Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00128650

Standard Name

UDH6 (UvrD/REP-family DNA helicase 6)

Aliases

PreTt09429 | 9.m00450 | 3699.m00158

Description

UDH6 UvrD/REP helicase family protein; UvrD/REP-family DNA helicase

Genome Browser (Macronucleus)

Full Screen View


Genome Browser (Micronucleus)

Full Screen View

External Links

Gene Ontology Annotations

No Data fetched for Gene Ontology Annotations

Domains

  • ( PF00036 ) EF hand
  • ( PF00270 ) DEAD/DEAH box helicase
  • ( PF00580 ) UvrD/REP helicase
  • ( PF01443 ) Viral (Superfamily 1) RNA helicase
  • ( PF04851 ) type III restriction enzyme, res
  • ( PF07492 ) Neutral trehalase Ca2+ binding domain
  • ( TIGR01073 ) ATP-dependent DNA helicase PcrA
  • ( TIGR01074 ) ATP-dependent DNA helicase Rep
  • ( TIGR01075 ) DNA helicase II

Gene Expression Profile

Vegetative Cell Cycle (Zhang et al., 2023)

GeneMania

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for Tetrahymena Stock Center

Homologs

Source Identifier Score
Tetrahymena borealis EI9_19668.1 8.99652583192316e-145
Description: UvrD/REP helicase (1047 aa)
SGD YJL092W 0.00000005999527666938375
Description: SRS2 DNA helicase and DNA-dependent ATPase involved in DNA repair, needed for proper timing of commitment to meiotic recombination and transition from Meiosis I to II; blocks trinucleotide repeat expansion; affects genome stability
Oxytricha Contig14871.0.0.g77 0.000005000363240844623
Description: UvrD-like helicase C-terminal domain

