Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00292270

Standard Name

VPS18C (vacuolar protein sorting 18C)

Aliases

PreTt26055 | 26.m00407 | 3688.m00198

Description

corvet complex core vacuolar protein

Genome Browser (Macronucleus)

Full Screen View

No Genome Browser Data Present

Genome Browser (Micronucleus)

Full Screen View

No Genome Browser Data Present

External Links

• Uniprot
• Alphafold

Gene Ontology Annotations

No Data fetched for Gene Ontology Annotations

Domains

• ( PF00637 ) Region in Clathrin and VPS
• ( PF05131 ) Pep3/Vps18/deep orange beta-propeller domain

Gene Expression Profile

Vegetative Cell Cycle (Zhang et al., 2023)

GeneMania

No results were calculated for this gene in GeneMania.

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for Tetrahymena Stock Center

Homologs

Source	Identifier	Score
Tetrahymena borealis	EI9_09412.1	9.997093137033517e-262
	Description: hypothetical protein (1060 aa)
Oxytricha	Contig618.1.g107	2.0009803861620222e-78
	Description: Pep3/Vps18/deep orange family
DictyBase	DDB_G0269924	4.001287313050914e-66
	Description: vps18 on chromosome: 1 position 3875953 to 3879788
Stentor Coeruleus	SteCoe_29243	2.7487850079102147e-43
	Description: None
WormBase	WBGene00021058	3.9990760533890984e-36
	Description: locus:vps-18 status:Partially_confirmed UniProt:Q23194 protein_id:CCD73641.1
WormBase	WBGene00001173	3.9990760533890984e-36
	Description: locus:egl-4 cGMP-dependent protein kinase egl-4 status:Confirmed UniProt:O76360 protein_id:CCD71859.1
SGD	YLR148W	8.003613776907505e-34
	Description: PEP3 Component of CORVET tethering complex; vacuolar peripheral membrane protein that promotes vesicular docking/fusion reactions in conjunction with SNARE proteins, required for vacuolar biogenesis

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

1. Ref:31964712: Sparvoli D, Zoltner M, Cheng CY, Field MC, Turkewitz AP (2020) Diversification of CORVET tethers facilitates transport complexity in . Journal of cell science 133:

Sequences

>TTHERM_00292270(coding)
ATGTCTTAATTAAAGGAAGGATATGTGGAGGAAAGCATTGATGAATTCGGCTTCCAAGAT
AAAATTTATAATTCCTAAGAAATATTTTAGCGCCTAAAGCAATATGACCCATTAGGCATT
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TAACTGTTAGCTAATGAATGCATTTTCTGTGGGCCAGGAGTAGTTGATAATATATTTATG
ATATACGAAAAGGATAAAGATCCAAAAACATCATGGGAATTTTGA

