Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_001295283

Standard Name

PAMD1 (PArtner of McmD1)

Aliases

None

Description

hypothetical protein; Required for homologous recombination in meiosis; interacts with Mcmd1

Genome Browser (Macronucleus)

Full Screen View


Genome Browser (Micronucleus)

Full Screen View

External Links

Gene Ontology Annotations

No Data fetched for Gene Ontology Annotations

Domains

No Data fetched for Domains

Gene Expression Profile

Vegetative Cell Cycle (Zhang et al., 2023)

GeneMania

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for Tetrahymena Stock Center

Homologs

Source Identifier Score
Tetrahymena borealis EI9_18594.1 9.997093137033517e-262
Description: hypothetical protein (1668 aa)

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

  1. Ref:31815942: Tian M, Loidl J (2019) An MCM family protein promotes interhomolog recombination by preventing precocious intersister repair of meiotic DSBs. PLoS genetics 15(12):e1008514

Sequences 

>TTHERM_001295283(coding)
ATGGAGAAATTTATTAAATTTTTGGAAGAAGACGTAGATTTTAATATAGAAATTCATAAT
AAGATTTAAGATTTAAAAGATTAAAAGTTAATAGATCCTAGCTTTATTGTTTTTAAGTGC
AGTCTCAGATTGGATATTATATAGTTGAATGACTAAGATTTAAACCTTTCCATTTATATT
TAGCAAAATTACCCTAATTTAGATTCGTTAATTAGAGATTATGTATAAAAGATTTTATCT
GAAGATAAATAATTGAGGAATATATAAATAAGACAAGAATAAATACTTCCTGATATCGAG
ATCATCAATGGGAATCTTACTAATAATCTTAATATTTATGCATAGAAAGGTATTCTTCAG
AATTCTTTGTTATAAAATTCTTTTGTTCAAGGACAGCTAGTTCTTATTGAATATTTTTAA
GTATTAAAAATTTTTCCTTTAGAGAATTATTACTCTATTAAGAGATATTCTTATTACTGT
GGTTGCAACAATAATGATTACAAGCTTTAAAATACTAATTTAATTCTTCATATTATTGAA
AACAATTAATCTGCATCCCTAAACAAACAGAGCTCTAATTTAATTAAAAATTTAAGCTGT
GATATATGTCATTAGGAAATGTATGAAGATAAAGAAAAGAGTAAACCTGAATTATGCCAA
AAAGTACTTATATATATTCCAGAGAGATATAATTCAACCAGAAATAGTTTATTAAACGGT
TTTTAAAAAGAAGAGGGAAAACTCATTGAAATGTTTTTAGAAAAATAATACTGCAACAGT
CTTTCATTAAATTAAACTTATAGCTGTATAGCTTATTATTCCCTGGCTACGAGTAACAAA
TAAACAAAGAACGACTTTCTAACAGGTTTTAAACCTTTAAATATTACTGAACACCTGTTT
GCTTGCACAATTTCTATTAATATTAAAGATCCTAATGCTTAATTTAATTAATAAATGATA
AACTAGGTTAGTTTATTTAATTGTATCACAGAACAAGAATAATTGGAGAGTTAAATGAAA
TAAAATTCTAATGATGAAAACGAAAACTTTCATTTTAAATTTAAATAATTAATGTTTGCA
GTTGATTCATTTTTCAATGAAGCAACAAAGTTTAGCTTTTTGTAATTGAAAACTGCTTTA
GTTATGAGTTATGTACTTGCTAATTCAAATAGGATTCTTCAAAAAAATAGCAGTCTCAAT
AGAGAAGGATCATTTAGTTAATTAAATGTACTTTTTTAATGTGAAAGCCAATTTGTCGAT
AGCATAATAGAAGAAATTTTGATGACATTTGGATATCTTTAAAGTTTCAATGTATTTGAT
TGTCTTCTTTAATTTGATATTGCTTCATCCCTTGTAAAATCGAATAATAGCATTCTTCTG
ATAAAAAATATTCAAGATATTTCGAAGCAACAATAAGAACAACTAAATAAAATACTATAA
AATTAAGAGATTTATTTCGATCAGCTTAAAACAAAATTAAATTTAAATGTTACAATATGG
GCTTTCAATTCCACAAGTAAACAATCAGGTAAAATCAAAAAATTTAAAAGTGATAAAAAT
ATTTCTTAAAGTTTTGAGCAGTATTTTGATGTTTGCCTTTCCCAAGATAAGTCAGTATTG
TCTTTAAAGGATTACCACCTGTTGATCCAAAATGAAGTTGATATGTTTTTAGATAAAGAA
TTACAAATGGGTTAAAAATTTTCAAGAAAAGCCCATCATGAACTCTCCACTGAAAAAAAA
CACATTCACTCAAAAAGCAATAGATTCAATGAGTAAATGTCAACTCTTAAGAAAGAAAAA
AGCAGTTAAAATTAGCATGTTTAGGCGTTAATAGGTGATAACTATAAAAATAATAATGAA
GAAGAAGCGCATTGCTTACTGAACAAGTTTATCAATACTGTTAGAAATAGTATGAGTGCG
AAAGAAATAAATTATTCTACAAGCAATATTAGCAGCTTATCGAAATTCGCAATAGCTAGT
TCTATCTTCAGAAATGTTTTTATTAAAAATAATAGCCAAGAATTAATTTCATGCGAGGAA
AATAGCAGAGTAATTATAGATACCTTTGATGCCTTTTTGTCTATATTCTTTAATATTTTG
TCTAGAAAAATATTTTGTAGAGATTTAGACACAAAGTATTTCCTTTCTTTCATAGTGAAC
TATGGCAGCGGCTACTTAGAGAACTCAGAAATGAGAATTCCTTAAGAAAAAGAATTTTTC
ATCGCCTTGGAGAAGATTTAAGATTAGATTTTAGATTTTATAAGATTTTGA


