Identifiers and Description
Gene Model Identifier
TTHERM_00142380Standard Name
BroW-1 (Bromodomain and WD40 1)Aliases
PreTt26644 | 11.m00341 | 3702.m00065Description
bromodomain proteinGenome Browser (Macronucleus)
Genome Browser (Micronucleus)
External Links
Gene Ontology Annotations
No Data fetched for Gene Ontology Annotations
Domains
Gene Expression Profile
Vegetative Cell Cycle (Zhang et al., 2023)
GeneMania
Tetrahymena Stock Center
No Data fetched for Tetrahymena Stock Center
Homologs
Source Identifier Score Tetrahymena borealis EI9_04836.1 9.997093137033517e-262 Description: bromodomain containing protein (2072 aa) Oxytricha Contig9009.0.1.g105 4.001416569413617e-37 Description: WD domain, G-beta repeat SGD YMR146C 0.000000000007996637300921877 Description: TIF34 eIF3i subunit of the core complex of translation initiation factor 3 (eIF3), which is essential for translation; stimulates rate of ribosomal scanning during translation reinitiation WormBase WBGene00001680 0.00000019998969434520019 Description: locus:gpb-2 Guanine nucleotide-binding protein subunit beta-2 status:Confirmed UniProt:Q20636 protein_id:CAA95824.1
General Information
No Data fetched for General Information
Associated Literature
- Ref:29523178: Saettone A, Garg J, Lambert JP, Nabeel-Shah S, Ponce M, Burtch A, Thuppu Mudalige C, Gingras AC, Pearlman RE, Fillingham J (2018) The bromodomain-containing protein Ibd1 links multiple chromatin-related protein complexes to highly expressed genes in Tetrahymena thermophila. Epigenetics & chromatin 11(1):10
- Ref:27892853: Hamilton EP, Kapusta A, Huvos PE, Bidwell SL, Zafar N, Tang H, Hadjithomas M, Krishnakumar V, Badger JH, Caler EV, Russ C, Zeng Q, Fan L, Levin JZ, Shea T, Young SK, Hegarty R, Daza R, Gujja S, Wortman JR, Birren BW, Nusbaum C, Thomas J, Carey CM, Pritham EJ, Feschotte C, Noto T, Mochizuki K, Papazyan R, Taverna SD, Dear PH, Cassidy-Hanley DM, Xiong J, Miao W, Orias E, Coyne RS (2016) Structure of the germline genome of Tetrahymena thermophila and relationship to the massivel
Sequences
>TTHERM_00142380(coding)
ATGTAGGAAGAAGAAATTATTATGACAAAACACGTAAGCTCAAAAGGCAGAGTGTTTTTT
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TTATTGGGCTAGCTACTGGCATTTGATGGAAGCCACGTAGATGCAACATTTGATGAGTTA
AATTTCTAATAAAAAGGAAGTAGTTGTCATTCTGCACTCTTTTCAAAGGATGAAAATCTT
AATACAATCTTATCTATTTATTAGCGCTTTAGTGCATAGCGCGTAAAAAACTAAAATAAA
GGTATACAGAATTTGTTTATTTAAAAGATGACCAAGCTTTCTTAAATGCTCAATGAGCCT
GCAATGTATATTTAACCAGCTAGAGACTTGTTTATTAAGAAAAAGAGATAAGGTAAGAGC
CTTAAAAATACTGATGAGTTATCCAACGATACATTTATCTTGAGGTTTTAGCATTTAAAA
ACATGTTTTGGTCATGCATATTCTGCTGACTCAGGCTCTATAAATGAGGAGAGTGGTGAA
CCTTACATTCCAATATACAATACAACATTCGATAAGAGCGGACGCCTAGTTATAACTGCA
GACGAAGAAGGATTAATTAAGATTTGGAGTGCTGAGAACGGATTACTTTTGTCAAATTTA
