Identifiers and Description
Gene Model Identifier
TTHERM_00194810Standard Name
MSH6 (homolog to human protein MSH6)Aliases
PreTt06765 | 16.m00421Description
MSH6 MutS domain III protein; MutS domain III family proteinGenome Browser (Macronucleus)
Genome Browser (Micronucleus)
External Links
Gene Ontology Annotations
Molecular Function
- ATP binding (IEA) | GO:0005524
- mismatched DNA binding (IEA) | GO:0030983
Biological Process
- mismatch repair (IEA) | GO:0006298
Domains
Gene Expression Profile
Vegetative Cell Cycle (Zhang et al.,
2023)
GeneMania
Tetrahymena Stock Center
No Data fetched for Tetrahymena Stock Center
Homologs
Source Identifier Score Tetrahymena borealis EI9_03750.1 9.997093137033517e-262 Description: MutS domain III family protein (1232 aa) Oxytricha Contig820.1.g122 9.997093137033517e-262 Description: MutS domain V WormBase WBGene00003091 9.997093137033517e-262 Description: locus:lys-2 status:Confirmed UniProt:O62416 protein_id:CAA16324.1 DictyBase DDB_G0268614 2.0004037638327014e-151 Description: msh6 on chromosome: 1 position 238722 to 242663 WormBase WBGene00003422 2.998573346093879e-125 Description: locus:msh-6 status:Partially_confirmed UniProt:Q9N3T8 protein_id:CCD72556.1 Tetrahymena borealis EI9_17185.1 2.998573346093879e-125 Description: hypothetical protein (557 aa) SGD YDR097C 9.995417076252815e-72 Description: MSH6 Protein required for mismatch repair in mitosis and meiosis, forms a complex with Msh2p to repair both single-base & insertion-deletion mispairs; potentially phosphorylated by Cdc28p Stentor Coeruleus SteCoe_17585 1.6458114310822737e-38 Description: None
General Information
No Data fetched for General Information
Associated Literature
No Data fetched for Associated Literature
Sequences
>TTHERM_00194810(coding)
ATGAAGCAAAGTTCACTATTAAGCTTTTTTGGAAATGTGTAGAGAAGGAAAAGAGAAGAG
ATGGAGAAGGAATAGGCCTAAAACGATAATAAAATTGCTGAATCCACTCAAATTTCTTTA
TCTACATAAAAGAGCAATAAAGAAGTTAAGGAAATTTCTACTTGTGATGATACAGAAGTA
GCAAATTCAAGCGTTTAGGGTACCAGAAAAAGTAATTTAAAACGTCCTAAATTGGCAATA
GATTCTGATGAAGATGATGTTTTTAATCCAGAAGATTTAAAATAATTTTCTCATACTAGC
CCTTAGAAAAATAGCTAGAAAAAAGGAATAAGGTTTTAAAAAAATGATATGATTGATGAA
GATAATGATGATGAATCTTTTAAGGAAGATGATATAGAAGACATTGAAGATGAAGAAGAT