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

No Data fetched for Associated Literature

Sequences 

>TTHERM_00128650(coding)
ATGGAATAACAGGTTTCAGATGAGAATAGCTGTTAAGAAAACATAGCATTAACTGATGAA
TAAAAAAAAATAATTAATTCCTCAATCGATGAAGATCAAAGAATTTTAGCATGTGCAGGT
TCAGGTAAAACAACTACACTCATTTATCGAATCAAGTATTTGATTGAATAAGGAATATGT
GCTAAATAAATACTACTAAGTACTTTTAATGTTGAAGCTGCTAATAACTTAAAAATAAAA
GCAAAACAAGTGTTATAGTAAGATGCAGAAGAAGTAAAAATGATGAATATAGATAAATTT
AATGCTGAAATTTATAACAAATATATAAAAGATAATGATAAAGATAATAACTTTAAATTA
GATATAAAAGAGTTAGGATATAAAGTTTAACAATTCTTAAGTACAAGAGAAGGAAATGAA
AAGGTTTTAAAGAAATATAAATACTTTTTTTTTGATGAGTTTTAAGATGTAAATCAAATC
TAGTATGACATCCTAATTCTTTTCAAAAAAGCAGGATGCAAAATTATAGTTATAGGAGAT
GAGGCTTAAAATATTTACAGCTTTAGAGATTCTAAATTAGAATTTATTCAAAGCAAAATA
AACTAAGATGTGCTAGAAATCTCAAAATAGGAAATAAAAACATATCACCTTAGTGTAAAT
TTTAGATGTTCAAGAAAAATCACATCATTTTGCAATTAAATTTTTGCAAACTAGAAGCAT
CTTGCAAGGCCTATGGATAGCTTAAAAAATGAAGAAGAGGAATGTTATTATCCTAAAATT
AGCCTTTATGGAGATTAAAATAAATAAGTGTATGATTTAATTTCAACTTTTAAAGGTTTA
ATATAGTAGGGGTATTAGTGGAGTGATTTGGCAGTACTTAGTCCTTCAAGAAAACCATTA
CTACACTTTTAGGAGTATTTAGAATAGCATTATTATATTTTTGGCCAAAAAATTCCTTAT
TCCCTAATATCCAGAAATATAGATAATCTTTTCACTTCTGATAATTTTGAATCTACTGAG
AAGTAAAATCACTTGACTTTGAGCACAATCCATTCTTCTAAGGGTTTGGAATGGAAGGTA
GTATTTATAATTGGAATTAATGATTTTAATTTTCCAGGAGCTTTCATCAAGTAGTTATAA
GTAGAAAAAAATATTTAAGAAAAGTTAAATGAGTGTAGAAGATTATTCTATGTAGCGTGC
ACTAGAGCTATGGAATAGCTAAAGTTTTGTTTCTTATAATATAAAGAAAAATATATATGT
AGGTTTTTCAGTGAAATTAATAAATAATATTACTAATCAGATCAAGATTTAAAAAAAGAA
GATTTTGCTTAAATCCAATCAAAATAAAAAAACTAAGTTTAACAAAGAAATTTATAAAAT
CCTTCCTAAAAAAAATCAACAATTGAAGCATTAGATATCAAAAATAAAATAGCTGATATC
ATACAAAATTTTGACATTAATGACTATGAAGTACTGAACAGTTTTCTATAAAAAATAAAA
CTTCTTAAATATTAAAGAGGGGAACATGTCACTTTCGACAATGAATAAATAAAATAAAAC
GCTCTTTAATAAGATTTGATTTGCTATCTTGAAATATTACTTTATAGAAGTGTTGTTGAA
AAATTCTTGTAAAGCTAGACAATTTAAAATGAAGATGCAGAGAAAATAATACTACGTACA
ATAAGTTGGAGTGGATATTAAAAGAGTTTTTATAATAGATACAAAGATTTCTTCAACTAA
TTAGATTTTCAAAAATTAGACAGCCTTGAGTCATTTATAGACAATTTCAAAGACTTTAAC
AAAATCGAAAAGAAATTAAATAGATTTGAAAATGAGAATTTATCGGATATGTACTCATCA
ATTTAAAAATTTTTAAAACAGTATAAGCTAAATTATAAAGATATTCATCATGCAACTGAA
ACTTATTTTTCAGATGATTTTGATAGGTAGAAATATTTTGACAGTTATTAACAATTTTCA
AATAAAGAATTGAAAACCTAAAATATTCTCAAAGACATTTATAATGTCAGTAAATTTAGT
TTAATTTCCTAAGGAATAAAGAGATCTTTATACAGAGATGATAGTAGTTTATTTCATAAT
GAGGATTTAACATTAAATATAGATAGATTTTTAAATGTCCTAGAATAATAATATGATTAG
AATAGGTTTGAAATAAAAAAGAAAATAAATTATGCTAATTTTTATGGGGTTATAGATTTA
ATAGCATTTGATAAATCTCTAGCTTATGCATGTATATTAAAAAAAATGAATTACAGGATA
CAAAATATTGTTTTCTATAATGTACTTCAAGATAATTGGATCATTTATTCGATAGAGTAA
TGGAATTAAGAAGAAGAATTCTTAAGATTTTTGTAAAAGAAAAAAGAAGATTACTAAAAA
GAGTAAGAAGAGAGTGAGGAGACTGATAATAATTTAGAGAAAGAGAAGTAATAGTAAGTA
AAAATCTAAGAGAAATCTTTGTAAAACTTATAAGTTCCTATTGAAGAATAAGAAAAAGAG
AATAATAGTAAGAATATTAATAATTATAGTCTACAAGAAAGTTAATAGGAAAAGAAAAAT
TAACTTATTTATCAAATTAATTGTCAATATTCTCAAAATTCAATTTAAAATTAAAGTTAA
AATTCTGATTAGACTGTATAAGAAAACAATCTTTAACATATGTACAAACAAAATGATTAA
TAAGGCAATATTGACATAGAAAATTAATTTAATTTTGGTAATTAAAGTAAGTAAAATGAT
AATTTAATACAAGTAGCTTTTGATAACTAAAAAATTAACCAAAATGAACCATTAGAAAAT
AAAAATAATTTATTTGGCAATTTTCAATAAATTAGAGATGACACCAAGAAAATTGAAGAG
CCTCGTTAATAATTAATTAATTTAAAAAATCATGTAGGAGAGAACTCTTAAGTTTTAGTA
AATAGCAATTAGAAAGGACTAAAAAAATCTAAAGTTGAAAACTAGAAAATTAATTTGAAC
TAAAAAAGGAAGAAAGAGAAGGATTAAGTTGATTATGAATAGTAGAAAATCAATTTTAAA
AAACAAAAAGTAGAATAAGGAGAGAAATCTATTTTCAATATCTAGATAATATTTTTAATA
ATTTACATATTATTTTAAATCATTAGAACTACATTAAAAAACAAGGAAATAAACTCATGA


