Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00242090

Standard Name

VPS18A (vacuolar protein sorting 18A)

Aliases

PreTt18947 | 20.m00411 | 3706.m00175

Description

corvet complex core vacuolar protein

Genome Browser (Macronucleus)

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External Links

Gene Ontology Annotations

No Data fetched for Gene Ontology Annotations

Domains

  • ( PF00097 ) Zinc finger, C3HC4 type (RING finger)
  • ( PF00628 ) PHD-finger
  • ( PF00637 ) Region in Clathrin and VPS
  • ( PF05131 ) Pep3/Vps18/deep orange beta-propeller domain
  • ( PF07337 ) DC-EC Repeat
  • ( PF09204 ) Bacterial self-protective colicin-like immunity

Gene Expression Profile

Vegetative Cell Cycle (Zhang et al., 2023)

GeneMania

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for Tetrahymena Stock Center

Homologs

Source Identifier Score
Tetrahymena borealis EI9_07784.1 9.997093137033517e-262
Description: hypothetical protein (1136 aa)
DictyBase DDB_G0269924 2.000065869309806e-55
Description: vps18 on chromosome: 1 position 3875953 to 3879788
Oxytricha Contig618.1.g107 6.001502944943701e-53
Description: Pep3/Vps18/deep orange family
WormBase WBGene00021058 3.00033207980219e-32
Description: locus:vps-18 status:Partially_confirmed UniProt:Q23194 protein_id:CCD73641.1
Tetrahymena borealis EI9_03359.1 3.00033207980219e-32
Description: hypothetical protein (462 aa)
Stentor Coeruleus SteCoe_29243 2.1705220113036395e-29
Description: None
SGD YLR148W 6.002718307283067e-26
Description: PEP3 Component of CORVET tethering complex; vacuolar peripheral membrane protein that promotes vesicular docking/fusion reactions in conjunction with SNARE proteins, required for vacuolar biogenesis

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

  1. Ref:31964712: Sparvoli D, Zoltner M, Cheng CY, Field MC, Turkewitz AP (2020) Diversification of CORVET tethers facilitates transport complexity in . Journal of cell science 133:

Sequences 

>TTHERM_00242090(coding)
ATGAATTAAAGCATACCTAGTGATTATAGCCCTTACTATAGCTAATAGGATGTGAAGGGA
TTTCAATCAAAAATTTATTAAACTGAATAGATTTTTGGAGATTTAAAGAACTATGATTTA
CCTTCTGAGTTATTTCGCAGTGAATAAATAAAATAATTGGCTGTGAGTCTTAACCAAATA
GCTGTATTGACCGCGAGCAATAAAATATATAGAATGACTAAAAAAAAAGGTTGGTAGAAA
TTGGAGATTCCTGATAGAATAGAGTAACCAGTTTAGTAGCAATAATAGCAATAAGCACAA
CAAAATTAAGGAAATCTAATCACTAATTTATTCAGCAATGTCTTTAATGGAGTAGGGACA
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AATATTACAGATGGTGCTTAGCCAGTAATCATAGATAGAATTTATCTTGACCCTTTTGGT
TATCATTTAATAGCATGTAGCAATCAAGGATTTTCTTTCTATATTAATTACCATCATGAA
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TATGATAATCTTACAATTATGTCTAGAATTAACGAGAGAATAGTAACTTCTTATGACCTC
AAAAGCATGGGTGTAGTTTATGGTATGTAATATGATAGCTTTAATAAAATTATATGGATA
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ATTTATTGGCTAATTGAAATAAAAGCAGAGAAAATTAATGCTTAAGAAGTTAGATACTAA
TATTATTAGTAGTATCCTATCTCAAAGTTTAAAAACGAGCAGGATAAGAGATACTGCCTG
GAGTTAATTAGCTAAAAAATACAGAGCTTAAAAGATAGCTTGAAATAACTTTTAGAACAG
TATATACATGATAGAGAATTAGACGAAAATACAATTTACTAAATTTTGTAAACTCATGGT
AGATTGAAAGATTGCTTCGAATATGCTAGAAAAAAGTAATCCTTTGAGGTCATTATCAAG
AATGACATTAATGAAGATAAATTTGATTAGGTACTTTTAGATTTAGAGTCTATTCCTAGA
GAAAAAGAAAGATATAGAAATGATTTATTAGTCAAATATTCTCATCTCCTTATTTAGAAA
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AAGGAACAAGAAAGATTTAACTTTAGTTTTGAATTTGCATTTACTATTGCCAAATCTTAC
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AGCTAAAAAGAATAAAAAAAGCTAATGCTATAAGTCGCTAAATACTACCTTGAAAAGGAC
AATATTTTTGAAGTTATAGATTTATTGCAATAATATCCTGTTCTTCAGATTGAAGAAATT
TTAGATCTGTTTTCTGAGAGTGTTGATGTTCAAAAAGTAACTGAGTAGATTTGCAACGGT
TTAGAACAAAAGAACAAAAAGATTGAGGAACTCAGAATTTTAATCAAAGCCTACTCACTA
GCAGCTGATAAAATTAAATCTGATCTTAATAAAATTAATAAATATGTTATTATCAAATAA
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TGTAAGCATGGGTTCCATCAAGCATGCCTGATTTATAAAGTGATAAAAAATGATGACGAT
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ATAGAATCTCTTACAACAAGAAAGAGAGCTTCAAGTGAAGATATTGACATAGGACTTTTC
AATAATCCTCTGAATAAGCTTGTAAATTTTGTTGCAAGCCATGCTATTGAAGAAGATAAT
GAAGAAAATACTGTATAGCTAGAGTAATATTAGAAAGAGCTTCTTAAATATAGAGAAGAA
TTAGATTAGTTGTTAGCAATAGAATGTATAGAATGTGGTCCTAGTATTGTTGAAAGTATT
TATAAAAAACCTTTTAATGATAATATAAAAATTGCAGATACATGGAAACTCTGA


