Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00219370

Standard Name

APB1 (Adaptor Protein complex 1 Beta subunit 1)

Aliases

PreTt22365 | 18.m00391 | 3701.m00150

Description

APB1 adaptin amine-terminal region family protein

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Gene Ontology Annotations

Molecular Function

Biological Process

  • axial mesodermal cell differentiation (IEA) | GO:0048321
  • negative regulation of mesodermal cell fate determination (IEA) | GO:0048335

Domains

  • ( PF01602 ) Adaptin N terminal region
  • ( PF02883 ) Adaptin C-terminal domain
  • ( PF02985 ) HEAT repeat
  • ( PF03112 ) Uncharacterized protein family (ORF7) DUF
  • ( PF06513 ) Repeat of unknown function (DUF1103)
  • ( PF09066 ) Beta2-adaptin appendage, C-terminal sub-domain
  • ( PF09090 ) MIF4G like
  • ( TIGR00129 ) formate dehydrogenase family accessory protein
  • ( TIGR01889 ) staphylococcal accessory regulator family

Gene Expression Profile

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for Tetrahymena Stock Center

Homologs

Source Identifier Score
Stentor Coeruleus SteCoe_34804 0
Description: None
Tetrahymena borealis EI9_06715.1 9.997093137033517e-262
Description: adaptin N-terminal region family protein (976 aa)
Oxytricha Contig10327.0.1.g114 2.000147820282363e-173
Description: hypothetical protein
WormBase WBGene00000160 6.997785648757479e-148
Description: locus:apb-1 status:Partially_confirmed UniProt:Q7YZG8 protein_id:CCD72408.1
SGD YKL135C 1.9993628512956726e-92
Description: APL2 Beta-adaptin, large subunit of the clathrin-associated protein (AP-1) complex; binds clathrin; involved in clathrin-dependent Golgi protein sorting
DictyBase DDB_G0283319 4.997860539111522e-53
Description: ap4b1 on chromosome: 4 position 525048 to 527810

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

No Data fetched for Associated Literature

Sequences 

>TTHERM_00219370(coding)
ATGGCGCAATATTTCTAATCATCAAACAAAAGAGGAGAATTATTCGAATTGACAGAAGAT
TTAAACTCTAATTCCTATGAAAAAAAGAAAGAGGCTGTCAAGAAGGTTATAGCCCATATG
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GTTGTTATGGACTACTTAGTTAACTACATTCCAGAGAACTCTAAAGAAGCTGAAATGATC
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GTTGTTTTAAAATGTGTTCCTCATATTCTTCAAAAGAGACCTGGAATTATGGAAAAGAAC
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GTTTACAGTAAGACTGTTGATGAAATGTTCCCTCGTCGTAGAAGAGTACCAACTAAAGAT
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AATAACAGATCTACTTTATTAATTAACGAATTTCTCTTATAAATTTCTCCTAATTACTTT
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CAAACCACTCTCTCATTCACAGGCAAATAGGATCCAACTAAATTACCTCCTAATCCTTAT
TAATTAATGATGGCTGTAAGAAATCAAATTGATACTTTCTTCTTTGATCTCCCTGCTAAC
ATAGTGCATTTGTTGAGTCTTGATGGAAGAGTAACCCAAGATGATTTTAAAACTATATGG
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ATAGTTCCAAGTAATACTAATCCTCAAGGAGCTACTGTTGGAGCACGTAGTTAAGATTAA
AACGTCTTGTAACCACTTATTAATGGAGTACTTGAAATTCTCTAAAAATGA


