Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00137850

Standard Name

ABC2 (ABC transporter protein 2)

Aliases

PreTt24411 | 10.m00460 | 3698.m00178

Description

ABC2 ABC transporter C family protein

Genome Browser (Macronucleus)



Genome Browser (Micronucleus)

External Links

Gene Ontology Annotations

Cellular Component

Molecular Function

Biological Process

Domains

  • ( PF00005 ) ABC transporter, ATP-binding protein
  • ( PF00664 ) ABC transporter transmembrane region
  • ( PF01741 ) Large-conductance mechanosensitive channel, MscL
  • ( PF02463 ) RecF/RecN/SMC N terminal domain
  • ( PF03002 ) Somatostatin/Cortistatin family
  • ( PF05115 ) Cytochrome B6-F complex subunit VI
  • ( PF07650 ) KH domain
  • ( TIGR00739 ) preprotein translocase, YajC subunit
  • ( TIGR00954 ) Peroxysomal long chain fatty acyl
  • ( TIGR00955 ) pigment precursor permease
  • ( TIGR00957 ) multi drug resistance-associated protein (MRP)
  • ( TIGR00958 ) antigen peptide transporter 2
  • ( TIGR00960 ) Type II (General) Secretory Pathway
  • ( TIGR00968 ) sulfate ABC transporter, ATP-binding protein
  • ( TIGR00972 ) phosphate ABC transporter, ATP-binding protein
  • ( TIGR01166 ) cobalt ABC transporter, ATP-binding protein
  • ( TIGR01184 ) nitrate ABC transporter, ATP-binding proteins
  • ( TIGR01186 ) glycine betaine/L-proline transport ATP binding
  • ( TIGR01187 ) polyamine ABC transporter, ATP-binding protein
  • ( TIGR01188 ) daunorubicin resistance ABC transporter, ATP-binding
  • ( TIGR01189 ) heme ABC exporter, ATP-binding protein
  • ( TIGR01192 ) glucan exporter ATP-binding protein
  • ( TIGR01193 ) ABC-type bacteriocin transporter
  • ( TIGR01194 ) cyclic peptide transporter
  • ( TIGR01271 ) cystic fibrosis transmembrane conductor regulator
  • ( TIGR01277 ) thiamine ABC transporter, ATP-binding protein
  • ( TIGR01288 ) nodulation ABC transporter NodI
  • ( TIGR01842 ) type I secretion system ATPase
  • ( TIGR01846 ) type I secretion system ATPase
  • ( TIGR01978 ) FeS assembly ATPase SufC
  • ( TIGR02142 ) molybdate ABC transporter, ATP-binding protein
  • ( TIGR02203 ) lipid A export permease/ATP-binding protein
  • ( TIGR02204 ) ABC transporter, permease/ATP-binding protein
  • ( TIGR02211 ) lipoprotein releasing system, ATP-binding protein
  • ( TIGR02314 ) D-methionine ABC transporter, ATP-binding protein
  • ( TIGR02315 ) phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein
  • ( TIGR02323 ) phosphonate C-P lyase system protein
  • ( TIGR02673 ) cell division ATP-binding protein FtsE
  • ( TIGR02769 ) nickel import ATP-binding protein NikE
  • ( TIGR02770 ) nickel import ATP-binding protein NikD
  • ( TIGR02857 ) thiol reductant ABC exporter, CydD
  • ( TIGR02868 ) thiol reductant ABC exporter, CydC
  • ( TIGR02982 ) ABC exporter ATP-binding subunit, DevA
  • ( TIGR03005 ) ectoine/hydroxyectoine ABC transporter, ATP-binding protein
  • ( TIGR03258 ) 2-aminoethylphosphonate ABC transport system, ATP-binding
  • ( TIGR03269 ) methyl coenzyme M reductase system,
  • ( TIGR03375 ) type I secretion system ATPase
  • ( TIGR03410 ) urea ABC transporter, ATP-binding protein
  • ( TIGR03411 ) urea ABC transporter, ATP-binding protein

Gene Expression Profile

Vegetative Cell Cycle (Zhang et al., 2023)

GeneMania

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for Tetrahymena Stock Center

