Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00112910

Standard Name

RIO2 (RIO2 subfamily protein kinase)

Aliases

PreTt27105 | 8.m00365 | 3812.m02402

Description

RIO2 RIO kinase family protein; serine kinase involved in the processing of the 20S pre-rRNA into mature 18S rRNA

Genome Browser (Macronucleus)

Full Screen View


Genome Browser (Micronucleus)

Full Screen View

External Links

Gene Ontology Annotations

Molecular Function

Biological Process

Domains

No Data fetched for Domains

Gene Expression Profile

Vegetative Cell Cycle (Zhang et al., 2023)

GeneMania

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for Tetrahymena Stock Center

Homologs

Source Identifier Score
Tetrahymena borealis EI9_03929.1 9.997093137033517e-262
Description: RIO1 family protein (539 aa)
Oxytricha Contig1004.1.g80 1.999787596754473e-118
Description: RIO1 family
DictyBase DDB_G0282099 5.997605038815675e-110
Description: rio2 on chromosome: 3 position 5366397 to 5368196
WormBase WBGene00013688 9.99583921019208e-96
Description: locus:riok-2 status:Confirmed UniProt:Q95Q34 protein_id:CAC70109.2
SGD YNL207W 2.0000012618802033e-84
Description: RIO2 Essential serine kinase involved in the processing of the 20S pre-rRNA into mature 18S rRNA; has similarity to Rio1p
Stentor Coeruleus SteCoe_22437 1.368539471173853e-44
Description: None

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

  1. Ref:16933976: Eisen JA, Coyne RS, Wu M, Wu D, Thiagarajan M, Wortman JR, Badger JH, Ren Q, Amedeo P, Jones KM, Tallon LJ, Delcher AL, Salzberg SL, Silva JC, Haas BJ, Majoros WH, Farzad M, Carlton JM, Smith RK, Garg J, Pearlman RE, Karrer KM, Sun L, Manning G, Elde NC, Turkewitz AP, Asai DJ, Wilkes DE, Wang Y, Cai H, Collins K, Stewart BA, Lee SR, Wilamowska K, Weinberg Z, Ruzzo WL, Wloga D, Gaertig J, Frankel J, Tsao CC, Gorovsky MA, Keeling PJ, Waller RF, Patron NJ, Cherry JM, Stover NA,

Sequences 

>TTHERM_00112910(coding)
ATGGCTAGCTGCTAAAACAAGTATTTAGAATATATGACAAAGGATGAATTCCGTGTCTTG
ACAGCAATTGAAATCGGTATGAGAAATCATGAACTTGTACCTATGCATCTTATAGAAAGA
ATCTCTCATTTAAAGAGAGTATGTGCTAGTAAAGTAGTAAAGTTACTTCTTAAAAATAAG
TTTATTGCACATGAAAATAAAAAATTCGACGGTTATAAATTAACTTACTTGGGATATGAT
TATCTTGCTTTACAGGTTTTTATCAGAAGAGGAGCTATTAAGGAAGTATTAGGAAAAGTA
GGATGTGGTAAAGAGTCAGATATTTATAAATGTGTAAATGAAAATGGAGATTTTGTTATC
TTGAAATTCACTCGTTTGGGCAGAACTTCATTTAGAACAATTAAAAAAAATAGAGATTAT
ATTTAGCATAGAACAAGTTATAGTTGGTTATATTTATCCAGACTTTCTGCTATTAAAGAA
TACACTTTTATGGATCTTCTACATAAGAATAACTTCCCTACACCTATTCCTATTGAGTAA
AATAGACATGGTATTGTTATGAGCTTAATTAATGGTGTTCCTATGCAAAACATTTCTGAA
ATTGACAATCCAAAATATGTTTTTGACTAATGCTTTTATTTGATTAAAAGATTAGCTGAG
AATGGACTTATCCATAGTGATTTTAATGAGTTTAACTTGATGGTAGAAGATAATGGAAAA
GTTATTATGATTGATTTTCCTCAGATGGTTAGCACAAAGCATAAAAATGCATAATTTTAC
TTTGATAGAGATGTTGAATGCATTCACGTTTTCTTTGAAAGAAGATTCAATTACCAGATT
ACTGATACTCTTGATTTCAACAAAATTGCTAGATTAAATGATCTTGATGTATAAGTAAAA
GCTTCTGGATTTATCAAAAAGGAAATAAAGAATATTGATGATTTTGATATTGATTTGAGA
GGTAGTGATGATGATGGCGACGATGATAATAGTGATGATGAAAATGAATAGAATGATTTA
GATAAAAATATAGAATAAGAAGATAGCGATAATGAAATAGAAGAATCTAATAAGAGAATA
CAAAATTTAAATATCTTAAATGATGAAGATATTAGCTAAGATGAAAATGAAGAAGAGCAA
AAAAATAACAAAAAATAAAAAAAGCATCACCTTAAAAAGCAATCAAAATCAAAATCTAAA
AAGTAAAACTAAGAATAAGAAGGAAAAGATGGAGAAGATGATGAAGATAACTAAAAAAAT
AACTTTTCTCCTGATCTTTCTGAAATATCAATAGAAGATTTGAAAGAACTTTAAAAGGTA
AACTAAGATTTATTTTCTGATGATGATAATGAAGATGATCCATTGGCTTTGAATGAGGTT
AAAGATATTAATGGAAATATTGTAGTTCCTGAATAAAAAGAGAAGAAAAAACCTAAAAAG
AAAATGGTAGATATTGCTAATGAATAAGACCAGGATAACAAACAAGACCTAAAAGAAAAA
ATATATATTAAAGAATCAGAATTAGCTGAAAAAGCAAAGGCTTATATTTAAAGATAAGTA
GAAAAGTAATTTAAGTAAAAATATAAAATTCTTAAGAAAAATACAAAAAGCAGTAACAGT
AATAAAGTTTTAGCTTCAGAGTATATGTGA


