Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00225630

Standard Name

SCC3 (Sister Chromatid Cohesion 3)

Aliases

PreTt12473 | 19.m00265

Description

hypothetical protein; HEAT repeat protein associated with the kleisin subunit of the cohesin complex.

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External Links

Gene Ontology Annotations

No Data fetched for Gene Ontology Annotations

Domains

  • ( PF02985 ) HEAT repeat
  • ( PF04764 ) Protein of unknown function (DUF613)
  • ( PF06732 ) Pescadillo N-terminus
  • ( PF08385 ) Dynein heavy chain, N-terminal region
  • ( PF08514 ) STAG domain

Gene Expression Profile

Vegetative Cell Cycle (Zhang et al., 2023)

GeneMania

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for Tetrahymena Stock Center

Homologs

Source Identifier Score
Tetrahymena borealis EI9_05536.1 9.997093137033517e-262
Description: hypothetical protein (932 aa)
WormBase WBGene00006820 0.0000007997233352734267
Description: locus:unc-89 Muscle M-line assembly protein unc-89 status:Partially_confirmed UniProt:O01761 protein_id:CCD63865.1

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

  1. Ref:29948142: Ali EI, Loidl J, Howard-Till RA (2018) A streamlined cohesin apparatus is sufficient for mitosis and meiosis in the protist Tetrahymena. Chromosoma ( ):
  2. Ref:23555314: Howard-Till RA, Lukaszewicz A, Novatchkova M, Loidl J (2013) A single cohesin complex performs mitotic and meiotic functions in the protist tetrahymena. PLoS genetics 9(3):e1003418

Sequences 

>TTHERM_00225630(coding)
ATGCCTCCTAAAAAATCTGGATAAAGCAGGGGAAACCAGCGTTAGGCAAACTAATAAAAA
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ATTAAACATGCGATTTTAGATTGTACTGACAATTTACATGAAATAGTAGTTCAAGAAAAG
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AAGTGCTTAGAAATCACTGATACAGCTACTTCATATACTTCAACTGACAACACTTGCATT
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TCATCAGTTAAAATAAACATAAAATAATAATAAGAAGAAAGCAGTAAAGTTGAAACTGTT
AAAAAAAATCATAGAAGATAAAAGAAGAATTGA


>TTHERM_00225630(gene)
ATGGTAAAACAATTATTTATTTATTGTTTTTGCTTGAATAAAATCTATTTTTTATTTTTA
AAAGCCTCCTAAAAAATCTGGATAAAGCAGGGGAAACCAGCGTTAGGCAAACTAATAAAA
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CTTAGTTGAGATAATAACATAATTAAATATTAAATATAATCAAGAGTAATTATCAAGAGA
AAATTGTTCGATTGAAGAGATTTTAGATCAAATAAAAGATGTAGATGATTAAGAAACAAA
AGAGAATATCCTATAAAACTTTGTTCAGTTGATTTTTAAAGTAATTTAAAGTAATTGTTG
GTATTTAATGTTGCTATAATTAATTTACTTATTAATATAGCTAGTAGGACTCAATAGTTT
TGTGATAAAATTAGAAGACAAATAATTTTCTTCTATTGATTAGGATTTTTTCAAATCAGA
AATAGAATCTAATTTAAAAAATGTTAAGGATTTTAATTGGGTTTTTACTACAAGAAAAGA
AGAGCACTAGTTCCTCAAAGACAATCTCTTTATTTTCTTTGACTCAATTTTATAGCAAAG
TCAATATTACAAATCAGAAAAAAAGGATGATTCTTTTATGGTAAATCTCTCTAATTTCCT
AATTATGTTATCAAAGTAAATTAGTTTTATTGAAATGATTTGAAAATTATTTTGAATAAG
CATCAAATTAACTTATAAAATGTAAATTAGATCCCATATTTAGAATGTAAGATAGAATGT
ATTGAGATTAGTAAGGATTATAGTTGAGTAGGGCTTGATTAGAATAGAGAAATTGAGGGC
TGCTTAATAGAGAAAATTATAGAAAGAAGAGCAATATTTAAAAAACATTCTTGAAAACAT
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GAATTCTTAGAATCTCATTTAATTGTGTTATTTATTTGATTCTGATATTGATCTCGCTAA
TGCACTCTTAAAAGTACTTATCAATATAAAATGGAAAGAAACAGAGTCATCTTTGGAGGC
TCTTAAAGAGTTAGTTCAATATGATAAATTCAGGAAGAGATTAATTTATTTTTCTAACAT
TTCAACATTTGTCACAAGTTACAGAGCTATTCAATTAGTTAACCTGATAGATGAAATTCT
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ATGAAGAAGTCAGAGCAGAGGGATTTAAGATTCTTTAAAAATTTTTAGAAGTTAATGAGG
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AAATAGTAATAAACCAATTCTTTAGCCTGTTAAACTTTTATAAAGAAATTTTATACACTT
TTGGATGAAGTGGATTCCAAAATTTATGAAAAAGAAGATTTGATCTAAAATATGATAAAT
TCTCTTGGTTTTGAATTTGGTGCTATTTACGATTTCCAAAATATTTTCCAATTGCTAAAT
TAGTTACCATCATCGAATTTAAAAGATAAAATTTTTGATTTGTTTAAATTGATTGTTATA
ATTTTGAAAAAAACGATGAAATTCTTATAGCTAATATCGTAAGGCGAGAATCCATCGAGC
ATTTACAACCAAAAGCAATCAGAAAAGTTGCTTATCATTAGAAATGAATTCTTTAAAGCC
TTGGTGGCTAATTTTGATAACTTTTATGAGAATATGAATAAACACCCTATCTTAAAAGAG
TATTCTTACCAATTATTGCTATCAATTCCAGCTATAGACCTCCAACAGAATTTAAAAGAA
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TAAGATTCTTTCATTGAAGATAAATCTTAATCTATGGGACTTGTTTTTGGATGCGTTAGC
ACCCTTTAATACTTCCTCTTACACACCCCAAGGGCCTACATCGATCCTTTTAAAGTAAAA
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TTATTATTCAACTAACTAAATTATCATTGAAAATTTCTAATATTTTGGCACTGAAATTTA
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GCACTTGCCTATTTACATAAAGCTCCATTCCGACGATCCCTTATTTACTTCTTTGATTGA
TTATATTAGTTACTACATTCCTTAGGGTCAGATAGGAGATGAAAAGAAATTAGAATCAAA
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GTTGACGCTAAGCAATCCTAAATTTATTCATTCTCAGTTTGGTGTTTATATTTTTAAGAA
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TCGTCTTTAAGGTGATAAATAGTCAGGATTTCCTCCTTTTTGGAGAGCTTTTGATGAAAT
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TACTCATAAATCATATTTCTCAGAAACTATAAATGAAGGCAATGTCCAAGTGAAACCTAA
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TCATCTAAAAATTAAAAATCTTCAAAAAAAATGGACGAAAATAAATAAAAACCCACTTCA
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TAAGAAGAAAGCAGTAAAGTTGAAACTGTTAAAAAAAATCATAGAAGATAAAAGAAGAAT
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>TTHERM_00225630(protein)
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NILQNFVQLIFKLVGLNSFVIKLEDKQFSSIDQDFFKSEIESNLKNVKDFNWVFTTRKEE
HQFLKDNLFIFFDSILQQSQYYKSEKKDDSFMVNLSNFLIMLSKSHIQNVRQNVLRLVRI
IVEQGLIRIEKLRAAQQRKLQKEEQYLKNILENIMNILIKGIFHSRILDKSQSIQQDCIE
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