Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00285680

Standard Name

RRM7 (RNA recognition motif-containing protein 7)

Aliases

PreTt25897 | 26.m00249 | 3688.m00045

Description

RRM7 RNA recognition motif protein putative

Genome Browser (Macronucleus)



Genome Browser (Micronucleus)

External Links

Gene Ontology Annotations

No Data fetched for Gene Ontology Annotations

Domains

  • ( PF00076 ) RNA recognition motif
  • ( PF00642 ) Zinc finger C-x8-C-x5-C-x3-H type (and similar)
  • ( PF05316 ) Mitochondrial ribosomal protein (VAR1)

Gene Expression Profile

Vegetative Cell Cycle (Zhang et al., 2023)

GeneMania

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for Tetrahymena Stock Center

Homologs

Source Identifier Score
Tetrahymena borealis EI9_09285.1 9.997093137033517e-262
Description: hypothetical protein (1120 aa)
Tetrahymena borealis EI9_40891.1 9.997093137033517e-262
Description: hypothetical protein (255 aa)
Oxytricha Contig22254.0.g55 1.0002124404074584e-26
Description: RNA recognition motif_ (a_k_a_ RRM, RBD, or RNP domain)
SGD YER068W 9.000561397357242e-21
Description: MOT2 Subunit of the CCR4-NOT complex, which has roles in transcription regulation, mRNA degradation, and post-transcriptional modifications; with Ubc4p, ubiquitinates nascent polypeptide-associated complex subunits and histone demethyase Jhd2p
WormBase WBGene00003827 3.0002687256732656e-20
Description: locus:ntl-4 status:Partially_confirmed protein_id:CDM63498.1
WormBase WBGene00007361 3.0002687256732656e-20
Description: locus:oac-3 status:Partially_confirmed UniProt:Q17701 protein_id:CAB01113.2
Stentor Coeruleus SteCoe_32514 0.000000002061153622438558
Description: None

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

No Data fetched for Associated Literature

Sequences

>TTHERM_00285680(coding)
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GGAGCCCTTATCTCAACCCTCTCTATAAATTAAGCAAATTCAAATTAAAATTTACAGGAA
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TTAAAGCAGGAGGGTAATAGAGATTAAAATTCAGTTGGTGTTTATGTTTCATATTCTTCT
CCTAATGAGGCTTCAATTGCGATATTAGCATTAGATTAATTTGAACTCGATAGCAAGCCA
TTAAGAGCATTTTATGGATCAACTAAATACTGTAATTCATTTTTAAATGGCTAATAATGT
ATTAAAAAAGATTGTCCTTATTTGCATGAAAAAGCAAAAGAGCATACATTTTATAAAGAT
TAAAGATTTTATATAAATTATAAAGAAATAGCATTAAAAATAGTGAATTAAAAAATTAGT
TTTTACAATAATTATTCATCAGTTTAAAACCCTATATTTCCAGATGTTATGATAGTATTA
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AATACTTTAAATTATTATAAGATGGTCGAAAAATTAGATTTGCCTTTTTAAAATCCTAAT
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TCTTCAAAAAATATAAATTCAACTGTCAACTAGCAAGTAAAAACAATTTAAAAAACAACT
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AATGTTCCTATTGATAGTAAACTGAACTATAGATCTAGCAAATCTAAAAATGAGAAAAAT
CTTGCAAATAAGAAGAAAGAAGAGAAGCAAGTTTAGTATGAAAGCAAAGGTGAGTAGGCT
GTGTACAAAGGCACTCCAGAGGTAGGAATTAATGATGATAATGAGTGA