>TTHERM_00242090(gene)
ATGAATTAAAGCATACCTAGTGATTATAGCCCTTACTATAGCGTGATAAACTTTAATAGT
TAGATGAATAATATGGATAATTAGTTATTTGTTTTTAATATAGTAATAGGATGTGAAGGG
ATTTCAATCAAAAATTTATTAAACTGAATAGATTTTTGGAGATTTAAAGAACTATGATTT
ACCTTCTGAGTTATTTCGCAGTGAATAAATAAAATAATTGGCTGTGAGTCTTAACCAAAT
AGCTGTATTGACCGCGAGCAATAAAATATATAGAATGACTAAAAAAAAAGGTTGGTAGAA
ATTGGAGATTCCTGATAGAATAGAGTAACCAGTTTAGTAGCAATAATAGCAATAAGCACA
ACAAAATTAAGGAAATCTAATCACTAATTTATTCAGCAATGTCTTTAATGGAGTAGGGAC
AGTAGTCTAAGGAGTTGGATATGGAGTTGGTTATGTAGTATAAGGTGTTGGATAGATGTT
GAATATTACAGATGGTGCTTAGCCAGTAATCATAGATAGAATTTATCTTGACCCTTTTGG
TAATTTAAAAATGAAAGTTGAATATTTGATAAATAAAAATAAACAATAAAATGAAATAGC
AGAACATTTTTTTAATCTTCGGATAATATTTAACATCTGAGAATGATTTTAAAGTTCAAA
ATATAAAACGTGAGTTCAAATAAAAAGAATATTGTTATATAAATTAAAATAGGTTATCAT
TTAATAGCATGTAGCAATCAAGGATTTTCTTTCTATATTAATTACCATCATGAAAACCAG
ATGAAGCTGCTTAAAAATGTAAGAGGAGAAGAGTATATCATTACATCTATTGGATGGGAA
GACTCATAAGCAGAATAAAAAGCAGATAGTATAGAACATAAAACAAAAGTAAATCAAAAT
TTTTTTTAAAAATTAAAAGTTTATTTATCAAAAAAATGTATTGATAAAATTCTTACTATT
TATACAAGTTTACAGTTTAAGTCTTAGGCATAAATATTTAATAGGACGATATAAAAATAT
AAATAAATTTAAAAATTTTTGGAAGCTATATATACTTAGTGGAATATTATATTCTAGTTT
AATATTAAGTTTAATGAAACATTCATTATAAATGTTTTTGTTAATAATAGAGTGTTTTTA
AATAATCAAAATCATAGTATTAAAAATAATAAATTAGATTAGAAAATTAAATTAAAAAAG
AAATTGATCTAAAATGTTTATATTTAAAACAATCACTATGAAGTTTACAATTTATTTTAT
TTTTAAAAAATTATGATAGAGTTTTATCTTAGGTACTTCTAAAGGTGTACTTTACATTTA
TAGTATAAAGTGCTTAGATTAAGAATAGATAGAAGAGACAATACCCTTCATGGCTTTGGA
GCTGCATAGTTCAAGTTCTTCTAAAGCTATTAATGCTATTAAATATCTAAAAATATATAG
TGATAATAGAAAAGATAAAAAGTTTCTTGTCTTTGTTTCTACAAACTCCTCTGTATACGC
CTTTTCAGAAAAAGATATTGTCATTCATCTTTAAAATTTTAAATTGTATGACTATTAAAA
CAGAGTTAGCTTTAATGTGAATGACACTAGTTTTAATAACGATTTTAGAATTTCCCCAAA
TTCTTTACTTAGTGTATGCAGTGTTGTTGAGGGTCAAGATAAAAAGAAAATCCCTCATTC
TGTTTTATGGGTCAATGAATATGGCTTGTTTAATCAATTGGTAAGAGCATTTAATTCTTT
AACTTTTTGCCATTATTTTATGTTAAATTGTATTTTATTTTTCTAATGAGTTTTTAATTT
TAAAATATTTATAAAAATGAATTATTTAAAATATTAGATTCCAACTTGTTACGAGTAATA
CAAAGATACCTTTTTAAGAGATTTACAAAAACTTTCTTATGCTAAATAGTATGAATTTAG
AGGTTCTAAAGTAGACCCAAAGTCTGTAGATGAAATGCCTATAGACATTTTGTTGACGGA
ATTTCATTATATTTTACTCTTTTATGATAATCTTACAATTATGTCTAGAATTAACGAGAG
AATAGTAACTTCTTATGACCTCAAAAGCATGGGTGTAGTTTATGGTATGTAATATGATAG
CTTTAATAAAATTATATGGATATATTCGAGCAAAGATATCAAATACCTTAGTATTTAAAA
TGAAGAAAAAGTAATAAAGCTTAGTATTTTAATTATTTCAATACATTTTGTTTTAATTTA
AAAGGATGGCTGGAAGCTTTATTTAGAAAAAAAATAATTCAATCTAGCTTTCGAAAGTGC
TAAAAAAGCAGATGTGACAAAAGAAGATATAGCTTATGTACTTTTTTTAACAAGAAAAAC
