Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00094120

Standard Name

RRM60 (RNA recognition motif-containing protein 60)

Aliases

PreTt16567 | 6.m00641 | 3836.m02224

Description

RRM60 cyclic nucleotide-binding domain protein

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External Links

Gene Ontology Annotations

No Data fetched for Gene Ontology Annotations

Domains

  • ( PF00027 ) cyclic nucleotide-binding domain
  • ( PF00076 ) RNA recognition motif. (a.k.a. RRM,
  • ( PF03880 ) DbpA RNA binding domain
  • ( PF07560 ) Domain of Unknown Function (DUF1539)
  • ( PF07769 ) psiF repeat
  • ( TIGR01622 ) splicing factor, CC1-like family
  • ( TIGR01628 ) polyadenylate binding protein, human types
  • ( TIGR01642 ) U2 snRNP auxilliary factor, large
  • ( TIGR01643 ) YD repeat (two copies)
  • ( TIGR01648 ) hnRNP-R, Q splicing factor family
  • ( TIGR01649 ) hnRNP-L/PTB/hephaestus splicing factor family
  • ( TIGR01659 ) sex-lethal family splicing factor
  • ( TIGR01661 ) ELAV/HuD family splicing factor

Gene Expression Profile

Vegetative Cell Cycle (Zhang et al., 2023)

GeneMania

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for Tetrahymena Stock Center

Homologs

Source Identifier Score
Tetrahymena borealis EI9_02573.1 9.997093137033517e-262
Description: hypothetical protein (934 aa)
Oxytricha Contig6706.0.g19 2.0004286606204839e-16
Description: Cyclic nucleotide-binding domain
Stentor Coeruleus SteCoe_3020 0.00000000003775134544279098
Description: None
SGD YIL033C 0.00003998524687536623
Description: BCY1 Regulatory subunit of the cyclic AMP-dependent protein kinase (PKA), a component of a signaling pathway that controls a variety of cellular processes, including metabolism, cell cycle, stress response, stationary phase, and sporulation

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

No Data fetched for Associated Literature

Sequences 

>TTHERM_00094120(coding)
ATGACAGAATTGAGATAATAAACAAGCTTCGAGATGGAGAACTTAGAAGCTTAGTTTAAT
TTAGTAGATTAGGTAGATGACATCAAAGAAATAGAGCAAAATAATAATAAATTGATTAAG
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GTATAGTAGCCCATCCAATCTAATGCATAAAATCAGCTTTTGTAATAAGATGAAAAGCAA
AGTCATAGAAGAAGATTTACATATGATGCAAATTTCCATAGAGTATAGGTTAAAAAAGAT
TAGCTCAATTAACAATAATAAAACCAAAATAATAGTTGA


