Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00145270

Standard Name

XRN2 (5'-3' exoribonuclease 2)

Aliases

PreTt26735 | 11.m00432 | 3702.m00154

Description

XRN2 XRN 5-prime-3-prime exonuclease amine-terminal protein; XRN 5'-3' exonuclease family protein; 5'-3' exoribonuclease

Genome Browser (Macronucleus)

Full Screen View


Genome Browser (Micronucleus)

Full Screen View

External Links

Gene Ontology Annotations

No Data fetched for Gene Ontology Annotations

Domains

  • ( PF03159 ) XRN 5'-3' exonuclease N-terminus
  • ( PF17846 ) Xrn1 helical domain

Gene Expression Profile

Vegetative Cell Cycle (Zhang et al., 2023)

GeneMania

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for Tetrahymena Stock Center

Homologs

No Data fetched for Homologs

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

  1. Ref:23084833: Couvillion MT, Bounova G, Purdom E, Speed TP, Collins K (2012) A Tetrahymena Piwi bound to mature tRNA 3' fragments activates the exonuclease Xrn2 for RNA processing in the nucleus. Molecular cell 48(4):509-20

Sequences 

>TTHERM_00145270(coding)
ATGGGTGTTCCAGCATTCTTTAGGTGGCTATGTGCAAGAAATCCTTAATTTATTCTTGAT
GCTCATGAAAATTATGAGGAGTTTGACGCGGAGTCAAATAATCCAGAAATAGATAATTTA
TATTTAGATATGAATGGTATTATTCATCCATGTTGTCGTTCTGATGGTTCTGTTGTACCT
ATAGCTCATACAATTTAAGATATGTTTAATAACATATTTTTATACGTAGATAAGCTTATG
GATCTTTGTAGACCTAAGAAAATTTTGTACATGGCAATTGATGGTGTAGCTCCAAGAGCA
AAAATGAATCAGTAGAGAGCTAGAAGATTCAAAGGAGCTAAAGAAGCTGTAGAATTATAA
TAAAAAAAAGAAGAACTTCTTAATGAATTTCGTGAAAGAAGTGAAATTAATGATGATGTT
TTAGCTTTTGTTTAAAATAGATTTGATACAAATGTCATTACTCCAGGTACCGCTTTTATG
AGAGATTTGAGCATGGCCTTATAGCATTATGTTATTGAAAGAATGAACAAACATCCTTTA
TTTAAAGATATTAAAGTAATATTTTCAGATGCTAGTATTCCTGGTGAAGGAGAGCATAAA
ATATTGGATTTCATTAGAGTTTAAAGAGACTAGCAAAATTATGATCCTAATACTAAACAC
TGCTTGTATGGTGCTGATGCTGATTTAATTATGCTTGGATTAAGTACTCATGAGCCCTAT
TTTTATATTATTAGAGAATAAATTATTACTCAAGAAGAAAAACGTTGCTCCATATGTTAG
TAGACTGGACACTTTTAAATGGACTGTCCAAACGAGATGGCAGTTGAAGCTGGATAAAAA
CCAATTAGTTAAAAAATTCTTTAAGCTTAGGAGCAAAAGGTTAGAAAGGGAATCACCTAG
AGTTTTTAGTTTGCAAAATTATATGTAATGCGTCAATACTTAAACATGAGATTCTCAAAA
GTACTTTTCAACGATAATCTTGAGTGCAAATTGAAGATGCAATATGATATTGAAAGGATT
ATAGATGATTTTGTATTTATGTGCTTTTTTGTTGGTAATGACTTCTTACCTCACATACCT