Homologs

Source Identifier Score
WormBase WBGene00003408 9.997093137033517e-262
Description: locus:mrp-2 status:Confirmed UniProt:Q20943 protein_id:CCD69448.1
Tetrahymena borealis EI9_05850.1 9.997093137033517e-262
Description: ABC transporter (1245 aa)
DictyBase DDB_G0287691 9.997093137033517e-262
Description: abcC3 on chromosome: 5 position 792495 to 797051
SGD YGR281W 1.9999565133760522e-166
Description: YOR1 Plasma membrane ATP-binding cassette (ABC) transporter, multidrug transporter mediates export of many different organic anions including oligomycin; similar to human cystic fibrosis transmembrane receptor (CFTR)
Oxytricha Contig841.0.g97 1.999765224767555e-159
Description: ABC transporter transmembrane region
Stentor Coeruleus SteCoe_30112 1.1983630608508849e-70
Description: None

General Information

No. Gene Name(s) Paragraph Text
28 ABC2 ABC2 shares homology with members of the ABC family transporter proteins. This protein appears to have two types of domains. It is thought that the two domains function together to bind ATP to transport substances such as glutathione, glucuronate, and sulfate across the membrane. Using energy from ATP hydrolysis, both domains of ABC transporters facilitate the transport of a wide variety of materials out of the cell. Paragraph by undergraduates from the Keck Science Department at Claremont McKenna and Scripps Colleges

Associated Literature

No Data fetched for Associated Literature

Sequences

>TTHERM_00137850(coding)
ATGGTTAGCGCAAAGGTGAAAATCAGTGAAGAACCTCCTTAAAAATAAACATAAAATGAT
TATAATTTAAATTTAGAAAACAGAGCTTCATTCATTAGTAAAGCTCTGTTTTTGTGGACC
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GGTGGTGACTTAACTGAGATTGGTGAAAGAGGTGTAAATCTAAGTGGAGGATAAAAACAA
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GCTAAAAATTCTGAAGCTTTATCTTACTTGCTTAATAATGAAAAGAGTTAAGTATAAAAG
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GAATAGCCCAATTAAGGACAAGATAAAGAGAATGAAGCAAAAGGTATGCTTGTTTAAAGT
GAAGAAAAAGCTGTAGGATCCGTTCCTTTTTTCGTTTACAAAGAATATTTCTTACTCGGA
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TTGTCAGATTGGTGGTTAGGCTAATGGAGTTAAAATGCTTATACAGAATTAGATAATAAC
TAATATGCAGGAATTTATGCAGGAGTGAGCATAACAAGTGGTTTACTTTACATTTTCAGA
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GTTAGACTGCTTTAAAGCCCAATGGAATTCTTTGATAAAACTCCACTAGGACGTATTGTG
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ATATTCATTGCTGTAGCAGTTTTTATTTTAATTTGCTATTACTTTATTCTCAGGAGATAA
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GTTTACACAGAGCTAAATCAAGGCTTACTACAGATTAGGGGACTTAACAAAGAAAAATTT
TTTTTCAAAACATTTAGCAAATGTGTAGATGGACACACTAGATCCACTTTTAATGAATTT
TTCTGTAATCATTGGCTTAATCTTATTACTGATCTATTCTCTTCGATCATAGTCGCTGCT
TCTGCCTATTTAGGTTTAGCTTAAAAAGAAATTAATGGTTATGATATATAATTAGCTGCT
CATATTGGTTTGAGTTTAACATGGGCTTTAAGAATAAGTTCTTCTCTACCTGTAACAATA
AGGTTTGTCGGTGATACTGAGTTGTAAATGAACTCGTTCCATAGAATTTTAAACTATATC
AATGAAACACCATAAGAAAGAGATTTTGAAATTTTAAGTGAGACTAATTAAGCTAAAACT
CTAGAAAAATGGCCTTAATAAGGAGATCTAGAACTAGAAAATGTTTCTTACAGATACAGA
AAAGAAACACCGATAGTGTTAAAAAATATAACTCTTTCCATCAAAGCTAACGAAAAGATT
GGTGTTATTGGCAGAACCGGAAGTGGCAAATCAACATTAACCTTAGGATTACTTCGTATT
CTTGAATTAGTAGATGAAGAAAACAGTAAAATTCTATTGAATGGGTAAAATATTGCAAAA
ATAGGATTAAACTAATTAAGAAGTAATGTATCCATGATTCCTTAAGATCCTGTGCTATTT
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GATGCTCTCAAAAAAGTCCAACTATGGGAAACATTACTAAGCAAGGCCAATCCAACTGAA
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AAAGTAGATTCTCAAGGTGCAAATTTTTCTCAAGGAGAGAAGTAGTTGATAGCTCTTTCT
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GAAAAAACTGATTGGATAATTCAAAATATGATAAGAAGCGAATTCTAAGAGACTACAATT
ATAACCATAGCACATCGTCTCAAAACAATTATTTAATATGATAGGATTTTAGTTTTAAGT
GATGGTGAAATTAAAGAATTTGATTCTCCAAAATCGATGCTTAACAACCCAAACAGCTAT
CTATTAAAGTTGATTAGAGAAAATGGTAAAGAACATGAAGCAGATATGAGAAGACTAGCA
TATAGCAATTGA