>TTHERM_001295283(gene)
ATGGAGAAATTTATTAAATTTTTGGAAGAAGACGTAGATTTTAATATAGAAATTCATAAT
AAGATTTAAGATTTAAAAGATTAAAAGTTAATAGATCCTAGCTTTATTGTTTTTAAGTGC
AGTCTCAGATTGGATATTATATAGTTGAATGACTAAGATTTAAACCTTTCCATTTATATT
TAGCAAAATTACCCTAATTTAGATTCGTTAATTAGAGATTATGTATAAAAGATTTTATCT
GAAGATAAATAATTGAGGAATATATAAATAAGACAAGAATAAATACTTCCTGATATCGAG
ATCATCAATGGGAATCTTACTAATAATCTTAATATTTATGCATAGAAAGGTATTCTTCAG
AATTCTTTGTTATAAAATTCTTTTGTTCAAGGACAGCTAGTTCTTATTGAATATTTTTAA
GTATTAAAAATTTTTCCTTTAGAGAATTATTACTCTATTAAGAGATATTCTTATTACTGT
GGTTGCAACAATAATGATTACAAGCTTTAAAATACTAATTTAATTCTTCATATTATTGAA
AACAATTAATCTGCATCCCTAAACAAACAGAGCTCTAATTTAATTAAAAATTTAAGCTGT
GATATATGTCATTAGGAAATGTATGAAGATAAAGAAAAGAGTAAACCTGAATTATGCCAA
AAAGTACTTATATATATTCCAGAGAGATATAATTCAACCAGAAATAGTTTATTAAACGGT
TTTTAAAAAGAAGAGGGAAAACTCATTGAAATGTTTTTAGAAAAATAATACTGCAACAGT
CTTTCATTAAATTAAACTTATAGCTGTATAGCTTATTATTCCCTGGCTACGAGTAACAAA
TAAACAAAGAACGACTTTCTAACAGGTTTTAAACCTTTAAATATTACTGAACACCTGTTT
GCTTGCACAATTTCTATTAATATTAAAGATCCTAATGCTTAATTTAATTAATAAATGATA
AACTAGGTTAGTTTATTTAATTGTATCACAGAACAAGAATAATTGGAGAGTTAAATGAAA
TAAAATTCTAATGATGAAAACGAAAACTTTCATTTTAAATTTAAATAATTAATGTTTGCA
GTTGATTCATTTTTCAATGAAGCAACAAAGTTTAGCTTTTTGTAATTGAAAACTGCTTTA
GTTATGAGTTATGTACTTGCTAATTCAAATAGGATTCTTCAAAAAAATAGCAGTCTCAAT
AGAGAAGGATCATTTAGTTAATTAAATGTACTTTTTTAATGTGAAAGCCAATTTGTCGAT
AGCATAATAGAAGAAATTTTGATGACATTTGGATATCTTTAAAGTTTCAATGTATTTGAT
TGTCTTCTTTAATTTGATATTGCTTCATCCCTTGTAAAATCGAATAATAGCATTCTTCTG
ATAAAAAATATTCAAGATATTTCGAAGCAACAATAAGAACAACTAAATAAAATACTATAA
AATTAAGAGATTTATTTCGATCAGCTTAAAACAAAATTAAATTTAAATGTTACAATATGG
GCTTTCAATTCCACAAGTAAACAATCAGGTAAAATCAAAAAATTTAAAAGTGATAAAAAT
ATTTCTTAAAGTTTTGAGCAGTATTTTGATGTTTGCCTTTCCCAAGATAAGTCAGTATTG
TCTTTAAAGGATTACCACCTGTTGATCCAAAATGAAGTTGATATGTTTTTAGATAAAGAA
TTACAAATGGGTTAAAAATTTTCAAGAAAAGCCCATCATGAACTCTCCACTGAAAAAAAA
CACATTCACTCAAAAAGCAATAGATTCAATGAGTAAATGTCAACTCTTAAGAAAGAAAAA
AGCAGTTAAAATTAGCATGTTTAGGCGTTAATAGGTGATAACTATAAAAATAATAATGAA
GAAGAAGCGCATTGCTTACTGAACAAGTTTATCAATACTGTTAGAAATAGTATGAGTGCG
AAAGAAATAAATTATTCTACAAGCAATATTAGCAGCTTATCGAAATTCGCAATAGCTAGT
TCTATCTTCAGAAATGTTTTTATTAAAAATAATAGCCAAGAATTAATTTCATGCGAGGAA
AATAGCAGAGTAATTATAGATACCTTTGATGCCTTTTTGTCTATATTCTTTAATATTTTG
TCTAGAAAAATATTTTGTAGAGATTTAGACACAAAGTATTTCCTTTCTTTCATAGTGAAC
TATGGCAGCGGCTACTTAGAGAACTCAGAAATGGTAAATTAAACAATATTAAAAATAAAA
TTGTAAGCTTTTATTATTAAAAATGAATGTAGAGAATTCCTTAAGAAAAAGAATTTTTCA
TCGCCTTGGAGAAGATTTAAGATTAGATTTTAGATTTTATAAGATTTTGA


