Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00112910

Standard Name

RIO2 (RIO2 subfamily protein kinase)

Aliases

PreTt27105 | 8.m00365 | 3812.m02402

Description

RIO2 RIO kinase family protein; serine kinase involved in the processing of the 20S pre-rRNA into mature 18S rRNA

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External Links

• Uniprot
• Alphafold

Gene Ontology Annotations

Molecular Function

• ATP binding (IEA) | GO:0005524
• catalytic activity (IEA) | GO:0003824
• protein serine/threonine kinase activity (IEA) | GO:0004674

Biological Process

• protein phosphorylation (IEA) | GO:0006468

Domains

No Data fetched for Domains

Gene Expression Profile

Vegetative Cell Cycle (Zhang et al., 2023)

GeneMania

No results were calculated for this gene in GeneMania.

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for Tetrahymena Stock Center

Homologs

Source	Identifier	Score
Tetrahymena borealis	EI9_03929.1	9.997093137033517e-262
	Description: RIO1 family protein (539 aa)
WormBase	WBGene00013668	9.997093137033517e-262
	Description: status:Partially_confirmed UniProt:Q8WQB6 protein_id:CAD21657.2
Oxytricha	Contig1004.1.g80	1.999787596754473e-118
	Description: RIO1 family
DictyBase	DDB_G0282099	5.997605038815675e-110
	Description: rio2 on chromosome: 3 position 5366397 to 5368196
WormBase	WBGene00013688	9.99583921019208e-96
	Description: locus:riok-2 status:Confirmed UniProt:Q95Q34 protein_id:CAC70109.2
Tetrahymena borealis	EI9_15188.1	9.99583921019208e-96
	Description: hypothetical protein (527 aa)
SGD	YNL207W	2.0000012618802033e-84
	Description: RIO2 Essential serine kinase involved in the processing of the 20S pre-rRNA into mature 18S rRNA; has similarity to Rio1p
Stentor Coeruleus	SteCoe_22437	1.368539471173853e-44
	Description: None

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

1. Ref:16933976: Eisen JA, Coyne RS, Wu M, Wu D, Thiagarajan M, Wortman JR, Badger JH, Ren Q, Amedeo P, Jones KM, Tallon LJ, Delcher AL, Salzberg SL, Silva JC, Haas BJ, Majoros WH, Farzad M, Carlton JM, Smith RK, Garg J, Pearlman RE, Karrer KM, Sun L, Manning G, Elde NC, Turkewitz AP, Asai DJ, Wilkes DE, Wang Y, Cai H, Collins K, Stewart BA, Lee SR, Wilamowska K, Weinberg Z, Ruzzo WL, Wloga D, Gaertig J, Frankel J, Tsao CC, Gorovsky MA, Keeling PJ, Waller RF, Patron NJ, Cherry JM, Stover NA,

Sequences

>TTHERM_00112910(coding)
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>TTHERM_00112910(gene)
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ATGATTGATTTTCCTCAGATGGTTAGCACAAAGCATAAAAATGCATAATTTTACTTTGAT
AGAGATGTTGAATGCATTCACGTTTTCTTTGAAAGAAGATTCAATTACCAGATTACTGAT
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GGATTTATCAAAAAGGAAATAAAGAATATTGATGATTTTGATATTGATTTGAGAGGTAGT
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AACAAAAAATAAAAAAAGCATCACCTTAAAAAGCAATCAAAATCAAAATCTAAAAAGTAA
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>TTHERM_00112910(protein)
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