Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00237490

Standard Name

RAD54 (Homolog of budding yeast RAD54)

Aliases

PreTt18793 | 20.m00257 | 3706.m00024

Description

RAD54 SNF2 family amine-terminal protein; SNF2 family N-terminal domain containing protein

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Gene Ontology Annotations

Molecular Function

Domains

  • ( PF00176 ) SNF2 family N-terminal domain
  • ( PF00270 ) DEAD/DEAH box helicase
  • ( PF00271 ) Helicase conserved C-terminal domain
  • ( PF04851 ) type III restriction enzyme, res

Gene Expression Profile

Vegetative Cell Cycle (Zhang et al., 2023)

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for Tetrahymena Stock Center

Homologs

Source Identifier Score
Tetrahymena borealis EI9_07944.1 9.997093137033517e-262
Description: SNF2 family domain-containing protein (1016 aa)
DictyBase DDB_G0282997 3.0008389609965914e-128
Description: rad54 on chromosome: 4 position 118731 to 121607
WormBase WBGene00004298 6.001241942754875e-123
Description: locus:rad-54 status:Partially_confirmed UniProt:G5EEN6 protein_id:CAA22254.2
SGD YGL163C 1.999447289884935e-116
Description: RAD54 DNA-dependent ATPase, stimulates strand exchange by modifying the topology of double-stranded DNA; involved in the recombinational repair of double-strand breaks in DNA during vegetative growth and meiosis; member of the SWI/SNF family
Stentor Coeruleus SteCoe_19439 3.917469664450395e-64
Description: None
Oxytricha Contig12570.0.g36 1.9999167998962255e-60
Description: SNF2 family N-terminal domain

General Information

No. Gene Name(s) Paragraph Text
53 RAD54 In yeast, DNA-dependent ATPase that stimulates strand exchange; modifies the topology of double-stranded DNA; involved in the recombinational repair of double-strand breaks in DNA during vegetative growth and meiosis

Associated Literature

No Data fetched for Associated Literature

Sequences 

>TTHERM_00237490(coding)
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>TTHERM_00237490(gene)
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CTTTGTGGTAGTGCAGGTGGTACAGGTTTAAATCTTAGTGCAGCAAACAGAATGGTTTTA
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AAAAATAAATTTTGGTTTAGTATCAAATTTTCACAGTTTGTATTGAAAAATGTTGTAATA
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ACAGATTAGTTGCTTGTGGCACTATGGAAGAAAAAGTTCTACAGAGATAGTTCTTGAAAG
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AAAATTAATTAAATTAATTAAAAGAGTTTACTCCTGATTATGTTGATACTATGGAGAAAT
ATATAACTTTTGTAAAGAGAACAATTAAGGGAGAAAAGAAAGATTAGGAGTAAGAGAGTG
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ATGAAGATGAAGCTGATGGAGAAGATTCATTAGATGATAAAGAAATTAATGAAGAAGAGG
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ATGATTTTGCTATATTTAATTATGCTAAAAAAAAGGATTCAGATAATGAATAACCCATAA
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CATAAAATAAAGATAATAAAGAAGCAGATATGCAAGTTGAAGAAAAAGCTGAAGATGAAG
ATGAAGTTGTTGTAACAAAAGGCAGAAGAGGAAGAAGAAAAGCAACTACAACAAGTGATA
CTAATCCAGCCAAAAATATACTTAAAAAATTAAAAAAATGA


>TTHERM_00237490(protein)
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DSENLKENKEKTTPVIQNKPQGLLGLKSKPFKPLVSKLEVKSNTDTKTQMKPSSTFSTNP
TAKNQPPQQEEKNSPEEFYKCFWSKDVKKKHKVLDDGIIVFTSSKVQIYNSDGEKIYDSY
KSKLYCPNPDNGNQYIVGQYFVEQDDKISKDDFLSGRCFVKAKMTYEKDQTIAKKKIAPM
KKNTQSEGPKPSDIVVPENSYLLTDPSNKQLFPVYIDVYLNNSMRIHQRLGVKFMFECIS
GLRGPDIGGCILADSMGLGKTLQTIALIWTLIRRNPHSGTSPLIRKVVVVAPVSLLGSWN
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IFDEGHRLKNMNIKTFRSFNSIKCNRRIILTGTPLQNSLDEFYSCVKFVNPNIFENEKQF
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