>TTHERM_00219370(gene)
ATGGCGCAATATTTCTAATCATCAAACAAAAGAGGAGAATTATTCGAATTGACAGAAGAT
TTAAACTCTAATTCCTATGAAAAAAAGAAAGAGGCTGTCAAGAAGGTTATAGCCCATATG
ACTATCGGAAAAGATGTTTCCCCTCTCTTTTAGCCAGTTATTAAATGCTTAGAATTCCCC
TAATTAGAATTGAAGAAGCTCGTATATTTATACATCATTAACTACTCTAAAACAAAGCCT
GACGATGCCATTATGGTTGTGAGTTAATTTGATAAGGATATTAAAAATAAGCAAAATCCT
ATTCTTAGAGCTCTTGCAGTGCGTACCATGGGTTGTGTAAGAGTACCAAGCATCAACTAA
TATTTAGCTGAACCTTTAAAAGAAGCTCTTGTAGATCCCGAGCCTTATGTTCGTATGACT
GCAGCACTTTGCATTCCCAAAGTTTATGAGGTTTCACCTGACATTATTGAAAATCATAAT
CTTATTTAATCCTTGTAAAATATGCTTACAAATGAAGCAAATGCAAAAGTTTTAGCTAAT
GTTCTTATAGCTTTAAACGAAATGTCATATTACAGGTAATTGTTTCTTTATTTTAATAGC
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ATTCATGCAAGAAAAATAAATAATAAGATAGATAGATAGAAATATATATAGATATGCGAA
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ATGTATTTAAACTTAAATCTTCTAGCTACTAATTATTGATAATATAAACTAACTTATTTT
TTTAAAATTAGAGGAAAGAATTTAATAACAATCACATAAAAAGTATTACAAAAAATGCTA
ACAGCTGTCAATGAATGTCATGGTAAATAGATATTTTTATGAGCTTCCTTCATTACATAT
TAAATATTTAGATTTGCTTATTAGTTATTTCGAAATATTAATTTTATGATGTCTTAAATA
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AAAGAAGCTGAAATGTAAAATACATTTTTTATATACTAAAATTATATATCTGTTAAAAAT
CTCATAGGATCGTTGAAAGAGTTCTTCCTAGATTGTCTCTTATTAATCCTGCTGTAGTAT
TTAGTGCAATTAAAGTAGTAATCAAGTTTATGGATTATATTACATCAGTTGACATTGTTA
AAAACTTGAGTGCTAAAATATCTCAAAATTTAAGTAATCTTTTTTATTATTAATAATCTG
AAATGTGTTTTATAATTTTCATCTATTAATATTATAAAGTTTCTTTAATATCATGGCAAT
AACCTTAAATTTAATACGTTGTTTTAAAATGTGTTCCTCATATTCTTCAAAAGAGACCTG
GAATTATGGAAAAGAACATCAAGGTCTTCTTTTGCAATATTAATGAGCCATATTATATTA
AGAATGAGAAGCTTGACATCTTAGCAAAAATTTGTGATAATAAGAACTACGAATCAGTGT
TAAATGAAATCAAAGAATACGTTAATGAACCAGATCCAGATTTCGTTAGACGTTCTATTA
GCTCTTTAAGCACTATAGCAATTAAATTCGAAAGAGCAGTTGATAAGTATGAATTTCATT
TATTTAACCTATTCATGATTGGAATATTTTTAACAATAAACAAAAAATAGGACAATTGAA
ATTTTAGTAGAATAAATGAAATAAATTAGAGAAACTTACAGAACCACTGAACCTTATGTT
TAGGAAATTATTATTGCAATGTAAAAAATATATAGAAAATATCCAAGTAAAATTAAGCAT
GAAAAAAGCTTGGAAGTTCTAATTAATATTGTTGATTTGGCCACCGAAGAACAAGCTAAA
GCAGCTGCATCTTGGATTATCGGTGAATATGCTGAGTTCATTCCTAAAGTTGTTGAGCTT
ATAAATACCAGAATTTCAGAGTAACTAACAATAAATAATTAGCATTTTGATCAATTTTTA
CAATAATATTTTCAATTAAATAAGATTTTTACAAGAACAAAGAGGTGTTTAGTTAGAAAT