>TTHERM_00285680(gene)
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GGAGCCCTTATCTCAACCCTCTCTATAAATTAAGCAAATTCAAATTAAAGTAGATTTATT
TTAGATTTTCGCTTATTAGAAATATTTTTTTTTGTGTATGCGTTATTATGATATTTACAA
ATATCTCATTTAGATAATTCATTAATGTAGTTTTTTCATAAATTCAACAGATTTACAGGA
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ATCTTTAAGTTTCTTAAGTACTTTCAAAAAGAAGCTGGCTTGCTTCAATGTTAAAACTAA
AAAAGCAAAAGCAAAATAAAATATTTTTTTGACATTATTTATCATAAAATTAGGTTTTAA
AGAAGAAGCAGTATATGGGATAGTATGGAAATGTTAAAAAAGTTATTTTAAAGCAGGAGG
GTAATAGAGATTAAAATTCAGTTGGTGTTTATGTTTCATATTCTTCTCCTAATGAGGCTT
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GCTTTTATTTTATTCCCGCGCTCAAAGTGCTTCAACTCAATTTTTATTTATTAATAGGCA
TTAGATTAATTTGAACTCGATAGCAAGCCATTAAGAGCATTTTATGGATCAACTAAGTAG
GCATTAAAATATATTTCTTCTTTTTCTCTTCTTCTCTCTTTTATATATATATCTCTAACT
TTTTACCAGCAAACCAAAAGAATATTACGCCAAGTGCTCTTATAATTAACTCATAAAAAT
AATAAGCTAAAGGGATCATGATCATAAATCTTTTTTTAGCTATTTTGAGCCATTTATTCA
CTTTATTATAGTTTTTGAATATCACTTCTAGCATTTAAATTGCAATTTTTAGAGACTAAC
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ACATATTTAGGGATTTATGAAGCATTTAGGTTAGTTGGTTTGATTTGGAGATATATAGAC
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TATTGATTAGCTTGGAAATATTAATTAACAACATATCTATCTATCAGTCTGGCTTAATCT
TGATCTTTTTTATTAAAAAAAAAATGAATTTTTACATTTTTAAAATTATTGGTTGGAAAT
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TATATACTTAACTAATGTTTAAAGAGATATCAAATATTTAAAAGTTAATAGCATCTTAAA
TAAAAGGAAATAATTTAGACATTAAAATACATCAAGTTAAATAAAATATTTAGGAAAAAA
TCTTTTTTAAAATTGTATAAGAAATAATTTTTATTGAATTAGGAGCTATGTAAAAAAAAG
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TGATGATGATGCTATGACAAATGAGGGAATTTAAAATTAAAATTAAGATTAAAATTAAAA
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TATGAATACTTTAAATTATTATAAGATGGTCGAAAAATTAGATTTGCCTTTTTAAAATCC
TAATTTGTATTAGTTATTATAACAACCTGATATACAATAATAGCTTGGTATAAATTAATA
CATTAACAGGGTAGAGCTTGATTCTATAAATTACTCACCAAATTAATTCTATTTTGATGA
TAAATTTTAACTAGCAGAAAATTCTTAAACTAGTAGATTTTTTAATGACTCTAGCAAGAG
CTTTAAATTTAAAAATATATGGGGACCTGTTGGTTAAAAAAAAAGCTCACTTAAAATTGA
AAATCCTAATAATCCTAATTATATAAATGGTTTGTAAGGAAATGATTGCATATAATTACC
TCAAAGTAATGAAGAAGATGAATTTAGTGTGCTTAACACATTTATTTTGGCATATAACAT
TACTCATAGTTTGTGGATTCCTTATGTCAAATTGCAAAATTTAACTGAAAAGATATTTAA
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TGATAACTGGATGTTGGAATTCCTTGAAAATAACTTATTTACTGATGAAGAAAAAGAAAT
TATTTTGAGTGCTGCTAGAAGTACATTTAAGGATAAAAATCTACTATATGTTGATATTGC
TCCATAATGTGTTGACTTGTTTACTCCTGTAGTTGAACAGAAGCAGCAATTGCAAGAGGT
TTAAACAATATTTACTTTACATCCGAATCATTAAAAGCAAAGAAAAAGATCTTCGAATTC
TCTTTAGGTATAATAATTCGATTTAAAAAATAGCTAAAATTTAAATAATTTTATACAGAG
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TAGTCAACCTAGTAATTTATCTTCTTCAATTGTTAAGAATGAGTTTCAAATCTAAAAATA
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AAAAAATATAAATTCAACTGTCAACTAGCAAGTAAAAACAATTTAAAAAACAACTTAAAA
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ACAACATGTTCACATTTTTAGAAAATGAATAAGAAGAAGATGAAGATAAAGATAAAGATA
AAGAGGAACAATAAAAGCAAAAGAATGATAATACAACTAAAAAGCAAAAAACCAAAGTAA
AATAAGCTGAAAAACCTGAGAAAAAGACCTCAAAAAAAATGAACTCTAAATAGCTAGAGC
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AACTTAATCTGATCAAATAAGAGAAAGAAAAAAACAAGTAAAAACAGCAGGAGTAAAAGC
AAGAATAGATGCAATAACAGCAAAAAAAAAAGTAAAAAGAGTAAGAGAAGGAATAGTAAC
AATAGGCATAAGCTGATAAATCTTAAATTTTGAATCCTTTGATAAATGGAGGTTGCTTGA
AGTTTAATTGTAATTCAATAAATTGCCACGAAATAAGCGGCTAACAGATTTTAGTGCAAA
ATGGTGAAATTCAAATTCCTTAAATTAAGCAGAGCACTTTTGATAAAAAGAGAAAGAAAA
GACAAGAAAGCAGTCTTAATAGCATTGACATATAGAAATAAATTAGCAACTTAATGAGCA
TAGACCCAAAGGCATTTTAATTTCAAAATTAGAATAGATTAGTTAACTAGTAATTAGCAT
TCCATGCTGAAGCTAGCGTTACTAATATAAATGTGACTAAAGAAGGCATAAATATAAGTG
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CTAAAATTTAAATGCCAAACAACATAGTAGTTCGTTTTGATAATGTAGATAATACAAACA
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TTAGTATGAAAGCAAAGGTATTTAATTTTTTTTAATTGATTTATCATTTTAACTTAAAAT
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AATTTTATTTAATCTTTTTATAATTAAACAGATGATAATGAGTGA


>TTHERM_00285680(protein)
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