>TTHERM_00137850(gene)
ATGGTTAGCGCAAAGGTGAAAATCAGTGAAGAACCTCCTTAAAAATAAACATAAAATGAT
TATAATTTAAATTTAGAAAACAGAGCTTCATTCATTAGTAAAGCTCTGTTTTTGTGGACC
AATAAAGTTATAAAATTGGGAAACTCTAAAATAATTAAAGGTAAAAAAAATCTTAGAGTT
TTTATTCCAAAAATAATATAAATAAATAAATATAAATAGAAAATGATTTATTTGATTTGA
GAGAAGAAGAAAGATTAGAAAAGGTTCTCTATGAACTGAAAAAAGCCTAATAAATTAACA
AAAATGTATGTATTTATTGCATAAATTAGCTATTTGAGTTAATTTAACCCTTTTTTATTA
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ATTATTCACAATTCTTGTTTCTGGGCTTTCTGTAAGTTAAATTGATACATAAAAAATAAT
CTTATGAAATTTAATAATTAATAGTTTGCAGGCCCCATATTTTTAAACTTGATTATTAAA
AATATTGCAGATCCGTTTTCTAATAAAAATGAAGGATATCTTTACTCAAGTCTCCTTTTT
GGGTGCTTTATATTAAAAGCCTTTTTGACACAACATTTAACGCTCTTAACTAATAGAATA
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TTTTTTTTAAAGTTTTTAATAGTTTCTTTTTATTAACTTTGTATGATTGATTCTACTTTA
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ACGAAAAATTACTCAAATTGAGTAACACAGGAAGAAAATATATGGATCCTGGTAAAATGA
CGAATCTTGTTATCATGAATACAATGGAAATATTGCAATTTTTTTTATTCGCGTTTACAG
CTTTGACTGCACCTTTTATTATTATTGCAGCTTCTGTTTACATCATTTATGAACTTGACT
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AAAGTAGGCTGATTTTAGAATGAAAGTGTTCTCTATCATAGATCAAAGAAGTAAGAAAAT
TACTGAGTTTTTTTAAGGTATGTTTATAATTTTGTAATAAATCTTTATTTGCAATTATTC
TTATGAATAACATAGGTATTAAAATTATCAAATATTATGCCTGGGAAAAATGGGTTGTGA
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TTGGATAAGTTGATTGTATTAGTTAAGTTTCTCCCAGTATTATAGCTGTGCTCGTTTTTG
TTATTTATATTCTTTTAGATAATTAACTAAATGCAGCCAAGGCTTTCACAGCTCTTTCCC
TTATAAATCTGCTTTAATCACCTATTATTCAACTTGTCTCTGGATGGGGTAAATTTATCT
AAGCTAGGGTTTCTTATAATCGTATAGCTCACTTTTTAGACTCAGAAGAATAACCTCAAG
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ATTATATGAAGAAAATGTAAATCAAATTTATTTAAAAAGAAATTTAGTCTAAGAAAAAAG
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CTGAAGTGCCAAAAATTTCACCCAACTTAACATCAATAAATTTACATTATAAGCCTAACA
CTTTTAATGCTATTTATGGAATATTTTCTAGCGGAAAGACTACCCTTGCTCATGCTATCA
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ATTTAAAAGCCTTGGCTCAGATCATGCAGCTTGAGAGATAACATTTTATTTGGAGAGGAA
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TAATTACCAGGTGGTGACTTAACTGAGATTGGTGAAAGAGGTGTAAATCTAAGTGGAGGA
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GACGACTGTCTTAGTGCTCTTGATAGTCATGTTGGTAGATTAATTTTTAAGAAGGTGTTT
TACAAATTCTTAAAGCAAAAAACAATTATTTTTATTACTCATCATACCCATTACATGAAG
TATTTTGATACAATTACTATCCTAAAAGAAGGAAAAGTAGCAGATTTTGGTTCTTACTCA
CAATTAACTGCTAAAAATTCTGAAGCTTTATCTTACTTGCTTAATAATGAAAAGAGTTAA
GTATAAAAGGCAAAAGAAGGAGATGAGCTTGATGATCAAGAAGGATAAAATAATGAAATA
AATGACGAATTGAGCTAAAATAATAAAATACCTCACAACCCTCCTCAATTAGGAAAAGCT
