Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00222280

Standard Name

POP1 (Ribonucleases P/MRP protein subunit POP1)

Aliases

PreTt12435 | 19.m00227

Description

POP1 ribonuclease P/MRP protein subunit POP1; Ribonucleases P/MRP protein subunit

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External Links

• Uniprot
• Alphafold

Gene Ontology Annotations

Molecular Function

• ribonuclease P activity (IEA) | GO:0004526

Biological Process

• tRNA 5'-leader removal (IEA) | GO:0001682

Domains

• ( PF06978 ) Ribonucleases P/MRP protein subunit POP1
• ( PF08170 ) POPLD (NUC188) domain
• ( TIGR01784 ) conserved hypothetical protein

Gene Expression Profile

Vegetative Cell Cycle (Zhang et al., 2023)

GeneMania

No results were calculated for this gene in GeneMania.

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for Tetrahymena Stock Center

Homologs

Source	Identifier	Score
Tetrahymena borealis	EI9_05553.1	9.997093137033517e-262
	Description: ribonuclease P/MRP protein subunit POP1 containing protein (757 aa)
DictyBase	DDB_G0291320	6.002971818577897e-50
	Description: pop1 on chromosome: 6 position 120925 to 123655
Oxytricha	Contig1019.1.g97	2.0003218023735366e-33
	Description: Ribonucleases P/MRP protein subunit POP1
Stentor Coeruleus	SteCoe_8648	3.221340285992516e-27
	Description: None
WormBase	WBGene00015486	2.0002795641672355e-21
	Description: Uncharacterized protein C05D11.9 status:Confirmed UniProt:Q11188 protein_id:CCD63199.1
SGD	YNL221C	0.00000030014504373857585
	Description: POP1 Subunit of both RNase MRP and nuclear RNase P; RNase MRP cleaves pre-rRNA, while nuclear RNase P cleaves tRNA precursors to generate mature 5 ends and facilitates turnover of nuclear RNAs; binds to the RPR1 RNA subunit in RNase P

General Information

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Associated Literature

No Data fetched for Associated Literature

Sequences

>TTHERM_00222280(coding)
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>TTHERM_00222280(gene)
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AATAATTTGATTTGTAAACAAACAGCTTGAAGCAAAAGTAACTAAACATTTCCTGAAACC
TAAAGGTAAAAGAGTAAATTATATGAAGATAAACTCACCTTTCCCTTTTAAACCTAATTT
CGATTACATTTTGAGTAAATATCTTGAGAGTGAAGATAAGATAATTGCTCAGCAAGAAGA
TCTATAAGATGTTAGAGTTATTATGGTAGGCAGGGGAAAGCCTGATACTAATTCTTACAT
TTGTTTGCCAGAGCCAGAAGATTTCAAAAAATACTAAGATATGCTCTTAAAAGACAAATC
CAGAGTTTATTCTATTCACGATGAGCCTTCTTATGTAAAAGTAGCTTCTAAATCGCTTGA
TATTCCAGAACCCTCTCAAATCAGCACAACAAGAAAAATTATCGGTATTTGCTTGCTTTA
TTGCTTATTAAAATTTTTTCTTTCTTTCCAATTTTGAGTTATAAATTTAATCAAATTTTT
AAATTTTTTCTATTTTTATGGAATTTTGATTCAAGAAATTCGTTGATTTTCTAATCTTTT
TAATTAAATCTTTATTGTAAAAGGGTTTTTATCATTTGGAGATTTTTCATTTAAATCTGG
AGTTGGAAAGGGAAGAGGCTAAATCATAAAGTATTATTTGGATGCTTTAAAAGCTAAAAG
CCAAGGAAACAACATGGAAATAGAGGATAAGCAAAAAAATAAAAAATAAAATGAAATATT
CTGCTTAATCCGTAATCCTACTTCAAGAAAGTACTATTTGGCAAACCTTTATTTAATTTG
A

>TTHERM_00222280(protein)
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MSHNRYRIPSRIRNRMNVQELDVIEKTQDPIKCRKHLRKPKLLMNSYIRRSRSDKWMETH
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LVESEIHLMIIFNNSKQHKAFGQGVTLVVNQGRGILVWRLLSFIACKAIGLSEYNNIIEE
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