>TTHERM_00094120(gene)
ATGACAGAATTGAGATAATAAACAAGCTTCGAGATGGAGAACTTAGAAGCTTAGTTTAAT
TTAGTAGATTAGGTAGATGACATCAAAGAAATAGAGCAAAATAATAATAAATTGATTAAG
AGTCTAAATAGATTCAAAAGGTAGTCTTGTATCTTCGTTGATTCAAATCAAAAAGATATC
AACTAAAAGTACAATTAACTCCTTAACAAAGAATATGTTGATTTAACAAATGAATTAGAT
AGTTCAGTAAAGTTTTATATCTAATCAATAGCTGTTCTTTTGCTAAACATTTTTTATTAA
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TTCATTAAAAATGCAATTTAAGGACTTTAGTTATTTAAAGAGCATAAAAATTTATTAACA
GCTCAAGGATTTGGAAATCACTTGCTAACATAAATGAAAGTGGAGTTTCACGAAAAAAAT
AATGTTATCTTTCACTATGGTATTAATATTAATTTTTAATTGGTTCTTTTTGTAGCAAAA
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TACATTTTACTCAAAGGTAATTTTAAGATTATATTTAATCTCTCTATTTAATTCTTAATT
AATACTATAAATTTAAGGAAAGCTTGATCTTATGATGCCAAAAAGTGAATGCATTGAAGA
AAATAACTTAAGAATGGAAAAAGGCTTACCTTCAATTCCTTATTTCTAAGAATACAAGTA
ATATTATATTTATGTAATAACTTAGATATTTATGTTAAGTTGTTTAGAAACACACCTGAA
GAATTACCAGATGAAACATTTGAATAATACATGGAGAGAATATATCCTAGATTAGGACAT
ATTAAAACATTTCTACCTGGTGAAGCATTTGGTGAAATTGCATTAATGACAAACCAGCAA
AGGTAAAGTTTTTTCAAATTAAACTATGATTAAAATAATTTTAATATAGAACTGGATCTA
TTATAGCAAGGGAAGATTCTTACACTTTGGTTATAACTAAGTCAGCCTTTCATGAACTTT
TAGGAAAATTTCACGAATTCATGCAAATGCAGAAATTAATTTTTTTGCAATAATTCTTTT
TCTTAAAGTAGATTCCTAGTTCAAAATTGCTATCTATTATTTAGCTCATGAAAATCTTTA
CATTCCAGAGAAACAATGTTATATATAATTAAAATTAAAGTATTAGTGGAATTTACTTTA
TTAAAGAAGGAGAAGTATAAATATCCACAAAAATAACTTAAATTGATGAAGAAAACTAAG
ATGAAAGTTAAAAACTCAAAATAAGATTTAGAAACATCAAAAAATCAGAAAAAGTCATTA
TTAAAGCCACAAATTCTTTCTTCGGAGAAGAAGAAATTATTTTAGGATAACATAGTAGAA
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AAATCATTATTAAATTCTAATTAAATTAATTTTACATACCATAGATTTCTATAATTATTC
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AAAATTAACATTTTTTAATTTTAATAAATTTAAAATTTACAAAAAAATATTAAAAATAAA
AATTGTTGTTTTAATTTTATATATAAATTAAAATAATTAGATCTTGCAAACTTATGGAAA
ATTATATGATATTGTTAAGAAGCTTAAATAAAATTATGATTTAAAATTAAAATGGGAGGA
ATAACGCACTTAAAATATACAAAATGTGCAAAAATAGAATGAGGAGAATATTAATACTCT
TAATTAGAACAAAGTCAAAGAGATAAATTTATCAAAATACATTTTAGAAAGTAGTCTACC
TAAAGGCAGAGTAAATTAAAGTGGCATTCCTATATACACAAATGGCAGTGATGATTAATT
AGAAAATAATGCATCTTCTTAGATGGAAGGATAAGGTATGTCAATGAGTTCCAAAAAGTA
TAGAAAATTATCTTACAATATGGAAATATAAACCATGTCTAGTCCTAAGAATTAAAATAA
ACTTGAATTAAACAATAATTTCCTTTAGGTTCAAAATTAAGAGAGAGATAATAATTTTCA
TATTTAAAATGGTTTTTCTAGTTAAAGTTCAAGTTTGAAACGCCAGTAGCCATACTTAAG
TCCTTAACCTTCTTAAATGAAAACTTAAAATTAAACAATGACCCCAGAAACTAACTACAC
AGGCCGTAAGAGTTTTCAGAGTAATATTTTTAAAAAACAAGGGAGCAAGGAAGATATCTT
AGAATCCTACAATGGATTTGGCGATAATATAAAAGAAAAAAATAAATTATAAAAATCTCC
ATCTTTTAATTATCAATTCAAGTAAAGAAATCCCAACTAAGATATTTAACTCAATCTACA
AACAAACAATTAATAAAATTCAAATACAAGTTCATAATTATCTATTCAAAGCTTTCAAAA
TACTTATGCCTTTGGTAATCCTTCGTCAAACAATAAAATTTAATCCAGTACTAACAACAG
TAGAGAAACTTCAGCTGAAAGATTATTTTTTGATTCGAGCCATAATGAATTTGAGTCAAT
GCTCAAAAAATAAACTTAACTTAAGCAAGAAATTTTAAAATAAATCAGTAAATCTAAAAA
TCCAACTCTTGATGGACTCACAGAAATAAATAAATAAAGAATAGATTTTAAAATACGCAA
ATAGAACAATTAATTTTTGCCAACAACACCCAAAACAATGAGAAACTCGTAATCATAAAG
TCTTAACTACATTTAAAGTTCAAGCAAAATTTCTTAAGCTAAAAGCTAAACTTTCATTCC
TTTAGATGCTCAAGGAATGAATGATAACATATTTAGTTTAAATTCAGAAAGCAAAAATAG
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TAGCAATACTAACATTACTGATAGAGTTGTAGTGGTACCTGCTTCAATGGCTAATTAAAA
AATGCAATTGAATTTTTTCTCAACTAAAGTCTAAGGAAATGATTAGCTTTAACTACCTTC
TTTATCTCAATAATAATAATAATAATTATAACAGTAATAAACTTTAGAGAAACCAATTTA
GCTGCATAATCAACCCTCAATTTAAATAAATAACAACTAACCCACTTTATATTAATTGGA
CACTCTTTTAGAAGAAGATGATGAAAATAGTCCTCTTAAATTTGGTAAAAAACTTAGAAT
ATAAATGGCAAGCTAGTAAAATATGACAGAAAATGGGTCTCATCCAGCTTCTTAGTTAAA
TTTCAATTACAATTAAAATGAAAAAGATTTAGAATTATAAAAAAATGCTTAGATTTTATG
TAAAAAATTTTAACTTGGTAAAAAAGTGGTAAAATATATCTAAAACAGAAAGTTCTACAA
TGAAAAGTTAGTTATTGACTTAGAAAAATAAATGAAGATACCTTCAAATTCCAATACATT
TAATTAATTTGATGAATTTATAAACCAGAAAAACTCTTCTTAGGTATCACCGTTGAATAA
TCTGGTAGATCAAAACCCATAGAAAGAAGTTATCATACAGGTTAAAGTACATAAGAGGGG
TGGTAGTATAATTTAACCTCCTACTTAATAAATTTAACACCACAATGTATAGTAGCCCAT
CCAATCTAATGCATAAAATCAGCTTTTGTAATAAGATGAAAAGCAAAGTCATAGAAGAAG
ATTTACATATGATGCAAATTTCCATAGAGTATAGGTTAAAAAAGATTAGCTCAATTAACA
ATAATAAAACCAAAATAATAGTTGA


>TTHERM_00094120(protein)
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AQILCKKFQLGKKVVKYIQNRKFYNEKLVIDLEKQMKIPSNSNTFNQFDEFINQKNSSQV
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