TTTAGTGAGTAACAATCACAGTTTTCAAAAATGTCAGAAGAAGCCTCTCAATTCACATAA
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GTTTAAAGTGAAGAAAAAGCTGTAGGATCCGTTCCTTTTTTCGTTTACAAAGAATATTTC
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GGATTAATGTAAATTACATTTTTATTTTAAGTTTCTCATTTTTTATTATGATGAACCAGG
TTGTCAGATTGGTGGTTAGGCTAATGGAGTTAAAATGCTTATACAGAATTAGATAATAAC
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TTATTTTTATTATTTAGGAGTGAGCATAACAAGTGGTTTACTTTACATTTTCAGATATTT
GGCTTTCTTAGTCTTTTCTATTAGAATATCAAAGAGTATATTTAGAAACCTTTTAGTTAG
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CTTCTATAATAACTAATTAGTGGTGTAATGACTCTTATTGGTAGTTTTGTTATGATTTCA
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CCTTTAATCGGTGTTTACACAGAGCTAAATCAAGGTAAGTTCTATTTAATTTATTAATAT
TTTAAAAACAACTTCTTAACAAATCAAATTTATTTTAATTTTTTATATAAAGGCTTACTA
CAGATTAGGGGACTTAACAAAGAAAAATTTTTTTTCAAAACATTTAGCAAATGTGTAGAT
GGACACACTAGATCCACTTTTAATGAATTTTTCTGTAATCATTGGCTTAATCTTATTACT
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AGGATTACTTCGTATTCTTGAATTAGTAGATGAAGTAAATAAAACTTATAGCATAATTTT
TTGGAATTTTTCTTATTTTTTACTGAAAAATAAAAAAAATAGGAAAACAGTAAAATTCTA
TTGAATGGGTAAAATATTGCAAAAATAGGATTAAACTAATTAAGAAGTAATGTATCCATG
ATTCCTTAAGATCCTGTGCTATTTTAGGGAACAATCAGGTCTAATGTAGACCCTTTTGAA
ATTTATACAGATACTCAGGTAGTTGATGCTCTCAAAAAAGTCCAACTATGGGAAACATTA
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ATAACAGCTGAAAATATTCAAACTTAGACATTAATGAATGGAAGTGAATTAAATGAAAAG
AGTATTAAAAGTATTTACTATTTATTTAATCACTTAATTATTCATTAAGCTTAATTTAAA
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AGAAGTAGTTGATAGCTCTTTCTCGTGTTATTGTGGTAAACTAAAGAAATTCAAAACAAA
TTTTAAAAATACTTATCTAAAAAATAGAGAAAATGTAAGTTATTGCTTATGGATGAAGCT
ACTGCTAGTATTGATGAAAAAACTGATTGGATAATTCAAAATATGATAAGAAGCGAATTC
TAAGAGACTACAATTATAACCATAGCACATCGTCTCAAAACAATTATTTAATATGATAGG
ATTTTAGTTTTAAGTGATGGTGAAATTAAAGAATTTGATTCTCCAAAATCGATGCTTAAC
AACCCAAACAGTAAATAAAGATATCTATTGAAAAGTATAATTAAATAATTTTTTTAAAAA
TAGGCTATCTATTAAAGTTGATTAGAGAAAATGGTAAAGAACATGAAGCAGATATGAGAA
GACTAGCATATAGCAATTGA


>TTHERM_00137850(protein)
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LSQNNKIPHNPPQLGKAFSEQQSQFSKMSEEASQFTQSQCEQPNQGQDKENEAKGMLVQS
EEKAVGSVPFFVYKEYFLLGGLGYVTIALLIFAISQAGLMLSDWWLGQWSQNAYTELDNN
QYAGIYAGVSITSGLLYIFRYLAFLVFSIRISKSIFRNLLVRLLQSPMEFFDKTPLGRIV
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FCNHWLNLITDLFSSIIVAASAYLGLAQKEINGYDIQLAAHIGLSLTWALRISSSLPVTI
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NKDNSPTQNPKIITAENIQTQTLMNGSELNEKSIKNVLDLKVDSQGANFSQGEKQLIALS
RVIVRKCKLLLMDEATASIDEKTDWIIQNMIRSEFQETTIITIAHRLKTIIQYDRILVLS
DGEIKEFDSPKSMLNNPNSYLLKLIRENGKEHEADMRRLAYSN