>TTHERM_00128650(gene)
ATGGAATAACAGGTTTCAGATGAGAATAGCTGTTAAGAAAACATAGCATTAACTGATGAA
TAAAAAAAAATAATTAATTCCTCAATCGATGAAGATCAAAGAATTTTAGCATGTGCAGGT
TCAGGTAAAACAACTACACTCATTTATCGAATCAAGTATTTGATTGAATAAGGAATATGT
GCTAAATAAATACTACTAAGTACTTTTAATGTTGAAGCTGCTAATAACTTAAAAATAAAA
GCAAAACAAGTGTTATAGTAAGATGCAGAAGAAGTAAAAATGATGAATATAGATAAATTT
AATGCTGAAATTTATAACAAATATATAAAAGATAATGATAAAGATAATAACTTTAAATTA
GATATAAAAGAGTTAGGATATAAAGTTTAACAATTCTTAAGTACAAGAGAAGGAAATGAA
AAGGTTTTAAAGAAATATAAATACTTTTTTTTTGATGAGTTTTAAGATGTAAATCAAATC
TAGTATGACATCCTAATTCTTTTCAAAAAAGCAGGATGCAAAATTATAGTTATAGGTATT
GTTTGTTTTACTTCTACTTTCTTATTAAATTAAGCTAATTTCTAAAATTATTTTTTTTAG
CATTGTTTTAATATTTCTTATTTAAAATAGGAGATGAGGCTTAAAATATTTACAGCTTTA
GAGATTCTAAATTAGAATTTATTCAAAGCAAAATAAACTAAGATGTGCTAGAAATCTCAA
AATAGGAAATAAAAACATATCACCTTAGTGTAAATTTTAGATGTTCAAGAAAAATCACAT
CATTTTGCAATTAAATTTTTGCAAACTAGAAGCATCTTGCAAGGCCTATGGATAGCTTAA
AAAATGGTAAAGCTCACAAAGCTAAATTATTAAAATAATCATGTTTTTATTTTAATTTAA
ATTGTGTTCATATTTTAAATATTAAAGTTAATTAAATATACAAATTCTTTACATAATTAA
TTAATTAATTAATTAATCATCTTTTACTACTTTAGTTAAATTTAAAAATGTTCAACTTTT
TTTTATAAATAACAGAAGAAGAGGAATGTTATTATCCTAAAATTAGCCTTTATGGAGATT
AAAATAAATAAGTGTATGATTTAATTTCAACTTTTAAAGGTTTAATATAGTAGGGGTATT
AGTGGAGTGATTTGGCAGTACTTAGTCCTTCAAGAAAACCATTACTACACTTTTAGGAGT
ATTTAGAATAGCATTATTATATTTTTGGCCAAAAAATTCCTTATTCCCTAATATCCAGAA
ATATAGATAATCTTTTCACTTCTGATAATTTTGAATCTACTGAGAAGTAAAATCACTTGA
CTTTGAGCACAATCCATTCTTCTAAGGGTTTGGAATGGAAGGTAGTATTTATAATTGGAA
TTAATGATTTTAATTTTCCAGGAGCTTTCATCAAGTAGTTATAAGTAGAAAAAAATATTT
AAGAAAAGTTAAATGAGTGTAGAAGATTATTCTATGTAGCGTGCACTAGAGCTATGGAAT
AGCTAAAGTTTTGTTTCTTATAATATAAAGAAAAATATGTAAATTTTAGTTAGATAATAT
TTTCATACTATAATAAAATTTTTATTGTTAAGATATGTAGGTTTTTCAGTGAAATTAATA
AATAATATTACTAATCAGATCAAGATTTAAAAAAAGAAGATTTTGCTTAAATCCAATCAA
AATAAAAAAACTAAGTTTAACAAAGAAATTTATAAAATCCTTCCTAAAAAAAATCAACAA
TTGAAGCATTAGATATCAAAAATAAAATAGCTGATATCATACAAAATTTTGACATTAATG
ACTATGAAGTACTGAACAGTTTTCTATAAAAAATAAAACTTCTTAAATATTAAAGAGGGG
AACATGTCACTTTCGACAATGAATAAATAAAATAAAACGCTCTTTAATAAGATTTGATTT
GCTATCTTGAAATGTAAAATTTTATAAATTAATTTTCAGTAAAGATTATTTAATTATTTC
AAAATAAAATTTTAGCTAACTTTTTATATGTAATCGAATGAATATTTTTTATACTAAAAT
CCAGTGATAAGAAAATTATTTTTTAATTCATTTTTCATAAAGCACTTAGCAATTTTAAAA
