Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00294740

Standard Name

VPS16B (vacuolar protein sorting 16B)

Aliases

PreTt15584 | 27.m00244 | 3692.m00047

Description

corvet complex core vacuolar protein

Genome Browser (Macronucleus)



Genome Browser (Micronucleus)

External Links

Gene Ontology Annotations

No Data fetched for Gene Ontology Annotations

Domains

Gene Expression Profile

Vegetative Cell Cycle (Zhang et al., 2023)

GeneMania

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for Tetrahymena Stock Center

Homologs

Source Identifier Score
Tetrahymena borealis EI9_08731.1 9.997093137033517e-262
Description: hypothetical protein (990 aa)
WormBase WBGene00006526 9.997093137033517e-262
Description: locus:tax-4 Cyclic nucleotide-gated cation channel status:Confirmed UniProt:Q03611 protein_id:CAB63418.2
DictyBase DDB_G0270754 9.99648502569394e-38
Description: vps16 on chromosome: 1 position 4423807 to 4426401
Oxytricha Contig9251.0.g55 5.002276765025871e-34
Description: Vps16, N-terminal region
Stentor Coeruleus SteCoe_16853 3.1391327920480296e-17
Description: None
SGD YPL045W 0.0000000020002373268528243
Description: VPS16 Subunit of the vacuole fusion and protein sorting HOPS complex and the CORVET tethering complex; part of the Class C Vps complex essential for membrane docking and fusion at Golgi-to-endosome and endosome-to-vacuole protein transport stages

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

  1. Ref:31964712: Sparvoli D, Zoltner M, Cheng CY, Field MC, Turkewitz AP (2020) Diversification of CORVET tethers facilitates transport complexity in . Journal of cell science 133:

Sequences

>TTHERM_00294740(coding)
ATGATATTTCACGAAGATATTATCAATTTAGGAGAAAAGCCATATGAGTATAAAGATTTT
TTTACTATGGACTCTAAAATATAAGAAGATAATATAAAGTTAAGTTATTTTCACAGTGCA
GTAGCTAAGTATGGTGGTCCAATAGCTCTCATGAGAAATAAAAATAAAATTGTTCCTAAC
TTAAAAACTTCTGTTTTGAATAATGAACTATGTTTTTTAACATCCGATGGTGTTATTTTT
AATCATATAAAATTTGATTATCAAGGTAGAGATGTAGTTTGTTTTGATTTCCTATAAAAT
GAATTGCTTTTAATTCTTACTAGCAATCCTCCTGTGTATTACTTAGTTGACCCATTCAGG
AATGAATAAAATCTTAAACCCTATAATTTGGATACAAAGTTTCAAAGTAACATCTATCAA
GCAAAGGCTTTCGGTAATGGATTTGCATTTTGTGCAAAAATAACCAATTAAAACTAACCA
GAAGAAGTAAGGTTCTTTTATGTTGATAATTTGCATATGCAAACAAGAGACAAAATTATT
CCAGAAAAAGCTTTCTATAAATCTGGAATTAAAGAAATGCCAAGAGATTGGATTATAATG
ACAAAGGATTAATCTGAATTAAAAACACTAGAAATATAAATGACTCACCCTGAAAGCGGT
GTTATTAGCCTAACTGAAACTAATCGTAAATTATATTACCAGATTCCTGACGTAAATCAA
TCAGATAAAGCTTCAGCTTAACCTAAATAAGTCTCTAGTAGTCTTCCTCCTATTAAAAAT
ATACAATTTATAGCTTTGTCACCTAGCAATTCTTTGATAGCTTACTTATAGGAAGTTGGA
AATGGAAAAATTAAGCTTAGTGTACTTTCAAATGATTACGAAGCTAAGAGATATACAGTT
TGTGATGTTGACTTAAAAGGACTTAAATTGCCAAATACTATTTCTTCCAAGGAATCATAA
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ATGATAGGGCCAGATGTTACAGAAATCATTTAAATTAATGAAGATTTTATCATGTCGAAG
GAAGTAGATGGAATAAGAATCATAACAAAGAAAGGTGATAAATTGCTCCGTTCATTACCA
GATGCTTTTTTAAATGTATATCCTGAGTACATATCAAATTGGGATTCATAAAAACCTGCA
GCTAAATTACTTCAAAATTATTTGAATTTGAAATCAAAGCAACCTTTCGATGACTCAGAT
CTTAGAAGCAACCCAGCTTAACTTAGATAAGCAGTAAAAGATTGTATGACAGTAGCTGCA
TTTATTACAGATGAAGAGAAATAAAAAGATCTTCTAAAAGCAGCATCTTATGGAAAGACT
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GTTGTTTATAATTTTAGAGAAGTGAGTATCAAACGTATGATAACTTGTGCATAGGTTAAT
AATCTGCTCTCAGGAGACTTGTAATAACAATTGATAAATATAATGCTTAGATACGATTAT
CATGAATTAGCCTTTAATGTATGTAATTAACTTGATTTTAAGCCAAAAGTTAGAACTTAT
ATTTTTGAGCATTGGGCTGAAAGGGTCATTGAAAAGAGTTCTGCTGCAGCAAGATAGCAT
GAACAAAGAAACAGTAATGATTTAGGAGGCATAGGAGGAAATAAAGATTCATGGAATTCT
ATGTAATATAATGCCGATAATGAGGATAACAGAGTAGCTGAAAAAATCATAAGCAAGCTT
AGAAATGAAAAGAATGTTTCATTTGTAAATATAGCTAAGAGAGCTACAAAAGAGTGTAGA
TAAAATTTAGCAATGAAACTACTTTACTAGGAGCCATCTGCATTCAAAAGAGTTCCAGTT
TTGATTTGGATGGGGAAAAACTGCTTAGAATTTGAATCAAATGCCCTAACTTAAAGTGGA
TTAGACAGAAATGAAATTGAAGAAAAGCTTAAATCTAAGGAATGGAAAGAAGATGTTTAA
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GAATTAATTTATATGTGCTTAAAAGAAATGGATACATACATGAAAAATGAAACTTTAAAG
TTCCACGTGTTAAAAAGTGAATAAATTTATGCTAACCATTATAAAAACTATTTAAAAAAC
AGTTCTTCTTAGTCTAAACAAGAAAGATATAAAAATTTTATAAATTATTGTAATAATGAT
TAAGGTTTAGAAAAAGTAAGCTACTTCATCAAGAATAGCTTTTAAACTAACTATAAGAAG
TCTACAAAAGAAAATTTGATAAACAGACATGAAAATTTAAGACAAGCTTTAAAAGAAATT
AATTAAAAGAAAATAGATGATAACTTTTTAGGATAAGCACTATTAAAAGAAATTTAAAGT
TTGGAATATATACTGGGCAGTCCTACAGATGAATTGAACAAACACTTCATAGATGAAATT
TTAGAATGGACAGTCAATAAGAGCTTATCAGACACTTTAGCACGTGATGCCAAATCAATC
AAAGATAAAATAAAAGACTTTAATGTTTCTTAAAAGCGTACAGATTTTTTAAAAGTTCGT
AATTTAATAAAAGAGAAGGATTATGAGTAGCTTGAATTTTTCTTGGTTAAAGAAGTTAAT
AAAAAGAACGTTGTTATTCCCTACGAATTGGTTGCCGATTTACTAATAAAAGAAGGAGCA
AAAGACTAAGCAGTTCGTTTGATATTAAATATTCCAAAAATGGAAGAAAGAGTTACTATC
CTTCTCAAAATCGATGAGGCAAAGCGTGCCGTGTAAGATGTAATCAATTCAAGAAAAAAT
TTAGACTTACTTGAAATGATTAGAGAACAGTGTAGAGATCCTAGTGTGATTAGTTACATG
GAAAATTAACTTTAATCAGCTGGTCTTAGAAAATGA