>TTHERM_001295283(protein)
MEKFIKFLEEDVDFNIEIHNKIQDLKDQKLIDPSFIVFKCSLRLDIIQLNDQDLNLSIYI
QQNYPNLDSLIRDYVQKILSEDKQLRNIQIRQEQILPDIEIINGNLTNNLNIYAQKGILQ
NSLLQNSFVQGQLVLIEYFQVLKIFPLENYYSIKRYSYYCGCNNNDYKLQNTNLILHIIE
NNQSASLNKQSSNLIKNLSCDICHQEMYEDKEKSKPELCQKVLIYIPERYNSTRNSLLNG
FQKEEGKLIEMFLEKQYCNSLSLNQTYSCIAYYSLATSNKQTKNDFLTGFKPLNITEHLF
ACTISINIKDPNAQFNQQMINQVSLFNCITEQEQLESQMKQNSNDENENFHFKFKQLMFA
VDSFFNEATKFSFLQLKTALVMSYVLANSNRILQKNSSLNREGSFSQLNVLFQCESQFVD
SIIEEILMTFGYLQSFNVFDCLLQFDIASSLVKSNNSILLIKNIQDISKQQQEQLNKILQ
NQEIYFDQLKTKLNLNVTIWAFNSTSKQSGKIKKFKSDKNISQSFEQYFDVCLSQDKSVL
SLKDYHLLIQNEVDMFLDKELQMGQKFSRKAHHELSTEKKHIHSKSNRFNEQMSTLKKEK
SSQNQHVQALIGDNYKNNNEEEAHCLLNKFINTVRNSMSAKEINYSTSNISSLSKFAIAS
SIFRNVFIKNNSQELISCEENSRVIIDTFDAFLSIFFNILSRKIFCRDLDTKYFLSFIVN
YGSGYLENSEMRIPQEKEFFIALEKIQDQILDFIRF