AATATTCATCGCTATTTATTATCGAATTAATATTTAGAAATAAACATAATTTAATTAAAG
ATTATGTGTATATATAAAACTTATTTTCTGATATATTTTGATGAAAAATAGTATCTCATC
AAAATATTTATAAATTTTGCGTATTATTTCATCTTTTTATATTTTTCTAAAAAGGAGAGC
TTATATTTAAATTAATTTTTTATTTAGATTACTTTATAGAAGTGTTGTTGAAAAATTCTT
GTAAAGCTAGACAATTTAAAATGAAGATGCAGAGAAAATAATACTACGTACAATAAGTTG
GAGTGGATATTAAAAGAGTTTTTATAATAGATACAAAGATTTCTTCAACTAATTAGATTT
TCAAAAATTAGACAGCCTTGAGTCATTTATAGACAATTTCAAAGACTTTAACAAAATCGA
AAAGAAATTAAATAGATTTGAAAATGAGAATTTATCGGATATGTACTCATCAATTTAAAA
ATTTTTAAAACAGTATAAGCTAAATTATAAGTAATATGATTTATTCTAATCAAATAAAAA
TAAAATTTCTTTAATATTTAAAATAGAGATATTCATCATGCAACTGAAACTTATTTTTCA
GATGATTTTGATAGGTAGAAATATTTTGACAGTTATTAACAATTTTCAAATAAAGAATTG
AAAACCTAAAATATTCTCAAAGACATTTATAATGTCAGTAAATTTAGTTTAATTTCCTAA
GGAATAAAGAGATCTTTATACAGAGATGATAGTAGTTTATTTCATAATGAGGATTTAACA
TTAAATATAGATAGATTTTTAAATGTCCTAGAATAATAATATGATTAGAATAGGTTTGAA
ATAAAAAAGAAAATAAATTATGCTAATTTTTATGGGGTTATAGATTTAATAGCATTTGAT
AAAGTAAATTATTTATTTATTAATTAAGTTAGAAGTAAGCGATTGAATAAACATTTTTCT
AATAATTTAAATTTTAAGTAATAGGATAAAGGTGATATATTTTAATTTATCTATTATTAA
GGAGAGTCTGAATTAAGTATTTCTAAACAATAAATTATTTAAGTAAATATTTTCAATTAG
CTTCAGAATTTATAATCAAGCAAATTTACTTATATTAAAAAGTCTCTAGCTTATGCATGT
ATATTAAAAAAAATGAATTACAGGATACAAAATATTGTTTTCTATAATGTACTTCAAGAT
AATTGGATCATTTATTCGATAGAGTAATGGAATTAAGAAGAAGAATTCTTAAGATTTTTG
TAAAAGAAAAAAGAAGATTACTAAAAAGAGTAAGAAGAGAGTGAGGAGACTGATAATAAT
TTAGAGAAAGAGAAGTAATAGTAAGTAAAAATCTAAGAGAAATCTTTGTAAAACTTATAA
GTTCCTATTGAAGAATAAGAAAAAGAGAATAATAGTAAGAATATTAATAATTATAGTCTA
CAAGAAAGTTAATAGGAAAAGAAAAATTAACTTATTTATCAAATTAATTGTCAATATTCT
CAAAATTCAATTTAAAATTAAAGTTAAAATTCTGATTAGACTGTATAAGAAAACAATCTT
TAACATATGTACAAACAAAATGATTAATAAGGCAATATTGACATAGAAAATTAATTTAAT
TTTGGTAATTAAAGTAAGTAAAATGATAATTTAATACAAGTAGCTTTTGATAACTAAAAA
ATTAACCAAAATGAACCATTAGAAAATAAAAATAATTTATTTGGCAATTTTCAATAAATT
AGAGATGACACCAAGAAAATTGAAGAGCCTCGTTAATAATTAATTAATTTAAAAAATCAT
GTAGGAGAGAACTCTTAAGTTTTAGTAAATAGCAATTAGAAAGGACTAAAAAAATCTAAA
GTTGAAAACTAGAAAATTAATTTGAACTAAAAAAGGAAGAAAGAGAAGGATTAAGTTGAT
TATGAATAGTAGAAAATCAATTTTAAAAAACAAAAAGTAGAATAAGGAGAGAAATCTATT
TTCAATATCTAGATAATATTTTTAATAATTTACATATTATTTTAAATCATTAGAACTACA
TTAAAAAACAAGGTATTGTTAACAAACATATTTTTTTATTAAATTTTTTCTAATATAAAT
TAAAGGAAATAAACTCATGA