AATTTGAGTATCCGTGATGGAGGTATAGATGCCTTACTTACTCTGTATGATCATACTATA
ACTCAAGTAGATGATTATTTAACTTGTAATGGGGAATTAAATCTTAAATAAGTAGCTAAA
TTATTAGAAAATATGGCAATTGTTGAAGAAGACTTAATGAAATTTAGAAAAGATAAAGAA
GATCGTGATAAAAAGAATTAAGAGATTAACAAAGAAAAGGAAGCAAGGCTCTAAGAATTA
AGGCCTCACATTTCTGAAGAGGAATACTAAAAGAAAAGAAAAGAGTGGAGATTAAAGGAT
GAGAAAAAAGTTGAGATAATTAACAATGAATCGTTATTGTAAAGATTTAAAAGAATATTA
TCAGAAAGAAGTAATGAGGCTAAGACTATTAAGGAAGTAAAAGAAAGCACTTAAATTACT
CTTAACTATAACTATAAATTATCTTATTATAATGATAAATTTGGTGTAAAACCTGAAGAT
TTTATCTAAATGCAGTGGCTTATTAAATAATCATATGTTGAAGCCTTATGTTGGAACTTT
GCTTATTATTATAAAGGATGCATAAGTTGGAGTTGGTATTATCCTTTCCATTATAGTCCT
TTTGCTTCAGATTTAATAGATATTGATTAGCATATCATAGAATTTGAGAGAGGCGAACCA
TTCAAGCCTTTCTATTAGTTACTCTCTGTCTTTCCTCCTGCAAGTGCTTTAAGTGTACCC
GAATGCTTTAGACCTCTTATGATTGAGCCAACTTCAGAAATAGCTGATTTCTATCCTATT
GATTTTTATGTTGATTTAATTGGAAAAAAATTTGAGTGGCTTGGTGAAGTCATTTTACCA
TTTATTGAAGAAGAAAGACTATTAAGGGCTGCTAGAAAATATGAGCATCTGCTATCTCCT
GAAGAAAAGCAAAGAAATACTCCTGGAAAAATTTAGATTTTTTATAATTAAACTTCTATA
AATTATCCTTTAGAACTTAACTAGACAGAACATAAAATTACAGGTGTTCTTGATAATAAT
TGCAACTTTTTGATTAATGGACCAATTAACTTGTTAGATCCTTAGCTAAATTTAAAAAGA
GTAACATTAAATAACGTTTAATGTAGAAACATTACTTTTCCTGAATTTGAGAAACATGGT
ATACAACTTTTAGAAGGACTTATTGAACCAGTCGAAGAGATTTCTGAAAGCTACATTGAC
AAAGCTGATATGAGAACTTATTAAGGAGAAAACGTAATCAAGCTAATTTAAAGAATCTTA
AGAGGATAAGATAATAGATAACCATGGTAAAGAATTAATGATGAAAGGAATAACTATGAG
TAAGGTAGAAGTTAATATGGAAATTCATTAAATTATAGAGAAATGATGAAATATTAAGAT
TAGATGAATTCCCTTTCTTCAGGGTTTAACTAAAACAATAACGATCATCAGTAAACAAAC
GATCAGTATCAATAATAAGATGGCTAGTCAAATAACATCTTCTCCTCTTTAGAAGAAAGA
TAGCCTAGATATTAAAGGTATAACAACGGTAGAAATTCATATAATAACAATAACAATTAC
AGAAATAATTAATACAATAATGGAAACAATAAAAACTTTTAAGGAGGAAAATATTAGAGA
AATAATTCTAATCAACAATATAATAATTAAAATGATGGAAATTATAATAGAAACTACAGC
AACAATAACTATAGCAATAACTATAACAATAATAATTATAATAATAATAATAATAATAGA
AATGATGGATATTAAAGGGGAGGATCGAATCAAAATAACAGGCGTTATAATAATGGAAAC
TAATATTAAGGTAGTGGAATCGATTTGAATAATGTTAACTAAATAAGATCTCAATATTAA
AATTAATAATTATACTAATAAACCTTTTAAAATTAACCTTAATAGCCAGTATAATAATCA
AACTTATAAATATTCGAGCCTGCATAAACAACATAACCTAAAATATAAGCACCATCTTAT
ATCAATCAGTTCTAATTCAAATAGAACCAACCACCTGCTCAGCCAAATAAGATTTACGAA
CCAGACATAGGTTTAAATGATGGTAATTAAGAATATGATCCTTTAGAAGCAATAAAGAAA
TAATTTAAGAAAAATTGA