>TTHERM_00294740(gene)
ATGATATTTCACGAAGATATTATCAATTTAGGAGAAAAGCCATATGAGTATAAAGATTTT
TTTACTATGGACTCTAAAATATAAGAAGATAATATAAAGTTAAGTTATTTTCACAGTGCA
GTAGCTAAGTATGGTGGTCCAATAGCTCTCATGAGAAATAAAAATAAAATTGTTCCTAAC
TTAAAAACTTCTGTTTTGAATAATGAACTATGTTTTTTAACATCCGATGGTGTTATTTTT
AATCATATAAAATTTGATTATCAAGGTAGAGATGTAGTTTGTTTTGATTTCCTATAAAAT
GAATTGCTTTTAATTCTTACTAGCAATCCTCCTGTGTATTACTTAGTTGACCCATTCAGG
AATGAATAAAATCTTAAACCCTATAATTTGGATACAAAGTTTCAAAGTAACATCTATCAA
GCAAAGGTAGATAAAATACATAAAGTTTTATTTCAATAATACCATCAGTTTAATTTTTAA
ATTTTTATCAATTTACTGCATATTGGCTACTTTTATAATTATTATATTATTTAAAACAAA
AAGGCTTTCGGTAATGGATTTGCATTTTGTGCAAAAATAACCAATTAAAACTAACCAGAA
GAAGTAAGGTTCTTTTATGTTGATAATTTGCATATGCAAACAAGAGACAAAATTATTCCA
GAAAAAGCTTTCTATAAATCTGGAATTAAAGAAATGCCAAGAGATTGGATTATAATGACA
AAGGATTAATCTGAATTAAAAACACTAGAAATATAAATGACTCACCCTGAAAGCGGTGTT
ATTAGCCTAACTGAAACTAATCGTAAATTATATTACCAGATTCCTGACGTAAATCAATCA
GATAAAGCTTCAGCTTAACCTAAATAAGTCTCTAGTAGTCTTCCTCCTATTAAAAATATA
CAATTTATAGCTTTGTCACCTAGCAATTCTTTGATAGCTTACTTATAGTAATTAAAAATA
TTTAGAATCAGCAATTAAAATAAATTTTCAAAAAATATTGTAAAATAGGGAAGTTGGAAA
TGGAAAAATTAAGCTTAGTGTACTTTCAAATGATTACGAAGCTAAGAGATATACAGTTTG
TGATGTTGACTTAAAAGGACTTAAATTGCCAAATACTATTTCTTCCAAGGAATCATAATT
GCAGATGATGTGGTGTGGTGATGACTGCTGTGTATTATAAATAGATTAATCTATTCTTAT
GATAGGGCCAGATGTTACAGAAATCATTTAAATTAATGAAGATTTTATCATGTCGAAGGA
AGTAGATGGAATAAGAATCATAACAAAGAAAGGTGATAAATTGCTCCGTTCATTACCAGA
TGCTTTTTTAAATGTATATCCTGAGTACATATCAAATTGGGATTCATAAAAACCTGTAAC
TTATATTCTATTTAAAATATTTCATAATATCCACAATAAAAAATATATTATTAGGCAGCT
AAATTACTTCAAAATTATTTGAATTTGAAATCAAAGCAACCTTTCGATGACTCAGATCTT
AGAAGCAACCCAGCTTAACTTAGATAAGCAGTAAAAGATTGTATGACAGTAGCTGCATTT
ATTACAGATGAAGAGAAATAAAAAGATCTTCTAAAAGCAGCATCTTATGGAAAGACTTAT
TTGGGACCAGATGCGATTAACCATGATGAATTTGGGCTTTTGTGTCAAAAATTAAGGGTT
GTTTATAATTTTAGAGAAGTGAGTATCAAACGTATGATAACTTGTGCATAGGTATAACTT
TCTCATTATATTTTTATTGAATGATAAAATAAATAAATCATAAATCATAAAGGTTAATAA
TCTGCTCTCAGGAGACTTGTAATAACAATTGATAAATATAATGCTTAGATACGATTATCA
TGAATTAGCCTTTAATGTATGTAATTAACTTGATTTTAAGCCAAAAGTTAGAACTTATAT
TTTTGAGCATTGGGCTGAAAGGGTCATTGAAAAGAGTTCTGCTGCAGCAAGATAGCATGA
ACAAAGAAACAGTAATGATTTAGGAGGCATAGGAGGAAATAAAGATTCATGGAATTCTAT
GTAATATAATGCCGATAATGAGGATAACAGAGTAGCTGAAAAAATCATAAGCAAGCTTAG
AAATGAAAAGAATGTTTCATTTGTAAATATAGCTAAGAGAGCTACAAAAGAGTGTAGATA
AAATTTAGCAATGAAACTACTTTACTAGGAGCCATCTGCATTCAAAAGAGTTCCAGTTTT
GATTTGGATGGGGAAAAACTGCTTAGAATTTGAATCAAATGCCCTAACTTAAAGTGGATT
AGACAGAAATGAAATTGAAGAAAAGCTTAAATCTAAGGAATGGAAAGAAGATGTTTAAAC
TAGGTAAGCACGTCATTATGAAAATGCGCTCTAATAGGCACTTTAAAGTCGCGATAGTGA
ATTAATTTATATGTGCTTAAAAGAAATGGATACATACATGAAAAATGAAACTTTAAAGTT
CCACGTGTTAAAAAGTGAATAAATTTATGCTAACCATTATAAAAACTATTTAAAAAACAG
TTCTTCTTAGTCTAAACAAGAAAGATATAAAAATTTTATAAATTATTGTAATAATGATTA
AGGTTTAGAAAAAGTAAGCTACTTCATCAAGAATAGCTTTTAAACTAACTATAAGAAGTC
TACAAAAGAAAATTTGATAAACAGACATGAAAATTTAAGACAAGCTTTAAAAGAAATTAA
TTAAAAGAAAATAGATGATAACTTTTTAGGATAAGCACTATTAAAAGAAATTTAAAGTTT
GGAATATATACTGGGCAGTCCTACAGATGAATTGAACAAACACTTCATAGATGAAATTTT
AGAATGGACAGTCAATAAGAGCTTATCAGACACTTTAGCACGTGATGCCAAATCAATCAA
AGATAAAATAAAAGACTTTAATGTTTCTTAAAAGCGTACAGATTTTTTAAAAGTTCGTAA
TTTAATAAAAGAGAAGGATTATGAGTAGCTTGAATTTTTCTTGGTTAAAGAAGTTAATAA
AAAGAACGTTGTTATTCCCTACGAATTGGTTGCCGATTTACTAATAAAAGAAGGAGCAAA
AGACTAAGCAGTTCGTTTGATATTAAATATTCCAAAAATGGAAGAAAGAGTTACTATCCT
TCTCAAAATCGATGAGGCAAAGCGTGCCGTGTAAGATGTAATCAATTCAAGAAAAAATTT
AGACTTACTTGAAATGATTAGAGAACAGTGTAGAGATCCTAGTGTGATTAGTTACATGGA
AAATTAACTTTAATCAGCTGGTCTTAGAAAATGA


