Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00283900

Standard Name

RNH13 (RNase H1.3)

Aliases

PreTt04929 | 25.m00393 | 3694.m00176

Description

RNH13 RNase H family protein; RNase H family protein; localizes to micronucleus during conjugation; Ribonuclease H domain

Genome Browser (Macronucleus)

Full Screen View


Genome Browser (Micronucleus)

Full Screen View

External Links

Gene Ontology Annotations

No Data fetched for Gene Ontology Annotations

Domains

  • ( PF13456 ) Reverse transcriptase-like

Gene Expression Profile

Vegetative Cell Cycle (Zhang et al., 2023)

GeneMania

Tetrahymena Stock Center

  • ( SD02710 ) Macronucleus: RNH1.3 with HA tag
  • ( SD02711 ) Macronucleus: RNH1.3 with HA tag
  • ( SD02712 ) Macronucleus: Neo3 knockout of RNH1.3
  • ( SD02713 ) Macronucleus: Neo3 knockout of RNH1.3
  • ( SD02714 ) Macronucleus: Neo3 knockout of RNH1.3
  • ( SD02715 ) Macronucleus: Neo3 knockout of RNH1.3

Homologs

No Data fetched for Homologs

General Information

No. Gene Name(s) Paragraph Text
2323 RNH13 HA-tagged RNase H1.3 localizes to early meiotic micronuclei. RNH13 gene knockout causes aberrant numbers of nuclei in exconjugants.

Associated Literature

No Data fetched for Associated Literature

Sequences 

>TTHERM_00283900(coding)
ATGAAAATTTGCCCAAAACATAAATTACCTGCTCTTTAAGTTTGTTTATCTATTGATTGC
AAAAAGTAAAGAATGATGTGCTATAAGTGCCTTCCTGATCATAGTCTCCATTCTGAATAG
ATTGTTTAGCTTGATAACTTAAGTGATAAAAAAAACTTGGATTGCCAAGAGAATATCAAT
AGCTCTATAGACAGCAACAAAAATAATAAGCAGGGAGTCAGTCCACTTAAGGTAAATAGC
GAATTCAATGGATCTCCTTTTATGTTAAATAATCTAGCTAACTTAAAAATAAACTCCAGC
TCATAGGAGCCTTCAGATTAAAACGTAAAAAGAAGTAGTGTTAAAAATAGTTTTAGCAAA
GTAAAAGAATTCAATTCAACATCTAACATAGAAGAAGAAATACTTGACTAGGGTCAAATC
AAGCAAAAAAAGAAAAAATCTAGCATTTCTCTTGATAAGCCAGAAAAATAAATACAACTT
AACAATAATACACAAAGTAGAAAATAAGAATTTAGAGATGTGTTTGTAATTAAAGAAGAA
AATATGGATGATGATTATACAAACTGTAAAATTGAGAATGGTGGTAATTCTCATTTGAAA
AACACTAATGCTTTACCTCAAAATGGAAAGAAATATTCTAAAGAGTCTGCTCAAACTAAA
GTTTTTGGGACAGATATGTTGTCACAAATTTCCAGACAAAAAGGTAGTAGTTCCTAAAAA
AACATAAATCAGTTACTAAGTTAAGCTTCCACAGTATCTCCAAGCATCTAACCTGTTGAG
AAGAGTATGATGGATGTGATTTCTAATACAACTAATTATTATCCATAATATCCCTTCTAT
CCTCCTCATAATCCTTATGAAAATCCTTTCTAATTTAGCACTAATTTTAATCCAGGCCAC
TAAATGACTTATCCTCATCCACATCCTTAAGGGTACCCACCAAATTAGGTAAATGCGCCT
TTTTCTCACCTCTATAACCAGTAACATAATTTTAACAATATGCCTCCTTACTATCCTCCT
ACTCGTTCTTCTTATATGCCAAGCTTTAACCATAATTATTAGTAGAACCACATGCTTTAA
GAGTAAGAAACTAAAGAATAATATCATACTATATCTGATTCCAGTTCTAGTGATAAATAT
TTTTCAAAAAAAGATAAATTAAGTAATGAAAGAAGTCTCTAAAGAAATTAAATGAAAAAT
GACAAAATAGATTTTGTTTCATCTGATGAATCTTTGCAATAATAAGAATAGACAGCTACA
GACTTTTTTTAAAATGGAGCTCTCTCTGAGTTGATTAAGCAAAACGAAAACATTCAAAAG
ATATGTGTTTATCTTAGAACTTTAAATGACATTAAAATGTCAGTATGCACTAAAATTGAG
GCCATGAAGAATAAATTCCTACAACAAATATAAATGAAAGAATAAGATTTCAGTTATGCA
TTTTTGGCAAATACTTTCAACCAAAATAATAACTAAGTAGAAGAAAACTTAAAGAGCTAC
TTTGCAAAAATACAGCAACTAAATTCCTTTTTTGAAAAGAATTAACTAAGCTACAACCCT
TAAGCTGCTAGCAAATAGAAACTAAGCTAGATTGAATAAGAACTTGATAGAATGCTTTTT
TTTACTATTGAGAAAATAGATTAGGAAACTTTAAATTAAACTAAACTAATCAAGTAAGAA
CATATTGACCCTTTCAAAGATAATTCAGAGTATGAAGAATTAACATAATTTTATCAAAAC
TAACCTGCTAATATTGATGCAATCAAAGACAAAATAAACTTTTATTCTTAGTGTTAGCTC
GAATTTGATGGAACATCAAAAGGAAACCCTGGAAGATCTGGAGCTGGCTTTATCATCAAA
GATTTATACACTGAGAATAAATTACTTGAGTATTCAGTAGAAGTAGGAACAAAAACTATC
AATTAATCTGAGTATCTAGCTTTAATCTATGGAATGTATACTTGCTATAAGCTAGGTATT
AAGCAGCTTACAATTTAAGGTGACTCTGAAGTTGTGATAAAACACATGTTAGGTGTTTAC
TAATGCAGAAGCTAACAGCTCAGAGAATACTATAATCTAGCTAAAATTTTAGATGAGCTT
TTCCATTTTAAGGACTACGTTTAAGTAAAAAAAGAGCTTAACACTGAAGCTGATGCACTA
GCCAATCTAGCACTTAGTTGA



