Identifiers and Description
Gene Model Identifier
TTHERM_00123780Standard Name
Aliases
PreTt27292 | 8.m00552 | 3812.m02580Description
polycystin cation channel proteinGenome Browser (Macronucleus)
Genome Browser (Micronucleus)
External Links
Gene Ontology Annotations
No Data fetched for Gene Ontology Annotations
Domains
No Data fetched for Domains
Gene Expression Profile
Vegetative Cell Cycle (Zhang et al., 2023)
GeneMania
Tetrahymena Stock Center
No Data fetched for Tetrahymena Stock Center
Homologs
Source Identifier Score Tetrahymena borealis EI9_20502.1 9.997093137033517e-262 Description: hypothetical protein (1199 aa) Oxytricha Contig3081.0.g76 3.0002687256732656e-20 Description: Ion transport protein SGD YOR087W 0.000004000864880866421 Description: YVC1 Vacuolar cation channel, mediates release of Ca(2+) from the vacuole in response to hyperosmotic shock
General Information
No. Gene Name(s) Paragraph Text 124 (no standard gene name) This protein is a homolog of proteins in the polycystic cation channel transmembrane protein family. It contains one domain; the domain (E-value = 1.2 -10) is known as CL0030, which contains the cation channel region of PKD1 and PKD2 proteins. PKD1 and PKD2 functions through a common signaling pathway that is necessary for normal tubulogenesis. Tubulogenesis is the formation of tubules in epithelial or endothelial cells that transport liquid and gas throughout the body. In humans, the mutations in PKD1 and PKD 2 form thousands of cysts which inhibits the protein from efficiently carrying liquid and gas throughout the body. It is possible that in Tetrahymena this protein is an integral membrane protein. Paragraph by: Deborah Yi-an Lin, Keck Science Department, Scripps College
Associated Literature
No Data fetched for Associated Literature
Sequences
>TTHERM_00123780(coding)
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CTGTAATTAAATACTGATAATTTTTTCTTAAATAGATCATTTAGCTCATAACCTAACATA
AATGTTAATAACTTAAATTGA>TTHERM_00123780(protein)
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