>TTHERM_00294740(protein)
MIFHEDIINLGEKPYEYKDFFTMDSKIQEDNIKLSYFHSAVAKYGGPIALMRNKNKIVPN
LKTSVLNNELCFLTSDGVIFNHIKFDYQGRDVVCFDFLQNELLLILTSNPPVYYLVDPFR
NEQNLKPYNLDTKFQSNIYQAKAFGNGFAFCAKITNQNQPEEVRFFYVDNLHMQTRDKII
PEKAFYKSGIKEMPRDWIIMTKDQSELKTLEIQMTHPESGVISLTETNRKLYYQIPDVNQ
SDKASAQPKQVSSSLPPIKNIQFIALSPSNSLIAYLQEVGNGKIKLSVLSNDYEAKRYTV
CDVDLKGLKLPNTISSKESQLQMMWCGDDCCVLQIDQSILMIGPDVTEIIQINEDFIMSK
EVDGIRIITKKGDKLLRSLPDAFLNVYPEYISNWDSQKPAAKLLQNYLNLKSKQPFDDSD
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IFEHWAERVIEKSSAAARQHEQRNSNDLGGIGGNKDSWNSMQYNADNEDNRVAEKIISKL
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KKNVVIPYELVADLLIKEGAKDQAVRLILNIPKMEERVTILLKIDEAKRAVQDVINSRKN
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