>TTHERM_00112910(gene)
ATGGCTAGCTGCTAAAACAAGGTAAATGATAAAACGATTTAATTGAAAAATAATTTTTTT
AAATCATTTGCTTACTTTAATTACAAAAAGTTTGTAAGTTTGTTAGATAAATATTTTTTT
CTTGATTTTAATTCAGTATGAAAACATTATTTATTTTGATTTAAGTATATTAATAATTTA
TTTGAAAAATATTTAATTTTTAAAATCAAATATGCTTTATTTTGTTTTTGAAAAATTTAA
TGATTAAAATTAATTTAAAAAACAAGTATTAGCGGGATATTTCAAATTTATTTTTTATTT
TATAATTAATTTCCATTTAGATCTAAAAAATATGTGGAAATTAATTGTTTATTAGTCTAA
ATATATTTATCAAACATCAAAATTATAATAAATTAAATTATTAATAATTATAAGCAAAAT
ATAAAAATAGATATTTATTAAATTAAATAAATAGATATAGCAAGCATAAAATGGGAGGAG
ATAATAGCAAGATTATTGGTCAATAAAGGAAAGAGTTATCAGATGGACTGAGAGTTCTAG
AAAATAAAATGAATGATAGATTTAAAACTTTCTCTTCCACACAATAAATTTTAGACCAAA
TACTTAAATCTTAAAGTGACTTATCTAAATAAATGAAATCAATAGACAGCTAAAATAATG
AATTAAAAGTTGAAATCTTAGGTGAGATGTCTAGAATAAGCAATTAATAAGAAAGTCTTA
GCAATAGTTGCATAAAAGATCAGTAAATGGAAGTAGAATTTTCTTCTAAATTAGATATCC
TAAAGGAATCTATTTCTAGAGAATAAGATAATAAACTAGTTAAGAGTTTTGAAGGTCTTC
AGTCGAAGTTGACTTTAGTAGAAAAATAGCTAGACCTTATTAATAATTCATTCAACTAAA
AATGCACAAATCTTGAATAATCTTTATTATCTTAAATTAAAGAAAGCTAAGAGTTGTCAA
ATATCTAAACTACTAAAATGGTTGAGGAGGTTGTTTCTACTCAAATTGAAAAAATTATCA
TCTCTCACTCTCAAAAAATTTCAAAAGTTGAAGAAGACATGGCTAACTAAAAAACTCGTA
TCGATAGTCTCGAATCATCTGTAAAAAATATTTAAGAATCTAGTCAATCTACCAATAAGG
CAATTATCAAATCTATAACTGATTTAGAATAGAAGTTTTCATAAATATCATAAAAATTGG
AAAGCTAAAAAGATAATTTGATTTTAACTACTAAAGATGAGATAAATTAACTTAAAAAAG
AAGTTAACGAATATAAAACTTTAATCTTACGTTTAGAGAAGTAGATAGCATCCTAATAAT
AACAAAATCAAAAACTTATATCTTCTAATACAAGTAAACCTATCTAACAAGATATATCAT
AAGATATAGAAGAGGAATCACCAGCAAAAAAATTCAAGTAACCCTTATCTAAAGATCCTA
TTGATGCTCCAACTCCTAAATCCAAGAAAGAAAAAGACTAAATGGATATTTAGTAAGATA
TAACCACACCTAAATAAAAATAACAAGGCTAATTTAAACAGCAGTTGGCTGAATAATCAT
CTACACCTAAAGAAAAGAAAGATAAAGTCTAATAGTTCGAAATTTAAGAATTTAGCTAGA
AAGCAATCCAAAAGTAAAATGAAAAGGAATAATCTTAAACACTCTAGAAAAGTTAGATCA
AACAAGATAAAACTCCTTAAAATAATTCTGAAATAAAAGTAGATTAAACCCCAAAGTAAA
GCAATCAATCTAAAACAGAAATAACACCTAAGTCATTTGCATAAGAATCAAAGTAAGCCC
TGAAGATAATTAAAAAGGAGTAGCAAATCTAATTAAAAAATGATAATGATGATTATGGAT
CATCTAGCGAAGATGAAGAATCAAGTGAAAGTGAAAATTTACCAAGTAAGAGTAAAATTA
TGTCTAAATAAAATCAAAAAAAGAAGGAATAAAAAACTCCTTAAAGTGATAAAGATTTTA
ATAATTTGAATAAATTGAAAGAGAATACTAAAAATTTCATAAAACAAGAGTAAAATAACA
ACAATAAAGGAGAAAATACTCCTAATTAAAAGAAAAACTTGATTAATAACTAAAATATCA
CAAATAACTAATAAAACTAATAATCTAACTTTAATGGTAAAAATAAATAGAATTTAAAAG
AATAATAGCAAGAATCAACTCCACAAAGCTAGCAGAAGGGTAAAAAAAACTTCAAAAATT
AATATTGATAAATGTATCAGTATGATCTTAAATCTCATTTTAAAATTAGTAGATATACTT
AATAAAACTGTAATAAAATTTTTGATATTGAATTAAGTAAAAATAATTAATCTACAAAAG
TTAAGAGATTTATGTTTTGTTTTCGTTTATAAATAAAAAATGTTTCTTTCTAATTTATAT