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ACTGAATAACTCTACCTATTGATGATGAGCAATGTTGGAAATATTCTTATATACAAAGAA
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GCAATGAGAAAGCACAAAAAAATGCAAGAATCTAAGATAGTTGATAACGATAATAAGAAT
GAAGCTGTTTGCATAGAGACTCACCCATCTGGTTACTTAGTTGTCGGCACTGAAACAGGA
GAAATTTTAGTTTGGGAAAAGATACACACCCTCGAAAATAGAAATCGCTAAGTTCTTCCA
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GAGTTCATGATCACTGCTTCTTTCGATGGATATGCAAAAATATGGCCTTGGAAAAAGCTG
ATAGAAAACGATAAAAGACTCAGTGATTAAATCTTCTCAATTTATTTTGACAACTCCAAC
AAGTGCGAAAAAAACTGCTGGAATGTAGCATTCAGTTGCAAGAATAGATATGCATTCGCT
ACCTTTACCAGAAAAATGAAGAGGACAAAAGAAGTAGAAACAGTTGTTTATGTACATGAA
CTAGCTGAAAAGAAAATCAAGCATGAGTTTACTCAACAAAATACACCCGCAAGACTTTAA
GATCATATTTTAGTTTTTGAACCCCATCCAACATAAGAAAATATCCTCTTAACAGCAGAT
TACGCAGGTCAAATTATCATCTATGATGTCTCTTTAGGATGTATTTTGAATATATTCTAA
GAAAGGGGATACCATATTGGATATCCTAATCTTGAAGTACCCGTTTTAGATGGTTGTTGG
GCACCAGATGGATTAAAATTCGTCGCAAGTACTTACTATGGCTCTTTTAGCTTGTATGGA
TATGATTGCGCAGAAATATATAAGACTACTCCTACAGAATAATTCTTTGCTAATGACACA
GAGATATTTATATATAGTGATAATCATGTACCACTGTCTACAGATGATGATGTAGAAATT
AATACTAAAAGTAGAGGAAAAATTTGTGATTATTAGAGAATCCCATATAGATTTGAATAT
AATAATGATCTCAAAAAATTAAAAGATAGAGGCTATTTTGAAGAAACATCAGAAATGGCT
TTAAAGTTGATAGAAGATAAAATATCTGAATTAAAAATATTAGAAAATGAATAAAAAGAA
AAAGATGAAAACTTTTCAGAAAATTTAGTTGAAAAATATTTAAAAAACTAAGAAAAAGAG
AAACATGCTTATTTTGCTTTATGTAATTAATTGAGAGACTCCTATAACAATGCAAATGCA
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GAAGATTTGTTTTAATAAGTTATTTAGCAATCGCAACCTAGAATTCTACAAGAAAGATAA
ATTTCTGATCCTGCTCCTGCTCCTCTTCTTAGATAAGAAAGTGAATAGGCTACTCTTATA
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TCAAATACAATACCATTTGGGAATTAATAACTAAGTAGAAGGCCTAGCTAAATGCCTTAA
CCAGCTGCTTTAAATAATTAAAATTCAAGAACTGGATAGCGCGGAAGAGGAAGAAGACCA
GGTGGTAGATAGAGTAATACTAATTAGGTTGGATTCAATGATGACTTTGAAGACTCTATG
CAATCTGAGGAAGAGATACCGAGTTAAGATGATAGTGAGGTAAATTTCAAAGACATAAAT
GAAGATGATGATGAAATTTAAAAAGATTTACTTGAAGAAATGGAGATGTTTGATGATCCT
TTGCCTAGAAGAACTGGGGGAGGGTTCGAAAGTAATGACAGAAGAAACTAATCTAATAAT
AGAAATAGATCAAGAGGAGGAAGGAGAATCGTGGCTGATGACTATTTAGATGAAGAGGAA
GAAGAGAAAAAGGATTCTTCAAATTAGAGAAGAACACGCTTGAAAAGATTTTCTAATACG
ACTTCAAATGAAACAAGAGCACAAACCATAAGCCAGTAATAAACAGAAGGATAGCAGCGC
TAAGGTACATTAAGATATAATAGGAATACGAGAAGTAGTTATAGTATGTAGTATACTACT
GGAGAAGATGCTACTCTCTAATCTAATGCAGGATATAATAGCAGCTAAGATTATGAAGGT
AACACAAACACAAGATTGAGAAGGAGAAATCAACACATCATCGAAGAGGACAATGATGAT
TTATACTTAGACAATAATACTAATAGCAATAACCATCATTCTTTGAGATAGAATAACTCT
TCTCATTTATAATAATCTCATAATTTGGCTGAAACAAGAGCTAATGCACATCAAACTAGA
AGCTCAACTGCGACATATTAAGATTCACAAAATAATACAAAGACTCTCAGAGCTTCATCA
AGAAATAAAAAGAGCAAGAAAAATAGATAATATAATGACGGCTTTAACAGCAACGATAGT
GAGTCTGAAGATAGGTTTTCAGATGAAATCATGGAAGAAGATGACGATGAAGTTGATATT
AATTATGAGGACGAGGATGATTATGAATATAAGTTGAGGAAACCAAAAAAATCAGTAGGC
GGTGCTTAATCTTTATCATAAAATAACTAAAATTCAAGATAGAGTGGTCGTTCGCTTCGT
