Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00194810

Standard Name

MSH6 (homolog to human protein MSH6)

Aliases

PreTt06765 | 16.m00421

Description

MSH6 MutS domain III protein; MutS domain III family protein

Genome Browser (Macronucleus)

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Gene Ontology Annotations

Molecular Function

• ATP binding (IEA) | GO:0005524
• mismatched DNA binding (IEA) | GO:0030983

Biological Process

• mismatch repair (IEA) | GO:0006298

Domains

• ( PF00488 ) MutS domain V
• ( PF01624 ) MutS domain I
• ( PF03477 ) ATP cone domain
• ( PF05188 ) MutS domain II
• ( PF05190 ) MutS family domain IV
• ( PF05192 ) MutS domain III
• ( TIGR01069 ) MutS2 family protein
• ( TIGR01070 ) DNA mismatch repair protein MutS

Gene Expression Profile

Vegetative Cell Cycle (Zhang et al., 2023)

GeneMania

No results were calculated for this gene in GeneMania.

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for Tetrahymena Stock Center

Homologs

Source	Identifier	Score
Tetrahymena borealis	EI9_03750.1	9.997093137033517e-262
	Description: MutS domain III family protein (1232 aa)
Oxytricha	Contig820.1.g122	9.997093137033517e-262
	Description: MutS domain V
DictyBase	DDB_G0268614	2.0004037638327014e-151
	Description: msh6 on chromosome: 1 position 238722 to 242663
WormBase	WBGene00003422	2.998573346093879e-125
	Description: locus:msh-6 status:Partially_confirmed UniProt:Q9N3T8 protein_id:CCD72556.1
SGD	YDR097C	9.995417076252815e-72
	Description: MSH6 Protein required for mismatch repair in mitosis and meiosis, forms a complex with Msh2p to repair both single-base & insertion-deletion mispairs; potentially phosphorylated by Cdc28p
Stentor Coeruleus	SteCoe_17585	1.6458114310822737e-38
	Description: None

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

No Data fetched for Associated Literature

Sequences

>TTHERM_00194810(coding)
ATGAAGCAAAGTTCACTATTAAGCTTTTTTGGAAATGTGTAGAGAAGGAAAAGAGAAGAG
ATGGAGAAGGAATAGGCCTAAAACGATAATAAAATTGCTGAATCCACTCAAATTTCTTTA
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AGTACTCCCAAATTTGGATAAGAAAGTGCTAAAAAATCAGCAACTAAATAAAGTACAGCT
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GCTGAACAAACAGAAACTCCTGAGCAGATGAAATAGCGTTTAATGAGGGAAAAAAGTGGA
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TGCAGATTCATTTTCAAAGAGTTCTATGAAAGCTATAAAACATGGGATACCTTAATTAAT
ATTCTTGCAGAATTAGATTGCTTAATAAGCTTAAGCAGAGTAAGTTTCTTGCTTGCTGAT
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ATTTATCTTGGTGACATAAAATAGACAGGACAGTTTGAAGACAATAAGAACTTGATTCTT
TTAACAGGTCCTAACATGGGTGGTAAATCTACAACTTTGAGAATGGCTTGTGTAATGGCA
ATTTTAGCTTAAATTGGATGTTATGTACCTGCTAAATCTTTGAGAATGACATTGGTAGAT
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AAGTAAAAAGCTAAAGAATTTGAAGAAAATTTAAATATTTAGCATGCTTACAACACAAAT
AAGCGTTTTGGAATTTTGATGAAAGCAATCTAAGAATATGATAGAGATGAAAATTTGGAA
TAAATTATTGAATAATTTAATAAAGTTTAACTTTTATGA