TTTAACAGCTGCTATTAAGATTTTATTGAAGTACCCTGATGAAGGATAACACTTCATCTA
AAATCTTCTTGAATAAGCTTCATATAAGACTGAAAACCCTGATGTCCGTGATAGGTAATA
AAAAAATTCCAAAGAAAATGATAAAAATCCTTAATTTTAAATTAAATTTTAGAGCTTTTA
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TGCCCTCTATCCAAGAAGACAATTATTCAAATGATACTGAATTTACAGACAAAATGATTG
ACAGTTTGGGTTTAATTTGTGCTGTTTACAGTAAGACTGTTGATGAAATGTTCCCTCGTC
GTAGAAGGTGATTAAAATTTATCAAATCTAATTAATATATATTTAAAAGTTAAAATTAAA
ATAAAGAGTACCAACTAAAGATGCTAACGCTTCTCAAAACCAAAAGTCTCCTGAAAAATC
TAAGATAGAAGATAAAAAGGATGATTCTAAAGTTGAAAAAGCTGATGTAGTAGTTGAAGA
TAAAAAAGAAAAGGTTACTTAACCATAAACTTAGGTTGTAAATCCTCCTGCTCCCGTTCA
ACAACCTCAACCTGCTAACTTAAATCTTTTAGAATTATTGGATGATGCTCCAACTCCAGT
ATAGCCTGTTACCGTTCAAAAGTAACCTGAAGTTAAACCAGCTAACAATGTTGGAACTGA
TTTACTAGATATGCTTGATGACCACGTTGTTCCTGCATATTAGCCAACTTAAGCTGTAAG
CAACTAACCTGTTGTATAAAATAACAATGACTTTGACTTATTTGATTCTCCCTCCAAACC
CCAAGTCGCTCCCATATAATCCTAAATAAACTACATTGTATATTTTGTTTGAGTTGCTTT
AAATTAAAATCTTATTTTAAATAAAAAAAAGAATGTAATTAATAGTACAACCCCAGGAAA
AACTGGTAAATCTGGATTACAGCTTGATGCTTGCCTTGTTTATGAAAATAATTAAATTGT
TTTGAAGCTTAGAATTAATAACAGATCTACTTTATTAATTAACGAATTTCTCTTATAAAT
TTCTCCTAATTACTTTGGTTTGAAAATAAACGAATAACCTGTAGTCAACATTTACTAAAA
TGCAACTGTTGAAGTTCAAACCACTCTCTCATTCACAGGCAAATAGGATCCAACTAAATT
ACCTCCTAATCCTTATTAATTAATGATGGCTGTAAGAAATCAAATTGATACTTTCTTCTT
TGATCTCCCTGCTAACATAGTGCATTTGTTGGTAACTAAATTTTATAAATTTTTTTAATC
AATGAATTTATTTATTTCTTGTTACTAAAAACTAACAGAGTCTTGATGGAAGAGTAACCC
AAGATGATTTTAAAACTATATGGAAATCTATACCTGATACTACACATAGAGAGCAAAGTG
TAGCTTTTATTTAGCCCCAATATTTCTAGATAGAATCACTTAAATAGAAGCTTAATGATA
ATAGAATTTTCTACATTGCAGCTAAAAATAGTAAATAAATATTAATTAAACTTAATTTTT
GTGAATTAAAATATTTATTATTTAAAAAATAGAAAATAGTTATTATAGTGCTAAAATAAA
TAATACTGTTGTCTTATTGGAAGTTATAGTTCCAAGTAATACTAATCCTCAAGGAGCTAC
TGTTGGAGCACGTAGTTAAGATTAAAACGTCTTGTAACCACTTATTAATGGAGTACTTGA
AATTCTCTAAAAATGA


>TTHERM_00219370(protein)
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QKIYRKYPSKIKHEKSLEVLINIVDLATEEQAKAAASWIIGEYAEFIPKVVELINTRISE
FLQEQRGVQLEILTAAIKILLKYPDEGQHFIQNLLEQASYKTENPDVRDRAFIYWRMLSI
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FQIESLKQKLNDNRIFYIAAKNKNSYYSAKINNTVVLLEVIVPSNTNPQGATVGARSQDQ
NVLQPLINGVLEILQK