena. Journal of cell science 130(10):1822-1834
- Ref:19375312: Iwamoto M, Mori C, Kojidani T, Bunai F, Hori T, Fukagawa T, Hiraoka Y, Haraguchi T (2009) Two distinct repeat sequences of Nup98 nucleoporins characterize dual nuclei in the binucleated ciliate tetrahymena. Current biology : CB 19(10):843-7
Sequences
>TTHERM_00091620(coding)
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AATTAATAAGGCTAAAATAATCAATAAGCAAGTTCTAATTAATAAAATATATTTGGTGGT
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GGTGCAACTACTACTTAAACAGCATAAACTACATAAACAGCAGCAGCTCCTCCTAAAAGT
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TAAAATGCTGGAAGTAGCTAACCTAAGTTTTTAAATATAGGAGCTAATAAAGATAATATA
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AAAAAAACTCATTAACATACTTCTTAAGCAACTGGACCAGATGAGAGATTAGAAATGGAT
ATTAATTCTGCTAAAAATCTTAATGGAAGTTTACACATGTTTTGCCAAAATATCCATAAG
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ATGGATTGTTACCGTATGTTTGATGTTTTCCTTTCTCACGAGAGCAAATTTGTCGACTAT
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TTATTTGAATCTAACAATGTTGCAGTAAGAAAGGACTCTCCATTTATAATTAATTTGAAA
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CTTCTTTTACTTTTCACTGATGACCAATACAATTACGATGCTGTTAGAGATGTTGTCGCT
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AATCCTGAATTAAGTGCAGAAGATAGCGAGCTATTCTAACTTTAAAAATAATTTGAAAAC
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GGTGATTCTTGTTTGATGTTAGTATTTGCTAAAGTAAAAGAAATTTAATAAAATAAAAAC
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ATTGACTTATTCTGGGAAAAGCTCGAAAGCAGAGAACAAACTAAGCATTTCCAAAATATC
TTTTCTAGTCCTATTTCTATTTACAAAGTAATGAAAAGTGCACTAGGTATGAGCTCCGAC
CCTAAATCTCGTCATGTTATCATCTTTTTGACTACTTTAAGCAATTTTAATTGGATTAAC
TTTAACTAAATAGCTGACTCACAATAAAATTTAGATACTGCAAGCATATTAAAATTGAGA
TTAATTTATAAGCTTATAATTACTGATCCTAAATGCATTAATTTACTTTAATATGTATTT
TACTTCACTGATTTATCATAGAATACTTTCGATTAATACATAAATGAATGCAATGGTGAT
GAAGTAATTAAATTTGTGATAAAGAGTTTTGCATTATATAACGATTTGCGTAGCTATGCT
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CGTTTAGCAATATAAAATGATGTGACTGCCACTGAATACAGATTAAAATGCAAGAGAGAA
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CAAATAAAAGGAATGGAAAGAAACACAGAATATGATTCTCCTTTACTTGCTCATTTGTTC
CTCTTCTTCACTAGCTTTATTGAAGATTGGGAATAAAACTAAGGCGCTCTTTACCTTAAG
CATAAGTGGAAAATAGGCTCTTTAATCATGAAAATTACTGATATTTGTTTAAACAGATTA
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TTTTTCTTACACAACTTCCTCTGCAACTAATTAAAGAAAATCAGAGTAGATGAAATGATT
ATCAAGGTGCTTGAAGTAGCAGCTAACTAATCATCTATTAGTAACAACAAGATAAACAAC
AAAACTCTTAAATTGAATAACAAGTATTGGTAAACTTATATCATGAATACCTCAAATAAA
TTTAAAGAACACTAGGTTGAACACATTAAAAACTAAGTTAATTTAAGAAATCTGATTGTT
GACACATTGAAGGTGTTAGAAACTACTATGCAATTAATTGAATAAAAAATTTAAATCCGT
AAACAAGATTTCGAATATAGATTTTTACAGAAATCAATGCTTTTAGATGAAATCCCAATT
TTAGATTTCTTTGAAAGAATAATATGCAAATCTGACTGTATCTTCCATTACAAATAAGAA
TATTACATTGACTCAAGCTTAAACTCAATAAAAATAAATATTTTATACGCCATATCCTCT
TACATTAACTTTGAAAATCATTTCTACTCTTCAAACGATGAAGTTAACCCAACACTTCCC