ATTCAGTCATTTTTGTGATAGTTTATACAATTTATTACTTATTTTTAATGCTATTTGATT
TTTAATACTATTTCTTTCTAATTTATTAATTTAAAAAAATCAAATTTAATTATGTTTGCT
ATTTGTTCATGTATTTTACAAAAGGCCTAAATTATTATGATTATTATCAAAATTAGTAAT
CCCATGCAAATCAAAATTAAATAAAAAGAATTTGTTATTACCTCAAAATATCAAATATCA
TCAAAAAGTATTGAAAATAATTAAACTATAAATTCACTTCTATTAAATTTAATAAGTAAA
AAGCAAGAAAAAAAAAAAAAAAATGAGATTAGACCCTTCAGTAAAGATTTATATTTAATA
TCAATTTAAGATGTTCAATTCCCATTTTTAAAGTATTTAGAATATATGACAAAGGATGAA
TTCCGTGTCTTGACAGCAATTGAAATCGGTATGAGAAATCATGAAGTAATTTAATTAATT
TGTTATTTCTAAACTGAGTAATAATATTTTTTAATAAAGCTTGTACCTATGCATCTTATA
GAAAGAATCTCTCATTTAAAGAGAGTATGTGCTAGTAAAGTAGTAAAGTTACTTCTTAAA
AATAAGTTTATTGCACATGAAAATAAAAAATGTAAGTTTTAAAAATATTTTTGCTTGATT
AACAAAACTCCTACTTGATTAAATTGAAATTTAAAAACAAATTTATTATAATATGGACAC
TTATTTTAAAAAATCAAAATAGTCGACGGTTATAAATTAACTTACTTGGGATATGATTAT
CTTGCTTTACAGGTACCTATTTAGCTAATCATTTTGAAATTTATTTATCAATAAATATTT
TAATAACAGGTTTTTATCAGAAGAGGAGCTATTAAGGAAGTATTAGGAAAAGTAGGATGT
GGTAAAGAGTCAGATATTTATAAATGTGTAAATGAAAATGGAGATTTTGTTATCTTGAAA
TTCACTCGTTTGGGCAGAACTTCATTTAGAACAATTAAAAAAAATAGAGATTATATTTAG
CATAGAACAAGTTATAGTTGGTTATATTTATCCAGACTTTCTGCTATTAAAGAATACACT
TTTATGGATCTTCTACATAAGGTATTTATTTTAATCAATATTTAGTATTTAGTAAGCTAA
ATTATTAACCATATAAATAGAATAACTTCCCTACACCTATTCCTATTGAGTAAAATAGAC
ATGGTATTGTTATGAGCTTAATTAATGGTGTTCCTATGCAAAACATTTCTGAAATTGACA
ATCCAAAATATGTTTTTGACTAATGCTTTTATTTGATTAAAAGATTAGCTGAGGTAAAGA
AATTATTAATTAATTACGTAAAAAATATTTATATTTATTACTTTAATAAAAAAGAATGGA
CTTATCCATAGTGATTTTAATGAGTTTAACTTGATGGTAGAAGATAATGGAAAAGTTATT
ATGATTGATTTTCCTCAGATGGTTAGCACAAAGCATAAAAATGCATAATTTTACTTTGAT
AGAGATGTTGAATGCATTCACGTTTTCTTTGAAAGAAGATTCAATTACCAGATTACTGAT
ACTCTTGATTTCAACAAAATTGCTAGATTAAATGATCTTGATGTATAAGTAAAAGCTTCT
GGATTTATCAAAAAGGAAATAAAGAATATTGATGATTTTGATATTGATTTGAGAGGTAGT
GATGATGATGGCGACGATGATAATAGTGATGATGAAAATGAATAGAATGATTTAGATAAA
AATATAGAATAAGAAGATAGCGATAATGAAATAGAAGAATCTAATAAGAGAATACAAAAT
TTAAATATCTTAAATGATGAAGATATTAGCTAAGATGAAAATGAAGAAGAGCAAAAAAAT
AACAAAAAATAAAAAAAGCATCACCTTAAAAAGCAATCAAAATCAAAATCTAAAAAGTAA
AACTAAGAATAAGAAGGAAAAGATGGAGAAGATGATGAAGATAACTAAAAAAATAACTTT
TCTCCTGATCTTTCTGAAATATCAATAGAAGATTTGAAAGAACTTTAAAAGGTAAACTAA
GATTTATTTTCTGATGATGATAATGAAGATGATCCATTGGCTTTGAATGAGGTTAAAGAT
ATTAATGGAAATATTGTAGTTCCTGAATAAAAAGAGAAGAAAAAACCTAAAAAGAAAATG
GTAGATATTGCTAATGAATAAGACCAGGATAACAAACAAGACCTAAAAGAAAAAATATAT
ATTAAAGAATCAGAATTAGCTGAAAAAGCAAAGGCTTATATTTAAAGATAAGTAGAAAAG
TAATTTAAGTAAAAATATAAAATTCTTAAGAAAAATACAAAAAGCAGTAACAGTAATAAA
GTTTTAGCTTCAGAGTATATGTGA