GATGATGATTTTATTGAAGATAGTGATGAAGAAGTTAAGCCTAAACGCAAACAAAAACAA
AGTTAGTAAAAAACACCTGTCAAGAAAACTGGTTCAGCTTCAAAAGCAGGAGCAACAAAG
AGTACTCCCAAATTTGGATAAGAAAGTGCTAAAAAATCAGCAACTAAATAAAGTACAGCT
AAAAAAGCAGAAGATGAGTTTATAAATTGTGATTAAGAAAATGATTTAGCAAGAGCTGCT
GTAGATTAATTAGATGACACTACTCCCTATTTTGCGCTACCAGAAAATGCTATGGATTCA
AAGAAAAGAAAGAGGACGGATCCTAATTATGATCCTACTACTCTTTACGTACCTCCAGAG
TCGTTAAAGTAATTCACACCTGTTATGAGATAATACTGGGAAATTAAGTCTACTAATTTT
GATAAAATTCTTTTTTTTAAGCTAGGTAAATTCTATGAACTCTTTTACGAAGATGCCTTA
ATTACCCATAAAGAGTTAGATCTTAATTGGATGGGTAAAAAAATGCATACAGGTTTTCCT
GAAAAAGCTTTGGATAAAATGGCTTCTAAGCTAATTAGTTTAGGATATAAAGTAGCCGTA
GCTGAACAAACAGAAACTCCTGAGCAGATGAAATAGCGTTTAATGAGGGAAAAAAGTGGA
CCTAAGTGTGTTTCGAGAGAATTAGTATAGGTTATGACAAAAGGTACTTATGATTAAAAT
AACGAAACTGACTACCAGCCAAGATATTTAATGTCATTAAGAAATTTCTAAACAAAATTT
GGTATAATTATAGTTGAAAGTTCAACAAACGTTATAACTGTCGCTTACTTAAATGATGAC
ATACATTTTACACAATTTAAAACATTACTTTGTCAGGTTAAACCTTAAGAAATTGTTTAT
GATCCAGACAATATGACTCATGATATTAAAAAAATCATTTAATCAGGCTATTTAGCTCCT
TAATTATCTCCCCTTTAAAATAAAAATGATAACTGGAATAAAGGAATGGCTTATAATCAT
CTAGATAAAACACACGGTGATGTTCTAGAAGGCAAGTGGCCTAAATTGCTAAATAATTTG
TACAATACTGAAGAAACGAAGAGAGATCTTATATTTGAATCTATGGCAGGACTTTTTAAT
TATTTAAAATCTATTTTAATTTTAGATTAAGTTATTTCAGTTGCCAGATATCAAATTTAT
GATATTGAGAAGGGTGTTAGAAGCTGTATGATTTTAGACAGCTAGTCTCTATAGCACTTA
GAAATATTAGACTCTTCAAGCGGGCCAGTAAGCACTTAGAAAGAAAATTATAAGCTACAT
TTCGATGATGGATCACTACTTGGTTATATAAACAAAACAAAAACTCCATTTGGTTATAGA
ATGCTTAAGAATTGGATTTGTGCTCCTTTAATGGATATTAACAAAATTTATGATAGGTAT
GATGCTATTGAAGATCTTTAAAAGTTTAATTCTGAGAGAGATACCTTCCTCAGAGGTATT
GAAAAGCTTCCAGATCTTGAAAAAATGTGTGGTAGAATATACAAGTATTCCATCAGACAA
TAAAATTAAAATGTAGTTTATTTTGAAGATTTCTCATATTCTCGTTTAAAAGAGTTTAAA
GATTTAACAACTAAATTGGCAGAATCAGAAAAGCTCATTAAAACCCATCTTACTCCTTTT
GCTGACTAGTTTAAGAGTAAAAGACTGAGAAAATTGGTAACCCCAAACACCATTGACCAC
GAAGATGAAGAAGAGTATGAATTACCTGCTATGATTTACCATGGCTATTCAGATGAAGAA
GATGAGGTTGAAGAAAATATAAACTAGCATGCAGCAAAAGCAGAAAAGATGGAAATAGAA
AATAAACAAAGTAAAAAATCTAAAAGTTCTGGTTTACTTCCACCTGCTTCTAAATATATA
TAAGAATTCTAAAATTATATTGTCTGGTAAGGTCCTAAGGGCTAGGAAAAACCTTTACCT
AAAAAAGGGTTAGTTAATTCATATGATTTAGCCACAGAAGCTGTTTAGAATGTCGAGAAA
AAACTTTAAAATTACTTAGTTTAAATCTAATAGCAAATGAAAGACAAAACTATTAAATAT
GGCTTGAGATATGAATTAGAAATAAATGAAGATTTAGTTAAAGGAAATAAAAAACCTAAA