>TTHERM_00145270(gene)
GATTTGTAGCTCAATTACCCTTTAATTTAATTCAAAATAAAAGAACAAAATAAAAATATA
TATTAGTTAATATAGGGAGTTAATTTGATAACTTTAAAATAGGCAATTTATACAGAAAAA
TAAAAAACAATATAGGTTTATTAGATTGAAAGATGGGTGTTCCAGCATTCTTTAGGTGGC
TATGTGCAAGAAATCCTTAATTTATTCTTGATGCTCATGAAAATTATGAGGAGTTTGACG
CGGAGTCAAATAATCCAGAAATAGATAATTTATATTTAGATATGAATGGTATTATTCATC
CATGTTGTCGTTCTGATGGTTCTGTTGTACCTATAGCTCATACAATTTAAGATATGTTTA
ATAACATATTTTTATACGTAGATAAGCTTATGGATCTTTGTAGACCTAAGAAAATTTTGT
ACATGGCAATTGATGGTGTAGCTCCAAGAGCAAAAATGAATCAGTAGAGAGCTAGAAGAT
TCAAAGGAGCTAAAGAAGCTGTAGAATTATAATAAAAAAAAGAAGAACTTCTTAATGAAT
TTCGTGAAAGAAGTGAAATTAATGATGATGTTTTAGCTTTTGTTTAAAATAGATTTGATA
CAAATGTCATTACTCCAGGTACCGCTTTTATGAGAGATTTGAGCATGGCCTTATAGCATT
ATGTTATTGAAAGAATGAACAAACATCCTTTATTTAAAGATATTAAAGTAATATTTTCAG
ATGCTAGTATTCCTGGTGAAGGAGAGCATAAAATATTGGATTTCATTAGAGTTTAAAGAG
ACTAGCAAAATTATGATCCTAATACTAAACACTGCTTGTATGGTGCTGATGCTGATTTAA
TTATGCTTGGATTAAGTACTCATGAGCCCTATTTTTATATTATTAGAGAATAAATTATTA
CTCAAGAAGAAAAACGTTGCTCCATATGTTAGTAGACTGGACACTTTTAAATGGACTGTC
CAAACGAGATGGCAGTTGAAGCTGGATAAAAACCAATTAGTTAAAAAATTCTTTAAGCTT
AGGAGCAAAAGGTTAGAAAGGGAATCACCTAGAGTTTTTAGTTTGCAAAATTATATGTAA
TGCGTCAATACTTAAACATGAGATTCTCAAAAGTACTTTTCAACGATAATCTTGAGTGCA
AATTGAAGATGCAATATGATATTGAAAGGATTATAGATGATTTTGTATTTATGTGCTTTT
TTGTTGGTAATGACTTCTTACCTCACATACCTAATTTGAGTATCCGTGATGGAGGTATAG
ATGCCTTACTTACTCTGTATGATCATACTATAACTCAAGTAGATGATTATTTAACTTGTA
ATGGGGAATTAAATCTTAAATAAGTAGCTAAATTATTAGAAAATATGGCAATTGTTGAAG
AAGACTTAATGAAATTTAGAAAAGATAAAGAAGATCGTGATAAAAAGAATTAAGAGATTA
ACAAAGAAAAGGAAGCAAGGCTCTAAGAATTAAGGCCTCACATTTCTGAAGAGGAATACT
AAAAGAAAAGAAAAGAGTGGAGATTAAAGGATGAGAAAAAAGTTGAGATAATTAACAATG
AATCGTTATTGTAAAGATTTAAAAGAATATTATCAGAAAGAAGTAATGAGGCTAAGACTA
TTAAGGAAGTAAAAGAAAGCACTTAAATTACTCTTAACTATAACTATAAATTATCTTATT
ATAATGATAAATTTGGTGTAAAACCTGAAGATTTTATCTAAATGCAGTGGCTTATTAAAT
AATCATATGTTGAAGCCTTATGTTGGAACTTTGCTTATTATTATAAAGGATGCATAAGTT
GGAGTTGGTATTATCCTTTCCATTATAGTCCTTTTGCTTCAGATTTAATAGATATTGATT
AGCATATCATAGAATTTGAGAGAGGCGAACCATTCAAGCCTTTCTATTAGTTACTCTCTG
TCTTTCCTCCTGCAAGTGCTTTAAGTGTACCCGAATGCTTTAGACCTCTTATGATTGAGC
CAACTTCAGAAATAGCTGATTTCTATCCTATTGATTTTTATGTTGATTTAATTGGAAAAA
AATTTGAGTGGCTTGGTGAAGTCATTTTACCATTTATTGAAGAAGAAAGACTATTAAGGG
CTGCTAGAAAATATGAGCATCTGCTATCTCCTGAAGAAAAGCAAAGAAATACTCCTGGAA
AAATTTAGATTTTTTATAATTAAACTTCTATAAATTATCCTTTAGAACTTAACTAGACAG
AACATAAAATTACAGGTGTTCTTGATAATAATTGCAACTTTTTGATTAATGGACCAATTA
ACTTGTTAGATCCTTAGCTAAATTTAAAAAGAGTAACATTAAATAACGTTTAATGTAGAA
ACATTACTTTTCCTGAATTTGAGAAACATGGTATACAACTTTTAGAAGGACTTATTGAAC
CAGTCGAAGAGATTTCTGAAAGCTACATTGACAAAGCTGATATGAGAACTTATTAAGGAG
AAAACGTAATCAAGCTAATTTAAAGAATCTTAAGAGGATAAGATAATAGATAACCATGGT
AAAGAATTAATGATGAAAGGAATAACTATGAGTAAGGTAGAAGTTAATATGGAAATTCAT
TAAATTATAGAGAAATGATGAAATATTAAGATTAGATGAATTCCCTTTCTTCAGGGTTTA
ACTAAAACAATAACGATCATCAGTAAACAAACGATCAGTATCAATAATAAGATGGCTAGT
CAAATAACATCTTCTCCTCTTTAGAAGAAAGATAGCCTAGATATTAAAGGTATAACAACG
GTAGAAATTCATATAATAACAATAACAATTACAGAAATAATTAATACAATAATGGAAACA
ATAAAAACTTTTAAGGAGGAAAATATTAGAGAAATAATTCTAATCAACAATATAATAATT
AAAATGATGGAAATTATAATAGAAACTACAGCAACAATAACTATAGCAATAACTATAACA
ATAATAATTATAATAATAATAATAATAATAGAAATGATGGATATTAAAGGGGAGGATCGA
ATCAAAATAACAGGCGTTATAATAATGGAAACTAATATTAAGGTAGTGGAATCGATTTGA
ATAATGTTAACTAAATAAGATCTCAATATTAAAATTAATAATTATACTAATAAACCTTTT
AAAATTAACCTTAATAGCCAGTATAATAATCAAACTTATAAATATTCGAGCCTGCATAAA
CAACATAACCTAAAATATAAGCACCATCTTATATCAATCAGTTCTAATTCAAATAGAACC
AACCACCTGCTCAGCCAAATAAGATTTACGAACCAGACATAGGTTTAAATGATGGTAATT
AAGAATATGATCCTTTAGAAGCAATAAAGAAATAATTTAAGAAAAATTGATTAATGATTT
TTAAATCAACATAAATAATTATTCAATAGTCTCCTTATATAAGAAGGAATGCTAACCCTA
GAAAATTAAAAGTTAAAAATAATAAAGACCTAAAAATTATAATAAATTCAGTAAATAATT
AATAAATATCAGTTTTGTTTCTTTGTTTACTGATATAAGTATATTTATAATATATTTTCT
TTGAATTTTGATGATGA