>TTHERM_00283900(gene)
AAAGGAATTTATCAATCTAGCTAAAAAAATTAAAAGCTAACAAAAAACTGAAAACTATAT
TCGATATCTACATCTAGTTTCTAATATTTGATAGCTCTATTATAAAATTAGGTTGTAAAA
ACACTATTAGTTAGCATAAATGAAAATTTGCCCAAAACATAAATTACCTGCTCTTTAAGT
TTGTTTATCTATTGATTGCAAAAAGTAAAGAATGATGTGCTATAAGTGCCTTCCTGATCA
TAGTCTCCATTCTGAATAGATTGTTTAGCTTGATAACTTAAGTGATAAAAAAAACTTGGA
TTGCCAAGAGAATATCAATAGCTCTATAGACAGCAACAAAAATAATAAGCAGGGAGTCAG
TCCACTTAAGGTAAATAGCGAATTCAATGGATCTCCTTTTATGTTAAATAATCTAGCTAA
CTTAAAAATAAACTCCAGCTCATAGGAGCCTTCAGATTAAAACGTAAAAAGAAGTAGTGT
TAAAAATAGTTTTAGCAAAGTAAAAGAATTCAATTCAACATCTAACATAGAAGAAGAAAT
ACTTGACTAGGGTCAAATCAAGCAAAAAAAGAAAAAATCTAGCATTTCTCTTGATAAGCC
AGAAAAATAAATACAACTTAACAATAATACACAAAGTAGAAAATAAGAATTTAGAGATGT
GTTTGTAATTAAAGAAGAAAATATGGATGATGATTATACAAACTGTAAAATTGAGAATGG
TGGTAATTCTCATTTGAAAAACACTAATGCTTTACCTCAAAATGGAAAGAAATATTCTAA
AGAGTCTGCTCAAACTAAAGTTTTTGGGACAGATATGTTGTCACAAATTTCCAGACAAAA
AGGTAGTAGTTCCTAAAAAAACATAAATCAGTTACTAAGTTAAGCTTCCACAGTATCTCC
AAGCATCTAACCTGTTGAGAAGAGTATGATGGATGTGATTTCTAATACAACTAATTATTA
TCCATAATATCCCTTCTATCCTCCTCATAATCCTTATGAAAATCCTTTCTAATTTAGCAC
TAATTTTAATCCAGGCCACTAAATGACTTATCCTCATCCACATCCTTAAGGGTACCCACC
AAATTAGGTAAATGCGCCTTTTTCTCACCTCTATAACCAGTAACATAATTTTAACAATAT
GCCTCCTTACTATCCTCCTACTCGTTCTTCTTATATGCCAAGCTTTAACCATAATTATTA
GTAGAACCACATGCTTTAAGAGTAAGAAACTAAAGAATAATATCATACTATATCTGATTC
CAGTTCTAGTGATAAATATTTTTCAAAAAAAGATAAATTAAGTAATGAAAGAAGTCTCTA
AAGAAATTAAATGAAAAATGACAAAATAGATTTTGTTTCATCTGATGAATCTTTGCAATA
ATAAGAATAGACAGCTACAGACTTTTTTTAAAATGGAGCTCTCTCTGAGTTGATTAAGCA
AAACGAAAACATTCAAAAGATATGTGTTTATCTTAGAACTTTAAATGACATTAAAATGTC
AGTATGCACTAAAATTGAGGCCATGAAGAATAAATTCCTACAACAAATATAAATGAAAGA
ATAAGATTTCAGTTATGCATTTTTGGCAAATACTTTCAACCAAAATAATAACTAAGTAGA
AGAAAACTTAAAGAGCTACTTTGCAAAAATACAGCAACTAAATTCCTTTTTTGAAAAGAA
TTAACTAAGCTACAACCCTTAAGCTGCTAGCAAATAGAAACTAAGCTAGATTGAATAAGA
ACTTGATAGAATGCTTTTTTTTACTATTGAGAAAATAGATTAGGAAACTTTAAATTAAAC
TAAACTAATCAAGTAAGAACATATTGACCCTTTCAAAGATAATTCAGAGTATGAAGAATT
AACATAATTTTATCAAAACTAACCTGCTAATATTGATGCAATCAAAGACAAAATAAACTT
TTATTCTTAGTGTTAGCTCGAATTTGATGGAACATCAAAAGGAAACCCTGGAAGATCTGG
AGCTGGCTTTATCATCAAAGATTTATACACTGAGAATAAATTACTTGAGTATTCAGTAGA
AGTAGGAACAAAAACTATCAATTAATCTGAGTATCTAGCTTTAATCTATGGAATGTATAC
TTGCTATAAGCTAGGTATTAAGCAGCTTACAATTTAAGGTGACTCTGAAGTTGTGATAAA
ACACATGTTAGGTGTTTACTAATGCAGAAGCTAACAGCTCAGAGAATACTATAATCTAGC
TAAAATTTTAGATGAGCTTTTCCATTTTAAGGACTACGTTTAAGTAAAAAAAGAGCTTAA
CACTGAAGCTGATGCACTAGCCAATCTAGCACTTAGTTGATAAATCTAATAACCAATTTA
TATTATATTTATAATAGTTAAATATTTACCACCAAAAAAATTAAGAAAATTTATTTGATA
AAAAAAACATGGATAATTATTGAATTATTAAACTTTTTACTTTGTATATAAAACAAATTT
AAGTTCTATTGAATTATATATAATAGAAGACTGAATTAGCTTTTCATTACAAGCATATAA
TTATAATTAATAAGAGTTAAAATAAAACTATAAACTAAT