AACTTTGATTTCACAAGTAAAGCAGGCAAATATCAAAGATTCTAAACAAAAGAATTGCGT
GAACTCATAGCTGAGCTCGATGAAGCTGAAGATGTTCAAAAAAAAGAACTCAAAGAATTT
TGCAGATTCATTTTCAAAGAGTTCTATGAAAGCTATAAAACATGGGATACCTTAATTAAT
ATTCTTGCAGAATTAGATTGCTTAATAAGCTTAAGCAGAGTAAGTTTCTTGCTTGCTGAT
GGAGTTATGAGCAGACCTGAATTATATCCTGCTTCTGAAAAATATGTACCATTCATTGAG
TTAACCTCTGGAAGACATCCATGCTTAGCTTCGATGGGAGTTAACTTTATCCCTAACGAT
ATTTATCTTGGTGACATAAAATAGACAGGACAGTTTGAAGACAATAAGAACTTGATTCTT
TTAACAGGTCCTAACATGGGTGGTAAATCTACAACTTTGAGAATGGCTTGTGTAATGGCA
ATTTTAGCTTAAATTGGATGTTATGTACCTGCTAAATCTTTGAGAATGACATTGGTAGAT
CGTATATTCACTCGTATTGGTGCAAGTGATAAATTGATGGATGGAAAAAGTACTTTCTTC
ATTGAAATGGAAGAAACATCAAATGCAGTCAAGTAAGGTTCAAAGCATTCTTTGATTATT
ATGGATGAATTAGGAAGAGGTACTTCCACTTTTGATGGAGTTGCCATTGCATACTCTATA
GTAAGATACTTGGTAGAAAATTTACAAAGTCGTTGTTTATTTGCTACTCATTATCATGTA
TTACTTGATGAATTTAGACATTATCCATAAATAGCATATTATCACATGGCATGTCATGTT
GATGAGAAGAGAAGTAAAGTCATATTTTTATATAGATTAAAAGCAGGAGAATGTTCATCT
AGTTTTGGTATAAATGTTGCAAAGGTTGTTGGTATAAGCGATAATTTGATTGAAATTGCA
AAGTAAAAAGCTAAAGAATTTGAAGAAAATTTAAATATTTAGCATGCTTACAACACAAAT
AAGCGTTTTGGAATTTTGATGAAAGCAATCTAAGAATATGATAGAGATGAAAATTTGGAA
TAAATTATTGAATAATTTAATAAAGTTTAACTTTTATGA>TTHERM_00194810(gene)
ATGAAGCAAAGTTCACTATTAAGCTTTTTTGGAAATGTGTAGAGAAGGAAAAGAGAAGAG
ATGGAGAAGGAATAGGCCTAAAACGATAATAAAATTGCTGAATCCACTCAAATTTCTTTA
TCTACATAAAAGAGCAATAAAGAAGTTAAGGAAATTTCTACTTGTGATGATACAGAAGTA
GCAAATTCAAGCGTTTAGGGTACCAGAAAAAGTAATTTAAAACGTCCTAAATTGGCAATA
GATTCTGATGAAGATGATGTTTTTAATCCAGAAGATTTAAAATAATTTTCTCATACTAGC
CCTTAGAAAAATAGCTAGAAAAAAGGAATAAGGTTTTAAAAAAATGATATGATTGATGAA
GATAATGATGATGAATCTTTTAAGGAAGATGATATAGAAGACATTGAAGATGAAGAAGAT
GATGATGATTTTATTGAAGATAGTGATGAAGAAGTTAAGCCTAAACGCAAACAAAAACAA
AGTTAGTAAAAAACACCTGTCAAGAAAACTGGTTCAGCTTCAAAAGGTAACAATTATCAT
AAATTTGAAATACTTAATATAAAATATTAATGATAAAGAAAATGATTTAGCAAGCCAATA
ATTTAATTTTTATAATTAAAAAGCAGGAGCAACAAAGAGTACTCCCAAATTTGGATAAGA
AAGTGCTAAAAAATCAGCAACTAAATAAAGTACAGCTAAAAAAGCAGAAGATGAGTTTAT
AAATTGTGATTAAGAAAATGATTTAGCAAGAGCTGCTGTAGATTAATTAGATGACACTAC
TCCCTATTTTGCGCTACCAGAAAATGCTATGGATTCAAAGAAAAGAAAGAGGACGGATCC
TAATTATGATCCTACTACTCTTTACGTACCTCCAGAGTCGTTAAAGTAATTCACACCTGT
TATGAGATAATACTGGGAAATTAAGTCTACTAATTTTGATAAAATTCTTTTTTTTAAGCT
AGGTAAAGAAAAAGATATAAAATATTTTGAGTTAGTAAGTAAGTGATATGTTATTTTTAA