>TTHERM_00145270(protein)
MGVPAFFRWLCARNPQFILDAHENYEEFDAESNNPEIDNLYLDMNGIIHPCCRSDGSVVP
IAHTIQDMFNNIFLYVDKLMDLCRPKKILYMAIDGVAPRAKMNQQRARRFKGAKEAVELQ
QKKEELLNEFRERSEINDDVLAFVQNRFDTNVITPGTAFMRDLSMALQHYVIERMNKHPL
FKDIKVIFSDASIPGEGEHKILDFIRVQRDQQNYDPNTKHCLYGADADLIMLGLSTHEPY
FYIIREQIITQEEKRCSICQQTGHFQMDCPNEMAVEAGQKPISQKILQAQEQKVRKGITQ
SFQFAKLYVMRQYLNMRFSKVLFNDNLECKLKMQYDIERIIDDFVFMCFFVGNDFLPHIP
NLSIRDGGIDALLTLYDHTITQVDDYLTCNGELNLKQVAKLLENMAIVEEDLMKFRKDKE
DRDKKNQEINKEKEARLQELRPHISEEEYQKKRKEWRLKDEKKVEIINNESLLQRFKRIL
SERSNEAKTIKEVKESTQITLNYNYKLSYYNDKFGVKPEDFIQMQWLIKQSYVEALCWNF
AYYYKGCISWSWYYPFHYSPFASDLIDIDQHIIEFERGEPFKPFYQLLSVFPPASALSVP
ECFRPLMIEPTSEIADFYPIDFYVDLIGKKFEWLGEVILPFIEEERLLRAARKYEHLLSP
EEKQRNTPGKIQIFYNQTSINYPLELNQTEHKITGVLDNNCNFLINGPINLLDPQLNLKR
VTLNNVQCRNITFPEFEKHGIQLLEGLIEPVEEISESYIDKADMRTYQGENVIKLIQRIL
RGQDNRQPWQRINDERNNYEQGRSQYGNSLNYREMMKYQDQMNSLSSGFNQNNNDHQQTN
DQYQQQDGQSNNIFSSLEERQPRYQRYNNGRNSYNNNNNYRNNQYNNGNNKNFQGGKYQR
NNSNQQYNNQNDGNYNRNYSNNNYSNNYNNNNYNNNNNNRNDGYQRGGSNQNNRRYNNGN
QYQGSGIDLNNVNQIRSQYQNQQLYQQTFQNQPQQPVQQSNLQIFEPAQTTQPKIQAPSY
INQFQFKQNQPPAQPNKIYEPDIGLNDGNQEYDPLEAIKKQFKKN