>TTHERM_00112910(protein)
MASCQNKYLEYMTKDEFRVLTAIEIGMRNHELVPMHLIERISHLKRVCASKVVKLLLKNK
FIAHENKKFDGYKLTYLGYDYLALQVFIRRGAIKEVLGKVGCGKESDIYKCVNENGDFVI
LKFTRLGRTSFRTIKKNRDYIQHRTSYSWLYLSRLSAIKEYTFMDLLHKNNFPTPIPIEQ
NRHGIVMSLINGVPMQNISEIDNPKYVFDQCFYLIKRLAENGLIHSDFNEFNLMVEDNGK
VIMIDFPQMVSTKHKNAQFYFDRDVECIHVFFERRFNYQITDTLDFNKIARLNDLDVQVK
ASGFIKKEIKNIDDFDIDLRGSDDDGDDDNSDDENEQNDLDKNIEQEDSDNEIEESNKRI
QNLNILNDEDISQDENEEEQKNNKKQKKHHLKKQSKSKSKKQNQEQEGKDGEDDEDNQKN
NFSPDLSEISIEDLKELQKVNQDLFSDDDNEDDPLALNEVKDINGNIVVPEQKEKKKPKK
KMVDIANEQDQDNKQDLKEKIYIKESELAEKAKAYIQRQVEKQFKQKYKILKKNTKSSNS
NKVLASEYM