Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00138430

Standard Name

SFB2 (transport protein SFB2)

Aliases

PreTt24470 | 10.m00519 | 3698.m00236

Description

SFB2 Sec23/Sec24 trunk domain protein; Sec23/Sec24 trunk domain containing protein

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External Links

• Uniprot
• Alphafold

Gene Ontology Annotations

Cellular Component

• COPII vesicle coat (IEA) | GO:0030127

Molecular Function

• protein binding (IEA) | GO:0005515
• zinc ion binding (IEA) | GO:0008270

Biological Process

• endoplasmic reticulum to Golgi vesicle-mediated transport (IEA) | GO:0006888
• intracellular protein transport (IEA) | GO:0006886

Domains

• ( PF04810 ) Sec23/Sec24 zinc finger
• ( PF04811 ) Sec23/Sec24 trunk domain
• ( PF04815 ) Sec23/Sec24 helical domain
• ( PF08033 ) Sec23/Sec24 beta-sandwich domain
• ( PF08181 ) DegQ (SacQ) family

Gene Expression Profile

Vegetative Cell Cycle (Zhang et al., 2023)

GeneMania

No results were calculated for this gene in GeneMania.

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for Tetrahymena Stock Center

Homologs

Source	Identifier	Score
Tetrahymena borealis	EI9_05904.1	9.997093137033517e-262
	Description: Sec23/Sec24 trunk domain-containing protein (831 aa)
WormBase	WBGene00009477	9.997093137033517e-262
	Description: locus:rbpl-1 status:Confirmed UniProt:O62235 protein_id:CAB04326.3
Oxytricha	Contig903.1.g86	3.0008389609965914e-128
	Description: Sec23/Sec24 trunk domain
DictyBase	DDB_G0281255	2.0006821221283624e-88
	Description: sec24 on chromosome: 3 position 4298212 to 4301618
WormBase	WBGene00004756	3.000298514542485e-73
	Description: locus:sec-24.2 status:Partially_confirmed UniProt:Q23368 protein_id:CAA92988.3
WormBase	WBGene00003401	3.000298514542485e-73
	Description: locus:mpk-1 Mitogen-activated protein kinase mpk-1 status:Confirmed UniProt:P39745 protein_id:CAA87057.1
SGD	YIL109C	1.0002758036576784e-62
	Description: SEC24 Component of the Sec23p-Sec24p heterodimer of the COPII vesicle coat, required for cargo selection during vesicle formation in ER to Golgi transport; homologous to Sfb2p and Sfb3p
Stentor Coeruleus	SteCoe_22962	5.74952226429356e-19
	Description: None

General Information

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Associated Literature

No Data fetched for Associated Literature

Sequences

>TTHERM_00138430(coding)
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>TTHERM_00138430(gene)
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AACTGCCTACCTTGCAAGAAATGCAATAAGCAAAATATATCTTTAACCAATATCAAATTT
AAAAGCAGAACTAATTGGAATTACTAAAAGAATTTGTTCGAGTGCTATAAGCGTTAATTA
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AACTACCTGATAACTTAGCCTAACTTCCTCTTAATGTATTGGGAATTATGAAGCATGCAA
TATTCACAAGCAACTATTGTAAAAAATTTTATTAATAAATAATATCTAAAAATATAAACA
TAAAAAAGAAAATACACCATTTACTGACTTCATAAACGTTTAAAGACTTTAATTTAATTC
TATGCCTGTTGATGAATTGCTTGTTCATTTTGTGCCCTACTTATTCTGTATCGATGATAT
GAAAGATGAAAATGTGTCATACATTGATGATTAAGGGTTATTTGTATATCCATAATCATC
CTTAACAGCATTCAGCTCATTAGGAAAAACAATTTATCTAATGGATTTAGGACAATAGCT
TATATTATATATTAATACAAAGTATTTTATTTATTTTTTAAATAATTAATCTAAATCATA
ATTTAATCAACCTAACTAACAGCGGTACTGATTGGAATTACATTACAGACGTAATTGGAT
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TCTAAATATAGTTATAGCTGGTACTGGTTCACCTTTAGAAAATTTGTAATTTTTAAAAAT
AATAAATATAAATAAATAAATAAATATAATATTAAATATTTTCAAAGGTTCTATTACAAA
CTGGTTGAAGATAAATACGTTAATTACTCTATGGGCTATAATGCTAGTTATGAAGAGTTT
ATTAAATTTTTGATGTGA

>TTHERM_00138430(protein)
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