Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00219370

Standard Name

APB1 (Adaptor Protein complex 1 Beta subunit 1)

Aliases

PreTt22365 | 18.m00391 | 3701.m00150

Description

APB1 adaptin amine-terminal region family protein

Genome Browser (Macronucleus)



Genome Browser (Micronucleus)

External Links

Gene Ontology Annotations

Cellular Component

Molecular Function

Biological Process

Domains

  • ( PF01602 ) Adaptin N terminal region
  • ( PF02883 ) Adaptin C-terminal domain
  • ( PF02985 ) HEAT repeat
  • ( PF03112 ) Uncharacterized protein family (ORF7) DUF
  • ( PF06513 ) Repeat of unknown function (DUF1103)
  • ( PF09066 ) Beta2-adaptin appendage, C-terminal sub-domain
  • ( PF09090 ) MIF4G like
  • ( TIGR00129 ) formate dehydrogenase family accessory protein
  • ( TIGR01889 ) staphylococcal accessory regulator family

Gene Expression Profile

Vegetative Cell Cycle (Zhang et al., 2023)

GeneMania

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for Tetrahymena Stock Center

Homologs

Source Identifier Score
Stentor Coeruleus SteCoe_34804 0
Description: None
Tetrahymena borealis EI9_06715.1 9.997093137033517e-262
Description: adaptin N-terminal region family protein (976 aa)
WormBase WBGene00021331 9.997093137033517e-262
Description: locus:glrx-10 status:Confirmed UniProt:Q9N456 protein_id:CCD68052.1
Oxytricha Contig10327.0.1.g114 2.000147820282363e-173
Description: hypothetical protein
WormBase WBGene00000160 6.997785648757479e-148
Description: locus:apb-1 status:Partially_confirmed UniProt:Q7YZG8 protein_id:CCD72408.1
SGD YKL135C 1.9993628512956726e-92
Description: APL2 Beta-adaptin, large subunit of the clathrin-associated protein (AP-1) complex; binds clathrin; involved in clathrin-dependent Golgi protein sorting
DictyBase DDB_G0283319 4.997860539111522e-53
Description: ap4b1 on chromosome: 4 position 525048 to 527810

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

No Data fetched for Associated Literature

Sequences

>TTHERM_00219370(coding)
ATGGCGCAATATTTCTAATCATCAAACAAAAGAGGAGAATTATTCGAATTGACAGAAGAT
TTAAACTCTAATTCCTATGAAAAAAAGAAAGAGGCTGTCAAGAAGGTTATAGCCCATATG
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GTTGTTATGGACTACTTAGTTAACTACATTCCAGAGAACTCTAAAGAAGCTGAAATGATC
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GTTGTTTTAAAATGTGTTCCTCATATTCTTCAAAAGAGACCTGGAATTATGGAAAAGAAC
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ATAGTTCCAAGTAATACTAATCCTCAAGGAGCTACTGTTGGAGCACGTAGTTAAGATTAA
AACGTCTTGTAACCACTTATTAATGGAGTACTTGAAATTCTCTAAAAATGA