>TTHERM_00292270(gene)
ATGTCTTAATTAAAGGAAGGATATGTGGAGGAAAGCGTAATATTTCTATCATAAACTTTT
TAACTAATTAATGATTTTGTTTTAATTAATTTGTAAAATATAAAGATTGATGAATTCGGC
TTCCAAGATAAAATTTATAATTCCTAAGAAATATTTTAGCGCCTAAAGCAATATGACCCA
TTAGGCATTCCCTTAGATTCTGAAAAAATTAAATTATTTGCAGTTAGCACTCATCAGATA
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GATAGAATTTTCCTTGATCCAAATGGTATTATTCTTATTTTTAATATCTTTTGAACTAAA
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TTATTAGGTTATCACTGTATTTTGACTTGTGACTCTGGTTGTAGCTTTTATCTAAATTAT
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AAGAATAAGCTGAGCTTAAATTCCCAAATATCACACTTACTTCTGTAATGAGTGTTTGTT
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TTAATAAATTGAAAGTCTTTAAGATAAAAATATTAAAATAAATATTACTTTATTAAATTA
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AAAAATAGTTTAAAAGTTTGATCTAAAGTTTATGGGAATAGTCTATGGTATGAGCTTTGA
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TTATGAAATAAGCATGAGAAACGGTTAAGATGCTACTGAATATGTATATTTTTAAAGCTA
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CTTTTAGAAGCTAAGAAGTATCAGGAAGCTGCAAATTAGTATTTTTAAACTTCAAGAAGT
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GATGGATTAGAAGGTTGATATTAATTTAAACTAATTAATTTTTCTAGTTTTTTATAATTA
AAATAGTTTATTTAATGCTGTGGCTAAGTAATTTAAGTCCTGAGGCAAAAGTTTAAAGGA
TTATGATAATTAATTGGTTGATTGAGCTTAAAGTTAGCCGTTACAATTATTTTATCTAGC
AAGTAACAAGTAAAATATTTTTTATTTTTATTTTTTAAGATACTAAATGAAAAATAAATA
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CAAGATTACAAAAAATGGGAAAGATCTTTAAATTTTTAAGATTAAAATATTGAATAGTTC
TTAGAGTAATATTGTGATGATATTCCTGAGGAGTCTATTTATCAGATTATGCAAAGTCAT
GGAAGGCTTAAAGAATGCATTTAATTTGCCAAACAAAGAAAATCATATGAAATGATTGTT
TAGCATTATATAAATGAAGAATAATTTGATAATGTTATAGAAGTATTCAAAGGTATTAAT
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AAAGTTTTTAATTAATAAAATTAATTAATAATTAGTATTGCCATATTCTATTACAGAAAT
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TCAGAACTGAAAAACTAGTTATAGGCATCATGAACGTTCCTGAAAAGCATAAAAAGGATG
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TTTATATTTATCTGTTATGTGATAAAAACTATAAATCAGAGCTAAATAAACATCTGACTT
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GACTTACATCCTAGAAAATGCTCAGAAATGCTCAAATTCAAATTTACGGGTAAATGATAT
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TATTAAGAAGCAATTGATTTGGCTTTAAATCAAGAACTAATTGAAGCAGCTATTAGCTTT
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CATTTTAAAGATTAAATCTGCAATTGCTTATAAAATTATAATACAGAAATTAAAGAGTTA
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ATCAAAAACAGGTATGTTGAAATGAATCAAAATGTAACTTGCATGGAATGTGTGCAAAGT
CTCTTTAACGAGTCCTTTTATATATTTCCTTGTATGCATGGATTCCATAAAGTAAAAATA
AATAAATTATACCTTTATGTTTTTTATTAAATATAGTTTTTTAATAAAATAATTTATTTT
TATCAAATAAAAGGCTTGCTTGATATAAAGAATGAAAAAAGATAACATAGATTAAGGCAA
AATAAATTAAATAGAATAATTGAATTAGGAAATTGAGATTTTATAATAGAAGCAGCTCAA
AATAGAAGTTAGGAAGAGTAAATTTAAATAATAATAAAAAATATTAAATTAATTATTTAT
TAGGATAATCAGGTAGTGGATTCTTTAACAACATAAACCAAATTTTTTCAGCTGCAAGAG
GAGGATCTGAAGAAATTGAAATTAATTAACAACAAATGAGTCTAAATGAAGAGAGGGAGC
TTTAAGAATAAAAAGTAAACTAATTTAACATTTTAAATTTTATTAATTTCTTTTTTAGTA
AAAAATAGATTAACTGTTAGCTAATGAATGCATTTTCTGTGGGCCAGGAGTAGTTGATAA
TATATTTATGATATACGAAAAGGATAAAGATCCAAAAACATCATGGGAATTTTGA

>TTHERM_00292270(protein)
MSQLKEGYVEESIDEFGFQDKIYNSQEIFQRLKQYDPLGIPLDSEKIKLFAVSTHQIVIV
TDQNKVYRLREELDEKFINYPVPEKKVDNPNKEFKEKIKDMGKQILFLGAQGPKVSIDRI
FLDPNGYHCILTCDSGCSFYLNYDHNKIKFLKNLKGTEFVIKSVGWDETCNNTTTKNILF
GTQEGMLYIYKIEIGKNNEIIDCNPEKTLALKGGRSVLQINYLRLGSEENPRIVILVSTS
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TNGVALQVFDIPQDASSLQETKYYKYAKNSDEHSQDEYKVKEMPIDIFLSEFHYFLLHSD
QLTILSRINEKIVQKFDLKFMGIVYGMSFDYSSQSLWIYSSKQIFKLSIRNEGTDAWRLL
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