ACTTCATACACAAACAGAAAAAAAATTTAAGATTCTGATGAAGAAGAAGATGAATTACCA
AAGTAAAAAAACAGAAGCAGTAAAAAGAATGGTATTGTTAATGACGAGGATGATAACCAA
GTTTAAAATGAGCATAAAAACATAGAGAAGCATAAAATCTATGATAATGATGAAGATGAA
GAAATAGATGACTTTGATGAAGAGGACGAAGAATACACTGACAAGAAGAAGAAAAATTAC
TTGAAAAAAAGAACTTCATCAGAAGCTGGTATTAAGAAAAGTGGTTAAAGTAGTAATAAA
TTAGTTAAAAAAATAAAAACTAACGACTCTGATGCGCTTAATGAAGATATGGCATCAATG
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GATCCTTACCAATATATTCCATAAATAAATGACATGTGTTATTACATCTTCTAGGCTCAT
GAAGAGTACTGTGAAAAATATTTCGAAATCTTTGATTACGAACCATTGATTGACAGACTA
TAAAAAGAAAATGAAAAATCTCTTTAAAATGGAAATAATAAGTCTACAAAAAAAAGTATC
CAAAGGTCCTCTAAATTGATAGACAGTGGTGATGAATTTCAAGGAGATGAGCATTCTTCT
AACTTTTAAAAGAAAGGTTAGACATCTTAAGCTTAAGATTATCATATTCTACCATTTTTA
AGTTACAAAGAGCTCTATAAGCCAACCTTATGTCAAATAAGCTCTATCGAATACTCCTAT
CCTATGTTAAGCACAAAAAAGATGCAAGAAAAATATAGAGAAAGACCTATATTCTTACTT
ATTCAGCTCAAAATTTTAGAAACAGGAGAAGAATTCTCAGTTTATTTTTCAAATTCTTAA
GTTTAATGTGGAAGTTTCTTGATTCCTTAGGAATTATATGATTAGTCAATTTGCTTCTAA
GAAAACCTTAAGGTACCTCAGTAATTAGAATTCTTTTACCATAATTAAGTATTCAGCGGT
TAAGTGGTTGAAGTGTCACCAAAAGAAGAATATTAAAAGTTGAATTCTGAGTACTTGAAG
CTTAAAGTCAAATTAGATACAACAGATGAAAAAATTATACAAAAGTTAAAATAAAATTTA
GAAGGGCCTAATATGATTAGAATCTCTTGCTGGGATGTCATATATCCAATCAGAAGAACA
TCCTCTCCTGATGACTATCCAAACGATGACGCATGTCTTTCTAAGGAAGAAACAGAATAA
ATTTTTAAGCTAATTTAAGCAGTAATTGATAATCAAAGTGAAATAACTTGCTATTTTGAA
GAAGCTGTCAACTTAAAGAAATATAAACATTATTATGAATTTGTTGAATTCCCAATGGAT
ATTTCAAAAATTAGAAGAAGACTATTAAACGGATACTATCGTTCTCAACAAAGCATATTT
CATGATATAAACTTGATAGATTCGAATGCTCATAAATTTAATAATCCTGATAGTCCTATC
TGTGAGAGTTCGAAGAGAGTTAAAGAAATATTAACTTCGATTGTAAGCAATTTCCTAAAC
GTAGAAATGTGTTTATCTCTAGCAATAAAAAATAAAAAAAATCTAATAAAAACTATTTAA
ACTCTGTTCCCCAACTACAATACTAACTCCAACTAAAACAATTTATCAATAAATAATAAT
AACATTTAAATAAAGATTCCTTAATAATCTTAATAAAGTTTAATACCTGTACCAATAGAA
AAACCTCACGCTCTAATTAACAATCCTCTACTTTAGGCAGAACAATATTAATAAAAATAT
CCTAACTCTCAAGTAGCATATAATGCAATCCAACAATAAAAACCTCAACAAAATTATAAT
TAAATTAACAATAATTTTAATCAATAAAATTAATAATACCAGTATAATAATTCCGCATAT
CAAAATAACTCTAACAGTAATGATACTTATTTTAACCAACAAAATGCTAATTAAAATGGT
TAACCTTATGCAGTTACTGGTTTAATAAACGAACCTAGCAACTAATACTTTAATAATCAA
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AACTAAAATGTGAATTAAGATTACTAATTAAACGAATTCTAATCTTAAAATTTAGGATAG
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AATTGA>TTHERM_00142380(gene)
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AAACATCATTTTTATTTTAATCTTTCCCTATTTTTTCAATATTTTTCCAGTGATTTTTCC
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AATTTAGAATTTAGTTTGTTTAATTCTACTTTTTGATTAGCACTTCTATGCCAGCTTCAG
AAAATTTAGATTTATTTCAAAATACACAATTCAATTTAAACAATCAAATATTAATGAACG
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TTAAGGATTTTGGTTGGTTGGTTATTAAAAAAGATTAATTGATTCATATCTATATTTCAA
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