AATCAAAATAGGTAAATTCTATGAACTCTTTTACGAAGATGCCTTAATTACCCATAAAGA
GTTAGATCTTAATTGGATGGGTAAAAAAATGCATACAGGTTTTCCTGAAAAAGCTTTGGA
TAAAATGGCTTCTAAGCTAATTAGTTTAGGATATAAAGTAGCCGTAGCTGAACAAACAGA
AACTCCTGAGCAGATGAAATAGCGTTTAATGAGGGAAAAAAGTGGACCTAAGTGTGTTTC
GAGAGAATTAGTATAGGTTATGACAAAAGGTACTTATGATTAAAATAACGAAACTGACTA
CCAGCCAAGATATTTAATGTCATTAAGAAATTTCTAAACAAAATTTGGTATAATTATAGT
TGAAAGTTCAACAAACGTTATAACTGTCGCTTACTTAAATGATGACATACATTTTACACA
ATTTAAAACATTACTTTGTCAGGTTAAACCTTAAGAAATTGTTTATGATCCAGACAATAT
GACTCATGATATTAAAAAAATCATTTAATCAGGCTATTTAGCTCCTTAATTATCTCCCCT
TTAAAATAAAAATGATAACTGGAATAAAGGAATGGCTTATAATCATCTAGATAAAACACA
CGGTGATGTTCTAGAAGGCAAGGTAAATTTAATAAATCATTTATTGACATTAAGTTATTG
ATATTAAACTAAATTAAATTAAAAGTGGCCTAAATTGCTAAATAATTTGTACAATACTGA
AGAAACGAAGAGAGATCTTATATTTGAATCTATGGCAGGACTTTTTAATTATTTAAAATC
TATTTTAATTTTAGATTAAGTTATTTCAGTTGCCAGATATCAAATTTATGATATTGAGAA
GGGTGTTAGAAGCTGTATGATTTTAGACAGCTAGTCTCTATAGCACTTAGAAATATTAGA
CTCTTCAAGCGGGCCAGTAAGCACTTAGAAAGAAAATTATAAGCTACATTTCGATGATGG
ATCACTACTTGGTTATATAAACAAAACAAAAACTCCATTTGGTTATAGAATGCTTAAGAA
TTGGATTTGTGCTCCTTTAATGGATATTAACAAAATTTATGATAGGTATGATGCTATTGA
AGATCTTTAAAAGTTTAATTCTGAGAGAGATACCTTCCTCAGAGGTATTGAAAAGCTTCC
AGATCTTGAAAAAATGTGTGGTAGAATATACAAGTATTCCATCAGACAATAAAATTAAAA
TGTAGTTTATTTTGAAGATTTCTCATATTCTCGTTTAAAAGAGTTTAAAGATTTAACAAC
TAAATTGGCAGAATCAGAAAAGCTCATTAAAACCCATCTTACTCCTTTTGCTGACTAGTT
TAAGAGTAAAAGACTGAGAAAATTGGTAACCCCAAACACCATTGACCACGAAGATGAAGA
AGAGTATGAATTACCTGCTATGATTTACCATGGCTATTCAGATGAAGAAGATGAGGTTGA
AGAAAATATAAACTAGCATGCAGCAAAAGCAGAAAAGATGGAAATAGAAAATAAACAAAG
TAAAAAATCTAAAAGTTCTGGTTTACTTCCACCTGCTTCTAAATATATATAAGAATTCTA
AAATTATATTGTCTGGTAAGGTCCTAAGGGCTAGGAAAAACCTTTACCTAAAAAAGGGTT
AGTTAATTCATATGATTTAGCCACAGAAGCTGTTTAGAATGTCGAGAAAAAACTTTAAAA
TTACTTAGTTTAAATCTAATAGCAAATGAAAGACAAAACTATTAAATATGGCTTGAGATA
TGAATTAGAAATAAATGAAGATTTAGTTAAAGGAAATAAAAAACCTAAAAACTTTGATTT
CACAAGTAAAGCAGGCAAATATCAAAGATTCTAAACAAAAGAATTGCGTGAACTCATAGG
TAAATAAAAAATTTAATTTTTATTAAGTAAATTTTAAAACAATTTTTAAATTAGCTGAGC
TCGATGAAGCTGAAGATGTTCAAAAAAAAGAACTCAAAGAATTTTGCAGATTCATTTTCA
AAGAGTTCTATGAAAGCTATAAAACATGGGATACCTTAATTAATATTCTTGCAGAATTAG
ATTGCTTAATAAGCTTAAGCAGAGTAAGTTTCTTGCTTGCTGATGGAGTTATGAGCAGAC