>TTHERM_00128650(protein)
MEQQVSDENSCQENIALTDEQKKIINSSIDEDQRILACAGSGKTTTLIYRIKYLIEQGIC
AKQILLSTFNVEAANNLKIKAKQVLQQDAEEVKMMNIDKFNAEIYNKYIKDNDKDNNFKL
DIKELGYKVQQFLSTREGNEKVLKKYKYFFFDEFQDVNQIQYDILILFKKAGCKIIVIGD
EAQNIYSFRDSKLEFIQSKINQDVLEISKQEIKTYHLSVNFRCSRKITSFCNQIFANQKH
LARPMDSLKNEEEECYYPKISLYGDQNKQVYDLISTFKGLIQQGYQWSDLAVLSPSRKPL
LHFQEYLEQHYYIFGQKIPYSLISRNIDNLFTSDNFESTEKQNHLTLSTIHSSKGLEWKV
VFIIGINDFNFPGAFIKQLQVEKNIQEKLNECRRLFYVACTRAMEQLKFCFLQYKEKYIC
RFFSEINKQYYQSDQDLKKEDFAQIQSKQKNQVQQRNLQNPSQKKSTIEALDIKNKIADI
IQNFDINDYEVLNSFLQKIKLLKYQRGEHVTFDNEQIKQNALQQDLICYLEILLYRSVVE
KFLQSQTIQNEDAEKIILRTISWSGYQKSFYNRYKDFFNQLDFQKLDSLESFIDNFKDFN
KIEKKLNRFENENLSDMYSSIQKFLKQYKLNYKDIHHATETYFSDDFDRQKYFDSYQQFS
NKELKTQNILKDIYNVSKFSLISQGIKRSLYRDDSSLFHNEDLTLNIDRFLNVLEQQYDQ
NRFEIKKKINYANFYGVIDLIAFDKSLAYACILKKMNYRIQNIVFYNVLQDNWIIYSIEQ
WNQEEEFLRFLQKKKEDYQKEQEESEETDNNLEKEKQQQVKIQEKSLQNLQVPIEEQEKE
NNSKNINNYSLQESQQEKKNQLIYQINCQYSQNSIQNQSQNSDQTVQENNLQHMYKQNDQ
QGNIDIENQFNFGNQSKQNDNLIQVAFDNQKINQNEPLENKNNLFGNFQQIRDDTKKIEE
PRQQLINLKNHVGENSQVLVNSNQKGLKKSKVENQKINLNQKRKKEKDQVDYEQQKINFK
KQKVEQGEKSIFNIQIIFLIIYILFQIIRTTLKNKEINS