Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00128620

Standard Name

UDH4 (UvrD/REP-family DNA helicase 4)

Aliases

PreTt09426 | 9.m00447 | 3699.m00155 | REP3

Description

UDH4 UvrD/REP helicase family protein; UvrD/REP helicase family protein

Genome Browser (Macronucleus)

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No Genome Browser Data Present

External Links

• Uniprot
• Alphafold

Gene Ontology Annotations

Molecular Function

• ATP binding (IEA) | GO:0005524
• ATP-dependent DNA helicase activity (IEA) | GO:0004003
• DNA binding (IEA) | GO:0003677

Biological Process

• DNA repair (IEA) | GO:0006281

Domains

• ( PF00270 ) DEAD/DEAH box helicase
• ( PF00580 ) UvrD/REP helicase
• ( PF04644 ) Motilin/ghrelin
• ( PF04702 ) Vicilin N terminal region
• ( PF05153 ) Family of unknown function (DUF706)
• ( TIGR00372 ) CRISPR-associated protein Cas4
• ( TIGR01073 ) ATP-dependent DNA helicase PcrA
• ( TIGR01074 ) ATP-dependent DNA helicase Rep
• ( TIGR01075 ) DNA helicase II

Gene Expression Profile

Vegetative Cell Cycle (Zhang et al., 2023)

GeneMania

No results were calculated for this gene in GeneMania.

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for Tetrahymena Stock Center

Homologs

Source	Identifier	Score
Tetrahymena borealis	EI9_19668.1	9.997093137033517e-262
	Description: UvrD/REP helicase (1047 aa)
SGD	YJL092W	0.00000005999527666938375
	Description: SRS2 DNA helicase and DNA-dependent ATPase involved in DNA repair, needed for proper timing of commitment to meiotic recombination and transition from Meiosis I to II; blocks trinucleotide repeat expansion; affects genome stability

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

1. Ref:23884606: Gao S, Xiong J, Zhang C, Berquist BR, Yang R, Zhao M, Molascon AJ, Kwiatkowski SY, Yuan D, Qin Z, Wen J, Kapler GM, Andrews PC, Miao W, Liu Y (2013) Impaired replication elongation in Tetrahymena mutants deficient in histone H3 Lys 27 monomethylation. Genes & development 27(15):1662-79

Sequences

>TTHERM_00128620(coding)
ATGGACAACTAAAATAAATATAGAGTAATTAATTATTAGGATTATAATGGATCGGAGTGT
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>TTHERM_00128620(gene)
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>TTHERM_00128620(protein)
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