CTGAATTATATCCTGCTTCTGAAAAATATGTACCATTCATTGAGTTAACCTCTGGAAGAC
ATCCATGCTTAGCTTCGATGGGAGTTAACTTTATCCCTAACGATATTTATCTTGGTGACA
TAAAATAGACAGGACAGTTTGAAGACAATAAGAACTTGATTCTTTTAACAGGTCCTAACA
TGGGTGGTAAATCTACAACTTTGAGAATGGCTTGTGTAATGGCAATTTTAGCTTAAATTG
GATGTTATGTACCTGCTAAATCTTTGAGAATGACATTGGTAGATCGTATATTCACTCGTA
TTGGTGCAAGTGATAAATTGATGGATGGAAAAAGTACTTTCTTCATTGAAATGGAAGAAA
CATCAAATGCAGTCAAGTAAGGTTCAAAGCATTCTTTGATTATTATGGATGAATTAGGAA
GAGGTACTTCCACTTTTGATGGAGTTGCCATTGCATACTCTATAGTAAGATACTTGGTAG
AAAATTTACAAAGTCGTTGTTTATTTGCTACTCATTATCATGTATTACTTGATGAATTTA
GACATTATCCATAAATAGCATATTATCACATGGCATGTCATGTTGATGAGAAGAGAAGTA
AAGTCATATTTTTATATAGATTAAAAGCAGGAGAATGTTCATCTAGTTTTGGTATAAATG
TTGCAAAGGTAATTTAATAATTTTATTTCACTTCTAAATTATTAATTCTATTAAATAAAT
TAATAAAACAGGTTGTTGGTATAAGCGATAATTTGATTGAAATTGCAAAGTAAAAAGCTA
AAGAATTTGAAGAAAATTTAAATATTTAGCATGCTTACAACACAAATAAGCGTTTTGGAA
TTTTGATGAAAGCAATCTAAGAATATGATAGAGATGAAAATTTGGAATAAATTATTGAAT
AATTTAATAAAGTTTAACTTTTATGA>TTHERM_00194810(protein)
MKQSSLLSFFGNVQRRKREEMEKEQAQNDNKIAESTQISLSTQKSNKEVKEISTCDDTEV
ANSSVQGTRKSNLKRPKLAIDSDEDDVFNPEDLKQFSHTSPQKNSQKKGIRFQKNDMIDE
DNDDESFKEDDIEDIEDEEDDDDFIEDSDEEVKPKRKQKQSQQKTPVKKTGSASKAGATK
STPKFGQESAKKSATKQSTAKKAEDEFINCDQENDLARAAVDQLDDTTPYFALPENAMDS
KKRKRTDPNYDPTTLYVPPESLKQFTPVMRQYWEIKSTNFDKILFFKLGKFYELFYEDAL
ITHKELDLNWMGKKMHTGFPEKALDKMASKLISLGYKVAVAEQTETPEQMKQRLMREKSG
PKCVSRELVQVMTKGTYDQNNETDYQPRYLMSLRNFQTKFGIIIVESSTNVITVAYLNDD
IHFTQFKTLLCQVKPQEIVYDPDNMTHDIKKIIQSGYLAPQLSPLQNKNDNWNKGMAYNH
LDKTHGDVLEGKWPKLLNNLYNTEETKRDLIFESMAGLFNYLKSILILDQVISVARYQIY
DIEKGVRSCMILDSQSLQHLEILDSSSGPVSTQKENYKLHFDDGSLLGYINKTKTPFGYR
MLKNWICAPLMDINKIYDRYDAIEDLQKFNSERDTFLRGIEKLPDLEKMCGRIYKYSIRQ
QNQNVVYFEDFSYSRLKEFKDLTTKLAESEKLIKTHLTPFADQFKSKRLRKLVTPNTIDH
EDEEEYELPAMIYHGYSDEEDEVEENINQHAAKAEKMEIENKQSKKSKSSGLLPPASKYI
QEFQNYIVWQGPKGQEKPLPKKGLVNSYDLATEAVQNVEKKLQNYLVQIQQQMKDKTIKY
GLRYELEINEDLVKGNKKPKNFDFTSKAGKYQRFQTKELRELIAELDEAEDVQKKELKEF
CRFIFKEFYESYKTWDTLINILAELDCLISLSRVSFLLADGVMSRPELYPASEKYVPFIE
LTSGRHPCLASMGVNFIPNDIYLGDIKQTGQFEDNKNLILLTGPNMGGKSTTLRMACVMA
ILAQIGCYVPAKSLRMTLVDRIFTRIGASDKLMDGKSTFFIEMEETSNAVKQGSKHSLII
MDELGRGTSTFDGVAIAYSIVRYLVENLQSRCLFATHYHVLLDEFRHYPQIAYYHMACHV
DEKRSKVIFLYRLKAGECSSSFGINVAKVVGISDNLIEIAKQKAKEFEENLNIQHAYNTN
KRFGILMKAIQEYDRDENLEQIIEQFNKVQLL