Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00295100

Standard Name

DRH4 (DExD/H box RNA helicase 4)

Aliases

PreTt15620 | 27.m00280 | 3692.m00083

Description

DRH4 DEAD/DEAH-box helicase

Genome Browser (Macronucleus)



Genome Browser (Micronucleus)

External Links

Gene Ontology Annotations

Cellular Component

Molecular Function

Domains

  • ( PF00270 ) DEAD/DEAH box helicase
  • ( PF00271 ) Helicase conserved C-terminal domain
  • ( PF01059 ) NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4, amino terminus
  • ( PF01733 ) Nucleoside transporter
  • ( PF02487 ) CLN3 protein
  • ( PF04851 ) Type III restriction enzyme, res subunit
  • ( PF07690 ) Major Facilitator Superfamily
  • ( PF08290 ) Hepatitis core protein, putative zinc finger
  • ( TIGR00614 ) ATP-dependent DNA helicase, RecQ family
  • ( TIGR00881 ) phosphoglycerate transporter family protein
  • ( TIGR00939 ) Nucleoside Transporter
  • ( TIGR01587 ) CRISPR-associated helicase Cas3
  • ( TIGR02614 ) cell division protein FtsW

Gene Expression Profile

Vegetative Cell Cycle (Zhang et al., 2023)

GeneMania

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for Tetrahymena Stock Center

Homologs

Source Identifier Score
Tetrahymena borealis EI9_08774.1 9.997093137033517e-262
Description: CLN3 protein (1138 aa)
Oxytricha Contig20704.0.g65 5.997537942519205e-151
Description: DEAD/DEAH box helicase
DictyBase DDB_G0288501 7.999856284897459e-146
Description: ddx42 on chromosome: 5 position 1607944 to 1611404
WormBase WBGene00008119 9.999130229490956e-141
Description: status:Partially_confirmed UniProt:Q93382 protein_id:CAB03765.1
SGD YNL112W 1.99959632430224e-111
Description: DBP2 Essential ATP-dependent RNA helicase of the DEAD-box protein family, involved in nonsense-mediated mRNA decay and rRNA processing
Stentor Coeruleus SteCoe_12603 1.1379798735078682e-50
Description: None

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

No Data fetched for Associated Literature

Sequences

>TTHERM_00295100(coding)
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>TTHERM_00295100(gene)
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TCTAGTAGTTAACAATAGTAATAGCAGTAAAATTAGCCAGTATAAAATTAAGTGCCTTAG
AGATAGTCTAGAGAGAGTATAATGGAAAATTTTAGAGATCAGATGAAAAAAGGCATGTAA
TAATAATTCAGAAGTGGATTTGTGAGTGGAGGAATGCTTCAGAAAAAAAGTAATTTTATT
TATAAAAGAATAAGATATATTTGAACTTTTTTATTATTTTTTAAAATTTAGAGTGA


>TTHERM_00295100(protein)
MGDWRKKRQLTEDLRQDKYFDEEDDEQQQNNENNNDGDDEEDELDAFMKGIEEQADKDIK
ETIQKKENPDLLNLNTKRKAGERLDEDDHLDTYMDSIKKKLIQEADKMNPNKKSKKQKDK
NENSSNDNSEDDYEEEDEDNNNQYDFLDSDGEVDFNKVKEMKKKNFQLLEQVDHSSIKYE
AFTKNFYQEHPDITKLTEQQVEKIRKEFEIKVSGVRPPKPIVSFGHLGFDEELMRQITKL
GFEKPTQIQCQALPCGLSGRDIVGVAKTGSGKTVSYLWPLLIHILDQRELEKNEGPIGLI
LAPTRELCQQVYTESKRYAKIYNISVGALLGGENKHEQWKMLKAGVEILIATPGRLMEMI
QKKATNLRRCTYVVIDEADKMFSMGFEKQIRSIMQQIRPDRQTLLFTATLKKKIQNLVMD
VLRNPVTIKIGGENQANEDIRQEPIIFKDSNFKDQWILNNLNLCLQKGKVLIFVNHITNC
NKLSELIKQRLYLEALVLHGDKIQSERTDIINKFKAAKNLLIATDVASRGLDIPEIKTVI
NYDLPQDTDTYIHRIGRTGRAGATDGTAYSLILMSESKFASDMLKVMEISGQPVPPNLEE
VAMNDDQFKAQRLATKLGVDFAKGKDSSKLLKQALSRQRNTKHGLGYKQEDELSIKDQIK
ADVDQDIKKQKISQTQAPPPPLFDLEQLISQKDLLEQEEQKLLKEKEKAIQTQKIVREYQ
EQLLQTGKITQEQFNIQAQLQQLQINEKEIIFQQIQDQLQFVRIQIQQAQNQKSSITSNS
SSSQQQQQQQNQPVQNQVPQRQSRESIMENFRDQMKKGMQQQFRSGFVSGGMLQKKK