>TTHERM_00194810(gene)
ATGAAGCAAAGTTCACTATTAAGCTTTTTTGGAAATGTGTAGAGAAGGAAAAGAGAAGAG
ATGGAGAAGGAATAGGCCTAAAACGATAATAAAATTGCTGAATCCACTCAAATTTCTTTA
TCTACATAAAAGAGCAATAAAGAAGTTAAGGAAATTTCTACTTGTGATGATACAGAAGTA
GCAAATTCAAGCGTTTAGGGTACCAGAAAAAGTAATTTAAAACGTCCTAAATTGGCAATA
GATTCTGATGAAGATGATGTTTTTAATCCAGAAGATTTAAAATAATTTTCTCATACTAGC
CCTTAGAAAAATAGCTAGAAAAAAGGAATAAGGTTTTAAAAAAATGATATGATTGATGAA
GATAATGATGATGAATCTTTTAAGGAAGATGATATAGAAGACATTGAAGATGAAGAAGAT
GATGATGATTTTATTGAAGATAGTGATGAAGAAGTTAAGCCTAAACGCAAACAAAAACAA
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TAATTATGATCCTACTACTCTTTACGTACCTCCAGAGTCGTTAAAGTAATTCACACCTGT
TATGAGATAATACTGGGAAATTAAGTCTACTAATTTTGATAAAATTCTTTTTTTTAAGCT
AGGTAAAGAAAAAGATATAAAATATTTTGAGTTAGTAAGTAAGTGATATGTTATTTTTAA
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ATTTAAAACATTACTTTGTCAGGTTAAACCTTAAGAAATTGTTTATGATCCAGACAATAT
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TTAAAATAAAAATGATAACTGGAATAAAGGAATGGCTTATAATCATCTAGATAAAACACA
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GGGTGTTAGAAGCTGTATGATTTTAGACAGCTAGTCTCTATAGCACTTAGAAATATTAGA
CTCTTCAAGCGGGCCAGTAAGCACTTAGAAAGAAAATTATAAGCTACATTTCGATGATGG
ATCACTACTTGGTTATATAAACAAAACAAAAACTCCATTTGGTTATAGAATGCTTAAGAA
TTGGATTTGTGCTCCTTTAATGGATATTAACAAAATTTATGATAGGTATGATGCTATTGA
AGATCTTTAAAAGTTTAATTCTGAGAGAGATACCTTCCTCAGAGGTATTGAAAAGCTTCC
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TGTAGTTTATTTTGAAGATTTCTCATATTCTCGTTTAAAAGAGTTTAAAGATTTAACAAC
TAAATTGGCAGAATCAGAAAAGCTCATTAAAACCCATCTTACTCCTTTTGCTGACTAGTT
TAAGAGTAAAAGACTGAGAAAATTGGTAACCCCAAACACCATTGACCACGAAGATGAAGA
AGAGTATGAATTACCTGCTATGATTTACCATGGCTATTCAGATGAAGAAGATGAGGTTGA
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TAAAAAATCTAAAAGTTCTGGTTTACTTCCACCTGCTTCTAAATATATATAAGAATTCTA
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AGTTAATTCATATGATTTAGCCACAGAAGCTGTTTAGAATGTCGAGAAAAAACTTTAAAA
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TAAATAAAAAATTTAATTTTTATTAAGTAAATTTTAAAACAATTTTTAAATTAGCTGAGC
TCGATGAAGCTGAAGATGTTCAAAAAAAAGAACTCAAAGAATTTTGCAGATTCATTTTCA
AAGAGTTCTATGAAAGCTATAAAACATGGGATACCTTAATTAATATTCTTGCAGAATTAG
ATTGCTTAATAAGCTTAAGCAGAGTAAGTTTCTTGCTTGCTGATGGAGTTATGAGCAGAC
CTGAATTATATCCTGCTTCTGAAAAATATGTACCATTCATTGAGTTAACCTCTGGAAGAC
ATCCATGCTTAGCTTCGATGGGAGTTAACTTTATCCCTAACGATATTTATCTTGGTGACA
TAAAATAGACAGGACAGTTTGAAGACAATAAGAACTTGATTCTTTTAACAGGTCCTAACA
TGGGTGGTAAATCTACAACTTTGAGAATGGCTTGTGTAATGGCAATTTTAGCTTAAATTG
GATGTTATGTACCTGCTAAATCTTTGAGAATGACATTGGTAGATCGTATATTCACTCGTA
TTGGTGCAAGTGATAAATTGATGGATGGAAAAAGTACTTTCTTCATTGAAATGGAAGAAA
CATCAAATGCAGTCAAGTAAGGTTCAAAGCATTCTTTGATTATTATGGATGAATTAGGAA
GAGGTACTTCCACTTTTGATGGAGTTGCCATTGCATACTCTATAGTAAGATACTTGGTAG
AAAATTTACAAAGTCGTTGTTTATTTGCTACTCATTATCATGTATTACTTGATGAATTTA
GACATTATCCATAAATAGCATATTATCACATGGCATGTCATGTTGATGAGAAGAGAAGTA
AAGTCATATTTTTATATAGATTAAAAGCAGGAGAATGTTCATCTAGTTTTGGTATAAATG
TTGCAAAGGTAATTTAATAATTTTATTTCACTTCTAAATTATTAATTCTATTAAATAAAT
TAATAAAACAGGTTGTTGGTATAAGCGATAATTTGATTGAAATTGCAAAGTAAAAAGCTA
AAGAATTTGAAGAAAATTTAAATATTTAGCATGCTTACAACACAAATAAGCGTTTTGGAA
TTTTGATGAAAGCAATCTAAGAATATGATAGAGATGAAAATTTGGAATAAATTATTGAAT
AATTTAATAAAGTTTAACTTTTATGA

>TTHERM_00194810(protein)
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ANSSVQGTRKSNLKRPKLAIDSDEDDVFNPEDLKQFSHTSPQKNSQKKGIRFQKNDMIDE
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STPKFGQESAKKSATKQSTAKKAEDEFINCDQENDLARAAVDQLDDTTPYFALPENAMDS
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