>TTHERM_00219370(gene)
ATGGCGCAATATTTCTAATCATCAAACAAAAGAGGAGAATTATTCGAATTGACAGAAGAT
TTAAACTCTAATTCCTATGAAAAAAAGAAAGAGGCTGTCAAGAAGGTTATAGCCCATATG
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TAATTAGAATTGAAGAAGCTCGTATATTTATACATCATTAACTACTCTAAAACAAAGCCT
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GCAGCACTTTGCATTCCCAAAGTTTATGAGGTTTCACCTGACATTATTGAAAATCATAAT
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GTTCTTATAGCTTTAAACGAAATGTCATATTACAGGTAATTGTTTCTTTATTTTAATAGC
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ATGTATTTAAACTTAAATCTTCTAGCTACTAATTATTGATAATATAAACTAACTTATTTT
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ACAGCTGTCAATGAATGTCATGGTAAATAGATATTTTTATGAGCTTCCTTCATTACATAT
TAAATATTTAGATTTGCTTATTAGTTATTTCGAAATATTAATTTTATGATGTCTTAAATA
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AAAGAAGCTGAAATGTAAAATACATTTTTTATATACTAAAATTATATATCTGTTAAAAAT
CTCATAGGATCGTTGAAAGAGTTCTTCCTAGATTGTCTCTTATTAATCCTGCTGTAGTAT
TTAGTGCAATTAAAGTAGTAATCAAGTTTATGGATTATATTACATCAGTTGACATTGTTA
AAAACTTGAGTGCTAAAATATCTCAAAATTTAAGTAATCTTTTTTATTATTAATAATCTG
AAATGTGTTTTATAATTTTCATCTATTAATATTATAAAGTTTCTTTAATATCATGGCAAT
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AGAATGAGAAGCTTGACATCTTAGCAAAAATTTGTGATAATAAGAACTACGAATCAGTGT
TAAATGAAATCAAAGAATACGTTAATGAACCAGATCCAGATTTCGTTAGACGTTCTATTA
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TATTTAACCTATTCATGATTGGAATATTTTTAACAATAAACAAAAAATAGGACAATTGAA
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GAAAAAAGCTTGGAAGTTCTAATTAATATTGTTGATTTGGCCACCGAAGAACAAGCTAAA
GCAGCTGCATCTTGGATTATCGGTGAATATGCTGAGTTCATTCCTAAAGTTGTTGAGCTT
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TGCCCTCTATCCAAGAAGACAATTATTCAAATGATACTGAATTTACAGACAAAATGATTG
ACAGTTTGGGTTTAATTTGTGCTGTTTACAGTAAGACTGTTGATGAAATGTTCCCTCGTC
GTAGAAGGTGATTAAAATTTATCAAATCTAATTAATATATATTTAAAAGTTAAAATTAAA
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TAAGATAGAAGATAAAAAGGATGATTCTAAAGTTGAAAAAGCTGATGTAGTAGTTGAAGA
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ACAACCTCAACCTGCTAACTTAAATCTTTTAGAATTATTGGATGATGCTCCAACTCCAGT
ATAGCCTGTTACCGTTCAAAAGTAACCTGAAGTTAAACCAGCTAACAATGTTGGAACTGA
TTTACTAGATATGCTTGATGACCACGTTGTTCCTGCATATTAGCCAACTTAAGCTGTAAG
CAACTAACCTGTTGTATAAAATAACAATGACTTTGACTTATTTGATTCTCCCTCCAAACC
CCAAGTCGCTCCCATATAATCCTAAATAAACTACATTGTATATTTTGTTTGAGTTGCTTT
AAATTAAAATCTTATTTTAAATAAAAAAAAGAATGTAATTAATAGTACAACCCCAGGAAA
AACTGGTAAATCTGGATTACAGCTTGATGCTTGCCTTGTTTATGAAAATAATTAAATTGT
TTTGAAGCTTAGAATTAATAACAGATCTACTTTATTAATTAACGAATTTCTCTTATAAAT
TTCTCCTAATTACTTTGGTTTGAAAATAAACGAATAACCTGTAGTCAACATTTACTAAAA
TGCAACTGTTGAAGTTCAAACCACTCTCTCATTCACAGGCAAATAGGATCCAACTAAATT
ACCTCCTAATCCTTATTAATTAATGATGGCTGTAAGAAATCAAATTGATACTTTCTTCTT
TGATCTCCCTGCTAACATAGTGCATTTGTTGGTAACTAAATTTTATAAATTTTTTTAATC
AATGAATTTATTTATTTCTTGTTACTAAAAACTAACAGAGTCTTGATGGAAGAGTAACCC
AAGATGATTTTAAAACTATATGGAAATCTATACCTGATACTACACATAGAGAGCAAAGTG
TAGCTTTTATTTAGCCCCAATATTTCTAGATAGAATCACTTAAATAGAAGCTTAATGATA
ATAGAATTTTCTACATTGCAGCTAAAAATAGTAAATAAATATTAATTAAACTTAATTTTT
GTGAATTAAAATATTTATTATTTAAAAAATAGAAAATAGTTATTATAGTGCTAAAATAAA
TAATACTGTTGTCTTATTGGAAGTTATAGTTCCAAGTAATACTAATCCTCAAGGAGCTAC
TGTTGGAGCACGTAGTTAAGATTAAAACGTCTTGTAACCACTTATTAATGGAGTACTTGA
AATTCTCTAAAAATGA


>TTHERM_00219370(protein)
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VLIALNEMSYYRGKNLITITQKVLQKMLTAVNECHEWGQVVVMDYLVNYIPENSKEAEMI
VERVLPRLSLINPAVVFSAIKVVIKFMDYITSVDIVKNLSAKISQNLISLISWQQPQIQY
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YVNEPDPDFVRRSISSLSTIAIKFERAVDKTIEILVEQMKQIRETYRTTEPYVQEIIIAM
QKIYRKYPSKIKHEKSLEVLINIVDLATEEQAKAAASWIIGEYAEFIPKVVELINTRISE
FLQEQRGVQLEILTAAIKILLKYPDEGQHFIQNLLEQASYKTENPDVRDRAFIYWRMLSI
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FQIESLKQKLNDNRIFYIAAKNKNSYYSAKINNTVVLLEVIVPSNTNPQGATVGARSQDQ
NVLQPLINGVLEILQK