TTTTATATTTACAATTTCTTGGAAAGTGAAGGTAATTTAATTAACTAATTGGCAGATACT
CATTACCTTCTCGACTATGACACTATTAGAAACCCATTAAATAATTCTCGTTTACCAAAT
GGTACTTACTGTGAATTGATTAGCTCTTTGAGTTTGAGAATTTTAACTTAAATCATGTTG
GCTTGGGAAGCTCAATAGTCAATTAGAAAACCTATTTTAGTAGATTTCTTAAGCAACATG
AATATGGAAAACTACTGGGAGAAGTTAAATTACTCTTCTATTAACACTTAATTAACTAAT
TTCATAATTGAGATGTTTAACATATTGAAATTGAATGAATATGATTCTAACAATGATAGT
GAAGCTCTCAGAAAAAACATATCAGACAACAGCTGTGCAGTTATCGATTTCATGCTCACT
GCCTTATACACTCAACCTCTCTTCATGAACTTGATTCTTAAACCTGATAATCTTAACAGA
AAAAAGAAAGATAATGATCTTAAAATCAGATTTAAGCGCTTCTTTGAATCAAATGTTTGC
ACTTATGACATGCGTTTACTCAACAAATATTTGAATCTTTTAGTTGAAATCTTTAAGAGA
GATTAAATGTACCCAAGCTTTTGTTAGGAATTCCGTTAAGACACACAATATATTTTCGAA
AAGATTACTAAAGTCGTAGTTTAAAACTTTAAACCTTATGAAATCGACTAGCTCGTTGAA
AGAGATCTTTACTTTTTAAATTCTCCCAAAGAACCAAATATTCCTTACTTCGAGTTCTAA
AAATTAAAGTTATCTCAATTACTTAGAGAACACATAAAATAAACAGAACTCTACTAATAG
ATGATTTGCTTACACAGTTTCTAGATTTTACTTGATTTAATTAGCAAAGAATATCTTTCC
AATAAATGTAAATCAGTCCAATCTATCCAAAATAGCTTAAAAGCAATATTCGAAAATAAA
TAAGTTAATCACATCATGAACAGCTTATCTAAGTTCGCTCCAAGCTATTCATTAGATCTT
TGGCCAGTTCCTCAATAAATTCAAACTAAGATGAACATTGAAAATGAAGAGTAATTTAAG
GGAAAAATTTTCTAATAATCTTTCTTCTATTTGTTGGAAACTAACCAATATTCATATGGA
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TAAGACTACTTGTCTAGAGCTAAATACATTCTCTTTAAATTAATTGAATTCCGTCAAAAG
AGTATTAAATGGTCTATTGAAGAAATAAAACTAAGGACATTTGATTCATGGATTAGACTA
TTTTGTTTAGTTACTTCTTCAGGAGTTGAAGGTTACGCTATGAGTACTGTACAATCTTCT
ATTCCAAATTTCACTCTTAAGTAGCTCAGAGAGAGAAAGATTATTTTAGAGCATGAATAA
TTATGTTTACTCTATCCTAACTATGAAATAGAGTTTGTGAGTGGATTTGTTAACATCTTC
TGTGCCTCTAACCCACAATGTGTTGGTCTTTTCTCTAACTTATAGAGCGAAATGATGAAA
TAAATTCTCTAAGATTTGAAAAAAGGGTACTTTGGAGTGCTCTTTGATCAAAAACTCAAA
TTTTTACTTTACATATTATTCTCACTCAGACACTTACAAGATCTAGACTACCATTCCAAA
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AAAGTAATGACATAAATTTTAGAAGAAGCTGTCCATCGTGGTACTAGAGTTCAAATATGT
GATTTCATTTAGTGCTTATTCTTGCAATTACAAGTGATGGAAGTTCTCTACTTATAAACC
TTCTAAAACAACAAGAAAAAATTCGTTATCAATGAAAACTTGAATCCTTACTTTACAAAA
ATAATTGGTATTTTAATGAATTTGGCTGCTTAGAATATTGATGGTCTCCCTATTTTAATA
TCTTGTCTTAACAGTGCCCTACATATCTATCCATAATACTTTATTCTTTAATTCAAATAT
CAAGTTAAAGCTTTAGAATTTTTGATTAATAAAATCTTTTATGAAAAGAATGAAACTGCT
TAAATCTTTGTTTCTATTATAAATCTGTTGACAGATATTGCTAAGTATCCTGAAGGTGCT
CTTTTATTGAGTGAAGCTAATATTGTAAGTATGATATGCAACACTCCCATTTTTAAGAAT
ATAGAAAATGAACCATTCTATTGGCAAAATGGAGAAAGAAATCTCTTACATTCTTTCTGG
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ATTCCTCAAGTTTTATAAAACACTGCTACAAATTTAGCTAATAACAAAATGATTAACACT
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TCAGTTTATTTCTGCCAAGCCAATATCTTCAAAAGAAAGATGAGCAACGATTTTGAATAA
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TCTATCTTCATGCCAGTTTCTAAAATGGAAAAGAAGCTCTCTCAAATTTATGACATTTAT
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TTCTAATATTCTAGCAACAGCTTCAGTGATAATTTGATCAATAATGAAAGCAAGTAAGTT
TATTCTGTAAATTACTGGTAGAGCTTTGCAAATTCTTTGTTTGACTGCCTTAAATTCGTA
GAAAATACTCTAAATAAATGGGATTATAAGAAAAATAAAAATGTTAATATGGATGACTAG