ATATTAATTGTCTTTTTAATAATTTTTATAGCTAGCTGGATTGTATGGAGATCAATAGTT
TTTGTAAAAAGATTATATGAAAGCAGCATAACTTTACTTTGAAACAAACAGAAATTTCGA
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TCTTGAAGGTATTTTTTTAATTTTAGGTAATTTGTTATATCTTTTAATATCACTTTTAAT
TATCTAGAATACCTCACATTATGGCTTAAAAATTTAAGATAAGATGTAAAGACTTAAAAG
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ATTAGATTATTAGTAGTATCCTATCTCAAAGTTTAAAAACGAGCAGGATAAGAGATACTG
CCTGGAGTTAATTAGCTAAAAAATACAGAGCTTAAAAGATAGCTTGAAATAACTTTTAGA
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TGGTAGATTGAAAGATTGCTTCGAATATGCTAGAAAAAAGTAATCCTTTGAGGTCATTAT
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TAGAGAAAAAGAAAGATATAGAAATGATTTATTAGTCAAAGTAATAAATTATTCTAATTC
AAATCTTTAAAATAATATTATTTATATCTAAATAGTATTCTCATCTCCTTATTTAGAAAG
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GCAAAATTAATAAAAGATAATAGTCTTAAATACAAGACACTAGAGAAATTAAGCTTATAA
GAAGTTTAATTGATACTCCTCCATCTAAAAAAAGACATGTAATTGAGTATATAAAAGGTC
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ATTTCCATATCATACTTGTTAAATTATATGGGTAAGTCTTTTAATATTTTTTTTAAAACA
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ATGAAATTTTAAATGTTAGATAAACTTGGTTTTATTAATTCTCGAACAAAATTAAAAGTT
TAAATTATCATTTATATTATAATACAGATTAAAGGATATGTGCAGCGAAGCTATCAAAGT
TGCTTTGGAAAATGATCTTGGATATCTTATTTAAAGTTATATAACTTAACCTTCAAGCTA
AAAAGAATAAAAAAAGCTAATGCTATAAGTCGCTAAATACTACCTTGAAAAGGACAATAT
TTTTGAAGTTATAGATTTATTGCAATAATATCCTGTTCTTCAGATTGAAGAAATTTTAGA
TCTGTTTTCTGAGAGTGTTGATGTTCAAAAAGTAACTGAGTAGATTTGCAACGGTTTAGA
ACAAAAGAACAAAAAGATTGAGGAACTCAGAATTTTAATCAAAGCCTACTCACTAGCAGC
TGATAAAATTAAATCTGATCTTAATAAAATTAATAAATATGTTATTATCAAATAAGATAA
AACTTGTAGAGAGTGTAATAGACCTTTATATACAGATTCATTTTATATATTCCCCTGTAA
GCATGGGTTCCATCAAGTAAATTAAATTTATTTTTTTAATAAAGATTTTAAATAAAAAAT
AAAAAATAGGCATGCCTGATTTATAAAGTGATAAAAAATGATGACGATCAAATAAAATTA
GAAAAAATAAATACTTTGAATTCAAAAATAGAACAAATTTAAAAAAGCATAGAATCTCTT
ACAACAAGAAAGAGTAAATTCATTTTATTTTATCTATCTATTTTTACAAACAAATATTTT
TTTATTAAATTAAGGAGCTTCAAGTGAAGATATTGACATAGGACTTTTCAATAATCCTCT
GAATAAGCTTGTAAATTTTGTTGCAAGCCATGCTATTGAAGAAGATAATGAAGAAAATAC
TGTATAGCTAGAGTAATATTAGAAAGAGCTTCTTAAATATAGAGTAATTTTTTTATACAA
ATTAGCTTTTTAAATATTTTATAATTAAATATTAGGAAGAATTAGATTAGTTGTTAGCAA
TAGAATGTATAGAATGTGGTCCTAGTATTGTTGAAAGTATTTATAAAAAACCTTTTAATG
ATAATATAAAAATTGCAGATACATGGAAACTCTGA


>TTHERM_00242090(protein)
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QIKLEKINTLNSKIEQIQKSIESLTTRKRASSEDIDIGLFNNPLNKLVNFVASHAIEEDN
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