>TTHERM_00283900(protein)
MKICPKHKLPALQVCLSIDCKKQRMMCYKCLPDHSLHSEQIVQLDNLSDKKNLDCQENIN
SSIDSNKNNKQGVSPLKVNSEFNGSPFMLNNLANLKINSSSQEPSDQNVKRSSVKNSFSK
VKEFNSTSNIEEEILDQGQIKQKKKKSSISLDKPEKQIQLNNNTQSRKQEFRDVFVIKEE
NMDDDYTNCKIENGGNSHLKNTNALPQNGKKYSKESAQTKVFGTDMLSQISRQKGSSSQK
NINQLLSQASTVSPSIQPVEKSMMDVISNTTNYYPQYPFYPPHNPYENPFQFSTNFNPGH
QMTYPHPHPQGYPPNQVNAPFSHLYNQQHNFNNMPPYYPPTRSSYMPSFNHNYQQNHMLQ
EQETKEQYHTISDSSSSDKYFSKKDKLSNERSLQRNQMKNDKIDFVSSDESLQQQEQTAT
DFFQNGALSELIKQNENIQKICVYLRTLNDIKMSVCTKIEAMKNKFLQQIQMKEQDFSYA
FLANTFNQNNNQVEENLKSYFAKIQQLNSFFEKNQLSYNPQAASKQKLSQIEQELDRMLF
FTIEKIDQETLNQTKLIKQEHIDPFKDNSEYEELTQFYQNQPANIDAIKDKINFYSQCQL
EFDGTSKGNPGRSGAGFIIKDLYTENKLLEYSVEVGTKTINQSEYLALIYGMYTCYKLGI
KQLTIQGDSEVVIKHMLGVYQCRSQQLREYYNLAKILDELFHFKDYVQVKKELNTEADAL
ANLALS