CTTGTCAAGCTTCGCGCTCTCACAAATTCTGTAGAGTATAACTTATGTTGCTATGGATTT
GGTTCTCAAACTTCTTTAATAAATAGTGCTAAAACAATTATTTAAACATCTTAATTTAGT
CTTTAAGCTATCGTTCTTTCTGCTATCAAGCACTTCTAAATGTTAAACGAATTCAAATAA
TGGTTTGGACACTCTATAAAAGACAGTTTAACTGATTTATAAAATAAATTAAATGCAAAG
CTAGATGGATTGAAGAAACTAGAATATGAAGATATTTAACTTAAAAAATAAATTGAAGAG
CATATTTTACAATTCTAAAGGCTATCAGTGACATAAGATAGATATTGA>TTHERM_00091620(gene)
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GCTATATAATAACAATAAGGAGGAGGAAACTTATTTGGCTAAACTCAATAAAGTTAATAG
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GCAGCTAAGTAAAATGAAACACCAGTCCCTCCTTAAACTCAAAATTAATTGTTTGCAAAT
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TCAAATTAAAATCAGGCTTAAAACAATACCCAAAATTAGTAAGCTGAAAAGCCAAATTCT
CTTTTTGGAGATAAGCAAAATCAAGGAGCTCCATAAGTCACAGGAGGCTTATTTGGTAAC
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TAAATGTAATAAAATGCCTAAAGCTAATAGACCCAATAGTAATAATAACCTCCCACATAA
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GAAGAACCAAAGACATCTTTAGGTGGATTAAATTTATTAGGTTAAGCTCCTTTAAATACT
TAAAACTAGTAGAATTAAGCCCCAAAATAACCTGCATAAAGTGGCGGCTTATTTGCTTAG
GCTCCATAATAACAATAATAATAACAACAACAACAACAATAAAATAATACATAACCAACT
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CTTTTAGGAGGATAATAAAAACCAGCAACTAATCCTCCTACTATAGGAGCTACCTCTTAA
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ATTAATTCTGCTAAAAATCTTAATGGAAGTTTACACATGTTTTGCCAAAATATCCATAAG
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AAAAAATATGAATTGAAGCAATTTATTAATTAGCATAAAAGTTTACTCAAATTTCTTAAT
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GAAAGACTCCTTTGAAGTTCTGGAGTGAGAGATTATCAAAATATAAATATTAGTATTTGA
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CTTCTAATGAACCTTGCATCGAATTTTTCTACGAATAACAAGCTATTTTATTTGAATCTA
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TCTATTTACAAAGTAATGAAAAGTGCACTAGGTATGAGCTCCGACCCTAAATCTCGTCAT
GTTATCATCTTTTTGACTACTTTAAGCAATTTTAATTGGATTAACTTTAACTAAATAGCT
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AAACTTTTTCTTCAAAAAATTCTTTTAGGCTCTTTAATCATGAAAATTACTGATATTTGT
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TCTCGTTTACCAAATGGTACTTACTGTGAATTGATTAGCTCTTTGAGTTTGAGAATTTTA
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TGTTTAAATTATTATATTTATTATAGGCTCAATAGTCAATTAGAAAACCTATTTTAGTAG
ATTTCTTAAGCAACATGAATATGGAAAACTACTGGGAGAAGTTAAATTACTCTTCTATTA
ACACTTAATTAACTAATTTCATAATTGAGATGTTTAACATATTGAAATTGAATGAATATG
ATTCTAACAATGATAGTGAAGCTCTCAGAAAAAACATATCAGACAACAGCTGTGCAGTTA
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ATAAATCAATTTATTTATTTATTTACTCTCTTATTTGCTTATTTTGTTTATTTACTTTTG
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ATCTTGTCTTAACAGTGCCCTACATATCTATCCATAATACTTTATTCTTTAATTCAAATA
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TATTTTCATTTATTATTTGTTTGATTAACTTTTTTAACTTTAAAATTAGAATGAAACTGC
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TCTTTTATTGAGTGAAGCTAATATTGTAAGTATGATATGCAACACTCCCATTTTTAAGAA
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